盧 野,董右銘
(四平市產(chǎn)品質(zhì)量檢驗院,吉林 四平 136000)
噬菌體(bacteriophage) 是感染細(xì)菌的一種病毒,噬菌體分布極廣,凡是有細(xì)菌的場所,就可能有相應(yīng)噬菌體的存在[1]。由于其可以在宿主體內(nèi)快速復(fù)制及繁殖的特性,目前被廣泛用于抑制多種食源性致病菌的感染[2-3]。但在酸奶發(fā)酵過程中所需要的乳酸菌也逃脫不了噬菌體的感染,造成乳酸菌產(chǎn)酸量降低產(chǎn)生的品質(zhì)問題,從而導(dǎo)致生產(chǎn)方的經(jīng)濟損失[4-6]。酸奶目前銷售量不斷上升,人們對酸奶飲品的青睞也日益提高,但噬菌體的感染使酸奶在發(fā)酵過程中風(fēng)味變差,品質(zhì)下降甚至產(chǎn)酸終止等現(xiàn)象一直困擾著酸奶業(yè)。目前,關(guān)于乳酸菌噬菌體的分離,酸奶發(fā)酵中噬菌體污染的預(yù)防已有很多報道,但對乳酸菌噬菌體的功能基因開發(fā)、鑒定卻研究很少[7-8]。試驗對酸奶中分離到的保加利亞乳桿菌噬菌體CC34 的裂解基因進行克隆、表達及功能的初步鑒定,為酸奶工業(yè)噬菌體污染的預(yù)防奠定基礎(chǔ)[9-10]。
1.1.1 菌株、毒株與質(zhì)粒
大腸桿菌 DH5α(TaKaRa)、pET-28b(+)(Novagen)、保加利亞乳桿菌(Lactobacillus bulgaricus)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大腸桿菌(Escherichia coli)、噬菌體CC34,實驗室提供。
1.1.2 試劑
凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、基因組DNA 提取試劑盒、各種限制性內(nèi)切酶、T4 連接酶、Taq 酶,大連寶生物公司 (TaKaRa) 提供;DNA 純化試劑盒,長春庫美生物科技有限公司提供;Gold erView染料(SBS)、中范圍蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)分子量(MBI),長春翊博生物科技有限公司提供;TAE 電泳緩沖液,Tris 緩沖液 (pH 值 7.2)、PBS 緩沖液 (pH 值 7.2)、Tris - 甘氨酸電極緩沖液,由實驗室事先配制。
1.2.1 裂解基因e 的PCR 擴增
根據(jù)噬菌體CC34 片段測序結(jié)果,對e 基因開放閱讀框設(shè)計一對特異性引物(ATAGCCATGGCAGGCATTCGTTG,下劃線為Nco Ⅰ酶切位點) 及(ATG-GGTCGACGGTAAGCCTGGAA,下劃線為SalⅠ酶切位點),由大連TaKaRa 公司合成。以噬菌體基因組DNA 為模板,擴增條件為94 ℃,3 min;94 ℃,45 s;57 ℃,45 s;72 ℃,90 s;總共循環(huán) 30 次;72 ℃延伸10 min。擴增結(jié)束后取2 μL PCR 產(chǎn)物通過瓊脂糖凝膠電泳檢測條帶大小,在紫外照射下回收目的片段,根據(jù)TaKaRa 凝膠回收試劑盒說明書對e 基因的PCR 擴增產(chǎn)物回收純化,將產(chǎn)物放置在-20 ℃下保存。
1.2.2 表達載體pET- 28b(+)- e 的構(gòu)建及鑒定
擴大培養(yǎng)含有pET-28b(+)質(zhì)粒的大腸桿菌,按照TaKaRa 質(zhì)粒小提試劑盒提取pET-28b(+)質(zhì)粒,與1.2.1 得到的膠回收產(chǎn)物分別用NcoⅠ和SalⅠ2種限制性內(nèi)切酶進行雙酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測后純化回收2種產(chǎn)物,以質(zhì)?!肈NA = 1∶10 的比例用T4 連接酶連接過夜,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,過夜培養(yǎng)后挑取疑似陽性菌落通過雙酶切進行鑒定是否轉(zhuǎn)化成功。
1.2.3 pET- 28b(+)- e 的 IPTG 誘導(dǎo)表達
將轉(zhuǎn)化成功的pET-28b(+)-e 的大腸桿菌BL21接種至5 mL LB 液體培養(yǎng)基(含25 μg/mL 卡那霉素)中,于37 ℃下以轉(zhuǎn)速200 r/min 振蕩培養(yǎng)過夜;以1%的接種量接種至50 mL LB 液體培養(yǎng)基(含25 μg/mL卡那霉素) 中,培養(yǎng)溫度及轉(zhuǎn)速與上述步驟相同,OD600達 0.4~0.6; 加 入 500 μL IPTG 至 終 濃 度 為1 mmol/L 誘導(dǎo),繼續(xù)以相同的培養(yǎng)溫度及轉(zhuǎn)速培養(yǎng),每間隔1 h 取誘導(dǎo)后的菌液1 mL;將菌液離心后分別收集上清液和沉淀物,沉淀物用50 μL PBS 重懸沉淀,于-20 ℃下保存待用。
1.2.4 pET- 28b(+)- e 表達產(chǎn)物 SDS- PAGE分析
細(xì)菌沉淀加入2×SDS 樣品緩沖液50 μL,充分混勻后,放置沸水中煮5 min,配制12.5%的SDSPAGE分離膠,5%濃縮膠,取10 μL 樣品電泳,電泳結(jié)束后用銀染法顯色。
1.2.5 pET- 28b(+)- e 細(xì)菌的溶菌試驗
將1.2.3 步驟中誘導(dǎo)表達的細(xì)菌沉淀分別用TBS和PBS 重懸,冰浴超聲 10 s,間隔 10 s,30~50 循環(huán),直至樣品變清亮;超聲完成后,于4 ℃下以轉(zhuǎn)速12 000 r/min 離心20 min,轉(zhuǎn)移上清進行溶菌試驗。取100 μL 生長到對數(shù)期的指示菌(保加利亞乳桿菌、金黃色葡萄球菌、大腸桿菌)分別與3 mL LB半固體培養(yǎng)基混勻,均勻鋪在有下層LB 固體培養(yǎng)基上。將無菌的牛津杯放在鋪有指示菌的上層瓊脂上,依次加入 100 μL 的 pET-28b(+)-e,pET-28b(+)(空白對照) 的超聲上清,于30 ℃下培養(yǎng)過夜,第2 天觀察溶菌圈。
以噬菌體基因組為模板,可以擴增得到一條大小在490 bp 左右的特異性條帶,與目的片段e 基因的大小相符。
裂解基因e 的PCR 擴增結(jié)果見圖1。
圖1 裂解基因e 的PCR 擴增結(jié)果
用 Nco Ⅰ和 Sal Ⅰ對構(gòu)建好的 pET-28b(+)-e 載體進行雙酶切,得到5.3 kD 和490 bp 2 條片段(圖2),分別對應(yīng)pET-28b(+)和e 基因的大小,與預(yù)期結(jié)果一致。
雙酶切鑒定結(jié)果見圖2。
圖2 雙酶切鑒定結(jié)果
pET-28b(+)-e 的細(xì)菌沉淀總蛋白及表達上清總蛋白在18 kD 附近都有一明顯的蛋白表達帶(黑箭頭所指),分子量大小與預(yù)期相符。pET-28b(+)-e在誘導(dǎo)表達后的第2,第3 小時的表達量最大,之后減少。與之相反的是pET-28-e 的表達上清的目的蛋白在誘導(dǎo)表達的后期(4,5,6 h) 卻增加(圖4)。出現(xiàn)這種情況的原因是pET-28-e 在誘導(dǎo)表達時會出現(xiàn)溶菌,表達宿主的大量死亡,使本來胞內(nèi)表達的e蛋白釋放到培養(yǎng)液里。
pET-28b(+)-e 細(xì)菌沉淀總蛋白的 SDS-PAGE見圖3,pET-28b(+)-e 表達上清總蛋白的SDS-PAGE見圖4。
圖3 pET-28b(+)-e 細(xì)菌沉淀總蛋白的SDS-PAGE
圖4 pET-28b(+)-e 表達上清總蛋白的SDS-PAGE
pET-28-e 細(xì)菌沉淀超聲所得到的粗提液對保加利亞乳桿菌、金黃色葡萄球菌、大腸桿菌都有不同程度的溶菌作用,而且其在Tris 緩沖液的活性比PBS 緩沖液的活性強。
pET-28b(+)-e 蛋白粗提液對不同細(xì)菌的溶菌試驗結(jié)果見表1。
表1 pET-28b(+)-e 蛋白粗提液對不同細(xì)菌的溶菌試驗結(jié)果
成功構(gòu)建了酸奶中乳酸菌噬菌體CC34 的裂解基因 e 的表達載體:pET-28b(+)-e。pET-28b(+)-e的胞內(nèi)表達,使e 的表達量有極大的提高,根據(jù)溶菌試驗的證明,pET-28b(+)-e 表達的e 對多種細(xì)菌都有溶菌作用,e 的表達量大,但溶菌活性表現(xiàn)還不是很強,可能是pET-28b(+)-e 表達有相當(dāng)一部分形成沒有活性的包涵體,只有少部分以可溶性蛋白表達的原因??赏ㄟ^降低誘導(dǎo)表達的培養(yǎng)溫度來增加可以溶性蛋白的表達量,以增加pET-28b(+)-e 的溶菌活性[11-13]。pET-28b(+)-e 的蛋白粗提液表現(xiàn)出對TBS 的偏好性,在PBS 中,溶菌活性被完全抑制了。
很多噬菌體進入宿主機體的關(guān)鍵步驟就是通過溶菌酶打開細(xì)菌細(xì)胞壁肽聚糖的多種共價鍵,使肽聚糖降解,造成細(xì)菌的死亡,這種能力在人類病原菌治療、食品、植物病害防治等方面有著很大的開發(fā)利用價值[14-15]。所研究的裂解基因e 和溶菌酶基因在理化性質(zhì)上有很多相似的地方,所做的研究也為進一步了解噬菌體病毒包裝機制奠定了基礎(chǔ)。