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        一個(gè)新的奧氮平甲醇水合物的晶體結(jié)構(gòu)和Hirshfeld表面分析*

        2022-02-13 06:00:54談仲川楊德森干國平周琪
        醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2022年2期
        關(guān)鍵詞:晶型奧氮共晶

        談仲川,楊德森,干國平,周琪

        (1.湖北中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,武漢 430070;2.湖北省中藥炮制工程技術(shù)研究中心,武漢 430070)

        固體化學(xué)藥物的溶解性是影響藥物臨床療效的主要因素之一。通過增加藥物溶解度是提高固體藥物生物利用度、改善藥物臨床療效的主要途徑[1]。藥物晶型及共晶不改變藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu),通過篩選優(yōu)勢晶型或共晶能有效增加藥物溶解度,提高生物利用度,進(jìn)而改善藥物臨床療效,是目前固體藥物研究熱門方向之一[2-4]。由于目前沒有一種有效的方法或工具能夠準(zhǔn)確預(yù)測藥物晶型或共晶,因此在優(yōu)勢晶型及共晶篩查時(shí),盡可能獲得所有可能的藥物晶型及共晶,在這個(gè)過程中水合物及溶劑合物也可能被發(fā)現(xiàn)。據(jù)估計(jì),在小分子有機(jī)化合物中,33%化合物能夠形成水合物,10%化合物能夠形成溶劑合物[5]。水合物晶型在臨床中廣泛應(yīng)用,比如阿奇霉素[6]、阿托伐他汀鈣[7]、甲磺酸培氟沙星[8]、頭孢拉定[9]以及頭孢唑林鈉[10]等藥物都是以水合物形式作為臨床藥用主體。此外,溶劑合物晶型也可以作為臨床用藥形式,例如,卡巴他賽丙酮合物為卡巴他賽的藥用晶型[11]。因此,溶劑合物作為藥物晶型的特殊類型,在晶型研究過程中非常重要。

        1 材料與方法

        1.1儀器 APEX-II CCD型單晶X射線衍射儀,德國布魯克公司;SPX-50型生化培養(yǎng)箱,天津賽得利斯有限公司。

        1.2藥品與試劑 奧氮平(批號:E120059,純度>98%),薩恩化學(xué)技術(shù)(上海)有限公司;糖精(批號:447140,純度>98%),百靈威科技有限公司;甲醇(分析純),國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。實(shí)驗(yàn)用水為超純水。

        1.3晶體制備 精密稱取奧氮平156.2 mg(0.5 mmol)與糖精91.5 mg(0.5 mmol),溶于甲醇-水溶液(體積比1:1)20 mL中,于60 ℃加熱溶解,趁熱濾過后,于35 ℃恒溫下靜置,5 d后獲得塊狀固體,用少許甲醇洗去固體表面糖精粉末,獲得紅棕色塊狀晶體,經(jīng)單晶X射線衍射儀測定并進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析,確定為化合物Ⅰ。

        1.4單晶結(jié)構(gòu)測定 單晶X射線衍射儀分析化合物Ⅰ,采用石墨單色器,MoKα輻射(λ=0.710 73 ?)源,/φ掃描方式,在296K下收集衍射強(qiáng)度數(shù)據(jù),收集的數(shù)據(jù)通過SAINT程序還原,采用多重掃描方式對數(shù)據(jù)進(jìn)行吸收校正。

        利用Olex2軟件采用直接法解析晶體結(jié)構(gòu),獲得所有非氫原子位置,使用幾何計(jì)算和差值傅里葉法獲得全部氫原子位置。晶體結(jié)構(gòu)相關(guān)圖采用Diamond4.6版軟件繪制。

        2 結(jié)果

        2.1晶體結(jié)構(gòu)分析 化合物Ⅰ屬于單斜晶系,空間群為P21/c,晶胞參數(shù)見表1所示。由于溶劑分子呈位置無序,甲醇的C18原子與水分子O2原子占同一個(gè)位置,甲醇的O1原子與另一個(gè)水分子O3原子也占同一個(gè)位置,占有率均為0.5。因此,化合物Ⅰ的不對稱單元中含有1分子奧氮平,0.5分子甲醇及兩個(gè)0.5分子水,其分子橢球圖,如圖1所示。奧氮平分子的苯二氮卓環(huán)呈船式構(gòu)象,噻唑環(huán)與苯環(huán)的二面角為57.66°,哌嗪環(huán)呈船式構(gòu)象,且甲基位于赤道方向?;衔铫竦臍滏I參數(shù)如表2所示。在化合物Ⅰ中,奧氮平分子與對稱變換的分子通過C-H…π分子間氫鍵作用形成中心對稱的奧氮平二聚體,并沿著a軸方向形成奧氮平分子二聚體柱,是奧氮平所有晶型的典型特征,在固態(tài)結(jié)晶中普遍存在[14, 17]。

        表2 化合物Ⅰ的氫鍵參數(shù)Tab.2 Hydrogen bonding parameters of compound Ⅰ

        表1 化合物Ⅰ晶體學(xué)參數(shù)Tab.1 Crystal parameters of compound Ⅰ

        圖2 化合物Ⅰ晶胞堆積中結(jié)構(gòu)基元為的Z型鏈狀Fig.2 The Z-shapedchain of motif in the crystal packing diagram of compound Ⅰ

        圖3 化合物Ⅰ的晶胞堆積圖(沿著a軸方向)Fig.3 The crystal packing diagram of compound I (viewed along the a-axis direction)

        2.2Hirshfeld表面分析 為了進(jìn)一步分析分子間的各種弱作用力,采用Hirshfeld表面分析方法[18]對化合物Ⅰ分子間弱作用力進(jìn)行定量分析。運(yùn)用CrystalExplorer17.5軟件,采用6-31G(d,p)基組和從頭計(jì)算的方法對奧氮平分子的靜電勢能進(jìn)行計(jì)算,其Hirshfeld表面采用dnorm作圖,并獲得其相應(yīng)的二維指紋圖譜。Hirshfeld表面用dnorm作圖能夠可視化分析晶體的三維空間結(jié)構(gòu)中分子間近距離的弱鍵作用關(guān)系,并采用二維指紋圖譜對其作用大小進(jìn)行定量分析[19]。dnorm克服了di和de未考慮原子相對大小的缺陷,是一種標(biāo)準(zhǔn)化的接觸距離。Hirshfeld表面有紅-白-藍(lán)三種色帶,當(dāng)接觸距離小于范德華半徑時(shí)用紅色表示(作用力相對較強(qiáng),在Hirshfeld表面上表現(xiàn)出亮紅色或淡紅色的圓斑點(diǎn)),等于范德華半徑附近時(shí)用白色表示,大于范德華半徑時(shí)用藍(lán)色表示,見圖4。

        圖4 化合物Ⅰ的三維Hirshfeld表面分析Fig.4 The 3D Hirshfeld surface of compound Ⅰ

        化合物Ⅰ的Hirshfeld表面及各種作用方式對Hirshfeld表面的貢獻(xiàn)百分比見圖5,H…H、C…H及S…H連接為三個(gè)主要的作用方式。其中H…H作用分布在指紋圖譜中間區(qū)域,對Hirshfeld表面的貢獻(xiàn)最大(圖5B-1),達(dá)到59.4%,為最主要的作用方式。其次是C…H/H…C作用,貢獻(xiàn)比為21.5%,對應(yīng)于C-H…π,O-H…π及N-H…π氫鍵,在Hirshfeld表面中呈淡紅色或近似白色的圓斑,像一對翅膀基本對稱地分布在指紋圖譜的兩側(cè)(圖5B)。在三維Hirshfeld表面中顯示紅色圓斑(圖4)的為強(qiáng)的O-H…N,O-H…O及N-H…O氫鍵,對應(yīng)于N…H及O…H作用,在指紋圖譜中呈釘子狀(圖5A),對Hirshfeld表面貢獻(xiàn)分別為6.6%及3.7%(圖5B)。其余連接方式對整個(gè)Hirshfeld表面面積的貢獻(xiàn)均不到1%。

        A..全局二維指紋圖譜;B.不同連接作用的指紋圖譜。圖5 化合物Ⅰ二維指紋圖譜A.global 2D fingerprint;B.fingerprint of different molecular connections.Fig.5 2D fingerprint of compound Ⅰ

        3 討論

        筆者在研究中雖未成功獲得奧氮平與糖精的共晶,但意外獲得化合物Ⅰ。其實(shí)這種情況也時(shí)常有報(bào)道,例如奧氮平晶Ⅳ型是在研究奧氮平與煙酰胺共結(jié)晶時(shí)獲得[15];馬來酸晶Ⅱ型是在研究馬來酸與咖啡因共結(jié)晶時(shí)獲得[20];姜黃素晶Ⅱ型是在研究姜黃素與4-羥基吡啶共結(jié)晶時(shí)獲得[21]。筆者嘗試在不加糖精時(shí),其他條件保持一致,卻只能獲得已知的甲醇水合物或甲醇合物,可能的原因是糖精作為一種結(jié)晶修飾劑[22],只改變結(jié)晶溶劑性質(zhì),不參與結(jié)晶。

        經(jīng)檢索,化合物Ⅰ為一種新的奧氮平甲醇水合物,并將其晶體結(jié)構(gòu)存儲(chǔ)于英國劍橋大學(xué)晶體數(shù)據(jù)庫中,獲得CCDC號為2002376。本研究可為奧氮平藥物進(jìn)一步研究,尤其是新晶型研究提供新的思路以及實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)支撐。

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