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        大鼠miR-133a-3p 慢病毒載體的構(gòu)建及穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立

        2022-07-15 06:41:36張志蕊陳耀平
        關(guān)鍵詞:原代滴度測序

        張志蕊, 陳耀平

        (1.寧夏醫(yī)科大學(xué),銀川 750004; 2.寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院,銀川 750004)

        遲發(fā)性性腺功能減退癥(late-onset hypogonadism,LOH)是一種與老齡相關(guān)的臨床和生化綜合征,其特點是一系列特異的臨床癥狀和血清T水平缺乏(低于年輕的健康成年男性參考范圍)[1,2]。由于睪酮的作用廣泛涉及生殖、皮膚、泌尿肌肉、骨骼、心血管等存在雄激素受體的系統(tǒng),LOH 的發(fā)生會導(dǎo)致患者生活質(zhì)量的改變,且使多器官系統(tǒng)的功能受到影響[3]。研究發(fā)現(xiàn),循環(huán)miRNA 可以非常準(zhǔn)確地作為衰老[4]、癌癥[5-7]、肌肉疾病[8-9]和神經(jīng)退行性疾病有前途的生物標(biāo)記物[10]。課題組前期研究[11]發(fā)現(xiàn),miR-133a-3p 在LOH 患者低表達(dá),并且miR-133a 作為肌肉特異性的miRNA,能促進(jìn)肌肉的成熟,降低肌肉蛋白質(zhì)分解的速度而促進(jìn)肢體骨骼肌的健康[12-13]。本研究通過構(gòu)建過表達(dá)及干擾慢病毒載體并篩選建立miR-133a-3p 穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株,為進(jìn)一步研究miR-133a-3p與LOH 的相關(guān)機(jī)制以及LOH 的診斷和治療奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 主要材料

        SPF 級2 月齡SD 雄性大鼠3 只,體質(zhì)量190~220 g,由寧夏醫(yī)科大學(xué)實驗動物中心提供;大腸桿菌菌株DH5α,慢病毒載體GV309、GV280及Polybrene 均購自上海吉凱基因科技有限公司;DMEM 細(xì)胞培養(yǎng)液、標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)購自美國Gibco 公司;Mir-XTMmiRNA First-Strand Synthesis 和TB GreenqRTPCR、DNase I、TB Green Advantage qPCR Premix均購自日本TaKaRa 公司,Trizol 試劑購自美國Invitrogen 公司,限 制 性 內(nèi) 切 酶AgeⅠ、NheⅠ及EcoRⅠ均購自美國NEB 公司;質(zhì)粒抽提試劑盒購自德國Qiagen 公司,miR-133a-3p 引物合成由廣州銳博生物科技有限公司完成,質(zhì)粒測序由上海吉凱基因科技有限公司完成;α-平滑肌肌動蛋白(α-SMA)購自Abcam 公司。

        1.2 大鼠陰莖海綿體平滑肌細(xì)胞(corpus cavernosum muscle cell,CCSMC)的原代培養(yǎng)及鑒定

        采用改良組織塊法原代培養(yǎng)大鼠CCSMCs[14],選取2 月齡雄性SD 大鼠,頸椎脫臼或異戊巴比妥鈉注射處死大鼠,放入75%乙醇浸泡15 min。在超凈臺無菌條件下剪開包皮,在陰莖腳處截取陰莖,將其迅速移入含雙抗預(yù)冷PBS 中洗去血漬并除去尿道、纖維及脂肪等組織。

        將海綿體組織剪成0.5~1.0 mm3的組織塊(組織塊太大影響細(xì)胞爬出,太小會對細(xì)胞有損傷),按0.5 cm 的間隔放置到涂有20%胎牛血清DMEM/F12 培養(yǎng)基的無菌T25 培養(yǎng)瓶底部,翻轉(zhuǎn)培養(yǎng)瓶后加入3~4 mL 20%完全培養(yǎng)液,放入培養(yǎng)箱5 h 后翻轉(zhuǎn)培養(yǎng)瓶,使組織與培養(yǎng)液充分接觸,繼續(xù)在培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)。第4 天顯微鏡下觀察可見細(xì)胞從組織塊中爬出,次日去除組織塊繼續(xù)培養(yǎng)。以后每隔2~3 d 更換1 次培養(yǎng)液,待細(xì)胞融合約90%時,用胰酶消化細(xì)胞,后加入含10%胎牛血清的DMEM/F12 培養(yǎng)基終止消化,吹打細(xì)胞制成單細(xì)胞懸液,將懸液置于培養(yǎng)皿中,靜置20 min 后,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至另一培養(yǎng)皿中,再次靜置、貼壁,反復(fù)2 次后,將培養(yǎng)皿放入37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待細(xì)胞生長至對數(shù)生長期,細(xì)胞融合約90%,按1∶3 傳代培養(yǎng)。同時載玻片放置于6 孔板中,傳至P2 代,后按1×105個/孔接種,待細(xì)胞匯合約70%,行免疫熒光鑒定實驗。

        1.3 miR-133a-3p 過表達(dá)及干擾慢病毒載體的構(gòu)建

        1.3.1 慢病毒載體的構(gòu)建 根據(jù)miRBase(http://www.mirbase.org/)數(shù)據(jù)庫信息設(shè)計擴(kuò)增大鼠miR-133a-3p 前體序列的引物及成熟體反向互補(bǔ)序列,引物信息見表1。構(gòu)建miR-133a-3p 過表達(dá)慢病毒載體為GV309,原件順序為hU6-MCSUbiquitin-EGFP-IRES-puromycin;構(gòu)建miR-133a-3p 干擾慢病毒載體為GV280,原件順序為S-UbiquhU6-MCitin-EGFP-IRES-puromycin,均由上海吉凱基因科技有限公司提供。用限制性內(nèi)切酶AgeI 和EcoRI 在37 ℃條件下分別酶切載體GV309、GV280。3 h 后獲得酶切后的線性載體。1)以大鼠基因組DNA 為模板擴(kuò)增miR-133a-3p前體序列,擴(kuò)增體系為(50 μL):ddH2O 32.5 μL;5×PS Buffer 10 μL;dNTP Mix(4 μL);上下游引物(10 μmol·L-1)各1 μL;PrimeSTAR HS DNA Polymerase 0.5 μL;模板(10 ng·μL-1)1 μL。擴(kuò)增程序:98 ℃預(yù)變性5 min,98 ℃變性10 s,55 ℃退火10 s,72 ℃延伸30 s,30 個循環(huán)后72 ℃延伸8 min。得到的PCR 產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳用DNA 純化試劑盒進(jìn)行切膠回收,然后將回收的片段和線性化載體進(jìn)行重組反應(yīng),實現(xiàn)線性化載體和目的片段的體外環(huán)化。2)根據(jù)設(shè)計的反向互補(bǔ)序列分別合成兩段寡核苷酸序列,見表2,合成后成對的引物干粉溶解于退火緩沖液中,90 ℃水浴15 min,自然冷卻至室溫,通過T4 DNA ligase 將雙酶切線性化載體和退火雙鏈DNA 連接,16 ℃過夜,得到重組產(chǎn)物。兩種重組產(chǎn)物分別轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌(escherichia coli)DH5α,涂布LB固體培養(yǎng)板上,37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜,挑取平板上的單克隆進(jìn)行PCR 鑒定,對陽性克隆進(jìn)行測序及結(jié)果分析。將正確克隆菌液擴(kuò)大培養(yǎng)、抽提,獲得高純度質(zhì)粒,用于下游病毒包裝。

        表1 引物信息

        表2 DNA 寡核苷酸序列

        1.3.2 慢病毒包裝 采用三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞的方法進(jìn)行慢病毒包裝,轉(zhuǎn)染前24 h,消化對數(shù)生長期的293T 細(xì)胞,以含10%血清的培養(yǎng)基重新接種于10 cm 細(xì)胞培養(yǎng)皿,24 h 待細(xì)胞密度達(dá)70%~80%時,更換為無血清培養(yǎng)基,2 h 后向一滅菌離心管中加入所制備的各DNA 溶液(GV載體質(zhì)粒20 μg、pHelper1.0 載體質(zhì)粒15 μg、pHelper 2.0 載體質(zhì)粒10 μg),相應(yīng)體積的轉(zhuǎn)染試劑混合均勻,調(diào)整總體積為1 mL,在室溫下溫育15 min,混合液緩慢滴加至293T 細(xì)胞培養(yǎng)液中,混勻,培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)6 h,棄去培養(yǎng)基加入10 mL PBS 清洗1 次,加入含10%血清的細(xì)胞培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48~72 h,收集細(xì)胞上清液,4 ℃、4 000×g 離心10 min,去細(xì)胞碎片,0.45 μm 過濾后,4 ℃、25 000 r·min-1離心2 h,棄上清,加病毒保存液,輕輕反復(fù)吹打重懸,充分溶解后10 000 r·min-1離心5 min 后分裝,-80 ℃保存。

        1.3.3 慢病毒滴度測定 測定前一天,將293T細(xì)胞按4×104個/孔鋪96 孔板,準(zhǔn)備7~10 個無菌的EP 管,將病毒原液按10 倍梯度稀釋:每管中加入90 μL 無血清培養(yǎng)基,將待測定的病毒原液10 μL 加入第1 個管中,混勻后,取10 μL 加入第2 個管中,繼續(xù)相同的操作直到最后一管;選取所需的細(xì)胞孔,棄去90 μL 培養(yǎng)基,加入90 μL稀釋好的病毒溶液,培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,加入完全培養(yǎng)基100 μL,48 h 后熒光顯微鏡下觀察熒光亮度并拍照。根據(jù)綠色熒光蛋白的表達(dá)量計算病毒滴度,病毒滴度=熒光細(xì)胞數(shù)/病毒原液量。

        1.4 感染復(fù)數(shù)

        CCSMCs 細(xì)胞按5×104個/孔接種96 孔板,共21 孔。將miR-133a-3p up 及down 慢病毒稀釋液及A/P 增強(qiáng)液分別加入相應(yīng)的孔中,使其感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)分別為0、1、10 及100,轉(zhuǎn)染12 h 后將病毒液棄掉,添加新鮮培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)72 h,熒光顯微鏡下觀察并拍照。對感染效率進(jìn)行評估,明確CCSMCs 細(xì)胞的感染條件及合適MOI。

        1.5 穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞株篩選

        CCSMCs 細(xì)胞按1×105個/孔接種6 孔板,培養(yǎng)24 h 待細(xì)胞匯合約30%時棄掉培養(yǎng)基,加入MOI 為10 的病毒液培養(yǎng)24 h,更換新鮮培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)72 h,熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光后,加入含2 μg·mL-1嘌呤霉素培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng),每天更換培養(yǎng)基,當(dāng)細(xì)胞匯合度達(dá)90%時提取RNA,檢測miR-133a-3p 的表達(dá)。

        1.6 qRT-PCR 檢測mir-133a-3p 的表達(dá)

        實驗設(shè)為miR-133a-3p 過表達(dá)組、miR-133a-3p 干擾組、陰性對照組和空白對照組,以不感染病毒作為空白對照,感染病毒空載體作為陰性對照。當(dāng)細(xì)胞匯合度達(dá)90%時,收集6 孔板中的細(xì)胞,用Trizol 法提取細(xì)胞總RNA,DNase I 處理 去 除RNA 中 的DNA 污 染,然 后 用Nanodrop 2000 測定RNA 的濃度及純度,分別用Mir-XTMmiRNA First-Strand Synthesis Kit,TB Green Advantage qPCR Premix 按照使用說明書合成miRNA 的第一鏈并進(jìn)行qRT-PCR:95 ℃預(yù)變性10 s,95 ℃5 s,60 ℃20 s,共40 個循環(huán)。用2-ΔΔCT計算基因相對表達(dá)量,實驗重復(fù)3 次。

        1.7 統(tǒng)計學(xué)方法

        數(shù)據(jù)采用GraphPad Prism 6 統(tǒng)計軟件進(jìn)行分析。計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間比較采用方差分析,兩兩比較采用LSD-t 法。P≤0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 原代大鼠CCSMCs 的分離培養(yǎng)及鑒定結(jié)果

        采用改良組織塊法原代培養(yǎng)CCSMCs,選取2月齡雄性SD 大鼠。原代培養(yǎng)第4 天,顯微鏡下可見少許CCSMCs 從組織塊中爬出,形態(tài)呈梭形(圖1A)。當(dāng)細(xì)胞生長至融合后,細(xì)胞高低起伏,呈現(xiàn)平滑肌細(xì)胞典型的“峰-谷”樣生長(圖1B),α-SMA 免疫熒光鑒定:熒光顯微鏡下可見綠色熒光分布在胞核和胞漿中,陽性率達(dá)90%(圖2)。

        圖1 顯微鏡下原代培養(yǎng)的CCSMCs

        圖2 CCSMCs 免疫熒光鑒定(×200)

        2.2 miR-133a-3p 慢病毒載體的構(gòu)建及測序結(jié)果

        miR-133a-3p 過表達(dá)及干擾慢病毒載體GV309 和GV280(圖3A、B)。將鑒定出的陽性克隆轉(zhuǎn)化子接種于適量含相應(yīng)抗生素的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)12~16 h,取適量菌液進(jìn)行測序,并與miR-133a-3p 的反向互補(bǔ)序列進(jìn)行比對分析。結(jié)果表明,測序結(jié)果與目標(biāo)序列完全一致(圖3C、D)。

        圖3 GV309 和GV280 載體結(jié)構(gòu)及測序

        2.3 慢病毒滴度測定

        構(gòu)建完成的miR-133a-3p 過表達(dá)慢病毒滴度為3×108TU·mL-1,miR-133a-3p 干擾慢病毒滴度為1×109TU·mL-1(圖4)。

        圖4 慢病毒熒光法滴度測定(×100)

        2.4 細(xì)胞轉(zhuǎn)染和穩(wěn)轉(zhuǎn)株的篩選

        miR-133a-3p 過表達(dá)及干擾慢病毒載體感染CCSMCs 細(xì)胞72 h 后,Polybrene 濃度為2 μg·mL-1時,轉(zhuǎn)染效率最高,且效率>80%,篩選后得到目的細(xì)胞(圖5、圖6)。

        圖5 慢病毒轉(zhuǎn)染72 h 后的CCSMCs(×100)

        圖6 嘌呤霉素篩選10 d 的CCSMCs(×100)

        2.5 miR-133a-3p 相對表達(dá)量的測定

        qRT-PCR 檢測各組穩(wěn)轉(zhuǎn)株中miR-133a-3p的表達(dá)情況。如圖7 所示,與陰性對照組相比,過表達(dá)組的miR-133a-3p 表達(dá)量升高,干擾組miR-133a-3p 的表達(dá)量降低(P 均<0.01),說明本研究成功構(gòu)建了過表達(dá)及干擾miR-133a-3p 的穩(wěn)轉(zhuǎn)株。

        圖7 實時熒光定量分析過表達(dá)組和干擾組穩(wěn)轉(zhuǎn)后miR-133a-3p 的表達(dá)水平

        3 討論

        LOH 的特征是隨著年齡的增長,肌肉的容積、大小和力量下降,給予雄激素治療,肌肉容積和力量會顯著增加[2,15-16]。本研究采用改良組織塊法培養(yǎng)原代大鼠CCSMCs,在組織塊法原代培養(yǎng)第4 天,平滑肌細(xì)胞從組織塊中爬出,第5 天開始會有成纖維細(xì)胞爬出,采用反復(fù)差速貼壁法去除成纖維細(xì)胞的污染獲得高純度的CCSMCs。本實驗α-SMA 陽性細(xì)胞率達(dá)90%及以上,從而保證了后續(xù)實驗的準(zhǔn)確性與可靠性。

        miR-133a-3p 是成熟的miRNA,它來源于兩個前體miRNA(miR-133a-1 和miR-133a-2),成熟序列為22nt。miR-133a 具有肌肉特異性表達(dá)的特點,它通過肌肉生長的協(xié)同轉(zhuǎn)錄、選擇性剪接調(diào)控因子、生長激素通路來調(diào)控骨骼肌細(xì)胞的增殖和分化過程。Chen 等[17]表明miR-133 可以通過靶向SRF 來增強(qiáng)小鼠成肌細(xì)胞的增殖;Huang 等[18]證實miR-133 在成肌細(xì)胞分化過程中上調(diào),表明miR-133a-3p 也可作為miR-133家族的一員參與骨骼肌的生肌分化。同時miR-133a 已被證明可調(diào)節(jié)人主動脈內(nèi)皮細(xì)胞中的eNOS 活性[19],并參與炎癥性心肌病[20]和內(nèi)皮功能障礙[21]。Jiang 等[22]研究結(jié)果表明,miR-133a-3p在維持內(nèi)皮健康的穩(wěn)態(tài)和生理功能中有著重要作用。

        源自人類免疫缺陷病毒的慢病毒載體是修飾真核細(xì)胞(如造血干細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞)基因的有力工具。慢病毒載體可以將外源基因或外源shRNA 有效地整合到宿主染色體上,從而實現(xiàn)目的序列持久性表達(dá)。慢病毒的宿主相對廣泛,無論對分裂或非分裂細(xì)胞均有感染能力。特別對于一些較難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,如干細(xì)胞、原代細(xì)胞、不分化細(xì)胞等,慢病毒也表現(xiàn)出較好的感染效果。本研究構(gòu)建了miR-133a-3p 過表達(dá)慢病毒載體GV309 和miR-133a-3p 干擾慢病毒載體GV280,并對所構(gòu)建的載體進(jìn)行滴度測定。將構(gòu)建成功的慢病毒載體轉(zhuǎn)染大鼠CCSMCs,經(jīng)嘌呤霉素的篩選,對轉(zhuǎn)染后的CCSMCs 進(jìn)行qRT-PCR 檢測,結(jié)果顯示過表達(dá)組miR-133a-3p 的相對表達(dá)量升高,干擾組miR-133a-3p 的相對表達(dá)量降低,說明成功建立了穩(wěn)定表達(dá)miR-133a-3p 的細(xì)胞株,可為后續(xù)開展大鼠miR-133a-3p 的功能研究提供一定的實驗基礎(chǔ)。

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