趙丹,劉坤,晏磊
(黑龍江八一農(nóng)墾大學生命科學與技術(shù)學院,大慶 163319)
隨著科技的不斷進步,微型機械在生物醫(yī)學、航空航天、國防航海等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,是構(gòu)成微型機器人、微型工具、微型飛機等微型機械的基本單元[1]。機械加工可以用來在工件上添加、去除或塑造材料的形狀。根據(jù)所使用的能量種類,用于去除材料的加工過程可以分為物理、化學和生物[2]。傳統(tǒng)機械加工在加工微小零件時,容易產(chǎn)生變形、發(fā)熱等問題,不能精確地控制其精度。生物加工是一種可控的微生物過程,通過金屬去除或溶解在工件上選擇性地形成微結(jié)構(gòu)[3]。微生物活動不會產(chǎn)生太多熱量或殘余應(yīng)力,利用微生物代謝過程中一些復(fù)雜的生化反應(yīng)來去除待加工基體上的多余材料,將微生物作為微小的“刀具”加工出精細結(jié)構(gòu)保證了精度,高質(zhì)量,并避免扭曲或損壞工件[4]。氧化亞鐵硫桿菌是一種化能自養(yǎng)菌,以還原態(tài)的硫及亞鐵為能源,專性好氧,嗜酸性,廣泛生活在金屬硫化礦和煤礦的酸性礦坑水中。研究表明氧化亞鐵硫桿菌可以對紫銅表面的微細圖形進行選擇加工,得到具有清晰齒輪輪廓結(jié)構(gòu)的圖形[4]。中國科學院和北京航空航天大學合作,制作出了微小齒輪和微小溝槽[5]。
然而微生物生長繁殖至衰亡期時,細菌的活性逐漸降低,還需要再次對其進行氧化培養(yǎng),且菌液的批次更替造成大量微生物損失,降低了加工效率。固定化微生物在工業(yè)應(yīng)用中具有效率高,耗能低,可多次利用的優(yōu)點[6]。因此研究了通過固定化方法來增大細胞密度,使反應(yīng)加速,實現(xiàn)連續(xù)化操作,以提高生物刻蝕速度。研究表明氧化亞鐵硫桿菌(A.ferrooxidans)和氧化硫硫桿菌(A.thiooxidans)2種菌株混合組成的混合腐蝕菌,可在含F(xiàn)e2+和硫代硫酸鈉的雙底物培養(yǎng)基中正常生長[7],且已驗證鐵硫混合腐蝕菌系在傳代過程中組成和功能都較為穩(wěn)定[8]。
常用的細胞固定化方法有包埋法、交聯(lián)法、吸附法、自絮凝法、載體結(jié)合法[9]。其中吸附法微生物與載體結(jié)合能力弱,易受環(huán)境影響;自絮凝法生成機械強度差,大小不均勻;載體結(jié)合法反應(yīng)條件劇烈,環(huán)境控制嚴苛[10]。包埋法在微生物固定化有條件溫和,操作簡單穩(wěn)定性好的優(yōu)點[11]。常用的載體材料有海藻酸鈉、聚乙烯醇、聚丙烯酰胺、明膠、卡拉膠等[12]。海藻酸鈉微球在多次利用后機械強度下降,有溶解現(xiàn)象[13];聚丙烯酰胺對生物有毒性;明膠生成微球有粘連現(xiàn)象[14],亞鐵氧化率無法達到工業(yè)要求?;旌细g菌系雙底物培養(yǎng)基為強酸性、高離子濃度,海藻酸鈉、卡拉膠、明膠微球維持穩(wěn)定性困難。聚乙烯醇有較好的機械強度和無毒性是一種良好的微生物包埋材料。在聚乙烯醇中加入少量海藻酸鈉能抑制微球在交聯(lián)劑中的粘連[15],運用硝酸鈣代替?zhèn)鹘y(tǒng)的氯化鈣作交聯(lián)劑能提高氧化亞鐵硫桿菌的生物活性[16]。優(yōu)化和改進細胞固定化條件能夠更好的發(fā)揮微生物的能力,響應(yīng)面法是一種較好的實驗優(yōu)化的方法,因其具有實驗次數(shù)少,實驗精度高的特點而在生物實驗中廣泛應(yīng)用[17]。實驗前期探究了溫度(20~40℃)、培養(yǎng)時間(0~72 h)、培養(yǎng)液pH(1.50~2.50)、裝液量(10%~60%)、接種量(0~20%)、交聯(lián)時間(45~75 min)、交聯(lián)轉(zhuǎn)速(80~160 rpm)、Ca(NO3)2濃度(1%~5%)等單因素條件的改變對亞鐵氧化的影響,結(jié)果顯示未優(yōu)化之前固定化細胞的亞鐵氧化率在51%~60%之間。在得到的單因素實驗數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,選出對亞鐵氧化率影響最顯著的三個因素,采用響應(yīng)面Design-Expert v8.0.6軟件中的Box-Behnken設(shè)計響應(yīng)曲面模型,考察不同固定因素如交聯(lián)時間、交聯(lián)轉(zhuǎn)速、鈣離子濃度三個因素對亞鐵氧化率的影響,優(yōu)化出混合腐蝕菌的最佳固定化條件,以便改善生物刻蝕加工微小構(gòu)件的質(zhì)量。
1.1.1 菌種
試驗菌種為氧化亞鐵硫桿菌(A.ferrooxidans ATCC 23270)和氧化硫硫桿菌(A.thiooxidans ATCC 19377)組成的混合腐蝕菌系。
1.1.2 儀器
電子天平(BT223S型,上海越平科學儀器有限公司);pH計(PHB-4型,上海儀電科學儀器股份有限公司);高壓蒸汽滅菌鍋(MLS-3781L型,松下健康醫(yī)療器械株式會社);空氣浴搖床(HZQ-C型,哈爾濱市東聯(lián)電子技術(shù)開發(fā)有限公司);高速冷凍離心機(2K15型,德國Sigma);掃描電子顯微鏡(JSM-7500F型,日本電子株式會社)。
1.1.3 試劑
聚乙烯醇(聚合度1 750+50)、FeSO4·7H2O、(NH4)2SO4購自遼寧泉瑞試劑有限公司;海藻酸鈉、MgSO4·7H2O、Ca(NO3)2購自天津市大茂化學試劑廠;K2HPO4、K2Cr2O7采購自天津市永大化學試劑有限公司;KCl為天津市百世化工有限公司;Na2S2O3·5H2O購自天津市河東區(qū)紅巖試劑廠;二苯胺磺酸鈉購自天津市科密歐化學試劑有限公司,以上試劑均為分析純。
1.1.4 培養(yǎng)基
0K培養(yǎng)基:3 g(NH4)2SO4,0.5 g K2HPO4,0.5 g Mg-SO4·7H2O,0.1 g KCl,0.01 g Ca(NO3)2,蒸餾水1 L,用硫酸調(diào)節(jié)至所需pH[18]。
雙底物培養(yǎng)基:0K培養(yǎng)基中加入FeSO4·7H2O和Na2S2O3·5H2O,濃度分別達44.3 g·L-1和5 g·L-1。
1.2.1 菌體的培養(yǎng)及收集
將混合腐蝕菌系以10%的接種量接種到雙底物液體培養(yǎng)基中,30℃,100 rpm搖床培養(yǎng),培養(yǎng)菌體生長至對數(shù)期,取濾液用直徑50 mm 0.22 μm微孔濾膜過濾,棄掉濾液,將濾紙上的菌體用pH為2的H2SO4沖洗,菌體懸浮液2 000 rpm,5 min離心,收集上清液,棄去底部的鐵礬沉淀物。將上清液在12 000 rpm轉(zhuǎn)速下離心10 min,棄去上清液,用pH為2的H2SO4溶液懸浮沉淀,在12 000 rpm轉(zhuǎn)速下離心10 min,棄去上清,用pH為2的H2SO4溶液懸浮沉淀,重復(fù)離心至菌體中的鐵礬沉淀物完全去除,最后用pH為2的H2SO4溶液重新懸浮,制成菌懸液備用[19]。
1.2.2 混合菌系的細胞固定化
按質(zhì)量比10∶1的比例,稱取聚乙烯醇(PVA)和海藻酸鈉(SA),混合后倒入適量蒸餾水中,PVA和SA含量為9.0%(W/V)和0.9%(W/V),95℃水浴加熱2 h。使之完全溶解,密封后高壓蒸汽滅菌。在常溫條件下靜止存放約24 h,加入已備好的混合菌系菌懸液,輕緩攪拌,盡量避免氣泡產(chǎn)生,使之混合均勻。將此混合液倒入100格冷凍盒中,每個小格體積為1 cm3,存放于-20℃溫度下12 h,取出放入4℃環(huán)境下解凍,去除多余水分,制成1 cm3的小塊。按指定濃度Ca(NO3)2溶液、交聯(lián)時間、交聯(lián)轉(zhuǎn)速交聯(lián),交聯(lián)結(jié)束后保存于4℃?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 細胞固定化條件的優(yōu)化
利用Design expert.V8.0.6軟件中Box-Behnken設(shè)計響應(yīng)曲面模型,考察交聯(lián)時間、交聯(lián)轉(zhuǎn)速、鈣離子濃度三個因素,進行細胞固定化條件的優(yōu)化,分別記為變量X1、X2、X3,每個因素取三個水平,以亞鐵氧化率為響應(yīng)值,記為Y。設(shè)計實驗方案,響應(yīng)面試驗因素水平表見表1。
表1 響應(yīng)面試驗因素水平表Table 1 Response surface test factor level table
將按照實驗設(shè)計條件制作好的固定化細胞微塊,放入裝有50 mL雙底物培養(yǎng)基的錐形瓶中,在30℃,120 rpm搖床中培養(yǎng)72 h取樣,取樣1 mL。
1.2.4 分析方法
用重鉻酸鉀滴定法測定培養(yǎng)基中亞鐵離子的濃度[20]。取200 μl樣品,加入1 mL比例為1∶1的硫磷混酸,加入2滴0.2%二苯胺磺酸鈉,用0.005 mol·L-1的重鉻酸鉀標準溶液滴定,由無色變?yōu)樽仙珵榈味ńK點,計算亞鐵離子的氧化率。
1.2.5 固定化細胞掃描電鏡樣品制備方法
取固定化顆粒斷面,放入2.5%戊二醛中固定過夜。然后0.1 mol·L-1磷酸緩沖液(pH 7.4)中用超聲波清洗器振蕩半分鐘后,反復(fù)沖洗3次,每次15 min。再放入1%鋨酸中暗處固定1 h。用0.1 mol·L-1磷酸緩沖液(pH 7.4)沖洗3次,每次15 min。用70%、80%、90%、100%乙醇逐級脫水,每次6 min,加入包埋劑固化置于烘箱中40℃和70℃各24 h,離子鍍膜。采用JSM-7500F型掃描電鏡(成像電壓為5 kV,放大倍數(shù)10 000倍,工作距離為5.8 mm)表征固定化細胞表面形態(tài)結(jié)構(gòu),分析微生物的生長環(huán)境,以及交聯(lián)過程的包埋塊結(jié)構(gòu)的變化。
通過實驗制作得到外形規(guī)范的固定化細胞微塊,交聯(lián)后機械強度、彈性較好,無粘連情況,能夠在酸性培養(yǎng)基中培養(yǎng)72 h穩(wěn)定存在。生長24 h后固定化細胞微塊由乳白色變?yōu)辄S色,培養(yǎng)基呈微微黃褐色,說明氧化亞鐵硫桿菌在固定化細胞微塊中生長情況較好。
2.2.1 模型方程的建立及方差分析
通過實驗得到各種固定化條件下的亞鐵氧化率,結(jié)果見表2。利用Design expert軟件對數(shù)據(jù)進行分析,得到回歸方程為Y=76.16+3.05 A-0.80 B+2.00 C-2.75 AB+3.75 AC-2.30 BC-15.73 A2-10.53 B2-13.88 C2,表3顯示了每個回歸系數(shù)的顯著性結(jié)果。結(jié)果顯示此回歸模型極其顯著(P<0.000 1)。其中A、A2、B2、C2對Y值的影響極顯著(P<0.000 1)。其他因素如C、AB、AC、BC也對Y值影響顯著(P<0.05)。各因素對亞鐵氧化率的影響因素大小是A>C>B,即鈣離子濃度影響力最大,其次是交聯(lián)轉(zhuǎn)速,交聯(lián)時間影響力最小。交互項AC、AB、BC顯著,表明鈣離子濃度與交聯(lián)時間、鈣離子濃度與交聯(lián)轉(zhuǎn)速、交聯(lián)轉(zhuǎn)速與交聯(lián)時間都存在顯著交互作用。方差分析結(jié)果顯示模型的F值為266.05,說明模型是有效的。R2=99.71,R2adj=99.33表示模型的擬合度較好,CV值<10%,說明實驗的可信度和精確度較好。Adeq Precision值大于4是可取的,說明實驗?zāi)P涂捎糜趯嶒炘O(shè)計,各影響因素對亞鐵氧化率的影響為非線性關(guān)系,適用于氧化亞鐵硫桿菌固定化細胞對亞鐵氧化率的預(yù)測。
圖1 不同培養(yǎng)時間固定化細胞微塊生長情況(a,培養(yǎng)時間0 h;b,培養(yǎng)時間24 h)Fig.1 Growth of immobilized cells under different culture time(a,culture time 0 h;b,culture time 24 h)
表2 響應(yīng)面分析實驗設(shè)計及結(jié)果Table 2 Response surface analysis experimental design and response values
表3 亞鐵氧化率回歸模型方差分析Table 3 Variance analysis table of ferrous oxidation regression model
續(xù)表3亞鐵氧化率回歸模型方差分析Continue table 3 Variance analysis table of ferrous oxidation regression model
2.2.2 響應(yīng)面分析
通過多元回歸分析,得到圖2三組響應(yīng)面圖形與等高線圖。其中a、b分別代表交聯(lián)轉(zhuǎn)速不變下,交聯(lián)時間和鈣離子濃度的響應(yīng)面圖形和等高線圖;c、d分別代表交聯(lián)時間不變下,交聯(lián)轉(zhuǎn)速和鈣離子濃度的響應(yīng)面圖形和等高線圖;e、f分別代表鈣離子濃度不變下,交聯(lián)時間和交聯(lián)轉(zhuǎn)速的響應(yīng)面圖形和等高線圖。等高線趨于橢圓形,表明兩兩之間相互作用顯著,等高線趨于圓形則表明相互作用不顯著。由響應(yīng)面圖a、c、e中可以看出,單方面增加鈣離子濃度、交聯(lián)時間和交聯(lián)轉(zhuǎn)速,亞鐵氧化率都是先增加后減少。由等高線圖b、d、f可以看出,三個因素兩兩之間相互作用顯著。交聯(lián)轉(zhuǎn)速極大值出現(xiàn)在112~128 rpm,交聯(lián)時間極大值出現(xiàn)在57~63 min;鈣離子濃度極大值出現(xiàn)在2.5%~3.5%。通過分析得到細胞固定化最佳條件為鈣離子濃度3%、攪拌轉(zhuǎn)速120 rpm、交聯(lián)時間為60 min,得到最大亞鐵氧化率為77.3%。
圖2 交聯(lián)時間、鈣離子濃度、交聯(lián)轉(zhuǎn)速對亞鐵氧化率影響的三維圖(a,c,e)和等高線圖(b,d,f)Fig.2 Three-dimensional map(a,c,e)and contour map(b,d,f)of the effects of cross-linking time,the concentration of calcium ion,and cross-linking speed on the oxidation rate of ferrous iron
模型的充分性檢查,確保它提供了響應(yīng)和因子之間關(guān)系的最大近似,最小二乘法的殘差是判斷模型充分性的重要工具,由圖3顯示了殘差和預(yù)測響應(yīng)值,模型殘余塊是隨機分布的,沒有任何趨勢。結(jié)果表明,隨著二次模型的不斷變化和充分性,對最大響應(yīng)的預(yù)測是正確的。
圖3 模型預(yù)測值與殘差的殘差圖Fig.3 Residual plot of predicted value and residual
固定化細胞的高效率和穩(wěn)定性與其微觀結(jié)構(gòu)有很大的關(guān)系。圖4分別為接菌種和未接菌種固定化細胞微塊在交聯(lián)0、25、75 min掃描電鏡圖片。圖中可看出未接菌的固定化細胞微塊表面光滑,接菌的固定化細胞小塊存在小坑并形成了大小孔隙結(jié)構(gòu),隨著交聯(lián)時間的增加,孔隙生成的越多,生成的孔隙結(jié)構(gòu)越好,該結(jié)構(gòu)有利于混合菌系的代謝及其營養(yǎng)物質(zhì)的運輸擴散。
圖4 培養(yǎng)前固定化細胞微塊電鏡表征圖(a,c,e代表未接菌種固定化細胞微塊交聯(lián)0、25、75 min;b,d,f代表混合菌系固定化細胞微塊交聯(lián)0、25、75 min)Fig.4 Scanning electron microscope of immobilized cells before culture(a,c,e,cross-linking of immobilized cells of uninoculated bacteria at 0,25,75 min;b,d,f,cross-linking of immobilized cells of mixed corrosion bacteria at 0,25,75 min)
固定化細胞微塊置于雙底物培養(yǎng)基中培養(yǎng)活化后進行SEM表征,圖5為活化后SEM表征圖。結(jié)果顯示,經(jīng)培養(yǎng)活化后,固定化載體的微觀空洞結(jié)構(gòu)進一步改善,空隙更多,形成許多立體三維小孔,這些小孔為混合菌系的定殖、生長、代謝提供了良好的環(huán)境。這些空隙結(jié)構(gòu)既被載體隔離,同時又通過溝壑結(jié)果進行連接,非常利于營養(yǎng)物質(zhì)、氧、熱的傳送和運輸。
圖5 活化培養(yǎng)后固定化細胞微塊電鏡表征圖Fig.5 Scanning electron microscope of immobilized cells after activated culture
為確定模型所得結(jié)果的準確性,在模型最優(yōu)細胞固定化條件下進行三次重復(fù)實驗,亞鐵氧化率分別為76.45%、76.52%、76.42%,得到平均亞鐵氧化率為76.43%±0.09%,統(tǒng)計學分析表明與預(yù)測亞鐵氧化率76.45%無顯著差異(P>0.05),表明實驗?zāi)P途_度較高。
氧化亞鐵硫桿菌具有將亞鐵離子氧化成為鐵離子的功能,由于擁有這等性質(zhì),氧化亞鐵硫桿菌在生物脫硫、生物浸礦和處理電子垃圾方面廣泛應(yīng)用[18]。聚乙烯醇具有很多優(yōu)點,機械強度好,傳質(zhì)性能好,耐生物分解性也好,固定也比較容易,而且成本較低。對細胞無毒、價廉易得,是目前國內(nèi)外研究最為廣泛的一種包埋固定化載體材料,且能夠在酸性條件下存在。PVA-SA體系在生物細胞固定化有較好的機械強度,能保持較好的生物活性,是一種較為理想的細胞固定化材料[21]。PVA分子含有較多羥基,這些羥基隨著時間的變化會自己凝聚在一起。因此在PVA-SA溶解后放置24 h以提高微塊的性能。細胞固定化的條件對亞鐵氧化率有多方面的影響,其中PVA濃度、SA濃度、鈣離子濃度,交聯(lián)攪拌轉(zhuǎn)速為主要調(diào)控因素,已有研究表明氧化亞鐵硫桿菌在9%PVA的濃度時固定化具有較好的生物活性[16]。過高的SA濃度會導(dǎo)致PVA、SA混合不充分,溶液粘度值增大。SA濃度過低則包埋微塊不易成型[22]。實驗在前期研究基礎(chǔ)上選用PVA和SA含量分別為9.0%(W/V)和0.9%(W/V),采用響應(yīng)面分析法以亞鐵氧化率為響應(yīng)值,考察鈣離子濃度、交聯(lián)轉(zhuǎn)速和交聯(lián)時間三個因素對氧化亞鐵硫桿菌細胞功能的影響。結(jié)果表明,隨著鈣離子濃度、交聯(lián)時間的增加,亞鐵離子的氧化率是先增加后降低,說明適量增加鈣離子和增加交聯(lián)時間能更有利于菌體的生長,生成更適合混合菌系的生長環(huán)境。但鈣離子濃度過高、交聯(lián)時間過長,會導(dǎo)致生成的包埋體系吸收過多的鈣離子,生成過量的海藻酸鈣,增加鈣離子在培養(yǎng)基中的脫落時間。不利于盡快生成較好的孔隙結(jié)構(gòu),不利于營養(yǎng)物質(zhì)的傳輸,影響菌體的生長。實驗最終得到鈣離子濃度為3%;交聯(lián)時間60 min;交聯(lián)轉(zhuǎn)速120 rpm的最佳細胞固定化條件。雖然研究對鐵硫腐蝕菌的固定化條件進行了優(yōu)化,得到了最佳的優(yōu)化條件,固定化效率是否能真正達到理想化,是否適合經(jīng)濟適用還有待探究。
SEM分析顯示隨著交聯(lián)時間的增加,固定化細胞微塊孔隙結(jié)構(gòu)越好,活化后生成較好的孔隙結(jié)構(gòu),是因為海藻酸鈉在交聯(lián)時與硝酸鈣反應(yīng)生成海藻酸鈣凝膠,冷凍的過程中通過PVA分子間的自凝聚作用形成PVA凝膠[23]。雙底物培養(yǎng)基的pH值為2,在酸性環(huán)境下海藻酸鈣凝膠溶解,PVA凝膠因具有耐酸性而留下來,所以活化后固定化細胞微塊有更好的微觀孔隙結(jié)構(gòu),有較好的通透性,有利于菌體的生長。
通過響應(yīng)面實驗得到腐蝕混合菌系的最佳細胞固定化條件為鈣離子濃度3%、交聯(lián)轉(zhuǎn)速120 rpm、交聯(lián)時間為60 min,得到最大亞鐵氧化率為77.3%。SEM表征得到固定化細胞小塊在活化后生成較好的孔隙交錯的結(jié)構(gòu),形成許多三維立體小孔,有利于菌體的生長繁殖。