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        胃癌中DNA甲基化對miR-200c 141表達(dá)組分析

        2021-04-25 02:07:40張睿張郭亮王飛娟
        貴州醫(yī)藥 2021年3期
        關(guān)鍵詞:甲基化標(biāo)本引物

        張睿 張郭亮 王飛娟

        (銅川市人民醫(yī)院,1.腫瘤科;2.重癥科,陜西 銅川 727000)

        miRNA在腫瘤因子的萌芽、發(fā)展以及轉(zhuǎn)歸的過程中起著巨大的作用,為醫(yī)學(xué)界對腫瘤的研究提供了新思路、新方向[1-2]。竇維佳等[3]研究中表明miR-200c與miR-141在結(jié)腸癌組織中具有增加癌細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移能力的作用。近年來,隨著科技的迅速發(fā)展,對于腫瘤疾病的靶基因預(yù)測數(shù)據(jù)庫的更新?lián)Q代速度也在逐步加快,腫瘤疾病的研究也在不斷深入[4]。然而,目前醫(yī)學(xué)界仍尚未明確miR-NAs自身的調(diào)控機(jī)制[5]。近期有學(xué)者在研究中指出,DNA甲基化通過調(diào)節(jié)miR-200 c以及miR-141的水平對于一些腫瘤因子和正常細(xì)胞的表達(dá)起著重要的作用,但是在胃癌中表達(dá)的調(diào)控機(jī)制上不明確[6]。鑒于此,本次研究旨在為臨床研究miR-200 c/141在胃癌中表達(dá)的調(diào)控機(jī)制提供參考依據(jù)。報(bào)告如下。

        1 資料與方法

        1.1一般資料 選取我院2018年2月至2019年2月收治的58例胃癌患者納入至本次調(diào)研中,所有患者均接受胃癌根治術(shù)治療,且術(shù)前為接受任何放化療或新輔助治療。收集患者非壞死部分的腫瘤組織以及距腫瘤組織5 cm以上的癌旁組織作為檢測標(biāo)本,樣本收集完成后全部放置在凍存管中進(jìn)行保存。收集患者的相關(guān)病例資料,在收集的過程中發(fā)現(xiàn)有1例患者的數(shù)據(jù)資料遺漏,58例患者中男性45例,女性12例;年齡42~76歲,平均(54.73±2.56)歲。

        1.2檢測所用試劑 Trizol試劑、GoTaq? Hot Start Green Master Mix、GoTaq? qPCR Master Mix以及逆轉(zhuǎn)錄試劑盒均來自于上海玉博生物科技有限公司。

        1.3方法

        1.3.1PCR擴(kuò)增 實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)人員按照GoTaq? Hot Start Green Master Mix的說明書進(jìn)行操作,將通過亞硫酸鹽處理后的DNA作為試驗(yàn)?zāi)0?,進(jìn)行PCR反應(yīng)檢測。檢驗(yàn)結(jié)果顯示miR-200 c/141-M(miR-200 c/141甲基化引物)上游引物為:5′-GTAAATCGGTGTGTGTCGCGGGTCG-3′;下游引物為:5′-CAAACCCTCCGAAACCCCTCGACCG-3′。miR-200 c/141-UM(miR-200 c/141非甲基化引物)上游引物為:5′-GTAAATTGGTGTGTGTTGTGGGTTG-3′;下游引物為5′-CAAACCCTCCAAAACCCCTCAACCA-3′。所有檢測標(biāo)本皆設(shè)置為空白對照,采用2.0%瓊脂糖凝膠將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳,觀察軟件掃描結(jié)果,判斷甲基化率。

        1.3.2實(shí)時熒光定量PCR 利用Trizol試劑提取胃癌組織或癌細(xì)胞中的RNA,并進(jìn)行相關(guān)檢測,利用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將miRNA或mRNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。然后根據(jù)GoTaq? qPCR Master Mix說明書中所提供的內(nèi)容調(diào)配反應(yīng)溶劑,然后根據(jù)PCR反應(yīng)溶劑檢測情況判斷檢測結(jié)果。檢測中應(yīng)用到的特異引物為:hsa-miR-200 c-RT:GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGATCCATC;hsa-miR-200 c-Forward:GGCCTAATACTGCCGGGTAAT;hsa-miR-141-RT:GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACCATCT;hsa-miR-141-Forward:CCCGGGTAACACTGTCTGGTAA。

        1.4觀察指標(biāo) (1)觀察并分析miR-200 c以及miR-141在胃癌組織中的表達(dá)水平情況;(2)統(tǒng)計(jì)所有胃癌患者標(biāo)本中miR-200 c/141CpG島的甲基化水平;(3)分析miR-200 c/141CpG島的甲基化水平與miR-200 c以及miR-141之間的關(guān)系。

        1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS21.0分析,計(jì)數(shù)資料miR-200 c以及miR-141在胃癌組織中的表達(dá)水平、所有胃癌患者標(biāo)本中miR-200 c/141CpG島的甲基化水平,經(jīng)χ2檢驗(yàn),以%表示,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義為P<0.05。

        2 結(jié) 果

        2.1miR-200 c以及miR-141在胃癌組織中的表達(dá)水平情況對比 58例胃癌患者標(biāo)本中(1例數(shù)據(jù)資料遺漏),miR-200 c和miR-141的表達(dá)下調(diào)例數(shù)分別是44例、42例,占比為77.19%、73.68%,通過觀察可知,較之于癌旁組織標(biāo)本,胃癌組織中的miR-200 c和miR-141的表達(dá)有明顯下降(P<0.05)。見圖1。

        圖1 miR-200 c以及miR-141在胃癌組織中的表達(dá)水平情況對比

        2.2所有胃癌患者標(biāo)本中miR-200 c/141CpG島的甲基化水平情況對比 58例胃癌患者標(biāo)本中(1例數(shù)據(jù)資料遺漏),miR-200 c/141CpG島的甲基化水平上升的例數(shù)為47例,占比為82.46%;通過觀察可知,較之于癌旁組織標(biāo)本,胃癌組織中的miR-200 c/141CpG島的甲基化水平有明顯上升(P<0.05)。見圖2。

        圖2 所有胃癌患者標(biāo)本中miR-200 c/141CpG島的甲基化水平情況對比

        2.3miR-200 c/141CpG島的甲基化水平與miR-200 c以及miR-141之間的關(guān)系 miR-200 c/141CpG島的甲基化水平與miR-200 c/141表達(dá)水平為負(fù)相關(guān)關(guān)系。

        3 討 論

        胃癌是臨床上常見的消化道腫瘤,具有高發(fā)病率、高死亡率等特點(diǎn)[7]。近年來我國胃腸疾病患者的數(shù)量不斷增加[8]。胃癌是胃腸疾病病變的終極表現(xiàn),也是最有可能導(dǎo)致人體死亡的疾病,此外有研究表明胃癌手術(shù)有可能因手術(shù)時間長、感染等因素誘發(fā)重癥肺炎、重癥腹腔感染,且入住重癥監(jiān)護(hù)室(ICU)后還有較高風(fēng)險發(fā)生ICU綜合征,嚴(yán)重影響了患者的生命安全[9]。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WTO)的調(diào)查結(jié)果顯示,東亞地區(qū)是全球胃癌疾病的高發(fā)區(qū)域,其中我國胃癌病死率接近與全球胃癌死亡人口的五分之二[10-11]。因此,如何改善胃癌患者的治療環(huán)境,降低胃癌患者的病死率成為我國乃至全球醫(yī)學(xué)界需要重點(diǎn)研究的問題[12]。近幾十年來,醫(yī)學(xué)界的工作人員通過不斷研究,發(fā)現(xiàn)了miRNAs在腫瘤的生長和發(fā)展過程中起著中要的作用,能有效抑制腫瘤因子的成長[13]。

        作為一種小分子非編碼RNA,miRNAs其種類多樣,其中最常見的是miR-200,而miR-200 c、miR-141是miR-200組合中的重要組成部分,其主要分布在人體的第12常染色體上[14]。本次研究結(jié)果表明miR-200 c與miR-141在胃癌組織中的表達(dá)有明顯的下降,這與李鷹飛等[15]研究報(bào)告中所述基本一致。這說明在胃癌疾病的生長發(fā)展過程中,miR-200 c與miR-141發(fā)揮著重要的作用,臨床醫(yī)生與學(xué)者可將miR-200 c與miR-141作為生物靶點(diǎn),為患者提供有效的抗腫瘤治療方案[16-17]。

        隨著醫(yī)學(xué)界對miRNAs的深入研究中發(fā)現(xiàn),人類miRNAs基因主要分布在染色體易位或染色體缺失的位置,且遺傳學(xué)因素是影響miRNAs的重要因素,其中DNA甲基化是主要影響因素[18]。本次研究結(jié)果表明胃癌組織中的miR-200 c/141CpG島的甲基化水平有明顯上升,miR-200 c/141CpG島的甲基化水平與miR-200 c/141表達(dá)水平為負(fù)相關(guān)關(guān)系,這與周欣亮等[19]人研究報(bào)告中所述基本一致。

        BS-MSP方法是比較新穎的基因甲基化檢測模式,具有耗時較短、檢測速度快、實(shí)用性強(qiáng)、靈敏度高、特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),可快速檢測出CpG位點(diǎn)中甲基化的狀況,在研究腫瘤相關(guān)表達(dá)調(diào)控機(jī)制中具有極大的現(xiàn)實(shí)意義,能夠較好的獲取CpG島中的相關(guān)遺傳學(xué)信息,使研究者可明確DNA甲基化在miR-200 c與miR-141中的作用[20-21]。

        綜上所述,在胃癌組織中,miR-200 c以及miR-141的水平隨著miR-200 c/141CpG島的甲基化水平的升高而降低。同時BS-MSP方法有利于研究者從分子水平領(lǐng)域探究胃癌疾病發(fā)展的病因,為臨床診治胃癌疾病提供依據(jù)和方向,可在臨床中推廣和廣泛使用。

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