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        PRKAA2基因在腫瘤細胞與血細胞中表達差異研究

        2021-10-11 02:00:08孫春霞陳書坤鄭磊
        實用醫(yī)學雜志 2021年18期
        關鍵詞:檢測

        孫春霞 陳書坤 鄭磊

        南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院檢驗科(廣州510515)

        癌癥已經成為全球最嚴重的致死性疾病之一。據全球癌癥統(tǒng)計數據估計,2020年全球癌癥發(fā)病人數和死亡人數分別達到1 930 萬和1 000 萬[1]。研究[2]表明轉移和復發(fā)是癌癥患者死亡的主要原因,血行播散則是癌癥轉移和復發(fā)的主要途徑,因此檢測循環(huán)腫瘤細胞(circulating tumor cells,CTCs)對癌癥患者的轉移和復發(fā)的預測及療效監(jiān)測具有重要的臨床意義。CTCs 是由實體瘤脫落進入血液循環(huán)的腫瘤細胞,作為“液體活檢”的主要標本之一,具有無創(chuàng)、便捷和可實時監(jiān)測的特點,有助于實體瘤的早期檢測與預后評估,在個體化治療及療效監(jiān)測中具有重要臨床意義[3]。然而,CTCs 數量十分稀少,從數以萬計的血細胞中準確識別CTCs 成為了一項主要技術難題,極大阻礙其臨床應用[4]。目前,聯合多種上皮標志物及間質標志物檢測已經成為提高CTCs 檢出率的一個有效策略[5-6],但該策略存在特異性不足的問題。因此,迫切需要開發(fā)特異性高的標志物,方便實體瘤外周血的CTCs 的鑒定。

        本研究利用腫瘤細胞與血細胞脂質代謝水平差異的特點,使用原位鎖式探針雜交技術原位檢測腫瘤細胞和白細胞(WBC)的脂代謝相關基因PRKAA2 的差異表達,為PRKAA2 用于CTCs 的鑒定提供可靠的理論基礎。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 細胞系人肝癌細胞HepG2,宮頸癌細胞Hela,膠質瘤細胞U87 和前列腺癌細胞PC?3 均購自上海中科院細胞研究所細胞資源中心。

        1.1.2 主要試劑與儀器LightCycler 480 實時熒光定量PCR 儀(瑞士Roche 公司)、倒置共聚焦熒光顯微鏡(日本尼康公司)、細胞涂片離心機(中國上海盧湘儀離心機儀器有限公司)、FastKing gDNA Dispelling RT SuperMix(中國Tiangen 公司)、Fast?Fire qPCR PreMix(中國Tiangen 公司)、Ampligase?DNA Ligase(美國Lucigen 公司)、Rnase H,Rever?taid H Minus Rt Ea,Ribolock Rnase Inhibitor Ea,Phi29 DNA Polymerase Ea(美國Thermo Fisher Scien?tific 公司)、LymphoprepTM(加拿大Stemcell 公司)、qRT?PCR 引物(中國BGI 公司)、原位雜交引物和探針(中國BGI 公司)、CellTrace CFSE Cell Prolifer?ation,CFSE,Slowfade gold antifade reagent,2?(4?Amidinophenyl)?6?indolecarbamidine dihydrochlori?de,DAPI(美國Thermo Fisher Scientific 公司)。

        1.1.3 引物和探針原位鎖式探針實驗的熒光檢測探針來源于文獻[7],引物和檢測探針使用Inte?grated DNA technology 網 站(https://sg.idtdna.com/pages)進行設計,并在Blastn(https://blast.ncbi.nlm.nih. gov/Blast.cgi)網站的refseq_rna 數據庫中行序列比對以獲取特異性的引物(引物,鎖式探針和檢測探針序列見表1-2)。

        1.2 實驗方法

        1.2.1 細胞培養(yǎng)使用含有10%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)基培養(yǎng)細胞,并將細胞置于37 ℃、5% CO2孵箱中,待細胞匯合度為80%~90%時采用0.25%胰蛋白酶消化收獲細胞。

        1.2.2 提取WBC按照說明書使用Lymphoprep試劑提取健康體檢者外周血WBC,具體操作如下:在15 mL離心管中加入Lymphoprep分離液2 mL,取2 mL 3%FBA?PBS 稀釋等量全血,稀釋后血液疊加在Lymphoprep分離液上,1 200 g離心10 min后棄上清,3%FBS?PBS 離心洗滌后收集WBC 沉淀。

        1.2.3 腫瘤細胞和WBC 的PRKAA2 mRNA 定量檢測按照TRIZOLTM 試劑說明書步驟分別抽提腫瘤細胞和WBC 的總RNA。使用FastKing cDNA第一鏈合成試劑盒逆轉錄RNA,取1 μg RNA 合成cDNA。采用FastFire qPCR PreMix試劑盒用于qRT?PCR 反應,反應體系為20 μL。引物序列見表1,GAPDH 作為內參基因。反應程序如下:95 ℃預變性1 min;95 ℃變性5 s,60 ℃退火/延伸15 s,共40個循環(huán)。使用LightCycler 480實時熒光定量PCR儀檢測樣本熒光信號。使用2?ΔΔCT法計算基因相對表達量。

        表1 熒光定量PCR 引物序列Tab.1 Primer sequences of fluorescence quantitative PCR

        1.2.4 原位鎖式探針雜交實驗(1)制片:摻入實驗中,將對數生長期的腫瘤細胞消化成單個細胞,加入終濃度為5 μmol/L 的細胞追蹤染料CFSE(溶于1 mL PBS 中)后37 ℃水浴20 min,加5 mL 完全培養(yǎng)基37 ℃水浴30 min,PBS 清洗3 次,獲取細胞沉淀。腫瘤細胞、WBC和WBC混合CFSE標記腫瘤細胞置于細胞甩片離心機,1 600 r/min 離心3 min,制成細胞玻片樣本,3.7%多聚甲醛固定10 min,-20 ℃冰箱保存。(2)雜交實驗:詳細過程參照文獻[9],主要程序包括以下步驟:(1)加入Revertaid H minus RT 酶逆轉錄體系,45 ℃孵育3 h;(2)加入Rnase H,Ampligase?DNA Ligase 酶體系37 ℃孵育30 min,45 ℃孵育45 min;(3)加入Phi29 DNA polymerase 酶體系室溫滾環(huán)擴增過夜;(4)加熒光標記檢測探針置于37 ℃孵箱雜交30 min;(5)最后用1∶5 000 DAPI 復染細胞核,再滴加Slowfade gold antifade reagent 抗淬滅封片劑封片,4 ℃保存;(6)共聚焦熒光顯微鏡成像和分析。

        1.3 統(tǒng)計學方法使用SPSS 25.0 軟件進行統(tǒng)計分析,數據采用均數±標準差表示,正態(tài)分布兩組均數比較采用t檢驗,方差不齊時則采用校正t檢驗。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計學意義。

        表2 原位鎖式雜交實驗的引物和探針序列Tab.2 Primer and probe sequences for in situ padlock hybridization experiments

        2 結果

        2.1 PRKAA2 在WBC 與多種腫瘤細胞中的表達水平THPA 數據庫(https://www.proteinatlas.org/)的RNA 測序數據[8]顯示PRKAA2 基因在WBC 中幾乎不表達(圖1A)。應用qRT?PCR 實驗,驗證該基因在HepG2、U87、Hela、PC?3 細胞系和WBC 中的表達差異,結果見圖1B、表3,HepG2、U87、Hela和PC?3 細胞系中的PRKAA2 mRNA 水平顯著高于WBC,差異具有統(tǒng)計意義(均P<0.05)。

        圖1 PRKAA2 在WBC 與多種腫瘤細胞系中的表達水平Fig.1 The mRNA level of PRKAA2 in WBC and multiple tumor cell lines

        表3 PRKAA2 mRNA 在Hela、U87、PC?3、HepG2 和WBC細胞中相對表達量(2?ΔΔCT)Tab.3 PRKAA2 mRNA levels in Hela,U87,PC?3,HepG2 cancer cells and WBC(2?ΔΔCT)±s

        表3 PRKAA2 mRNA 在Hela、U87、PC?3、HepG2 和WBC細胞中相對表達量(2?ΔΔCT)Tab.3 PRKAA2 mRNA levels in Hela,U87,PC?3,HepG2 cancer cells and WBC(2?ΔΔCT)±s

        注:P 值均為與WBC 比較所得

        ?ΔΔCT 樣本WBC Hela U87 PC?3 HepG2 PRKAA2(2)1.12±0.73 429.40±109.6 206.18±15.5 57.11±7.67 778.70±156.9 P 值0.002 0.002<0.001 0.013

        2.2 PRKAA2 基因在HepG2、U87、Hela、PC?3 細胞中特異性高表達使用ACTB基因作為陽性對照,原位鎖式探針技術檢測HepG2、U87、Hela、PC?3 細胞系和WBC的PRKAA2 mRNA,結果見圖2,HepG2、U87、Hela 和PC?3 細胞顯示為DAPI+/PRKAA2+/ACTB+,而WBC 顯示為DAPI+/PRKAA2-/ACTB+,表明PRKAA2 基因在HepG2、U87、Hela 和PC?3 細胞中特異性高表達。

        圖2 腫瘤細胞HepG2、Hela、U87、PC?3 與WBC 的PRKAA2 mRNA 信號熒光圖 標尺:10 μM(放大倍數400×:目鏡10×,物鏡40×)Fig.2 Fluorescent images of PRKAA2 mRNA in cancer cells(HepG2,Hela,U87,PC?3)and WBC(magnification power:400×:eyepiece 10×,objective 40×)

        2.3 檢測PRKAA2mRNA 熒光信號可準確鑒定腫瘤細胞實驗采用原位鎖式探針雜交技術檢測PRKAA2 以識別CTCs。HepG2、U87、Hela 和PC?3腫瘤細胞被預先標記CFSE 熒光染料并摻入1 mL健康體檢者外周血中以模擬臨床樣本,內參基因ACTB 作為陽性對照。結果見圖3,WBC(DAPI+/CFSE-)未檢測到PRKAA2 信號,而幾乎所有腫瘤細胞(DAPI+/CFSE+)均檢測到PRKAA2 信號。CFSE 和PRKAA2 在共聚焦熒光顯微鏡下實現良好的熒光信號共定位,表明檢測PRKAA2 mRNA 熒光信號可準確鑒定腫瘤細胞。

        圖3 PRKAA2 mRNA 與CFSE 共定位熒光圖(放大倍數400×:目鏡10×,物鏡40×)Fig.3 Fluorescent images show co-localization of PRKAA2 mRNA and CFSE(magnification power:400×:eyepiece 10×,objective 40×)

        3 討論

        脂肪由磷脂、脂肪酸、甘油三酯、鞘脂、膽固醇和膽固醇酯等分子組成,是所有細胞膜的重要組成部分,也是特定條件下細胞的重要能量來源[9-10]。脂質代謝異常是眾多代謝性疾病,如心血管疾病、非酒精性脂肪肝、糖尿病、胰腺炎發(fā)生發(fā)展的關鍵因素[11-14]。越來越多的證據[15-17]表明,脂肪代謝異常即脂代謝重編程有利于癌細胞的存活、增殖、侵襲和轉移,在腫瘤惡性生物學行為中起著關鍵的作用。因此,靶向脂質代謝調節(jié)相關通路已成為一種新的抗癌策略[18-19]。

        本實驗室長期致力于CTCs 的富集和鑒定的研究,經脂代謝基因芯片篩選發(fā)現PRKAA2 在肝癌細胞中的表達水平顯著高于WBC。本研究發(fā)現,除了肝癌細胞,在前列腺癌、宮頸癌、膠質瘤等細胞中其表達量均和WBC 有統(tǒng)計學差異,這和PRKAA2 的功能密切相關:PRKAA2 基因編碼腺苷酸活化蛋白激酶(AMP?activated protein kinase,AMPK)的α2 催化亞基蛋白,該蛋白通過磷酸化乙酰輔酶A 羧化酶1(ACC1)、磷酸化線粒體相關亞型ACC2 和介導轉運蛋白CD36 轉位到質膜,達到抑制脂肪酸合成、上調脂肪酸氧化水平、激活脂肪酸攝取的效果,從而在應激條件下維持腫瘤細胞的代謝穩(wěn)態(tài)[20]。由于腫瘤細胞與正常細胞的脂代謝差異,PRKAA2 作為一個潛在的“通用型”腫瘤細胞標志物的優(yōu)勢如下:(1)可從細胞代謝功能上直接辨別癌與非癌,特異性高;(2)不局限于某種特定腫瘤細胞,有望提高CTCs 檢測通量,并且省時、經濟。因此,PRKAA2 有望成為極具潛力的CTCs 鑒定標志物。

        本研究使用的原位鎖式探針雜交技術整合了滾環(huán)擴增法,可在細胞原位檢測單個PRKAA2 mRNA 信號,具有靈敏度高、特異性強和信噪比高的特點[7],為得到準確可靠的實驗結果提供堅實的技術保障。我們將腫瘤細胞摻入外周血模擬CTCs,采用原位鎖式雜交技術可視化檢測PRKAA2熒光信號,結果表明對PRKAA2 的熒光信號檢測可從大量背景WBC 中準確識別腫瘤細胞,為PRKAA2 用于CTCs 的鑒定提供理論基礎和技術保障。

        總之,本研究初步證實,檢測標志物PRKAA2可特異鑒定多種類型的腫瘤細胞,并有望準確定量多種癌癥起源CTCs,對腫瘤的輔助診斷、治療檢測和預后評估等提供重要的臨床價值。然而,本課題局限于體外實驗,尚未進行體內實驗,后續(xù)的研究中會納入多腫瘤類型及擴大樣本量,來進一步驗證PRKAA2 作為泛癌CTCs 鑒定標志物的臨床應用價值。

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