張志博 張亞男 張笑 劉麗菲 贠娜娜 田慧敏
摘 要:從赤芍(Paeonia lactiflora Pall)植株根部分離到一株內(nèi)生真菌(編號Gen7).該菌菌絲無色,具隔膜,分生孢子梗短或無,分生孢子橢圓形初為無色,后為棕色;根據(jù)形態(tài)學(xué)特征鑒定為Coniella屬.基于ITS的BLAST檢索表明該菌株與Coniella fragariae相似度高達99.6%以上,鑒定為草莓墊殼孢Coniella fragariae (Oudem.)B.Sutton,該菌屬于半知菌門,球殼孢目spharropsidales,球殼孢科Sphaeropsidacea墊殼孢屬Coniella,為內(nèi)蒙古新記錄種,以黃瓜尖鐮孢菌Fusarium oxysporum f. sp.cucumerinum J.H.Owen、灰葡萄孢菌 Botrytis cinerea Pers和茄科勞爾氏菌Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi et al. 為材料,研究其抑菌活性,發(fā)現(xiàn)Coniella fragariae (Oudem.)B.Sutton對3種指示菌有不同程度的抑制作用,平均抑菌率分別達48.2%、43.1%和24.7%,該研究結(jié)果為內(nèi)生真菌分離培養(yǎng)鑒定提供研究提供方法,并為潛在生防菌的開發(fā)利用提供理論依據(jù).
關(guān)鍵詞:Coniella屬真菌;培養(yǎng)鑒定;抑菌活性
中圖分類號:Q914.83 ?文獻標(biāo)識碼:A ?文章編號:1673-260X(2020)06-0033-03
植物內(nèi)生真菌是指在健康植物各種組織和器官內(nèi)部或細胞間隙中度過全部或近乎全部生活周期而不使寄主表現(xiàn)任何癥狀的一類真菌[1],主要為子囊菌及其無性型,少數(shù)擔(dān)子菌和接合菌.內(nèi)生真菌感染植物組織,一般以菌絲存在于細胞內(nèi)和細胞間,從寄主中吸收營養(yǎng)物質(zhì)供其生長所需,同時內(nèi)生真菌為寄主生長發(fā)育提供水分、礦物質(zhì)元素等,二者互利互惠[2].植物內(nèi)生真菌普遍存在于植物組織中,種類多,代謝物不僅能刺激植物生長發(fā)育、增強寄主的抗逆性,如抗旱、抗寒等能力[3-5],而且能提高植物對病蟲害的抵抗力[6-10],研究發(fā)現(xiàn)植物內(nèi)生真菌能產(chǎn)生具有多種生物活性的新型化合物,如抗生素、植物生長調(diào)節(jié)劑、免疫抑制活性物質(zhì)、抗腫瘤活性物質(zhì)等,極有可能成為發(fā)現(xiàn)和生產(chǎn)生物活性物質(zhì)的重要來源,在醫(yī)藥、農(nóng)林業(yè)等領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用前景.
真菌傳統(tǒng)的分類鑒定主要是根據(jù)產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)和方式、孢子的形態(tài)學(xué)特征來確定.但有些內(nèi)生真菌在自然條件和人工培養(yǎng)條件下均以菌絲和無形態(tài)形式存在,因此給形態(tài)鑒定帶來困難,ITS即內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),是核糖體DNA(rDNA)中的非編碼轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),該區(qū)域基因在不同菌株間存在豐富的變異,國內(nèi)外對ITS區(qū)進行序列分析技術(shù)已很常見,在真菌的分類鑒定及系統(tǒng)發(fā)育等研究報道很多.本文采用形態(tài)學(xué)鑒定和ITS測序法對一株內(nèi)生真菌進行分離培養(yǎng)鑒定并對其抑菌活性進行研究.
1 材料和方法
1.1 供試材料
赤峰學(xué)院校園內(nèi)赤芍(Paeonia lactiflora Pall)為材料,截取健康新鮮的芍藥側(cè)根進行內(nèi)生真菌的分離.
1.2 內(nèi)生菌的分離和純化
取健康芍藥植株側(cè)根用自來水沖洗干凈晾干,分別用0.1%升汞漂洗10~30s,然后用無菌水沖洗,再用75%酒精漂洗0.5~1min,最后用無菌水沖洗數(shù)次.樣品經(jīng)處理完畢后,在超凈工作臺內(nèi)無菌狀態(tài)下切成0.2cm薄片,切口置于PDA培養(yǎng)基上,每個培養(yǎng)皿3個樣品.置于28℃條件下黑暗培養(yǎng)3~7d,觀察培養(yǎng)材料切口處長出菌絲,挑取切口處菌落邊緣菌絲轉(zhuǎn)接到新的PDA平板上,經(jīng)2~3次純化,得到純培養(yǎng).
1.3 內(nèi)生菌的形態(tài)鑒定
1.3.1 宏觀特征觀察法
根據(jù)內(nèi)生真菌在PDA培養(yǎng)基上的培養(yǎng)特征,包括菌落正面和背面顏色、紋飾、質(zhì)地以及邊緣形狀、生長速度、大小進行觀察,使用手機拍照記錄.
1.3.2 顯微觀察
挑取獲得的純培養(yǎng)菌絲,制成徒手切片,鏡檢觀察菌株菌絲及產(chǎn)孢結(jié)構(gòu),如:分生孢子梗、分生孢子形態(tài)及大小等.依據(jù)真菌分類文獻進行分類鑒定.
1.4 基于rDNA~ITS測序分子鑒定
將純培養(yǎng)菌絲加入液氮充分碾磨,取真菌組織約30mg,提取基因組DNA,用天根PFU PCR mix進行PCR擴增,引物ITS1F/ITS4R,對所得PCR產(chǎn)物進行切膠純化回收(DNA凝膠純化試劑盒,AXYGEN),使用NL4對回收DNA片段進行DNA測序.
1.5 數(shù)據(jù)處理
用NCBI Blast程序?qū)⑵唇雍蟮男蛄形募?6S數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進行比對,得到比對結(jié)果,從結(jié)果中挑選出同源性較高的DNA序列,查找相似性最高的菌種,確定分離菌株的分類地位.利用軟件MEGA5.1按照最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,發(fā)育樹的每個分支的統(tǒng)計學(xué)顯著性分析重復(fù)次數(shù)為1000次.
1.6 該菌株對幾種植物病原菌株的抑菌實驗
1.6.1 指示菌
采用植物常見病原菌,黃瓜枯萎病菌黃瓜尖鐮孢菌Fusarium oxysporum f. sp.cucumerinum J.H.Owen 、茄科勞爾氏菌Ralstonia solanacearum和灰葡萄孢菌 Botrytis cinerea Pers菌株均來自微生物實驗室.
1.6.2 實驗方法
采用對峙培養(yǎng)法,在無菌操作臺上分別取指示菌定量接種,在固體培養(yǎng)基中,挑取內(nèi)生真菌菌絲或孢子,每個樣品做3個重復(fù).培養(yǎng)皿置于室溫培養(yǎng),分別于培養(yǎng)3天、5天、9天后測定抑菌圈直徑大小,重復(fù)多次,檢測其抑菌效果.
1.6.3 抑制效果計算方法
在無菌操作臺上將三種指示菌接種于PDA培養(yǎng)基(d=10cm)中心,周圍接種Gen7,接種3個接種點,置于室溫24℃,培養(yǎng)72h后開始測量抑菌圈直徑,抑菌率=DCK~DX/DCK×100,DCK=CK菌落直徑,DX=對峙培養(yǎng)后尖孢鐮刀菌的菌落直徑.
2 結(jié)果與分析
2.1 Gen7菌株鑒定結(jié)果
2.1.1 形態(tài)學(xué)特征
培養(yǎng)特征:菌落起初白色,棉絮狀,背面呈灰白色,后期菌落會有黑棕色環(huán)形條紋,背面橘黃色,中央色深.最后整個菌落變?yōu)楹谏?
顯微特征:分生孢子梗未見,產(chǎn)孢細胞圓柱形,無色,光滑,直徑6~9μm,分生孢子初期無色長橢圓形,單胞頂端鈍圓,無色,有的有兩油滴,孢子6~8.4μm×4~6μm.
2.1.2 基于rDNA-ITS構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育分析
以Gen7所測兩條序列Gen7-1和Gen7-2的ITS基因序列在Genbank數(shù)據(jù)庫BLAST搜索,表明Gen7-1、7-2與Coniella fragariae(MH861493)相似度100%,Coniella fragariae (MG748688)相似度為99.61%,而與葡萄白腐病菌Coniella diplodiella 90.61%親緣關(guān)系較遠,與桉樹小帽殼孢菌Pilidiella eucalyptorum相似度90%,Pilidiella為Coniella同物異名,都屬于半知菌門,球殼孢目spharropsidales球殼孢科Sphaeropsidaceae.
2.1.3 Gen7鑒定結(jié)果
根據(jù)墊殼孢屬Coniella態(tài)特征的描述[11,12]結(jié)合分子鑒定結(jié)果,該菌為草莓輪紋葉斑病病原草莓墊殼菌Coniella fragariae(Oudem.)B.Sutton.
2.2 抑菌試驗結(jié)果
對Gen7菌株與黃瓜尖鐮孢菌Fusarium oxysporum f. sp.cucumerinum J.H.Owen、茄科勞爾氏菌Ralstonia solanacearum、灰葡萄孢菌Botrytis cinerea Pers進行抑菌實驗,結(jié)果表明,Gen5對所測試菌均具有不同程度的抑制作用.
從表中可以看出菌株Gen7對黃瓜尖鐮孢菌平均抑菌率達48.2%,對灰葡萄孢菌最大抑菌率達43.1%,對茄科勞爾氏菌的平均抑菌率24.7%,培養(yǎng)一周后對鐮孢菌最大抑菌率70.6%,能明顯抑制黃瓜枯萎病菌的生長,對灰霉病菌最大抑菌率達到62.5%,能明顯抑制灰霉病的生長,而對茄科病菌抑菌率最大為24.7%,具茄科青枯病菌生長具有一定的抑制作用.
Gen7對黃瓜尖鐮孢菌Fusarium oxysporum f. sp.cucumerinum、茄科勞爾氏菌Ralstonia solanacearum、灰葡萄孢菌Botrytis cinerea在第4天時,抑菌圈達到最大分別為48.8mm、20.7mm、40.7mm,抑制作用極強,5天后菌落直徑30mm以上,完全被抑制,生長緩慢基本停止,7天后抑菌率70%以上,完全被覆蓋.
3 討論
本研究從芍藥根部分離的一株真菌Coniella fragariae,該種存在的變形結(jié)構(gòu),常被誤定為Pilidiella屬,該種分布廣泛,是植物病原之一,可侵入植物根、莖、葉,寄主范圍較廣,同時也可腐生于動物糞便中,研究表明從鵝肺中分離出的菌株提取的化合物抑制腫瘤細胞的遷移[13].尖孢鐮刀菌、灰霉病菌和番茄青枯病菌具有很強的抑菌作用,為開發(fā)園藝植物病害生防菌提供理論依據(jù),本研究對內(nèi)生真菌僅做了分子鑒定及簡單的抑菌實驗,而內(nèi)生菌發(fā)酵產(chǎn)物的功能還需進一步研究,為菌物資源的鑒定及安全開發(fā)提供依據(jù).
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收稿日期:2020-04-01
基金項目:內(nèi)蒙古自治區(qū)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練項目(201810138009)
通訊作者:田慧敏(1980~),女,碩士,副教授,主要從事真菌學(xué)多樣性教學(xué)及科研工作,E-mail:tiancfxy2009@126.com