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        呼和浩特地區(qū)腹瀉患者艱難梭菌毒素基因多位點序列分型研究

        2021-11-29 11:33:38王艷艷王俊瑞鄭文琪申慧敏呂瑩瑩郭素芳
        檢驗醫(yī)學 2021年11期
        關(guān)鍵詞:產(chǎn)毒核糖體梭菌

        王艷艷, 王俊瑞, 鄭文琪, 申慧敏, 呂瑩瑩, 郭素芳

        (內(nèi)蒙古醫(yī)科大學附屬醫(yī)院檢驗科,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010050)

        艱難梭菌(Clostridium difficile)是一種專性厭氧、革蘭染色陽性的粗大芽孢桿菌,是醫(yī)院內(nèi)抗菌藥物相關(guān)腹瀉和偽膜性腸炎的主要病原體[1]。為了解呼和浩特地區(qū)臨床腹瀉患者艱難梭菌感染情況,本研究對臨床疑似抗菌藥物相關(guān)腹瀉和偽膜性腸炎患者糞便樣本進行艱難梭菌分離和培養(yǎng),并檢測艱難梭菌毒素基因,對產(chǎn)毒艱難梭菌進行多位點序列分型(multilocus sequence typing,MLST),為艱難梭菌感染的診治提供參考。

        1 材料和方法

        1.1 樣本來源

        收集2018年7月—2019年12月內(nèi)蒙古醫(yī)科大學附屬醫(yī)院疑似抗菌藥物相關(guān)腹瀉和偽膜性腸炎成人患者的糞便樣本326份。

        1.2 試劑與儀器

        艱難梭菌顯色培養(yǎng)基、厭氧產(chǎn)氣袋、VITEK 2 Compact自動化鑒定藥敏儀及配套ACT/ANC卡和VITEK MS微生物質(zhì)譜鑒定系統(tǒng)(法國生物梅里埃公司),Efficiency 96基因擴增儀(北京領(lǐng)宇科技有限公司),聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)酶[天根生化科技(北京)有限公司]。

        1.3 方法

        1.3.1 菌株培養(yǎng)及鑒定 將適量糞便樣本與無水乙醇按1∶1體積混合,靜置1 h后接種于艱難梭菌顯色培養(yǎng)基。35 ℃厭氧培養(yǎng)48 h。選擇顯色平板上黑色、邊緣不整,有特殊馬糞味的革蘭染色陽性大桿菌進行分離純化。采用VITEK 2 Compact自動化鑒定藥敏儀和VITEK MS微生物質(zhì)譜鑒定系統(tǒng)進行菌種鑒定。

        1.3.2 毒素基因檢測 采用熱激法提取細菌DNA,擴增艱難梭菌毒素基因(tcdA、tcdB)和二元毒素基因(cdtA、cdtB),明確是否為產(chǎn)毒艱難梭菌菌株。

        1.3.3 MLST 參考文獻[1]擴增艱難梭菌7個管家基因(adk、atpA、dxr、glyA、recA、sodA和tpi)。引物由中美泰和生物技術(shù)(北京)有限公司合成,引物序列見表1。反應(yīng)體系:2×pfu Master Mix 25 μL,上、下游引物(10 pmol/L)各2 μL,DNA模板2 μL,ddH2O 19 μL。反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性15 min;94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共35個循環(huán);72 ℃再延伸5 min。PCR產(chǎn)物分析:取 5 μL PCR 產(chǎn)物,在1.5%瓊脂糖凝膠中進行電泳(180 V,110 mA,20 min),溴化乙錠染色后,在凝膠電泳成像儀下觀察結(jié)果。擴增產(chǎn)物送中美泰和生物技術(shù)(北京)有限公司進行測序,測序結(jié)果通過http://pubmlst.org/clostndium difficile進行比對,得到每株菌的ST型別。

        2 結(jié)果

        2.1 菌株鑒定及毒素基因檢測結(jié)果

        326份糞便樣本中共分離出艱難梭菌46株(14.11%)。46株艱難梭菌中,有35株為產(chǎn)毒株,其中tcdA(-)、tcdB(+)型3株,tcdA(+)、tcdB(+)型32株,部分菌株電泳見圖1。未檢測到含二元毒素基因的菌株。

        圖1 艱難梭菌毒素基因tcdA和tcdB檢測

        2.2 MLST結(jié)果

        35株產(chǎn)毒艱難梭菌的7個管家基因目的條帶均清晰可見。MLST比對結(jié)果顯示,35株艱難梭菌共檢出13個ST型別(2、3、14、33、35、39、42、48、52、54、55、109、512),其中ST54型的菌株數(shù)量最多,有 8 株(22.9%);其次是ST2型和ST55型,各有5株(14.3%)。未檢測到高產(chǎn)毒株核糖體027型(ST1型)和核糖體078型(ST11型)。其中1株產(chǎn)毒菌株的7個管家基因擴增電泳見圖2。MLST結(jié)果見表2。

        圖2 艱難梭菌 MLST管家基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

        表2 35株艱難梭菌MLST結(jié)果

        3 討論

        艱難梭菌為革蘭陽性厭氧芽孢桿菌,是醫(yī)院獲得性腹瀉最主要的病原菌。當廣譜抗菌藥物的應(yīng)用破壞腸道正常菌群平衡時,產(chǎn)毒艱難梭菌會過度繁殖,導(dǎo)致腸道菌群失調(diào),并釋放毒素,引起腹瀉。抗菌藥物被認為是導(dǎo)致艱難梭菌感染的最大危險因素[2]。目前,艱難梭菌感染已成為嚴重的全球性公共衛(wèi)生問題[3]。

        不同國家和地區(qū)對艱難梭菌感染的報道有較大的差異,BAUER等[4]對歐洲34個國家106所醫(yī)院的艱難梭菌相關(guān)腹瀉流行病學特征調(diào)查結(jié)果顯示,盡管歐洲各醫(yī)院艱難梭菌相關(guān)腹瀉流行情況有差異,感染率為0~36.3/萬(平均4.1/萬),但總體呈上升趨勢。我國艱難梭菌感染率或分離率為12.6%~18.5%[5-6]。有學者分析了24家醫(yī)院2009—2015年住院腹瀉患者的病因,發(fā)現(xiàn)19%的腹瀉是由艱難梭菌感染引起的[7]。本研究艱難梭菌檢出率為14.11%。由于艱難梭菌分離培養(yǎng)條件苛刻,對檢測人員要求較高,我國目前只有為數(shù)不多的臨床微生物實驗室開展了艱難梭菌的常規(guī)分離培養(yǎng),導(dǎo)致艱難梭菌感染的實驗室診斷不足以滿足臨床診療需求。

        艱難梭菌主要產(chǎn)生腸毒素A(tcdA)及細胞毒素B(tcdB)2種毒素,部分高產(chǎn)毒株還可以產(chǎn)生1種二元毒素(cdtA、cdtB)。本研究共分離出35株產(chǎn)毒艱難梭菌,其中32株艱難梭菌同時產(chǎn)A、B 2種毒素,3株艱難梭菌只產(chǎn)B毒素。不同地區(qū)報道產(chǎn)毒類型也不盡相同。本研究產(chǎn)毒艱難梭菌以tcd(A+B+)雙陽為主,未發(fā)現(xiàn)tcd(A+B-)型菌株,與文獻[8-9]報道一致,與同俏靜等[10]報道的54株產(chǎn)毒菌株中有53株tcdB(A-B+),僅1株為tcdA(A+B-),未檢測到雙陽性菌株的研究結(jié)果有差異,可能與不同地區(qū)流行菌株類型不同有關(guān)。

        2002年以來,1種高產(chǎn)毒艱難梭菌在北美和歐洲暴發(fā)流行,即PCR-核糖體分型027型/脈沖場凝膠電泳分型NAPl型/限制性內(nèi)切酶分型BI型(簡稱RT027/NAP1/BI)[11-12]。該型菌株引起的臨床癥狀更加嚴重,且傳播性更強,易復(fù)發(fā)、預(yù)后差,導(dǎo)致艱難梭菌感染發(fā)病率快速增加[12-13]。2005年,在荷蘭又發(fā)現(xiàn)了另1種高毒力菌株——核糖體分型078型[14]。目前,我國有高產(chǎn)毒株、多重耐藥菌株的個案報道,但沒有出現(xiàn)艱難梭菌感染的暴發(fā)流行。黃海輝等[15]首次在國內(nèi)分離到高產(chǎn)毒株核糖體078型,我國香港和內(nèi)地也相繼報道了艱難梭菌高產(chǎn)毒株核糖體027型[16-19]。

        MLST是一種基于核酸序列測定的細菌分型方法。該法通過PCR擴增多個管家基因內(nèi)部片段并測定其序列,分析菌株的變異。MLST操作簡單,結(jié)果能快速得到,并且便于不同實驗室的比較,已經(jīng)用于多種細菌的流行病學監(jiān)測和進化研究。隨著測序速度的加快和成本的降低,以及分析軟件的發(fā)展,MLST逐漸成為常規(guī)的細菌分型方法。在我國,引起感染的艱難梭菌主要流行菌株為ST37型、ST35型和ST54型[20-21]。我國東部地區(qū)某教學醫(yī)院ST81型艱難梭菌在醫(yī)院內(nèi)多病區(qū)播散[22]。有研究發(fā)現(xiàn),ST81型艱難梭菌感染者的60 d死亡率明顯高于非ST81型感染患者,而ST81型也占艱難梭菌感染復(fù)發(fā)病例的大部分[23]。

        本研究MLST結(jié)果顯示,呼和浩特地區(qū)艱難梭菌ST型別較多,有13種,主要型別是ST54型,其次是ST2型和ST55型。未檢出高產(chǎn)毒株ST1型(核糖體027型)、ST11型(核糖體078型)。本地區(qū)艱難梭菌感染以散發(fā)為主,未出現(xiàn)某一型別的暴發(fā)流行。

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