李娟娟 杜偉 周舟 段福東 肖允艷 楊琳 劉敏
摘要:盡管治療有所進(jìn)步,肺癌仍然是全世界范圍內(nèi)與癌癥相關(guān)的死亡的主要原因,這很大程度上與許多患者在初診時(shí)已經(jīng)患有晚期疾病有關(guān)。由于大多數(shù)肺癌最初以結(jié)節(jié)的形式出現(xiàn),因此將肺結(jié)節(jié)正確分類(lèi)為早期肺癌對(duì)于降低肺癌的發(fā)病率和死亡率至關(guān)重要。人工智能(AI)算法在惡性病變的自動(dòng)檢測(cè),分割和計(jì)算機(jī)輔助診斷中起著至關(guān)重要的作用。在現(xiàn)有算法中,放射學(xué)及基于深度學(xué)習(xí)的類(lèi)型似乎是最有前途的。這篇綜述將從計(jì)算機(jī)輔助診斷的放射學(xué)和深度學(xué)習(xí)方面概述AI在肺結(jié)節(jié)分類(lèi)及早期肺癌篩查中的應(yīng)用最近取得的進(jìn)展。
關(guān)鍵詞:人工智能;放射學(xué);深度學(xué)習(xí);計(jì)算機(jī)輔助診斷;肺結(jié)節(jié);肺癌
【中圖分類(lèi)號(hào)】R563 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】1673-9026(2021)07-337-03
根據(jù)世界衛(wèi)生組織的數(shù)據(jù)[1],在全世界與癌癥相關(guān)的死亡中,肺癌是最常見(jiàn)的原因。盡管肺癌的一年生存率有所提高,但五年或五年以上的凈生存率低至13.8%[2],這主要因?yàn)樽畛踉\斷時(shí),高達(dá)55%的患者已經(jīng)處于肺癌晚期階段 [3]。孤立的肺結(jié)節(jié)其中很大一部分可能是可以治愈的早期肺癌,因此肺結(jié)節(jié)作為早期肺癌的準(zhǔn)確分類(lèi)對(duì)于降低肺癌的發(fā)病率和死亡率至關(guān)重要。幸運(yùn)的是,胸部低劑量計(jì)算機(jī)斷層掃描(low-dose computed tomography,LDCT)被認(rèn)為是肺癌篩查的主要方法[4-6]。但是,盡管通過(guò)LDCT可以提高對(duì)肺結(jié)節(jié)檢測(cè)的敏感性,但對(duì)肺癌診斷的特異性仍然較低[5]。與高死亡率和高發(fā)病率相關(guān)的肺癌需要對(duì)肺癌篩查技術(shù)進(jìn)行改進(jìn)和修改,而解決此問(wèn)題的一種可能方法是使用人工智能(artificial intelligence,AI)。就肺結(jié)節(jié)分類(lèi)及肺癌篩查而言,人工智能提供了一些算法來(lái)幫助放射科醫(yī)生,此類(lèi)技術(shù)可以用計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)(computer aided diagnosis System, CAD)的通用名稱(chēng)來(lái)表示,它可以識(shí)別候選結(jié)節(jié)并檢索盡可能多的診斷相關(guān)信息。本文將從計(jì)算機(jī)輔助診斷的放射學(xué)和深度學(xué)習(xí)方面對(duì)AI在肺結(jié)節(jié)分類(lèi)及早期肺癌篩查中的應(yīng)用研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。
1、用于檢測(cè)和診斷肺結(jié)節(jié)的計(jì)算機(jī)輔助系統(tǒng)
人工智能被定義為一門(mén)計(jì)算機(jī)科學(xué)學(xué)科,專(zhuān)注于創(chuàng)造能夠感知世界并執(zhí)行類(lèi)似于人類(lèi)的機(jī)器,最初的AI算法用于簡(jiǎn)單數(shù)據(jù)的分析,是由程序員進(jìn)行硬編碼的,無(wú)法識(shí)別未經(jīng)特別編程的模式[7]。機(jī)器學(xué)習(xí)(Machine learning,ML)是AI的一個(gè)子領(lǐng)域,算法可以識(shí)別和學(xué)習(xí)復(fù)雜數(shù)據(jù)集中的模式以產(chǎn)生智能預(yù)測(cè),而不是通過(guò)顯式編程來(lái)實(shí)現(xiàn)[8]。但是,大多數(shù)傳統(tǒng)的ML算法仍然需要人工輸入,并且這種算法能夠評(píng)估的模式仍然相當(dāng)簡(jiǎn)單。肺結(jié)節(jié)識(shí)別過(guò)程中使用的算法以計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)的通用名稱(chēng)進(jìn)行引用。CAD系統(tǒng)分為兩個(gè)子類(lèi)別:計(jì)算機(jī)輔助檢測(cè)(CADe)和計(jì)算機(jī)輔助診斷(CADx)系統(tǒng),用于檢測(cè)肺結(jié)節(jié)的CAD系統(tǒng)通常包括四個(gè)階段:肺分割,結(jié)節(jié)檢測(cè),特征分析和假陽(yáng)性消除[9]。為了應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn),許多研究人員已經(jīng)探索了從肺結(jié)節(jié)中提取信息以提高結(jié)節(jié)檢測(cè)的敏感性。在現(xiàn)有方法中,用于肺結(jié)節(jié)檢測(cè)的CAD在2000年代初開(kāi)始使用傳統(tǒng)的ML方法,研究人員手動(dòng)提取CT圖像中節(jié)點(diǎn)的特征和屬性,并將其輸入到分類(lèi)器或神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中,例如支持向量機(jī)(SVM)[10]。
用于肺結(jié)節(jié)的傳統(tǒng)CAD算法基于以下主要步驟:肺分割以及肺結(jié)節(jié)的檢測(cè)和分類(lèi)。首先是肺部分割,方法是從輸入的CT圖像中去除背景和不需要的區(qū)域以縮小圖像區(qū)域以進(jìn)行進(jìn)一步檢查。多年來(lái),已為此目的開(kāi)發(fā)了許多算法,第一種方法集中于二維(2D)和三維(3D)區(qū)域增長(zhǎng)算法[11],其他廣泛使用的算法是有效輪廓模型[12]。近年來(lái),深度學(xué)習(xí)算法具有較低的敏感度和準(zhǔn)確性,已經(jīng)取代了傳統(tǒng)方法。當(dāng)前最先進(jìn)的方法是利用統(tǒng)計(jì)有限元分析或三維肺分割,通過(guò)對(duì)抗性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練得到改進(jìn)[13]。其次是進(jìn)行結(jié)節(jié)候選檢測(cè),以識(shí)別懷疑是惡性肺結(jié)節(jié)的肺內(nèi)結(jié)構(gòu)。已經(jīng)發(fā)布了許多算法來(lái)完成結(jié)節(jié)檢測(cè)任務(wù),其中,多個(gè)灰度閾值被認(rèn)為是最好的[14],但是,基于形狀和模板匹配的算法,以及具有凸度模型和基于濾波的形態(tài)學(xué)方法,也能夠成功地高精度檢測(cè)候選結(jié)節(jié)。在2019年,提出了多邊形逼近算法,隨后在2020年提出了神經(jīng)進(jìn)化方案[15]。自2016年以來(lái),深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)在結(jié)節(jié)檢測(cè)中發(fā)揮了重要作用。
所選特征的數(shù)量和用于分類(lèi)的ML模型的類(lèi)型取決于所使用的CAD系統(tǒng)的類(lèi)型。盡管傳統(tǒng)的ML CAD成功地輔助了結(jié)節(jié)的檢測(cè),但是傳統(tǒng)的ML的一個(gè)陷阱是過(guò)擬合,因?yàn)閷?duì)于特定的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,明顯的高算法性能無(wú)法在其他獨(dú)立的數(shù)據(jù)集上得到復(fù)制[10]。盡管到目前為止進(jìn)行了所有研究,但仍然非常需要改進(jìn)用于肺癌診斷的現(xiàn)有CAD算法。
2、放射學(xué)在肺結(jié)節(jié)分類(lèi)及早期肺癌篩查中的應(yīng)用
肺結(jié)節(jié)是低對(duì)比度的組織,很難與周?chē)h(huán)境區(qū)分開(kāi),但是,每個(gè)結(jié)節(jié)都包含可由ML中的“特征”表示的特征,對(duì)于醫(yī)學(xué)成像,這些功能通常是數(shù)字的。在開(kāi)發(fā)CAD系統(tǒng)的同時(shí),有研究提出了現(xiàn)有的CAD算法的主要缺點(diǎn)是缺乏對(duì)可用于確定已識(shí)別結(jié)節(jié)是癌性還是良性的一組特征的嚴(yán)格定義,因此定義了一個(gè)新的概念,叫做radimics,放射學(xué)[16]。 放射學(xué)是與從圖像中提取一組特征有關(guān)的不斷發(fā)展的領(lǐng)域,這允許將醫(yī)學(xué)圖像自動(dòng)分類(lèi)到預(yù)定義的組中,該過(guò)程包括一系列連續(xù)的步驟,包括圖像采集和預(yù)處理,所需感興趣區(qū)域的分割,定義特征的計(jì)算,特征工程以及分類(lèi)模型的構(gòu)建[17]。Radiomics是基于使用數(shù)據(jù)特征化算法從單個(gè)圖像中提取大量特征的基礎(chǔ),這些特征有助于識(shí)別隱藏在人類(lèi)專(zhuān)家的肉眼中的癌癥特征。但是,放射線圖像處理管道比簡(jiǎn)單的特征提取包含更多的步驟。放射學(xué)特征計(jì)算之前采取的步驟是對(duì)感興趣區(qū)域(ROI)進(jìn)行分割,由于缺乏準(zhǔn)確的“金標(biāo)準(zhǔn)”技術(shù)來(lái)進(jìn)行肺結(jié)節(jié)分割,因此在大多數(shù)情況下需要手動(dòng)進(jìn)行分割[18]。每種放射組學(xué)分析的第三部分是肺結(jié)節(jié)分類(lèi)—執(zhí)行以下任務(wù)之一的模型選擇過(guò)程:(I)將分析結(jié)節(jié)分為兩類(lèi):惡性或良性;(II)預(yù)測(cè)對(duì)治療的反應(yīng)(主要是放射治療);或(III)預(yù)測(cè)患者的整體存活率[19]。
研究表明,放射線學(xué)可以提高基于低劑量計(jì)算機(jī)斷層掃描(LDCT)的肺癌篩查和肺結(jié)節(jié)分類(lèi)的準(zhǔn)確率,可以很好的將良性和惡性肺結(jié)節(jié)進(jìn)行分類(lèi)[20]。為了對(duì)孤立的肺結(jié)節(jié)進(jìn)行初步評(píng)估和監(jiān)測(cè),英國(guó)胸科學(xué)會(huì)[21](BTS)指南通過(guò)計(jì)算結(jié)節(jié)的體積倍增時(shí)間(VDT)來(lái)評(píng)估結(jié)節(jié)的穩(wěn)定性和增長(zhǎng)率,因?yàn)镹ELSON肺癌篩查試驗(yàn)的數(shù)據(jù)表明, VDT可以評(píng)估惡性腫瘤的可能性[22]。有研究在基于紋理的基礎(chǔ)上所提取出來(lái)的放射特征來(lái)對(duì)結(jié)節(jié)進(jìn)行分類(lèi),結(jié)果在良惡性結(jié)節(jié)的分類(lèi)中達(dá)到了82.7%的準(zhǔn)確性[23]。在另一項(xiàng)研究中,他們將篩查良性肺結(jié)節(jié)與肺癌的病人分成兩組,從每個(gè)結(jié)節(jié)中提取放射特征來(lái)用于預(yù)測(cè)隨后出現(xiàn)的癌癥,結(jié)果隨機(jī)森林分類(lèi)器中的特征預(yù)測(cè)到結(jié)節(jié)將在1年和2年內(nèi)癌變,其準(zhǔn)確度分別為80%和79%[24]。
基于低劑量計(jì)算機(jī)斷層掃描(LDCT)圖像計(jì)算的放射學(xué)特征經(jīng)常用于肺癌的篩查和診斷,研究表明[4],與分子或血液測(cè)試不同,該方法支持早期發(fā)現(xiàn)肺癌。全國(guó)肺部篩查試驗(yàn)證明了放射性組學(xué)在早期發(fā)現(xiàn)惡性肺結(jié)節(jié)方面的有效性,篩查組與肺癌相關(guān)的死亡人數(shù)比對(duì)照組低20%[25]。有研究證明放射線學(xué)是區(qū)分惡性腫瘤和良性腫瘤的有效工具,其準(zhǔn)確度為79.06%,靈敏度為78.00%,特異性為76.11%[26]。在另一項(xiàng)研究中[27],提供了53個(gè)特征的放射性標(biāo)記,可以對(duì)惡性結(jié)節(jié)和良性結(jié)節(jié)進(jìn)行分類(lèi),其曲線下面積(AUC)等于72%。
3、深度學(xué)習(xí)在肺結(jié)節(jié)分類(lèi)及早期肺癌篩查中的應(yīng)用
深度學(xué)習(xí)(DL)算法的發(fā)展使機(jī)器能夠處理高維數(shù)據(jù),例如多維解剖圖像和視頻,DL是ML的一個(gè)子領(lǐng)域,它描述了受人腦結(jié)構(gòu)和功能啟發(fā)的學(xué)習(xí)算法[13]。多年來(lái),隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,已經(jīng)開(kāi)發(fā)了不同的深度學(xué)習(xí)技術(shù)[28],例如卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN),生成對(duì)抗模型(GAN),深度自動(dòng)編碼器(DAN),卷積自動(dòng)編碼器(CAE),遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RNN),等。近年來(lái),深度學(xué)習(xí)方法已應(yīng)用于胸腔成像的多個(gè)方面,比如量化彌漫性肺部疾病、結(jié)核或肺炎的檢測(cè)以及肺結(jié)節(jié)的評(píng)估,而DL在胸腔成像中最常見(jiàn)的用途是此時(shí)的肺結(jié)節(jié)評(píng)估[3]。DL在肺結(jié)節(jié)分類(lèi)中的使用比較研究表明,其優(yōu)于標(biāo)準(zhǔn)ML技術(shù)。有研究在2017年推出了一種基于Lung-RADS的DL系統(tǒng),該系統(tǒng)在結(jié)節(jié)分類(lèi)性能上超過(guò)了傳統(tǒng)的ML,同時(shí)保持觀察者間的可變性可與四個(gè)有經(jīng)驗(yàn)的人類(lèi)觀察者相提并論[29]。在2018年,研究報(bào)道了一種通用的DL系統(tǒng),它有可能成為肺癌檢測(cè)的有價(jià)值的工具,因?yàn)樗趨^(qū)分惡性結(jié)節(jié)和良性結(jié)節(jié)方面達(dá)到了91.2%的準(zhǔn)確率[30]。 在2019年,研究報(bào)道了一個(gè)DL網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)使用深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DCNN)研究了CT圖像中肺結(jié)節(jié)的自動(dòng)分類(lèi),結(jié)果顯示可以區(qū)分出66.7%的良性結(jié)節(jié)和93.9%的惡性結(jié)節(jié)[31]。。
深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)已成功用于許多與自動(dòng)圖像識(shí)別相關(guān)的應(yīng)用中,在分析肺癌圖像時(shí),深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)主要用于執(zhí)行兩項(xiàng)關(guān)鍵任務(wù):(I)肺結(jié)節(jié)的檢測(cè)和分割;(II)肺結(jié)節(jié)的分類(lèi)[32]。有研究[33]描述了一種基于多模式稀疏表示的分類(lèi)(mSRC)方法來(lái)診斷肺癌,他們的研究捕獲了穿刺活檢標(biāo)本,并自動(dòng)分割了4372個(gè)細(xì)胞核區(qū)域以進(jìn)行肺癌分類(lèi),并且平均達(dá)到了88.10%的分類(lèi)準(zhǔn)確率。有研究報(bào)道[34] 了一種基于CT掃描圖像的肺癌自動(dòng)檢測(cè)方法,作者使用了優(yōu)化的集成學(xué)習(xí)廣義神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DAELGNN),獲得了超過(guò)99%的分類(lèi)精度。有研究[28]描述了一種基于肺癌的診斷方法,該方法基于使用CNN的基于感興趣結(jié)節(jié)區(qū)域(ROI)的特征學(xué)習(xí),他們從肺圖像數(shù)據(jù)庫(kù)協(xié)會(huì)(LIDC)和傳染病研究所(IDRI)數(shù)據(jù)庫(kù)中收集了CT掃描圖像,并利用生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)生成了其他圖像以增加樣本量,他們使用基于CNN的分類(lèi)算法實(shí)現(xiàn)了93.9%的分類(lèi)精度。美國(guó)學(xué)者描述了一種基于CT掃描圖像的肺結(jié)節(jié)檢測(cè)方法,采用的是輕型CNN體系結(jié)構(gòu),經(jīng)過(guò)對(duì)LIDC數(shù)據(jù)集的測(cè)試,他們的模型在區(qū)分正常,良性和惡性病例的同時(shí),實(shí)現(xiàn)了97.9%的分類(lèi)準(zhǔn)確率[35]。
需要診斷自動(dòng)檢測(cè)到的肺結(jié)節(jié),以確定它們是惡性還是良性的,此過(guò)程最初由CAD系統(tǒng)執(zhí)行,現(xiàn)在已成為深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一項(xiàng)任務(wù)。研究報(bào)道[36]了使用定制混合鏈接網(wǎng)絡(luò)(CMixNet)架構(gòu)的深度學(xué)習(xí)模型,結(jié)合臨床因素來(lái)檢測(cè)結(jié)節(jié),可以降低肺癌早期階段的假陽(yáng)性率和誤診率,并且發(fā)現(xiàn)具有更高的敏感性和特異性。有研究[37]提出了一種通過(guò)將手工制作的特征(HF)與三維(3D)深層卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)派生的特征融合來(lái)預(yù)測(cè)具有更高敏感性和特異性的肺結(jié)節(jié)惡性腫瘤的算法,該融合算法克服了HF的缺點(diǎn),與其他競(jìng)爭(zhēng)性分類(lèi)模型相比,發(fā)現(xiàn)其具有最高的AUC,靈敏度,特異性和準(zhǔn)確性。有研究報(bào)道[38]了一種基于螢火蟲(chóng)群優(yōu)化(GSO)的肺癌預(yù)測(cè)方法,該方法使用了多個(gè)來(lái)源的圖像,他們選擇了遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RNN)作為他們的學(xué)習(xí)算法,并獲得了最高98%的準(zhǔn)確性。有研究表明使用CNN模型的深度學(xué)習(xí)方法能夠成功地檢測(cè)出腫瘤,在檢測(cè)肺癌中具有0.93的敏感性,0.82的精確度,并且能夠?qū)ο侔Ⅶ[狀細(xì)胞癌進(jìn)行區(qū)分[39]。
4、總結(jié)
綜上所述,人工智能一直被證明是一個(gè)有前途的進(jìn)步,幾乎所有研究都得出結(jié)論,將AI納入胸部放射學(xué)領(lǐng)域?qū)⑼ㄟ^(guò)更早,準(zhǔn)確地檢測(cè)出肺癌,從而改善患者的護(hù)理及預(yù)后。由于更好的辨別力和對(duì)更大比例的肺結(jié)節(jié)的評(píng)估,可以減少遺漏的癌癥。各種人工智能算法的發(fā)展有益于各種條件下的胸腔成像。目前,肺結(jié)節(jié)的分類(lèi)及其早期肺癌的診斷問(wèn)題仍未完全解決,多年來(lái),雖然存在基于放射學(xué)和深度學(xué)習(xí)的方法為代表的許多計(jì)算機(jī)輔助的檢測(cè)系統(tǒng)及各類(lèi)技術(shù)。但是,此類(lèi)方法的金標(biāo)準(zhǔn)尚未完全建立,如果能夠?qū)⒎派鋵W(xué)和深度學(xué)習(xí)技術(shù)成功結(jié)合,那么我們相信將為放射科醫(yī)生提供一個(gè)強(qiáng)大,靈敏,準(zhǔn)確的計(jì)算機(jī)輔助診斷工具來(lái)用于肺結(jié)節(jié)的分類(lèi)及早期肺癌的篩查及診斷。通過(guò)早期篩查、診斷,適當(dāng)?shù)闹委?,從而帶?lái)更好的患者預(yù)后,這具有重要的臨床價(jià)值。
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作者簡(jiǎn)介:李娟娟,(1992-)女,漢族,云南大理,碩士,研究方向:醫(yī)學(xué)影像診斷、技術(shù)與人工智能。
【基金項(xiàng)目】祥云縣級(jí)科研立項(xiàng)項(xiàng)目,編號(hào):DX2020SF15