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        冠狀病毒膜孔蛋白E作為藥物靶點的探討

        2020-08-12 01:05:30廖瑛
        中國動物傳染病學(xué)報 2020年4期
        關(guān)鍵詞:金剛烷胺離子通道A型

        王 歡,丁 鏟,2,廖瑛

        (1.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海200241;2.江蘇省重大動物傳染病與人畜共患病預(yù)防與控制聯(lián)合創(chuàng)新中心,揚州225009)

        病毒編碼的離子通道蛋白,是一種在病毒生命周期中起多種作用的小跨膜蛋白,屬于病毒膜孔蛋白家族。病毒膜孔蛋白具有兩親性,可在宿主細胞膜上多聚化,形成親水的離子通道(圖1),介導(dǎo)離子(Na+、K+、Ca2+、H+、Cl-)的運輸,影響病毒的入胞、基因組復(fù)制、子代病毒的組裝和出芽以及致病性[1]。許多高致病性病毒編碼膜孔蛋白,例如艾滋病毒(Human immunodeficiency virus,HIV-1)vpu蛋白[2]、丙肝病毒(Hepatitis C virus,HCV)p7蛋白[3]、A型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)M2蛋白[4]、登革熱病毒(Dengue virus,DV)M蛋白[5]、輪狀病毒(Rotavirus,RV)nsp4蛋白[6]、呼吸道合胞體病毒(Respiratory Syncytial virus,RSV)SH蛋白[7]、腸道病毒(Enterovirus,EV)2B蛋白[8]和冠狀病毒(Coronavirus,CoVs)E蛋白[9-10]等。一些離子通道阻滯劑能阻滯病毒膜孔蛋白的功能,進而抑制病毒的增殖和降低其致病性,因此病毒膜孔蛋白可作為抗病毒治療的靶點。

        圖1 病毒膜孔蛋白分類[1]Fig.1 Classification of viroporins

        1 冠狀病毒簡介

        冠狀病毒在系統(tǒng)分類上屬于套式病毒目(Nidovirale)冠狀病毒科(Coronaviridae)冠狀病毒屬(Coronavirus)。已知冠狀病毒家族有二十多種冠狀病毒,主要感染人、家畜、家禽、寵物,給人類和動物健康帶來嚴(yán)重的危害??筛腥救祟惖墓跔畈《竟灿衅叻N,其中,人冠狀病毒-229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)、人冠狀病毒-HKU1(Human coronavirus,HCoV-HKU1)、人冠狀病毒-NL63(Human coronavirus NL63,HCoVNL63)、人冠狀病毒-OC43(Human coronavirus,HCoV-OC43)四種冠狀病毒是引起人類感冒的常見病原體;2003年出現(xiàn)的嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)[11],2011年出現(xiàn)的中東呼吸綜合征冠狀病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)[12],及2019年12月出現(xiàn)的嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒-2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARSCoV-2)[13],可引起致命的呼吸系統(tǒng)疾病,造成大范圍的傳染,給公共衛(wèi)生帶來嚴(yán)重的威脅。目前尚無有效的藥物防控冠狀病毒的感染。

        冠狀病毒具有囊膜,纖突蛋白S、包膜蛋白M和小包膜蛋白E位于病毒囊膜表面,核衣殼蛋白N與病毒單股正鏈RNA基因組結(jié)合形成螺旋核衣殼,包裹在病毒囊膜內(nèi)側(cè)(圖2)。冠狀病毒具有RNA病毒最長的單股正鏈RNA基因組,有5'帽子結(jié)構(gòu)和3'尾巴結(jié)構(gòu),長度為26.2~31.7 kb?;蚪M由6~10個開放閱讀框架(open reading frame,ORF)組成,5'端三分之二序列屬于ORF1,編碼復(fù)制和轉(zhuǎn)錄相關(guān)的酶;3'端的三分之一序列按照固定的排序編碼病毒結(jié)構(gòu)蛋白:(HE)-S-E-M-N和各個冠狀病毒特有的附屬蛋白。冠狀病毒具有15~16個非結(jié)構(gòu)蛋白(nonstructural protein,Nsp)。這些非結(jié)構(gòu)蛋白包括蛋白酶、RNA依賴型的RNA復(fù)制酶、RNA解旋酶、核酸內(nèi)切酶、核酸外切酶和RNA甲基化加帽酶等。參與病毒復(fù)制的非結(jié)構(gòu)蛋白和病毒基因組形成復(fù)制/轉(zhuǎn)錄復(fù)合體,完成負(fù)鏈亞基因組RNA(Subgenomic RNA)的合成,亞基因組mRNA(Subgenomic mRNA)的轉(zhuǎn)錄和病毒基因組gRNA(Genomic RNA)的復(fù)制。

        圖2 冠狀病毒模型圖[14]Fig.2 Model of coronavirus

        2 冠狀病毒膜孔蛋白-E蛋白

        冠狀病毒的E蛋白是最小的結(jié)構(gòu)蛋白,屬于跨膜整合蛋白,長度介于76~109個氨基酸[15-16]。在病毒復(fù)制過程中,E蛋白大量表達,但是只有少部分整合到病毒顆粒里。E蛋白在病毒感染過程中主要發(fā)揮兩個功能:(1)跟M相互作用,參與子代病毒的組裝和釋放。大部分E蛋白位于宿主細胞的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體之間的膜結(jié)構(gòu)上,參與病毒的組裝、出芽和胞內(nèi)運輸[16-18]。缺失E蛋白的重組病毒,病毒滴度顯著降低,病毒成熟發(fā)生缺陷,或產(chǎn)生沒有感染性的子代病毒,說明E蛋白在病毒的成熟和擴散中發(fā)揮重要作用[19-25]。(2)參與病毒致病過程:E蛋白的穿膜區(qū)大約為25個氨基酸,形成至少一個兩親性α螺旋,通過同源寡聚化在膜上形成離子通道,屬于病毒膜孔蛋白[26]。SARSCoV[9,18,27-28]、HCoV-229E[29]、鼠肝炎病毒(Murine hepatitis virus,MHV)[30]和禽傳染性支氣管炎病毒IBV(Infectious bronchitis virus,IBV)[29]的E蛋白,均能形成離子通道。最近發(fā)現(xiàn),SARS-CoV E蛋白的C端四個氨基酸是PDZ結(jié)合序列(PDZ-binding motif,PBM),能夠結(jié)合多個宿主蛋白,調(diào)控宿主細胞內(nèi)環(huán)境,促進病毒感染,跟病毒的致病性相關(guān)。

        E蛋白對于冠狀病毒的正常增殖和致病性具有重要作用。在豬傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)和MERS-CoV基因組中刪除E基因,病毒能夠復(fù)制,但是不能傳播和擴散[21-22,24];在MHV和SARS-CoV基因組中刪除E基因,病毒能復(fù)制,但是病毒滴度降低了20到1000倍[19-20];動物實驗中表明,缺失E基因的SARS-CoV毒力大大降低,并降低了炎癥反應(yīng),可作為疫苗候選株[31-34]。在所有冠狀病毒E蛋白的研究中,對SARS-CoV的E蛋白研究最為透徹。SARS-CoV E蛋白,具有76個氨基酸,能夠形成同源六聚體離子通道,其活性中心在形成α螺旋結(jié)構(gòu)的穿膜區(qū)(10~35 aa)[9]。穿膜區(qū)的Asn15和Val25, 是決定SARS-CoV E 蛋白離子通道活性的關(guān)鍵氨基酸。將Asn15和Val25進行突變,使E蛋白失去離子通道活性,重組的SARS-CoV毒力明顯減弱,并降低了炎癥反應(yīng)[35]。因此,E蛋白的離子通道活性,促進病毒的增殖和致病性。最近研究表明,SARS-CoV E蛋白能夠激活炎癥小體,促進炎癥反應(yīng)[35-36]。因此,抑制E蛋白離子通道活性,除了能夠抑制病毒增殖,還能夠抑制肺部的炎癥反應(yīng),是一個很好的抗病毒藥物設(shè)計靶點。

        3 靶向病毒膜孔蛋白的藥物

        3.1 鹽酸金剛烷胺 在靶向病毒膜孔蛋白的藥物中,鹽酸金剛烷胺對A型禽流感病毒M2蛋白的作用機制及其臨床使用效果較為清楚[37-38]。鹽酸金剛烷胺是最早用于抑制禽流感病毒的抗病毒藥,美國FDA于1968年批準(zhǔn)其作為A型禽流感預(yù)防藥物,并于1976年確認(rèn)其為A型禽流感治療藥物。該藥特異性靶向A型禽流感病毒編碼的膜孔蛋白M2。M2是A型禽流感的一個重要組成成分,在病毒囊膜上形成同源四聚體離子通道。當(dāng)病毒結(jié)合細胞表面受體發(fā)生內(nèi)吞后,M2在內(nèi)吞小體被酸性環(huán)境激活,氫離子選擇性通過M2通道,進入病毒囊膜內(nèi)部中心區(qū)[39]。病毒內(nèi)部的酸化導(dǎo)致靜電相互作用減弱,M1和核衣殼蛋白復(fù)合體分離[40]。隨之而來的膜融合,使發(fā)生脫殼的核衣殼蛋白復(fù)合體進入細胞質(zhì),轉(zhuǎn)運進細胞核進行病毒復(fù)制。當(dāng)病毒完成基因組復(fù)制和蛋白合成,M2插入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,通過高爾基體外側(cè)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)(trans-Golgi network,TGN)轉(zhuǎn)運到細胞表面。在酸性的TGN、M2把氫離子轉(zhuǎn)運出高爾基體內(nèi)腔,維持病毒HA蛋白的亞穩(wěn)態(tài)構(gòu)型[41]。另外,M2蛋白對于A型禽流感子代病毒在細胞表面的出芽非常重要。鹽酸金剛烷胺能夠進入M2形成的四聚體離子通道中心(圖3、4),阻斷氫離子進入病毒囊膜內(nèi)部,抑制M2的離子通道功能,影響病毒的脫殼,并影響后續(xù)的病毒復(fù)制、蛋白合成、病毒的組裝和出芽[42]。M2基因容易突變,使得A型禽流感對鹽酸金剛烷胺出現(xiàn)抗藥性,因此在雞場需要謹(jǐn)慎用藥。由于世界各地的A型禽流感病毒出現(xiàn)抗藥性,美國疾控中心目前不推薦鹽酸金剛烷胺用于A型禽流感的治療。此外,鹽酸金剛烷胺還能夠抑制HCV p7蛋白[43]、登革熱病毒M蛋白[5]和冠狀病毒E蛋白[44],并已經(jīng)用于HCV治療的臨床實驗[45]。

        圖3 鹽酸金剛烷胺分子結(jié)構(gòu)式Fig.3 Molecular structural formula of amantadine

        圖4 鹽酸金剛烷胺(紅色)抑制A型禽流感M2蛋白(藍色)的模型圖[41]Fig.4 Model of amantadine (red) inhibiting influenza A M2 protein (blue)

        有報道顯示,抗A型禽流感臨床藥物鹽酸金剛烷胺,能夠明顯抑制SARS-CoV E蛋白的離子通道活性[44]。在病毒實驗中,鹽酸金剛烷胺能夠靶向E蛋白,抑制鼠肝炎冠狀病毒MHV的增殖[46]。由于冠狀病毒E蛋白的結(jié)構(gòu)和功能相當(dāng)保守,因此,鹽酸金剛烷胺是對冠狀病毒感染進行治療的一個候選藥物。

        3.2 六亞甲基阿米洛利 目前,除了鹽酸金剛烷胺外,一種抑制HIV-1 vpu蛋白的六亞甲基阿米洛利[47],也能結(jié)合SARS-CoV[48]、HCoV-229E[29]、和MHV的E蛋白[29,49],抑制其活性(圖5、6)[48]。已有研究證實,六亞甲基阿米洛利能夠廣譜性抑制HCoV-229E[29]、貓傳染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,F(xiàn)IPV)[50-51]和豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)[52]的增殖。

        圖5 六亞甲基阿米洛利的分子結(jié)構(gòu)式Fig.5 Molecular structural formula hexamethylene amiloride

        圖6 六亞甲基阿米洛利與SARS-CoV E蛋白的抑制性結(jié)合[47]Fig.6 Model of hexamethylene amiloride inhibiting SARS-CoV E protein

        4 展望

        我們對SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERSCoV的E蛋白序列做了比對,發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2跟SARS-CoV的E蛋白具有很高的同源性,只有4個氨基酸的差異,離子通道活性位點Asn15和Val25完全保守(圖7)。因此,在SARS-CoV-2 E蛋白的藥物研發(fā)中,完全可以借鑒SARS-CoV的研究經(jīng)驗。根據(jù)現(xiàn)有的研究報道,鹽酸金剛烷胺和六亞甲基阿米洛利是治療SARS-CoV-2的候選藥物。其中,鹽酸金剛烷胺已用于抗A型禽流感的臨床治療,或許可以成為SARS-CoV-2的治療方案之一。

        圖7 SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV的E蛋白序列比對Fig.7 Sequence alignment of E protein of SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV

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