呂蕊花,陳 萌,趙 倩,馮 昭,史琳娜,張喜榮
(陜西中醫(yī)藥大學 醫(yī)學技術學院,陜西 咸陽 712046)
核盤菌(Sclerotinia sclerotiorum)菌核是菌絲在生長中遇到有限的營養(yǎng)環(huán)境,進行復雜的生理結合相互纏繞形成的堅硬結構,菌核在核盤菌侵染循環(huán)中起核心作用,可萌發(fā)產(chǎn)生子囊孢子,子囊孢子作為侵染源可以通過氣流傳播到寄主的根、莖、葉等器官而引起發(fā)病。植物一旦感染菌核病將很難得到控制,發(fā)病率也會逐年升高,甚至絕收,嚴重影響現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展[1]。因此,揭示核盤菌菌核形成機制,對于防控該病害的發(fā)生以及靶向殺菌劑的開發(fā)具有重要的理論和實踐意義。
核盤菌菌核形成同時受外界環(huán)境條件的誘導和內部信號分子的調節(jié)。光照、pH 值、碳源、活性氧、生物群落等因素[2?3]通過調節(jié)細胞內信號轉導途徑來調控菌核的生長發(fā)育過程,核盤菌菌核發(fā)育主要受環(huán)磷酸腺苷依賴的蛋白激酶(Cyclic adenosine monophosphate?dependent protein kinase A,cAMPPKA)信號通路調控。1998 年,ROLLINS 等[4]以菜豆中分離出來的S.sclerotiorum為研究對象,發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)基 中 腺 苷-3′,5′-環(huán) 磷 酸(Adenosine 3′,5′cyclic monophosphate,cAMP)添加量為5 mmol/L 便可抑制菌核的形成;同樣地,在不能形成菌核的灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea)突變菌株中,cAMP 含量也明顯上升[5?6],表明cAMP 是抑制菌核形成的一個重要因素。磷酸二酯酶(Phosphodiesterase,PDEs)作為細胞內水解cAMP 的酶類,與絲狀真菌的很多生命活動密切相關[7?8]。柑橘褐斑病菌(Alternaria alternatatangerine pathotype)的低親和性磷酸二酯酶基因(Low?affinity cAMP phosphodiesterase,Pdel)缺失會使病原菌分生孢子的產(chǎn)孢量以及黑色素沉著減少,并且Pdel在胞內cAMP水平的調控中發(fā)揮著重要作用[9]。黃曲霉(Aspergillus flavus)PDEs 缺失突變株(ΔpdeH)產(chǎn)生的分生孢子和菌核數(shù)目均明顯減少[10]。阿托品(Atropine)作為毒蕈堿受體抑制劑,可以抑制PDEs 水解cAMP,從而增加細胞內cAMP水平[11]。
PDEs是一個多基因大家族,其成員在不同真菌中的功能不盡相同,PDEs 家族具體如何調控cAMP水平而影響核盤菌菌核形成,目前尚未見報道。鑒于此,分析PDEs 在cAMP-PKA 途徑中對核盤菌菌核生長發(fā)育的調控過程,明確該通路系統(tǒng)調控菌核形成的機制,為核盤菌靶向殺菌劑的開發(fā)提供理論依據(jù)。
菌株:核盤菌(菌株編號:CCTCC AF 2021085Sclerotinia sclerotiorumSs10715)前期分離自油菜秸稈并保存于陜西中醫(yī)藥大學生物技術教學實驗中心。
培養(yǎng)基:馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA)培養(yǎng)基,由去皮馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂粉12 g、蒸餾水1 000 mL制成。
試劑:PCR 擴增、檢測及產(chǎn)物克隆所用試劑盒均購自TaKaRa 公司,膠回收試劑盒、質粒提取試劑盒均購自OMEGA 公司,瓊脂糖、核酸Marker、預染EB 均購自生工生物工程(上海)有限公司,RNA 提取試劑盒、反轉錄及定量PCR 所用試劑盒均購自TaKaRa公司,cAMP、阿托品購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司。
儀器:定量PCR 儀器購自Applied Biosystems 公司,光學顯微鏡購自日本Olympus 公司,雙壓電泳儀和電泳槽購自北京君意公司。
配制PDA 培養(yǎng)基并分裝,高壓滅菌后于無菌條件下分別加入cAMP和阿托品至終濃度為2 mmol/L、4 mmol/L、6 mmol/L 和8 mmol/L,將核盤菌菌絲塊接種于含不同濃度cAMP 和阿托品的培養(yǎng)基上,每個濃度重復5 次,于25 ℃光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng),以不添加cAMP和阿托品的PDA培養(yǎng)基上接種的核盤菌菌絲作為對照(CK),統(tǒng)計核盤菌菌絲生長速率以及菌核形成情況。菌絲生長速率=測量的菌落直徑/接種天數(shù)。
收集PDA 培養(yǎng)基上不同生長時期(菌絲生長期、菌絲形成菌絲團、菌絲團產(chǎn)生黑色素、成熟菌核)的核盤菌,按照TaKaRa公司RNA 提取試劑盒說明書提取總RNA,1.5%瓊脂糖凝膠檢測RNA 提取質量并用微量紫外分光光度計測定濃度。以提取的總RNA 為模板,將其反轉錄為cDNA,以EF引物(表1)檢測cDNA的質量,檢測合格后以此為模板進行后面試驗。
從核盤菌基因組數(shù)據(jù)庫中共檢索得到8 個PDEs基因序列,采用同源克隆的方法進行擴增。以反轉錄得到的cDNA 為模板進行PCR 擴增,引物見表1,將回收的PCR 產(chǎn)物與pMD18-T simple vector連接并轉化E. coliDH5α 感受態(tài)細胞,挑選PCR 鑒定為陽性的菌株送生工生物工程(上海)有限公司進行測序,并對測序結果進行分析。根據(jù)測序獲得的8 個PDEs 序列進行qRT-PCR 引物(表1)在線設計(https://www.genscript.com/tools/real?time?pcr?taqman?primer?design?tool),以β-tubulin作為內參,每組試驗重復3次,應用2-△△Ct進行數(shù)據(jù)分析。
為了進一步探究核盤菌菌核原基形成時cAMP-PKA通路中AC(F:5′-ACCGGATCTGGAAA?GTGAAG-3′,R: 5′-GGCATGTTCCACAATCTCAC-3′)、PDE1(F:5′-AGCATGGTATCCGACCGATT-3′,R: 5′-CTCCTGTACATCCAGCTCGT-3′)、PDE2(F:5′-TCTACCGGAGCATTCCCATC-3′,R:5′-AGCGA?AGCAGGGAAGTAAGA-3′)、PKA(F:5′-CGTTCGG?TTCTTGCAGATGT-3′,R:5′-CTCGTCGAATCGTTT?GGCTT-3′)和RAS(F:5′-AGGGCGAGAGACAAGTT?TCA-3′,R:5′-TAGCACCACCAGCTGTGTAA-3′)的表達量,分別收集在含1、2、3、4 mmol/L 阿托品的PDA 培養(yǎng)基上生長8 d(菌核原基形成時)的菌絲,提取其RNA,并檢測濃度,將合格樣品反轉錄為cDNA,以此為模板進行qRT-PCR,每組試驗重復3次,應用2-△△Ct進行數(shù)據(jù)分析。
在PDA 培養(yǎng)基上添加PDEs 特異性抑制劑阿托品對核盤菌菌絲生長具有抑制作用。當添加阿托品濃度為2 mmol/L 時,對菌絲生長速率影響很小,但當阿托品濃度為4 mmol/L 時,菌絲生長緩慢,抑制率可達80%以上,阿托品濃度大于6 mmol/L 時菌絲不生長,而菌絲可在cAMP 濃度為8 mmol/L 的培養(yǎng)基上生長(圖1A、1C)。表明PDEs 在核盤菌菌絲生長發(fā)育過程中具有重要作用。除此之外,添加阿托品的培養(yǎng)基對菌核產(chǎn)生的數(shù)目也有影響,當阿托品濃度為1~3 mmol/L 時,培養(yǎng)基上均可產(chǎn)生菌核,濃度越高菌核產(chǎn)生的數(shù)目越多。其中,當添加阿托品濃度為3 mmol/L 時,每皿(8 cm 直徑)平均可產(chǎn)生47 個菌核,而對照每皿產(chǎn)菌核的數(shù)目平均為21 個(圖1D)。當添加的阿托品濃度為4 mmol/L時,形成的菌絲較疏松,不能形成菌核(圖1B),表明PDEs不僅影響核盤菌菌絲發(fā)育,而且在菌核形成過程中也具有重要作用。
圖1 PDEs對核盤菌菌絲生長和菌核形成的影響Fig.1 Effects of PDEs on mycelial growth and sclerotia formation of Sclerotinia sclerotiorum
采用同源克隆的方法從核盤菌中共擴增到8個PDEs 基因片段(圖2),測序后比對分析發(fā)現(xiàn),8 個PDEs序列與目的片段同源性在99%以上。由qRTPCR 分 析 結 果 發(fā) 現(xiàn),XM_001587616(PDE1)和XM_001588027(PDE2)在菌絲形成菌核的4 個階段表達量均較高,其中,這2 個基因在S1 階段表達量最高,而其他6 個基因表達量在這4 個階段均較弱(圖3)。將PDE1和PDE2提交NCBI,得到基因登錄號分別為MZ611861和MZ611862。
圖2 擴增的PDEs瓊脂糖凝膠電泳結果Fig.2 Determination of amplified PDEs gene through agarose gel electrophoresis
圖3 菌絲形成菌核不同階段PDEs的相對表達量Fig.3 Relative expression levels of PDEs in different stages of sclerotia formation
收集在不同濃度阿托品培養(yǎng)基上生長8 d 的核盤菌菌絲為材料,檢測PDEs 對菌核原基形成的影響。由檢測結果可知,當培養(yǎng)基中添加阿托品濃度為1~4 mmol/L 時,cAMP-PKA 通路中相關基因表達趨勢相同,PDEs 上游基因AC和RAS表達量上調,PDE1、PDE2和PKA表達量均下降,但PDEs 抑制劑對PKA表達量的抑制作用并非呈典型的濃度對應關系(圖4)。表明PDEs 與菌核原基的形成密切相關,PDEs 抑制劑通過抑制PDE1/2的表達使得下游因子PKA表達量下降,進一步影響菌核原基的形成。
圖4 cAMP-PKA途徑相關因子表達量Fig.4 Expression levels of cAMP-PKA pathway related factors
菌核在核盤菌侵染循環(huán)中起核心作用,阻止菌核形成是切斷傳染源最有效的策略?,F(xiàn)階段,農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上預防菌核病發(fā)生的最有效措施還是噴灑殺菌劑,主要包括苯并咪唑類和二甲酰亞胺類,但長期使用這幾類殺菌劑會造成抗藥性和交叉抗性[12],因此,新型靶向殺菌劑的開發(fā)顯得尤為重要。
本研究從菌核形成的重要途徑cAMP-PKA 出發(fā),以該通路中發(fā)揮調控作用的PDEs 為著手點,從8 個PDEs 中篩選出2 個表達量較高的PDE1/2作為研究重心。研究發(fā)現(xiàn),當在培養(yǎng)基中添加阿托品時,cAMP-PKA 通路中PDEs 上游基因AC和RAS表達量上調,PDE1、PDE2和下游因子PKA表達量均下降。腺苷酸環(huán)化酶(Adenylate cyclase,AC)作為cAMP 的上游作用因子,其缺失菌株可以產(chǎn)生更多的小分生孢子且致病性缺失,最終形成畸形的菌核[13]。蛋白激酶A(PKA)作為cAMP-PKA 途徑的下游效應物,既可以調控病原菌的生長水平,同時對菌株毒力和致病力也發(fā)揮著重要調控作用。例如敲除尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)中的FoCPKA和粗糙脈孢菌(Neurospora crassa)中的PKAC-1,均可導致其生長水平和產(chǎn)孢能力下降[14?15]。在S.sclerotiorum中,PKA 活性水平在由菌絲生長發(fā)育為白色菌核時最高,而在不產(chǎn)生菌核的突變株中PKA的表達水平則很低[16],由此可知,cAMP-PKA 通路中AC 和PKA 對菌核形成非常重要。本研究在添加了PDEs 抑制劑后檢測出的AC表達量上調,而PKA表達量較低,說明PDEs 抑制劑通過抑制PDE1/2的表達使得下游因子PKA表達量下降,進一步影響菌核原基的形成,本研究結果可為開發(fā)以PDEs 為靶標的殺菌劑提供理論基礎。