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        云南省怒江州部分地區(qū)獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)感染情況及基因分型研究

        2021-05-12 06:25:14岳鳳嬌李海龍
        關(guān)鍵詞:獨(dú)龍獨(dú)龍江怒江州

        岳鳳嬌,羅 瀟,2,李海龍,3*

        (1.大理大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院寄生蟲(chóng)學(xué)教研室,云南大理 671000;2.云南昆明血液中心,云南昆明 650000;3.云南省自然疫源性疾病防控技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南大理 671000)

        微孢子蟲(chóng)(Micosporidia)是一種廣泛分布于世界各地的細(xì)胞內(nèi)寄生的真核生物,宿主范圍廣,從無(wú)脊椎動(dòng)物到脊椎動(dòng)物均可感染[1-2]。目前,已報(bào)道的微孢子蟲(chóng)有1 400多種,150多個(gè)屬,已鑒定出9個(gè)屬的17種微孢子蟲(chóng)可感染人類[3-4]。其中畢氏腸微孢子蟲(chóng)(Enterocytozoonbieneusi)是人和其他哺乳動(dòng)物最為常見(jiàn)的微孢子蟲(chóng)種類,是一種重要的人獸共患病原體[5]。畢氏腸微孢子蟲(chóng)分布極為廣泛,傳播方式多樣,受污染的食物和水是感染的主要途徑,免疫力正常人群或動(dòng)物感染后常表現(xiàn)為食欲減退、輕中度腸痙攣和自限性腹瀉;而免疫力低下者感染后表現(xiàn)為重度腸痙攣和長(zhǎng)期腹瀉,嚴(yán)重者會(huì)危及生命[6-7]。

        獨(dú)龍牛又名“大額牛”(Bosfrontalis),為我國(guó)云南省怒江州所獨(dú)有的珍稀牛品種,已被列入國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保護(hù)名錄和瀕危野生動(dòng)植物種國(guó)際貿(mào)易公約(2013年)[8-9]。在我國(guó),獨(dú)龍牛僅分布在云南省怒江州獨(dú)龍江和怒江流域(分別位于貢山獨(dú)龍族怒族自治縣和福貢縣)的山區(qū),地處偏遠(yuǎn),飼養(yǎng)方式為半野生、半家養(yǎng)(定期喂食鹽),寄生蟲(chóng)防治措施相對(duì)滯后[10]。獨(dú)龍牛生活的這兩大流域是當(dāng)?shù)鼐用耧嬘盟蜕钣盟闹饕獊?lái)源,若被獨(dú)龍牛人獸共患腸道寄生蟲(chóng)污染水源,可能導(dǎo)致嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問(wèn)題。本研究利用分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)云南省怒江州獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)的感染情況進(jìn)行了調(diào)查研究,以期為獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)病的防控提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣本來(lái)源 2017年9月至2018年9月采集自云南省怒江州不同地理位置的獨(dú)龍牛糞便樣本1 129份(鳩門當(dāng)218份,亞左洛村231份,古泉村220份,獨(dú)龍江鄉(xiāng)226份,茨開(kāi)鎮(zhèn)234份),將采集到的糞便樣本即時(shí)送回實(shí)驗(yàn)室,置-20℃保存。

        1.1.2 主要試劑 2×TaqPCR MasterMix、6×Loading Buffer購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;瓊脂糖、DNA Marker DL 500購(gòu)自TaKaRa公司;糞便DNA抽提試劑盒(stool)購(gòu)自O(shè)MEGA公司。

        1.1.3 主要儀器 TGyrate Basic渦旋混勻儀(OSE-VX-01),天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品;高速冷凍離心機(jī)(5427R),德國(guó)Eppendorf公司產(chǎn)品;PCR擴(kuò)增儀(C-XP-D),杭州博日科技有限公司產(chǎn)品;穩(wěn)壓電泳儀(EPS300),上海天能公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        1.2.1 樣本DNA提取 取糞便樣本20 g加水混勻,用60目篩網(wǎng)過(guò)濾去除雜質(zhì),3 000 r/min離心5 min,棄去上清,取沉淀嚴(yán)格按照糞便DNA提取試劑盒使用說(shuō)明書(shū)提取糞便樣本DNA,置-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)畢氏腸微孢子蟲(chóng)ITS基因,參考Zhang X X等[11]報(bào)道的序列進(jìn)行引物設(shè)計(jì),利用套式PCR對(duì)樣本DNA進(jìn)行擴(kuò)增,引物序列見(jiàn)表1。

        表1 畢氏腸微孢子蟲(chóng)套式PCR引物

        1.2.3 套式PCR檢測(cè) 反應(yīng)體系和循環(huán)參數(shù)參照Z(yǔ)hang X X等[11]方法,套式PCR經(jīng)兩輪反應(yīng),反應(yīng)體系均為25 μL。第一輪PCR反應(yīng)體系為:2×TaqPCR MasterMix 12.5 μL,上游引物(F1)和下游引物(R1)各為0.25 μL,樣本DNA 2 μL,ddH2O 為10 μL;反應(yīng)條件為:預(yù)變性94℃ 5 min,35個(gè)循環(huán)(94℃ 45 s,55℃ 45 s,72℃ 1 min),最后72℃延伸10 min。第二輪PCR反應(yīng)體系為:2×TaqPCR MasterMix 12.5 μL,上游引物(F2)和下游引物(R2)均為0.25 μL,第一輪PCR產(chǎn)物2 μL,ddH2O為10 μL;反應(yīng)條件為:預(yù)變性94℃ 5 min,35個(gè)循環(huán)(94℃ 45 s,55℃ 45 s,72℃ 40 s),最后72℃延伸10 min,結(jié)束反應(yīng)。

        1.2.4 PCR終產(chǎn)物檢測(cè)與測(cè)序 取6 μL PCR終產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,并使用凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)檢測(cè)結(jié)果,將擴(kuò)增呈陽(yáng)性的PCR產(chǎn)物送至寶生物工程(大連)有限公司進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序結(jié)果利用NCBI網(wǎng)站進(jìn)行Blast序列比對(duì)和同源性分析,并使用MEGA 6進(jìn)化分析軟件,選取Kimura雙參數(shù)模型,bootstrap值設(shè)定為1 000,繪制系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行蟲(chóng)種鑒定。

        1.2.5 統(tǒng)計(jì)分析 分別按流域、季節(jié)、采樣點(diǎn)的不同計(jì)算獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)感染率,采用SPSS軟件進(jìn)行卡方檢驗(yàn)(P<0.05表示差異顯著),對(duì)5個(gè)地點(diǎn)之間獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)陽(yáng)性率進(jìn)行兩兩比較。

        2 結(jié)果

        2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果

        采集到的1 129份獨(dú)龍牛糞便樣品中,經(jīng)套式PCR檢測(cè),共有19份為畢氏腸微孢子蟲(chóng)陽(yáng)性樣本,電泳得到的條帶大小約392 bp(圖1)。

        M.DNA標(biāo)準(zhǔn)DL 500;1~8.陽(yáng)性樣本;9~10.陰性樣本;11~12.陽(yáng)性對(duì)照;13~14.陰性對(duì)照

        2.2 獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)檢測(cè)結(jié)果

        1 129份獨(dú)龍牛糞便中,經(jīng)套式PCR檢測(cè),總感染率為1.68%(19/1 129,95% CI 0.93%~2.43%)。各采樣點(diǎn)畢氏腸微孢子蟲(chóng)陽(yáng)性率如表2所示,5個(gè)點(diǎn)之間兩兩比較,獨(dú)龍江鄉(xiāng)的陽(yáng)性率明顯高于鳩門當(dāng)?shù)年?yáng)性率,差異顯著(P<0.05)。根據(jù)5個(gè)采樣點(diǎn)的所在流域不同(獨(dú)龍江鄉(xiāng)位于獨(dú)龍江流域,其他4個(gè)點(diǎn)位于怒江流域),獨(dú)龍江流域(3.54%,8/226)顯著高于怒江流域(1.22%,11/903)(P<0.05)。4個(gè)季度夏季感染率最高(3.26%,9/276),春、秋、冬3個(gè)季度感染率分別為1.10%(3/272)、1.28%(4/312)、1.12%(3/269),經(jīng)比較,季節(jié)影響因素?zé)o顯著差異(P>0.05)。

        表2 不同地點(diǎn)間陽(yáng)性檢出率和基因型分布

        2.3 ITS基因結(jié)果分析

        通過(guò)對(duì)19份陽(yáng)性樣本的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行Blast比對(duì),結(jié)果獲得6種有差異的DNA序列(上傳GenBank號(hào)為:MK389483~MK389488)。用MEGA6軟件構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),得到6種基因型,分別是EbpC(n=6)、BEB4(n=4)、CHN3(n=3)、CHN4(n=4)、YNNJ1(n=1)、YNNJ2(n=1)?;贗TS序列構(gòu)建的種系發(fā)育進(jìn)化樹(shù)(圖2)表明,EbpC、CHN3、CHN4、YNNJ1和YNNJ2均屬于Group1;BEB4被分到Group2中。檢測(cè)的樣品中已知基因型(圖中■表示)和新基因型(圖中●表示)均為人獸共患基因型。

        圖2 基于ITS基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

        3 討論

        畢氏腸微孢子蟲(chóng)宿主范圍較為廣泛,是一類能夠感染人類及各種動(dòng)物的寄生性腸道原蟲(chóng)[6]。目前,對(duì)于獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)的檢測(cè)國(guó)內(nèi)外未見(jiàn)相關(guān)報(bào)道。本研究利用分子生物學(xué)技術(shù)所測(cè)得獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)總感染率為1.68%,低于國(guó)內(nèi)其他牛品種的感染率(廣東奶牛犢15.7%,青海牦牛7.03%,新疆奶牛犢16.5%,上海牛犢26.5%)[12-15],以及國(guó)外報(bào)道的美國(guó)東部奶牛23.0%、美國(guó)東部斷奶后犢牛13.0%、巴西肉牛17.5%、澳大利亞犢牛10.4%[16-19]。本文中獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)感染率相對(duì)較低,這可能與當(dāng)?shù)氐臍夂?、地理位置及?dú)特的飼養(yǎng)方式有關(guān)。

        本研究通過(guò)套式PCR對(duì)畢氏腸微孢子蟲(chóng)ITS基因序列進(jìn)行測(cè)序分析,共發(fā)現(xiàn)6種基因型。EbpC是畢氏腸微孢子蟲(chóng)主要基因型,不僅在家畜、野生動(dòng)物中有分布,在人群中也有發(fā)現(xiàn),分布較為廣泛[20-21]。數(shù)據(jù)分析表明,BEB4基因型為反芻動(dòng)物特異性的基因型,已出現(xiàn)宿主范圍擴(kuò)增現(xiàn)象,具有人獸共患潛力。Zhang X等[22]在人和牛的樣本中同時(shí)發(fā)現(xiàn)了畢氏腸微孢子蟲(chóng)CHN3和CHN4基因型,證明這2種基因型為人獸共患基因型。從同源性角度分析,本試驗(yàn)所得YNNJ1和YNNJ2兩種新基因型與EbpC基因型相近,為人獸共患基因型。本次研究新基因型的發(fā)現(xiàn),豐富了該蟲(chóng)種的基因型數(shù)據(jù),為怒江州獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)病的進(jìn)一步研究提供了參考依據(jù)。

        獨(dú)龍牛有著良好的肉牛體型,肉質(zhì)細(xì)嫩,具有很高的遺傳資源價(jià)值與經(jīng)濟(jì)利用價(jià)值。畢氏腸微孢子蟲(chóng)作為導(dǎo)致牛腹瀉的常見(jiàn)病原,可阻礙其養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展。本研究結(jié)果顯示,怒江州獨(dú)龍牛存在人獸共患基因型的畢氏腸微孢子蟲(chóng)感染,各個(gè)地點(diǎn)之間差異顯著,不同區(qū)域是畢氏腸微孢子蟲(chóng)感染的風(fēng)險(xiǎn)因素,獨(dú)龍江鄉(xiāng)感染風(fēng)險(xiǎn)較高;對(duì)兩大流域的調(diào)查結(jié)果進(jìn)行分析,怒江州獨(dú)龍牛畢氏腸微孢子蟲(chóng)的感染主要發(fā)生在獨(dú)龍江流域,當(dāng)?shù)貞?yīng)增強(qiáng)防范意識(shí),加強(qiáng)對(duì)水源的管理,及時(shí)做好防控工作,減少人與動(dòng)物互感的可能。

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