尚慶毅,梁偉
(1.贛榆區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇連云港 222100;2.連云港市第二人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)科,江蘇連云港 222023)
食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)是一種來(lái)源于食管鱗狀上皮黏膜細(xì)胞的惡性腫瘤,具有高侵襲性[1]。ESCC的轉(zhuǎn)移及復(fù)發(fā)是導(dǎo)致患者病死率升高的最主要原因[2],深入研究ESCC的發(fā)病機(jī)制及分子作用機(jī)制,對(duì)ESCC的早期診斷及預(yù)后判斷具有重要的臨床意義。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一類(lèi)長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸、無(wú)編碼能力的RNA分子,在調(diào)控機(jī)體表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄后加工等過(guò)程中發(fā)揮重要作用,近年來(lái),LncRNA在腫瘤進(jìn)展過(guò)程中的作用備受關(guān)注[3]。目前研究發(fā)現(xiàn),LncRNA linc00342在多種惡性腫瘤中表達(dá)上調(diào),并可通過(guò)激活信號(hào)通路或分子機(jī)制參與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[4-5]。然而LncRNA linc00342在ESCC中的表達(dá)情況目前尚不清楚。因此,本研究通過(guò)檢測(cè)ESCC患者組織中LncRNA linc00342的表達(dá)水平,分析其與患者臨床病理參數(shù)及預(yù)后的關(guān)系,初步討論其臨床意義。
1.1一般資料 選取2015年6月至2016年9月于贛榆區(qū)人民醫(yī)院接受ESCC根治術(shù)的89例ESCC患者癌組織及對(duì)應(yīng)的癌旁食管鱗狀上皮黏膜組織(距離癌組織>5 cm,且經(jīng)病理組織學(xué)證實(shí)無(wú)癌細(xì)胞)標(biāo)本為研究對(duì)象,術(shù)中獲取標(biāo)本立即置入液氮中保存。所有患者均經(jīng)消化內(nèi)鏡活檢或病理組織檢查確診,術(shù)前未接受任何放療、化療或抗腫瘤藥物等治療。排除合并其他惡性腫瘤或伴發(fā)器質(zhì)性損傷疾病或系統(tǒng)性疾病,如高血壓、糖尿病、慢性腎病等。89例ESCC患者中男51例,女38例,年齡46~82歲,中位年齡64歲,其中年齡<64歲43例,≥64歲46例;腫瘤位置:胸上段34例,胸中段29例,胸下段26例;分化程度:中分化或高分化49例,低分化或未分化40例;TNM分期:Ⅰ~Ⅱ期36例,Ⅲ~Ⅳ期53例;發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移47例,淋巴結(jié)無(wú)轉(zhuǎn)移42例。同時(shí)收集患者隨訪資料,隨訪截止日期為2020年9月30日,隨訪時(shí)間8~59個(gè)月,中位隨訪時(shí)間28個(gè)月,分析ESCC患者總生存時(shí)間。本研究獲得贛榆區(qū)人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(批準(zhǔn)文號(hào):No.150024),患者及家屬均知情同意。
1.2主要儀器及試劑 Trizol裂解液、SYBR Premix Ex Taq Ⅱ試劑盒(日本TaKaRa公司),逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(美國(guó)Applied Biosystem公司)。7500 Real-Time PCR系統(tǒng) (美國(guó)ABI公司),UV 240紫外可見(jiàn)分分光度計(jì)(日本島津公司),Bio-Rad PCR擴(kuò)增儀(美國(guó)伯樂(lè)公司)。
1.3方法
1.3.1RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng) 取手術(shù)切除的組織樣本,加入2 mL Trizol裂解液后在冰面上研磨,充分研磨成勻漿,提取組織中的總RNA,利用UV 240紫外可見(jiàn)分光度計(jì)檢測(cè)總RNA純度和濃度,以吸光度(A260/280 nm)值在1.8~2.2之間為純度較好。提取的DNA置于-80 ℃保存。按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。以上操作均按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。
1.3.2引物設(shè)計(jì)及qRT-PCR LncRNA linc00342及GAPDH引物序列參照文獻(xiàn)[6]設(shè)計(jì),linc00342上游引物序列:5′-CGTTCCAATGTGTTGGGT-3′,下游引物序列:5′-TGGGAGGAGGTTGAGATG-3′;GAPDH上游引物序列:5′-CACCCACTCCTCCACCTTTG-3′,下游引物序列:5′-CCACCACCCTGTTGCTGTAG-3′。采用SYBR Premix Ex Taq Ⅱ試劑盒及ABI 7500 Real-Time PCR系統(tǒng)進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng)。qRT-PCR總反應(yīng)體系共20 μL,包括SYBR Green qPCR Mix 10 μL,cDNA 2 μL,10 μmol/L上、下游引物各1 μL,ddH2O 6 μL。PCR循環(huán)參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃ 45 s,60 ℃ 34 s,共40個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。采用2-△△Ct法計(jì)算LncRNA linc00342相對(duì)表達(dá)水平。
1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 25.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)的錄入與分析。計(jì)數(shù)資料以n或%表示,生存分析采用Kaplan-Meier法,組間生存差異采用對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)(Log-Rank test);利用ROC曲線評(píng)估LncRNA linc00342的表達(dá)水平對(duì)ESCC患者的預(yù)測(cè)價(jià)值。多因素Cox回歸分析影響ESCC患者預(yù)后不良的危險(xiǎn)因素分析。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1LncRNA linc00342在ESCC患者組織中的表達(dá)量 ESCC患者癌組織和癌旁組織中LncRNA linc00342的相對(duì)表達(dá)量分別為3.16±1.27、1.64±0.51,兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=10.478,P<0.001)。
2.2LncRNA linc00342表達(dá)與ESCC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系 LncRNA linc00342的表達(dá)水平與ESCC患者年齡、性別、腫瘤位置、分化程度無(wú)關(guān)(P>0.05),而與TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P<0.05)。見(jiàn)表1。
表1 LncRNA linc00342表達(dá)與ESCC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系
2.3LncRNA linc00342預(yù)測(cè)ESCC的ROC曲線分析 以LncRNA linc00342的表達(dá)水平預(yù)測(cè)ESCC的ROC曲線下面積(AUCROC)為0.903(95%CI:0.874~0.938,P<0.001),當(dāng)cut-off值為2.33時(shí),其敏感性為80.90%,特異性為89.13%,約登指數(shù)為0.730。見(jiàn)圖1。
圖1 LncRNA linc00342預(yù)測(cè)ESCC的ROC曲線
2.4LncRNA linc00342表達(dá)與ESCC患者生存時(shí)間的關(guān)系 根據(jù)ESCC組織中LncRNA linc00342表達(dá)水平的中位數(shù)(3.03)將ESCC患者分為高表達(dá)組(46例)和低表達(dá)組(43例),生存分析結(jié)果顯示,LncRNA linc00342高表達(dá)患者累積生存率為21.74%,平均生存時(shí)間25.5個(gè)月(95%CI:20.247~30.753);LncRNA linc00342低表達(dá)患者累積生存率為55.81%,平均生存時(shí)間44.86個(gè)月(95%CI:39.83~49.89),兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Log-rankχ2=20.896,P=0.000)。見(jiàn)圖2。
圖2 LncRNA linc00342表達(dá)水平與ESCC患者生存時(shí)間的關(guān)系
2.5影響ESCC患者預(yù)后不良的單因素分析 單因素分析結(jié)果顯示,TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及LncRNA linc00342表達(dá)水平是影響ESCC患者預(yù)后不良的危險(xiǎn)因素(P<0.05)。見(jiàn)表2。
表2 影響ESCC患者預(yù)后不良的單因素分析[n(%)]
2.6影響ESCC患者預(yù)后不良的多因素Cox回歸分析 多因素Cox回歸分析結(jié)果顯示,臨床分期為Ⅲ~Ⅳ期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、LncRNA linc00342高表達(dá)是影響ESCC患者預(yù)后不良的獨(dú)立預(yù)測(cè)因素(P<0.05)。見(jiàn)表3。
表3 影響ESCC患者預(yù)后不良的多因素Cox回歸分析
近年來(lái),LncRNA在ESCC中的作用越來(lái)越受到重視。研究表明,多種LncRNAs在ESCC組織中呈異常表達(dá),可參與癌癥的轉(zhuǎn)移侵襲,并可能成為潛在的治療靶標(biāo)[7]。楊毅等[8]利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),LncRNA linc00152在ESCC組織中的表達(dá)顯著上調(diào),其表達(dá)量與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),并對(duì)ESCC轉(zhuǎn)移具有較高診斷價(jià)值,提示LncRNA linc00152可能是ESCC轉(zhuǎn)移及預(yù)后判斷的新的生物學(xué)指標(biāo)。
本研究結(jié)果顯示,LncRNA linc00342在ESCC患者癌組織中的表達(dá)水平顯著高于癌旁組織,表明LncRNA linc00342在ESCC組織中呈高表達(dá),可能發(fā)揮癌基因作用。另有研究發(fā)現(xiàn)[9],在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者組織和血清中LncRNA linc00342表達(dá)上調(diào),其高表達(dá)與較差的總生存期相關(guān),并進(jìn)一步證實(shí)其可通過(guò)PTEN和p53通路富集,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖,發(fā)揮癌基因作用。近年來(lái),LncRNA linc00342在消化道腫瘤中的作用逐漸受到人們關(guān)注。曾偉等[10]利用基因芯片重注釋發(fā)現(xiàn)LncRNA linc00342與肝細(xì)胞癌術(shù)后復(fù)發(fā)顯著相關(guān),并利用基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)與功能富集分析發(fā)現(xiàn)LncRNA linc00342主要富集到“細(xì)胞周期”相關(guān)生物學(xué)功能與通路,提示LncRNA linc00342可能參與消化道腫瘤細(xì)胞周期紊亂而導(dǎo)致的惡性增殖。結(jié)合ESCC患者臨床病理資料推測(cè),LncRNA linc00342可能由于ESCC細(xì)胞周期紊亂而發(fā)生異常表達(dá),并與TNM分期及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)。
本研究利用ESCC組織中LncRNA linc00342的表達(dá)水平預(yù)測(cè)ESCC的ROC曲線下面積為0.903,提示LncRNA linc00342對(duì)ESCC具有較高的預(yù)測(cè)價(jià)值,由于本研究納入的病例數(shù)較少,仍需更大樣本量進(jìn)行驗(yàn)證。此外,生存分析結(jié)果顯示,LncRNA linc00342高表達(dá)患者的5年累積生存率明顯低于低表達(dá)患者。進(jìn)一步行單因素分析和Cox回歸分析顯示,TNM分期為Ⅲ~Ⅳ期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及LncRNA linc00342高表達(dá)是影響ESCC患者預(yù)后不良的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,提示LncRNA linc00342可能作為預(yù)測(cè)ESCC患者預(yù)后的潛在生物學(xué)指標(biāo)。
綜上所述,ESCC組織中LncRNA linc00342呈高表達(dá),其表達(dá)水平與腫瘤TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),LncRNA linc00342表達(dá)水平升高提示ESCC患者預(yù)后不良風(fēng)險(xiǎn)增加,可能作為預(yù)測(cè)ESCC淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及預(yù)后不良的潛在生物學(xué)指標(biāo),但其中具體的作用機(jī)制有待進(jìn)一步研究。