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        實(shí)時熒光定量PCR 在新生兒肺炎鏈球菌性腦膜炎中的應(yīng)用

        2022-02-17 01:12:08盧改龍陳文娜王倩茹王舒萍黃君華
        科技視界 2022年2期
        關(guān)鍵詞:載量鏈球菌腦脊液

        盧改龍 陳文娜 王倩茹 王舒萍 黃君華

        (西安醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,陜西 西安 710021)

        0 引言

        細(xì)菌性腦膜炎(Bacterial Meningitis,BM)是一種嚴(yán)重危害新生兒生命的中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染性疾病,病死率高且常有不同程度的神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥[1,2],其中尤以肺炎鏈球菌性BM 后遺癥發(fā)生率最高,預(yù)后較差[3]。因此快速鑒定BM 病原菌對降低該病后遺癥發(fā)生率和病死率至關(guān)重要[4]。 目前,BM 的病原學(xué)診斷主要依靠培養(yǎng),但培養(yǎng)敏感性低,時間長,延誤最佳診療時機(jī)。 本研究以患肺炎鏈球菌性腦膜炎新生兒為研究對象, 旨在應(yīng)用熒光定量PCR (FQ-PCR) 擴(kuò)增腦脊液(Cerebrospinal Fluid,CSF)標(biāo)本中病原菌 DNA,探求腦脊液細(xì)菌載量與臨床表現(xiàn)及相關(guān)實(shí)驗(yàn)室檢測指標(biāo)之間的關(guān)系, 探討FQ-PCR 在檢測BM 病原菌中的作用,為判斷患兒預(yù)后和轉(zhuǎn)歸提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 臨床資料

        采集2020 年1 月至6 月就診于西安市兒童醫(yī)院的15 例經(jīng)16S rDNA 測序鑒定為肺炎鏈球菌BM 新生兒為研究對象,男 6 例,女 9 例,年齡 2~20 天。 其中10 例培養(yǎng)陽性,5 例培養(yǎng)陰性。

        1.2 方法

        1.2.1 CSF 培養(yǎng)

        嚴(yán)格無菌操作采集每位患兒CSF 標(biāo)本2~4 ml,其中1ml 注入BD 公司EDTA-K2 抗凝管, 剩余進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)陽性細(xì)菌經(jīng)VITEK 全自動細(xì)菌生化藥敏鑒定儀鑒定到種。 質(zhì)控菌株為肺炎鏈球菌ATCC49619。

        1.2.2 DNA 提取

        將 1mlCSF 標(biāo)本 12 000 rpm 離心 5 min, 取最下層沉淀,應(yīng)用QIAamp Blood DNA Mini Kit 試劑盒,提取步驟見參考文獻(xiàn)[5]。

        1.2.3 16S rDNA 擴(kuò)增及測序比對

        PCR 反應(yīng)體系及條件見參考文獻(xiàn)[6]。 擴(kuò)增產(chǎn)物送上海生工生物工程有限公司測序, 測序結(jié)果在GenBank 中 BLAST 比對。

        1.2.4 FQ-PCR

        應(yīng)用伯樂CFX96TMReal-time 定量 PCR 系統(tǒng),特異性引物參照文獻(xiàn)[7],5’-ACGCAATCTAGCAGATGAA GCA-3’,5’-TCGTGCGTTTTAATTCCAGCT-3’, 擴(kuò)增肺炎鏈球菌 lytA 基因。 20 μl 反應(yīng)體系,10 μl SYBR Green Realtime PCR Mix,引物(10 μM)各 0.8 μl,模板2μl,ddH2O6.4 μl。 反應(yīng)程序:95°C 預(yù)變性 5 min,進(jìn)入循環(huán) 95°C 變性 10 sec,60°C 退火 15 sec,72°C 延伸35 sec (采集熒光)。 40 個循環(huán)后分析溶解曲線:Melt curve 65°C→95°C,Increment 0.5°C,5 sec。 最后得到標(biāo)準(zhǔn)曲線(Standard Curve)、溶解曲線(Melt Curve)的 Ct值等數(shù)據(jù)。

        1.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        應(yīng)用SPSS 17.0 統(tǒng)計(jì)軟件。 計(jì)量資料采用兩獨(dú)立樣本t 檢驗(yàn),組間計(jì)數(shù)資料進(jìn)行卡方檢驗(yàn),P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 肺炎鏈球菌定量結(jié)果

        熔解曲線分析為單一峰圖, 無非特異性擴(kuò)增,如圖1 所示。

        圖1 肺炎鏈球菌熒光定量PCR 結(jié)果

        2.2 15 例臨床樣本培養(yǎng)、FQ-PCR 及相關(guān)指標(biāo)結(jié)果

        15 例CSF 樣本的相關(guān)實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果如表1 所示, 其中 10 例培養(yǎng)陽性標(biāo)本細(xì)菌載量 Ct 均值為19.52(19.52±4.32),5 例培養(yǎng)陰性標(biāo)本細(xì)菌載量 Ct 均值為 31.32 (31.32±1.74), 二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-5.793,P<0.05),說明培養(yǎng)陽性率與 CSF 中細(xì)菌含量有關(guān)。 筆者將10 例培養(yǎng)陽性設(shè)定為“低Ct 值組”,5例培養(yǎng)陰性設(shè)定為“高Ct 值組”,通過分析發(fā)現(xiàn):“低Ct 值組”發(fā)熱的例數(shù)較“高Ct 值組”多;腦脊液白細(xì)胞計(jì)數(shù)“低 Ct 值組”72.19(72.19±26.27)與“高 Ct 值組”37.64 (37.64±13.71) 二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (t=2.725,P<0.05); 腦脊液蛋白含量 “低 Ct 值組”1.80(1.80±0.77)與“高 Ct 值組”0.86(0.86±0.30)二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.607,P<0.05);腦脊液葡萄糖含量“低 Ct 值組”1.55(1.55±0.46)與“高 Ct 值組”2.46(2.46±0.80) 二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (t=-2.825,P<0.05);外周血白細(xì)胞計(jì)數(shù)“低 Ct 值組”10.52(10.52±3.11)與“高 Ct 值組”6.88(6.88±2.52)二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.313,P<0.05);而嘔吐、黃疸、驚厥、囟門膨脹、腦膜刺激征、肌張力改變等的表現(xiàn)在兩組之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。 另外,C-反應(yīng)蛋白(CRP)含量“低Ct值組”4.72(4.72±2.41)與“高 Ct 值組”2.50(2.50±0.97)二者差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.950,P>0.05)。 (見表 2)

        表1 15 例腦脊液標(biāo)本相關(guān)檢測結(jié)果

        表2 低Ct 值組與高Ct 值組臨床表現(xiàn)和檢測結(jié)果的比較

        3 討論

        BM 為病原菌侵入中樞神經(jīng)系統(tǒng), 嚴(yán)重危害新生兒生命健康,病死率高[8],常會引發(fā)不同程度的神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥[9,10],而尤以肺炎鏈球菌性BM 后遺癥發(fā)生率最高,患兒預(yù)后最差。 目前,BM 的病原學(xué)診斷主要依靠CSF 培養(yǎng),但培養(yǎng)法敏感性低、耗時久且無法準(zhǔn)確定量,延誤最佳診治時機(jī),而FQ-PCR 可為快速檢測CSF 中病原菌提供新方法。 本研究利用FQ-PCR 可以定量檢測的優(yōu)勢將定量結(jié)果與相關(guān)臨床表現(xiàn)及實(shí)驗(yàn)室檢查進(jìn)行比較, 以求探討肺炎鏈球菌載量對患兒的影響,為疾病預(yù)后和轉(zhuǎn)歸提供依據(jù)。

        本研究納入的15 例樣本均經(jīng)16S rDNA 測序比對為肺炎鏈球菌性BM,其中10 份培養(yǎng)陽性,5 份培養(yǎng)陰性; FQ-PCR 均得到擴(kuò)增曲線。 定量結(jié)果顯示10份培養(yǎng)陽性標(biāo)本細(xì)菌載量Ct 值在13.1~27.1 (均值為19.52),5 例培養(yǎng)陰性標(biāo)本 Ct 值在 29.3-33.8 (均值為31.32),二者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說明培養(yǎng)陽性率與腦脊液細(xì)菌含量有關(guān),一般需達(dá)到103CFU/ml 以上。

        兒童肺炎鏈球菌性BM 臨床表現(xiàn)主要為發(fā)熱,外周血白細(xì)胞計(jì)數(shù)、CRP、腦脊液白細(xì)胞計(jì)數(shù)及蛋白水平均會增高,腦脊液葡萄糖含量會下降[11],但上述表現(xiàn)與腦脊液肺炎鏈球菌含量的關(guān)系目前報道較少。 本研究通過將10 例培養(yǎng)陽性設(shè)定為 “低Ct 值組”,5 例培養(yǎng)陰性設(shè)定為“高Ct 值組”,可發(fā)現(xiàn):臨床表現(xiàn)方面,發(fā)熱的例數(shù)在“低 Ct 值組”較“高 Ct 值組”多,而嘔吐、黃疸、驚厥、囟門膨脹、腦膜刺激征、肌張力改變等的表現(xiàn)在兩組之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,說明新生兒由于囟門和顱骨未閉,其腦膜刺激征等表現(xiàn)不明顯,但發(fā)熱可能與CSF 病原菌含量有關(guān)。 實(shí)驗(yàn)室檢查方面,“低Ct 值組” 與“高 Ct 值組”在腦脊液白細(xì)胞計(jì)數(shù)(t=2.725,P<0.05)、腦脊液蛋白含量(t=2.607,P<0.05)和腦脊液葡萄糖含量(t=-2.825,P<0.05)上有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,說明細(xì)菌載量越高,腦脊液白細(xì)胞數(shù)和蛋白含量越高,而葡萄糖含量越低。 值得注意的是,二者在外周血白細(xì)胞計(jì)數(shù)上也有差異(t=2.313,P<0.05),這在無法得到腦脊液標(biāo)本而僅能得到外周血標(biāo)本的病例中有提示意義,外周血白細(xì)胞含量高(>1010)的病例其CSF 細(xì)菌載量也高。另外,CRP 含量“低 Ct 值組”與“高 Ct 值組”間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.950,P>0.05)。 本文針對后遺癥發(fā)生率較高的肺炎鏈球菌性BM 進(jìn)行研究,該細(xì)菌引起新生兒細(xì)菌性BM 的比例較低,因此僅納入10例培養(yǎng)陽性和5 例培養(yǎng)陰性,后續(xù)可收集更多的標(biāo)本以得到更多數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,可得到更客觀真實(shí)的結(jié)果。

        FQ-PCR 檢測快、敏感度高、定量精確且重復(fù)性好[12],能夠?qū)崟r動態(tài)監(jiān)測,是一種很好的檢測方法,但本研究僅探討了肺炎鏈球菌引起的腦膜炎,其他病原菌感染是否也存在上述現(xiàn)象,在其他年齡段兒童中是否有不同的表現(xiàn)仍需進(jìn)一步探討。

        本研究表明腦脊液培養(yǎng)陽性率與細(xì)菌載量有關(guān),需達(dá)到103CFU/ml 以上;細(xì)菌載量越高,發(fā)熱表現(xiàn)越明顯,腦脊液相關(guān)實(shí)驗(yàn)室檢查值越高,說明病情越嚴(yán)重,預(yù)后越差;實(shí)時FQ-PCR 可用于新生兒細(xì)菌性BM的快速診斷,其定量結(jié)果對患兒臨床表現(xiàn)、預(yù)后及轉(zhuǎn)歸具有提示作用。

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