王蕊,胡輝帆,陳文蘭,張強,劉變芳
(西北農(nóng)林科技大學 食品科學與工程學院,陜西 咸陽 712100)
真菌感染是導致農(nóng)業(yè)生產(chǎn)過程中農(nóng)作物減產(chǎn)和食品質(zhì)量安全問題的主要原因之一,每年由于真菌污染造成的食物損失接近30%[1]。真菌在自然界中分布廣、數(shù)量多,常見于食品及其原料中的污染真菌有疫霉屬、核盤菌屬、曲霉屬、青霉屬、鐮刀菌屬等[2-4]。一些真菌分泌產(chǎn)生的毒素會引起急慢性食物中毒,食品中真菌及真菌毒素的污染已成為一個重要的公共衛(wèi)生問題[5]。在農(nóng)作物和食品的生產(chǎn)加工過程中,更多以使用農(nóng)藥化肥、化學消毒劑、防腐劑為主要措施,但弊端日益顯現(xiàn),這些化學物質(zhì)的殘留不僅影響食品安全,也會造成環(huán)境污染,影響農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展[6]。
目前,通過植物源、動物源、微生物源有效活性成分抑制病原菌的生長與繁殖已經(jīng)成為研究熱點[7]。生物法有著高效、安全、無污染等特點,其中芽孢桿菌屬易繁殖,對環(huán)境適應能力強,具有很大的開發(fā)研究價值。有研究報道[8-10],芽孢桿菌已廣泛應用于豆豉、面包等發(fā)酵食品中,一方面可產(chǎn)生食品級的酶制劑,如淀粉酶、蛋白酶、豆豉纖溶酶、納豆激酶;另一方面可代謝產(chǎn)生能用于食品加工與保鮮、農(nóng)業(yè)生物防治等領域的脂肽類抑菌物質(zhì)。滿麗莉等[11]分離到一株枯草芽孢桿菌,研究發(fā)現(xiàn)其發(fā)酵液對青霉、金黃色葡萄球菌和大腸桿菌均有較強的抑制效果,具有開發(fā)為益生菌制劑的潛能。周濤等[12]從湖泥、土壤中分離篩選到具有廣譜抑菌作用的多粘類芽孢桿菌,研究發(fā)現(xiàn)其有作為堿性食品保鮮劑的潛能。本研究基于從有機質(zhì)土壤中選育的一株產(chǎn)淀粉酶的甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌,研究了其對真菌的拮抗作用,并對該菌株代謝產(chǎn)物中可能的抑菌物質(zhì)進行分離和鑒定,為進一步開發(fā)天然食品防腐劑及生防菌劑提供了理論基礎。
1.1.1 菌株
甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌BFWR11:本課題組分離并保存;黑曲霉菌:由西北農(nóng)林科技大學食品科學與工程學院提供;灰霉菌、赤霉菌:由西北農(nóng)林科技大學植物保護學院提供。
1.1.2 試劑
BaCl2:天津市天力化學試劑有限公司;NaCl、苯甲酸鈉、Na2HPO4·12H2O、甲醇、正丁醇:廣東光華科技股份有限公司;KH2PO4:成都市科龍化工試劑廠;YA1080普通干型透析袋MD25(3500D):北京索萊寶科技有限公司。
1.1.3 儀器
NRY-2102型搖床培養(yǎng)箱 上海南榮實驗室設備有限公司;LMQ.CE型立式滅菌鍋 山東新華醫(yī)療器械股份有限公司;SmartSpecTMplus 分光光度計 美國 Bio-Rad儀器有限公司;CD-UPTL II型超純水制造系統(tǒng) 成都越純科技有限公司;Bioscreen全自動生長曲線分析儀 上海謂載商貿(mào)發(fā)展有限公司。
1.2.1 BFWR11菌株生長曲線測定
從甘油保藏管中取1環(huán)菌液劃線接種于LB平板,30 ℃過夜培養(yǎng)。挑取單菌落接種到5 mL新鮮LB肉湯中,130 r/min、30 ℃培養(yǎng)12 h。用新鮮的LB肉湯調(diào)整培養(yǎng)物OD600值為0.5,稀釋10倍后吸取250 μL接于蜂窩板中,使用Bioscreen全自動生長曲線分析儀測定菌株生長曲線,設定參數(shù)為30 ℃、中速,每組試驗3次重復。
1.2.2 BFWR11菌株對真菌的拮抗作用
選擇赤霉菌、灰霉菌、黑曲霉菌為測試真菌。分別制備孢子懸液,涂布接種于PDA平板上,28 ℃培養(yǎng)5~7 d至菌絲長起,用直徑5 mm的打孔器取真菌菌塊,備用。采用平板對峙培養(yǎng)法測定BFWR11菌株對不同真菌的拮抗作用,在直徑90 mm的PDA平板中心輕輕放置真菌菌塊,菌絲面朝下,試驗組將BFWR11菌株點接種到距離真菌菌塊20 mm位置,平板上對稱取4點接種,3個重復平板。對照組只接入測試真菌菌塊。28 ℃培養(yǎng)5~7 d,觀察、測量菌塊大小,計算抑菌率。
抑菌率=(對照組菌塊直徑-試驗組菌塊直徑)/對照組菌塊直徑×100%。
1.2.3 BFWR11菌株發(fā)酵上清液的制備
挑取單菌落接種到5 mL新鮮LB肉湯中,130 r/min、30 ℃培養(yǎng)12 h進行活化,作為種子液。按5%接種量將種子液接種到100 mL的LB肉湯中,130 r/min、30 ℃培養(yǎng)50 h,作為發(fā)酵液。發(fā)酵液于4 ℃、10000 r/min離心20 min,取上清液,經(jīng)0.22 μm微孔濾膜除菌,獲得發(fā)酵上清液,備用。
1.2.4 脂肽粗提物的制備
參考邵天蔚等[13]的研究方法,取200 mL發(fā)酵上清液,用6 mol/L的HCl溶液調(diào)節(jié)pH為2.0,4 ℃靜置過夜。4 ℃,10000 r/min 離心20 min,倒掉上清,沉淀用50 mL甲醇溶解,真空抽濾后,將濾液進行旋轉蒸發(fā)去除有機溶劑,濃縮后將樣品于45 ℃進行真空干燥,所得的干燥樣品用PBS緩沖液(0.02 mol/L,pH 7.2)定容至5 mL,經(jīng)0.22 μm有機微孔濾膜除菌,獲得脂肽粗提物。
1.2.5 正丁醇萃取物的制備
取200 mL發(fā)酵上清液,加入等體積正丁醇,萃取2次后合并有機相,于60 ℃旋轉蒸發(fā)濃縮后進行真空干燥,所得的干燥樣品用PBS緩沖液定容至5 mL,經(jīng)0.22 μm有機微孔濾膜除菌,獲得正丁醇萃取物。
1.2.6 粗蛋白提取物的制備
取200 mL發(fā)酵上清液,稱取112.2 g硫酸銨顆粒,緩慢加入上清液中,使其飽和度達到80%,4 ℃靜置過夜。4 ℃,10000 r/min離心20 min,倒掉上清,沉淀用0.02 mol/L PBS緩沖溶液重懸后裝入透析袋(透析袋沸水浴10 min后于4 ℃保存在1%苯甲酸鈉溶液中備用,使用前用蒸餾水沖洗干凈),透析袋放置于裝有2 L PBS緩沖液的燒杯中透析除鹽。在透析3,6,12 h后更換透析液,直至采用1% BaCl2溶液滴定檢測燒杯中透析液無沉淀生成。將透析袋內(nèi)溶液于45 ℃進行真空干燥,所得的干燥樣品用PBS緩沖液定容至5 mL,經(jīng)0.22 μm有機微孔濾膜除菌,獲得粗蛋白提取物。
1.2.7 不同提取物抑菌活性的測定
采用雙層平板牛津杯法對上述粗提液進行抑菌活性的測定。將10 mL 2%瓊脂倒入培養(yǎng)皿中待其凝固,用鑷子將無菌牛津杯輕輕置于其上,均勻倒PDA培養(yǎng)基,待其凝固后于平板中心位置放置真菌菌塊,每個牛津杯孔加入200 μL待檢測粗提液,3個重復平板,28 ℃培養(yǎng)5~7 d。
1.2.8 LC-MS非靶標代謝組學檢測
稱取10 mg凍干后的正丁醇萃取物,加入10 mL提取液(乙腈∶水為1∶1,V/V),渦旋混勻30 s,冰水浴超聲10 min,將樣品于4 ℃,12000 r/min離心15 min,取100 μL上清液于進樣瓶中,采用超高效液相色譜-串聯(lián)四極桿飛行時間質(zhì)譜(UHPLC-QTOF-MS)分析檢測。
通過Waters ACQUITY UPLC BEH Amide (2.1 mm×100 mm,1.7 μm)液相色譜柱對目標化合物進行色譜分離。液相色譜A相為水相,含25 mmol/L乙酸銨和25 mmol/L氨水,B相為乙腈。采用梯度洗脫:0~0.5 min,95% B;0.5~7 min,95%~65% B;7~8 min,65%~40% B;8~9 min,40% B;9~9.1 min,40%~95% B;9.1~12 min,95% B。流動相流速:0.5 mL/min,柱溫:25 ℃,樣品盤溫度:4 ℃,進樣體積:正離子1 μL,負離子1 μL。
使用Triple TOF 6600高分辨質(zhì)譜,通過IDA(information-dependent acquisition)模式進行高分辨質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集。本部分檢測委托北京奧維森基因科技有限公司完成。
1.2.9 發(fā)酵液蛋白提取物定性分析
蛋白提取物使用FASP(filter aided sample preparation)法進行酶解,獲得的肽段使用0.1%甲酸-水溶液復溶,進樣15 μL,78 min色譜梯度分離,采用Thermo Scientific Fusion超高分辨率質(zhì)譜儀檢測。本部分檢測委托北京奧維森基因科技有限公司完成。
試驗數(shù)據(jù)采用OriginPro 2016軟件作圖,Minitab 16.2.3軟件對數(shù)據(jù)進行分析處理,結果用平均值±標準差(x±SD)來表示。
用平板對峙培養(yǎng)法檢測BFWR11菌株對真菌的拮抗作用,拮抗效果見圖1。
圖1 BFWR11菌株對真菌的抑制作用Fig.1 Inhibition of BFWR11 strain on fungi
由圖1可知,BFWR11菌株對赤霉菌、灰霉菌、黑曲霉菌的生長均有明顯的拮抗作用,其中赤霉菌氣生菌絲發(fā)達,向培養(yǎng)基上空伸展,由于皿蓋阻擋,限制了氣生菌絲直生,使其疊生于皿蓋上,但在BFWR11菌落周圍的培養(yǎng)基中沒有生長,灰霉菌和黑曲霉菌試驗組真菌菌絲生長均受到明顯抑制。BFWR11菌株對赤霉菌、灰霉菌、黑曲霉菌的抑菌率分別為45.03%、30.60%和47.56%,結果見表1。
表1 BFWR11菌株對真菌的抑菌率Table 1 The antibacterial rates of BFWR11 strain against fungi
采用全自動生長曲線分析儀測定BFWR11菌株在LB肉湯中的生長曲線,結果見圖2。
圖2 BFWR11菌株生長曲線Fig.2 Growth curve of BFWR11 strain
BFWR11菌株在3 h內(nèi)很快進入對數(shù)生長期,菌數(shù)快速增長,培養(yǎng)12 h后細菌密度達到最大值,OD600為0.54。對數(shù)期微生物是發(fā)酵工業(yè)中用作種子的最優(yōu)材料,后續(xù)試驗選擇12 h純培養(yǎng)物作為發(fā)酵種子液。12 h后細菌生長進入穩(wěn)定期,為積累代謝產(chǎn)物的發(fā)酵時期,此后OD600變化趨勢平緩,OD600為0.50~0.55,試驗選擇培養(yǎng)50 h即積累代謝產(chǎn)物較多的穩(wěn)定期的培養(yǎng)物作為發(fā)酵液,用其上清液提取不同代謝產(chǎn)物進行拮抗試驗。
BFWR11發(fā)酵上清液的不同粗提物對真菌的抑制效果見圖3。BFWR11菌株的發(fā)酵液和離心去除菌體后的上清液對赤霉菌有抑制作用。BFWR11發(fā)酵上清液經(jīng)酸沉淀、甲醇抽濾后得到的淡黃色脂肽類物質(zhì)對赤霉菌有抑制作用,和對照組比較,試驗組菌絲無法蔓延生長。正丁醇萃取物對赤霉菌菌絲的抑制效果明顯,揭示極性大的正丁醇可以萃取到較多的抑菌活性物質(zhì)。80%硫酸銨溶液鹽析提取的粗蛋白對赤霉菌菌絲生長也有抑制作用(見圖3中Ⅰ)。
BFWR11發(fā)酵液和上清液對灰霉菌菌絲都有抑制作用。發(fā)酵液比上清液的抑制作用強,推測發(fā)酵液中BFWR11菌株不僅分泌抑菌物質(zhì)在上清液中,而且還會通過生物競爭或其他途徑對灰霉菌進行抑制。脂肽粗提物、正丁醇萃取物、粗蛋白提取物對灰霉菌的抑制效果明顯,試驗組菌絲均無法正常蔓延生長,表明酸沉淀、正丁醇萃取、硫酸銨沉淀3種方法可提取到發(fā)酵上清液中不同類型抑菌活性物質(zhì)(見圖3中Ⅱ)。
BFWR11發(fā)酵液對黑曲霉菌有抑制作用,但上清液、脂肽粗提物、正丁醇萃取物、粗蛋白提取物對黑曲霉菌絲的生長均未表現(xiàn)出明顯的抑制作用,推測可能是因為黑曲霉繁殖力強,試驗采用的200 μL不足以抑制其菌絲生長,或是與赤霉菌、灰霉菌相比,BFWR11菌株和黑曲霉菌之間的拮抗作用機制不同(見圖3中Ⅲ)。
采用UHPLC-QTOF-MS對正丁醇萃取物成分進行定性分析,非靶標代謝組學檢測到2535種物質(zhì),包括酸類、酚類、堿類等。按相對含量由多到少列出部分抑菌相關物質(zhì)鑒定結果,見表2。其中棕櫚酸含量最高,其次為阿扎胞苷、3-羥基苯甲酸、肉豆蔻酸、水楊酸等。祁超等[14]對枯草芽孢桿菌YN201490發(fā)酵上清液的正丁醇萃取物采用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術鑒定到表面活性素和伊枯草菌素,與祁超等的研究結果不同可能是菌株差異或檢測技術不同造成的。
表2 正丁醇萃取物的UHPLC-QTOF-MS檢測分析結果Table 2 The analysis results of n-butanol extracts detected by UHPLC-QTOF-MS
每個蛋白經(jīng)酶解產(chǎn)生長短不一的肽段后應用LC-MS/MS對其進行鑒定,根據(jù)每個時間點質(zhì)譜信號強度最高的母離子繪制得到TIC圖(見圖4)。基于信號最強的肽段的強度值繪制得到Base Peak圖(見圖5)?;赨niProt-Bacillussubtilis序列庫進行蛋白樣品的序列庫搜索,比對獲得共計750個肽段,520個蛋白質(zhì)。抑菌活性相關蛋白信息見表3,鑒定到3種表面活性素合成酶亞基(基因名稱分別為srfAA、srfAB、srfAC)、聚酮合成酶(基因名稱分別為pksN、pksL)、鞭毛鉤相關蛋白(基因名稱分別為fliD、flgK)等。
圖4 總離子流圖Fig.4 Total ion chromatogram
圖5 基峰色譜圖Fig.5 Base peak chromatogram
表3 蛋白物質(zhì)LC-MS/MS定性分析結果Table 3 The qualitative analysis results of protein substances detected by LC-MS/MS
續(xù) 表
表面活性素由環(huán)7肽Glu-Leu-(D)-Leu-Val-Asp-(D)-Leu-Leu與β-羥基脂肪酸組成,是由非核糖體途徑合成的脂肽類抑菌物質(zhì),srfA,srfB和srfP基因已被證明是負責表面活性素合成的基因簇,srfA基因編碼表面活性素合成酶的3個大亞基[15]。試驗使用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術對BFWR11菌株發(fā)酵上清液的酸沉淀粗提物進行檢測,未鑒定到脂肽類相關物質(zhì),但從粗蛋白中鑒定到表面活性素合成酶亞基,因此推測BFWR11菌株可產(chǎn)生表面活性素這一環(huán)狀脂肽類抑菌物質(zhì)。聚酮合成酶和非核糖體肽合成酶均可催化合成抑菌物質(zhì),這兩類酶的基因常作為篩選產(chǎn)生新穎結構天然活性化合物的微生物指示基因[16]。鞭毛鉤蛋白由flgK基因編碼,fliD基因是鞭毛基因調(diào)節(jié)系統(tǒng)的關鍵組分,促使鞭毛亞單位聚合成完整的鞭毛蛋白,而鞭毛蛋白是典型的毒力因子,幫助細菌感染定殖,對抑菌活性有著重要作用[17,18]。
甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌作為芽孢桿菌屬的新成員,具有廣闊的應用前景。詹藝舒等[19]分離到一株甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌,研究發(fā)現(xiàn)其對食品腐敗真菌黑曲霉、康氏木霉、綠色木霉、少根根霉、易脆毛霉、赭綠青霉的生長具有較強的抑制作用。本試驗中選用的BFWR11菌株是本課題組前期分離到的一株甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌,牛津杯法和平板對峙培養(yǎng)法試驗結果表明其對赤霉菌、灰霉菌及黑曲霉菌具有較強的拮抗作用,酸沉淀、正丁醇萃取、硫酸銨沉淀3種不同方法的發(fā)酵上清液粗提物對赤霉菌和灰霉菌有明顯的抑制作用,這表明不僅可以利用BFWR11菌株進行生物防治,也可對其上清液中的抑菌物質(zhì)進行提取濃縮和開發(fā)利用。
甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌BFWR11可產(chǎn)生酸類、堿類、蛋白類等多種抑菌活性物質(zhì)協(xié)同抑菌,其中脂肽類物質(zhì)作為一種新型的生物表面活性劑,不僅具有良好的乳化性質(zhì),還具有抑菌、增溶、潤濕等作用,目前主要應用于魚、蝦及其制品的保鮮[20],這為甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌BFWR11及其代謝產(chǎn)物進一步開發(fā)為生防菌劑及天然食品防腐劑奠定了理論基礎,后續(xù)可基于鑒定到的抑菌活性物質(zhì)從代謝和基因水平進行系統(tǒng)深入研究,闡明其作用機理。