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        長江上游小麥新品種(系)品質(zhì)分析

        2020-07-31 09:47:16董亞超戴常軍李式昭朱華忠
        麥類作物學(xué)報 2020年4期
        關(guān)鍵詞:中筋粗蛋白質(zhì)基因型

        伍 玲,董亞超,戴常軍,李式昭,朱華忠

        (1.四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所,四川成都 610066;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,北京 100081;3.農(nóng)業(yè)農(nóng)村部谷物及制品質(zhì)量監(jiān)督檢驗測試中心(哈爾濱),黑龍江哈爾濱 150086)

        長江上游冬麥區(qū)屬于我國的中筋和弱筋小麥生產(chǎn)區(qū)域,小麥品質(zhì)改良經(jīng)歷了不重視質(zhì)量—重視蛋白質(zhì)含量—重視強(qiáng)筋—重視中筋和弱筋小麥品質(zhì)全面提升的過程。20世紀(jì)50-80年代,四川省的小麥育種以提高產(chǎn)量為第一目標(biāo),幾乎沒有對加工品質(zhì)進(jìn)行選擇;20世紀(jì)90年代后,該區(qū)域的小麥品質(zhì)改良注重了蛋白質(zhì)含量、濕面筋含量和高分子量麥谷蛋白亞基的改良和選擇[1];而同時期云南、貴州等省與四川的情況類似。到2010年前后,四川省小麥新品系的平均蛋白質(zhì)含量和濕面筋含量已與北方麥區(qū)基本相當(dāng),含優(yōu)質(zhì)高分子量麥谷蛋白亞基的品種大大增加,5+10、7+8、17+18等亞基在新品種中并不鮮見。但是該區(qū)域收獲期降雨較多,穗發(fā)芽嚴(yán)重,降落值較低,嚴(yán)重影響小麥品質(zhì)。且該區(qū)域小麥品種的面團(tuán)穩(wěn)定時間一直較短[2]。晏本菊等[3]分析了四川省“九五”和“十五”期間育成的小麥品種的蛋白質(zhì)組分,認(rèn)為對該區(qū)域的小麥品質(zhì)改良,在提高總蛋白質(zhì)含量的同時,需要提高谷蛋白含量。2012年以后,卻鮮見有關(guān)該區(qū)小麥品質(zhì)的報道。

        隨著小麥基因組學(xué)的發(fā)展,很多重要性狀的基因已被克隆,但育種家對這些已克隆基因在育成品種中的基因型了解并不多。目前這些基因的SNP差異,可用KASP(競爭性等位基因特異性PCR,Kompetitive allele-specific PCR)標(biāo)記進(jìn)行檢測。KASP標(biāo)記是對等位基因的差異位點(diǎn)(SNP和InDel)進(jìn)行競爭性特異擴(kuò)增,需要三條引物;其中兩條正向競爭性引物的5′端有與熒光基團(tuán)HEX和FAM互補(bǔ)配對的堿基序列,而這兩條正向引物的其余堿基序列僅在3′端的SNP和InDel處有差異;一條反向共同保守區(qū)引物。PCR反應(yīng)體系中含有熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)修飾的通用序列(Master Mix由LGC公司提供);因此,正向引物可以特異性地結(jié)合基因型與其匹配的DNA模板,兩條正向引物可以發(fā)出兩種顏色不同的光,若模板鏈中該位點(diǎn)為純合,則發(fā)出單一的、與其匹配的熒光,若為雜合,則可同時發(fā)出兩種熒光。PCR產(chǎn)物可用酶標(biāo)儀FAM VIC ROM光束掃描,并使用Kluster Caller軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析;或直接使用實時熒光定量PCR儀檢測。目前KASP技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于小麥、水稻和玉米等作物的分子標(biāo)記檢測[4-6],Rasheed等[7]開發(fā)了小麥已克隆基因的KASP標(biāo)記,并用于小麥育種材料的基因型檢測,但未見對長江上游品種KASP標(biāo)記檢測的報道。

        2012-2018長江上游區(qū)域試驗包括109個小麥品種(系),川麥42為長江上游麥區(qū)國家級品種試驗的對照。本研究擬分析這7年區(qū)試的品質(zhì)數(shù)據(jù),以明確長江上游小麥品種的品質(zhì)現(xiàn)狀,同時用KASP標(biāo)記分析這些品種相關(guān)位點(diǎn)的基因型,為明確下一步品質(zhì)育種目標(biāo)提供思路。

        1 材料方法

        1.1 供試材料及品質(zhì)數(shù)據(jù)來源與品質(zhì)分類方法

        供試材料為國家小麥區(qū)域試驗長江上游組在2012-2018參試的品種(系)109個,其中,參試一年的品種(系)94個,參試二年的品種(系)15個;以川麥42為對照。

        本文所用品質(zhì)數(shù)據(jù)均來源于2012-2018國家小麥區(qū)域試驗長江上游組的試驗總結(jié)。2017年僅一組試驗,其余年份均設(shè)置A、B兩組試驗,共有13組試驗。109個品種(系)及其系譜等見附表1。成都、綿陽、內(nèi)江、永川、昆明、貴陽、勉縣和十堰(2012和2013年為襄陽)8試點(diǎn)為區(qū)試品質(zhì)分析取樣點(diǎn);2016年品質(zhì)分析取樣點(diǎn)為7個(十堰試點(diǎn)未送樣),其余年份取樣點(diǎn)均為8個。

        區(qū)試分別采用NY/T1094.2-2006《小麥實驗室制粉》、GB5498-1985《糧食、油料檢驗容重測定法》、GB10361-2008《小麥及其面粉降落數(shù)值的測定》、NY/T3-1982《粗蛋白質(zhì)測定法(半微量凱氏法)》、GB/T5506.2-2008《小麥粉面筋含量儀器法測定濕面筋》、GB/14614-2006《小麥粉面團(tuán)的物理特性吸水量和流變學(xué)特性的測定粉質(zhì)儀法》等方法進(jìn)行制粉和容重、粗蛋白質(zhì)含量、濕面筋含量、面團(tuán)穩(wěn)定時間和吸水量等測定。

        8個品質(zhì)取樣點(diǎn)的樣品首先測定降落值,降落值低于200 s的樣品被視為芽麥而被剔除;相同品種(系)的樣品混合后用于測定粗蛋白質(zhì)含量、濕面筋含量、面團(tuán)穩(wěn)定時間和吸水量?;旌宵c(diǎn)率=樣品混合點(diǎn)數(shù)/全部取樣點(diǎn)數(shù)。

        根據(jù)小麥分級標(biāo)準(zhǔn)[8]將參試材料分為一到五級及等外六個級別;根據(jù)品種審定標(biāo)準(zhǔn)[9]將參試材料分為糯麥和非糯麥,非糯麥又分為強(qiáng)筋、中強(qiáng)筋、中筋和弱筋四類。

        1.2 KASP標(biāo)記分析

        采用2個高分子量麥谷蛋白亞基(high-molecular-weight glutenin subunit,HMW-GS)基因、3個低分子量麥谷蛋白亞基(low-molecular-weight glutenin subunit,LMW-GS)基因、2個穗發(fā)芽抗性基因、9個粒重及籽粒大小基因、3個籽粒硬度基因和1個小麥-黑麥1BL·1RS易位的KASP標(biāo)記對109個品種(系)進(jìn)行基因型檢測。所用標(biāo)記見表1,各標(biāo)記的引物序列等見表2。

        表2 KASP標(biāo)記的引物詳情

        表1 用于分析的KASP標(biāo)記

        每個材料取3~4粒種子,發(fā)芽后取2~3 cm的新鮮葉片,采用PVP-40法提取樣品DNA,得到DNA濃度為100 ng·μL-1的模板溶液。KASP標(biāo)記PCR擴(kuò)增體系和擴(kuò)增程序同Rasheed等[7]方法,Master Mix和MgCl2購買自LGC公司,Primer Mix含12%HEX引物、12%FAM引物、30%的共同反向引物、46%的ddH2O,由華大基因公司合成。用酶標(biāo)儀(BiOTek,SYNERGY/H1 microplate reader)的FAM VIC ROM光束掃描PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,用Kluster Caller分型軟件對掃描數(shù)據(jù)進(jìn)行分型檢測。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 試驗品種(系)的混合點(diǎn)率及兩個穗發(fā)芽抗性位點(diǎn)的基因型分析

        在供試材料中,試驗一年的品種(系)94個,得到混合樣94個,試驗兩年的品種(系)15個,得到混合樣30個,對照品種1個,得到混合樣13個,合計137個樣品。137個樣品的混合點(diǎn)率不盡相同(表3),其平均混合點(diǎn)率為0.662,多數(shù)樣品來自4~7個取樣點(diǎn),說明長江上游麥區(qū)品種(系)較易發(fā)生穗發(fā)芽。137個樣品中,混合點(diǎn)率為1的僅有9個,分別是2016年的川麥82、川育27、科成麥4號,2015年的R802、川14品16、渝1318、川13015、滇麥2號,2014年的13A8,說明高抗穗發(fā)芽的品種(系)較少。

        表3 2012-2018長江上游小麥區(qū)試品種(系)品質(zhì)混合樣品數(shù)統(tǒng)計

        用KASP標(biāo)記檢測兩個穗發(fā)芽抗性位點(diǎn)的結(jié)果表明,在TaPHS1位點(diǎn)646SNP位置上,96個品種(系)和對照為抗穗發(fā)芽基因型;3個品種(系)為感穗發(fā)芽基因型;其余10個品種(系)在該位點(diǎn)的基因型不能判定。含有該抗性等位基因的品種(系)的平均混合點(diǎn)率為0.672,而含感穗發(fā)芽基因型的川麥605、綿陽1302和德102的混合點(diǎn)率分別為0.625、0.43、0.625。在TaSdr-A1位點(diǎn),對照和106個品種(系)是感穗發(fā)芽基因型,2個品種(系)為抗穗發(fā)芽基因型,1個品種為雜合類型,含抗穗發(fā)芽基因型的品種(系)綿麥1302和W18的混合點(diǎn)率是0.430和0.75。兩個位點(diǎn)均含抗穗發(fā)芽基因的品系是W18,兩個位點(diǎn)均含感穗發(fā)芽基因的品種(系)是川麥605和德102,它們之間樣品的混合點(diǎn)率差異不大。綜合混合點(diǎn)率和兩個位點(diǎn)的基因型分析結(jié)果,這兩個位點(diǎn)不能很好區(qū)分長江上游區(qū)試品種(系)的穗發(fā)芽抗性。

        2.2 試驗品種(系)的籽粒容重分級及粒重、籽粒大小和硬度位點(diǎn)的基因型分析

        根據(jù)容重將109個品種(系)分成六個等級(兩年試驗的取高等級),一等和二等共有77個,四等以下的僅18個。13次對照樣品中,9次達(dá)到了二等以上,3次四等以下,對照等級變差可能與2016和2017發(fā)生嚴(yán)重凍害和條銹病有關(guān),推測部分品種(系)的籽粒容重也受到類似影響。

        用KASP標(biāo)記檢測7個粒重位點(diǎn)、2個籽粒大小位點(diǎn)和3個籽粒硬度位點(diǎn)發(fā)現(xiàn),109個品種(系)中,多數(shù)品種(系)在TaGW2-6B、TaGS-D1、Tabas、TaSus2-2A和TaSus1-7B位點(diǎn)分別為Hap-1,2,3、D1a、B1a、Hap-A和Hap-T,是高粒重基因型;在TaGs2-B1和TaSus1-7A位點(diǎn)分別為B1a和Hap-1,3,5,是低粒重基因型;川麥42在TaGW2-6B位點(diǎn)是Hap-4,其余6個位點(diǎn)與多數(shù)品種(系)的基因型相同。在TaGS5-A1和TaGASR-A1兩個籽粒大小位點(diǎn),多數(shù)品種(系)是A1b大籽?;蛐秃虷1g小籽?;蛐?。在Pina-D1和Pinb-D1位點(diǎn),多數(shù)品種(系)分別是D1a和D1a,為軟質(zhì)基因型;在Pinb2-v2位點(diǎn)有75個是B2b,為相對硬質(zhì)類型。不同基因型在相同容重等級的品種(系)數(shù)間的分布頻率差異不明顯,說明容重與這些基因的相關(guān)性不大(表4)。

        表4 2012-2018長江上游小麥品種試驗中占多數(shù)的基因型在不同容重級別品種(系)中的分布

        2.3 試驗品種(系)的品質(zhì)情況及HMW、LMW位點(diǎn)和1BL·1RS基因型分布

        由表5可知,對比品種審定標(biāo)準(zhǔn)[9],供試材料各被測指標(biāo)的平均值基本符合中筋品種標(biāo)準(zhǔn)。各指標(biāo)表現(xiàn)為:粗蛋白質(zhì)含量10.06%~ 14.7%,濕面筋含量15.5%~30.7%,面團(tuán)穩(wěn)定時間在 0.6~15.5 min之間,吸水率48.4%~ 70.7%。說明這4個指標(biāo)在品種(系)間的差別較大。參試兩年品種(系)各指標(biāo)的平均值均低于參試一年的品種(系),對照的粗蛋白質(zhì)含量和濕面筋含量平均最低。說明年份對各指標(biāo)的測定值有一定影響,多年的數(shù)據(jù)更能客觀反映材料的品質(zhì)。

        表5 2012-2018長江上游小麥品種試驗品種(系)品質(zhì)指標(biāo)統(tǒng)計

        109個品種(系)中,含糯小麥2個,弱筋小麥6個,中筋小麥101個。在101個中筋品種(系)中,4指標(biāo)全部符合中筋標(biāo)準(zhǔn)的僅20個,其余81個不完全符合中筋標(biāo)準(zhǔn)。在81個不完全符合中筋標(biāo)準(zhǔn)的品種(系)中,59個粗蛋白質(zhì)含量達(dá)中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)(表6),47個濕面筋含量達(dá)中筋及以上標(biāo)準(zhǔn),43個吸水率達(dá)中筋及以上標(biāo)準(zhǔn),36個穩(wěn)定時間達(dá)中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)。有38個粗蛋白質(zhì)含量符合中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)而穩(wěn)定時間為弱筋,14個粗蛋白質(zhì)含量為弱筋而穩(wěn)定時間為中筋,這兩個類型在81個品種(系)中占多數(shù)。

        表6 2012-2018長江上游國家品種試驗品種(系)品質(zhì)指標(biāo)分類及部分高低分子量麥谷蛋白亞基的基因型

        高、低谷蛋白亞基位點(diǎn)和1BL·1RS易位的KASP標(biāo)記分析表明:在109個品種(系)中,Glu-A1位點(diǎn)的1/2*基因型、Glu-D1位點(diǎn)的2+12基因型、非Glu-A3g基因型、非Glu-B3g基因型、非Glu-A3d和非1BL·1RS易位是主要基因型(表6)。云麥49的KASP為Glu-B3g基因型,是 1BL·1RS易位,用功能標(biāo)記驗證得到相同的結(jié)果。已知Glu-B3g在1BS上,而云麥49為1BL·1RS易位但含有Glu-B3g,值得進(jìn)一步的研究。

        6個弱筋小麥在Glu-A1位點(diǎn)、Glu-A3g和Glu-A3d的基因型是一致的,為2+12、非Glu-A3g和Glu-A3d基因型。有9個完全達(dá)到中筋標(biāo)準(zhǔn)的品種在這3個位點(diǎn)的基因型與6個弱筋小麥完全相同。中筋品系川14品16與弱筋品系11P2-4、中筋品系09J76與弱筋品系BL227、中筋品系R801與弱筋品系11P2-4在5個被測位點(diǎn)的基因型完全相同;還有較多品種(系)在5個被測位點(diǎn)基因型相同但品質(zhì)不同,說明僅這5個位點(diǎn)的基因型不能完全解釋小麥品種間品質(zhì)的差異。

        Glu-D1位點(diǎn)的5+10基因型,在109個品種(系)中占39.4%;而在79個粗蛋白質(zhì)含量達(dá)到中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)的品種(系)中有34個,占43%;在67個濕面筋含量達(dá)到中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)的品種(系)中有28個,占41.8%;在56個穩(wěn)定時間達(dá)到中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)的品種(系)中有26個,占 46.4%;在63個吸水率符合中筋及以上標(biāo)準(zhǔn)的品種(系)中有28個,占44.4%。綜上,5+10亞基在4個指標(biāo)分別達(dá)到中筋標(biāo)準(zhǔn)中的比例均高于在109個品種(系)中的比例,推測在長江上游區(qū)小麥品種中,5+10亞基對品質(zhì)提升有一定的貢獻(xiàn)。

        2.4 區(qū)試對照川麥42和試驗二年品種(系)年度間的品質(zhì)變化

        2012-2018川麥42有13個樣品,其中僅2018 B組、2017組、2016 A組和2012 B組共4個樣品達(dá)弱筋品種標(biāo)準(zhǔn);2013 B組樣品達(dá)中筋品種標(biāo)準(zhǔn);其余8個樣品不完全符合品質(zhì)分類指標(biāo),劃為中筋類型(表7)。由表7可看出,在7年里,川麥42在弱筋和中筋之間徘徊,更多的是偏弱筋小麥;以穩(wěn)定時間的變化最大。

        表7 川麥42和試驗二年品種(系)在2012-2018長江上游小麥品種試驗中品質(zhì)表現(xiàn)

        15個參試二年的品種(系)中,僅川14品16在兩年完全達(dá)到中筋標(biāo)準(zhǔn)。各品質(zhì)指標(biāo)在年度間均有變化,容重、濕面筋含量和穩(wěn)定時間年度間變化較大,粗蛋白質(zhì)含量和吸水量年度間的變化較小。綜合兩年的品質(zhì)數(shù)據(jù),川麥604、川農(nóng)32和N08-51在其中一年的指標(biāo)完全達(dá)到中筋品種標(biāo)準(zhǔn),可望在合適的條件下生產(chǎn)出符合中筋品種標(biāo)準(zhǔn)的中筋小麥,而綿麥312和N08-51在其中一年的指標(biāo)達(dá)到弱筋品種標(biāo)準(zhǔn),可望在合適的條件下生產(chǎn)出符合弱筋品種標(biāo)準(zhǔn)的弱筋小麥。

        3 討 論

        與專門研究區(qū)域品種品質(zhì)變化的試驗不同[1,2,3,29],區(qū)試的品質(zhì)數(shù)據(jù)是跨年度多品種數(shù)據(jù),很難得到規(guī)律性的結(jié)果;但因長江上游區(qū)域參加國家級區(qū)試的品種是長江上游七省市通過省級審定或完成省級區(qū)試2年的品種(系),及時分析區(qū)試品質(zhì)數(shù)據(jù),可為育種者提供該區(qū)小麥品種品質(zhì)的基本狀況,以發(fā)現(xiàn)影響因素,找到改良途徑。

        3.1 影響長江上游小麥品質(zhì)的因素及改良策略

        3.1.1 穗發(fā)芽嚴(yán)重影響長江上游小麥品質(zhì)

        發(fā)生穗發(fā)芽的小麥,其降落值會大幅降低。張 艷等[27]研究認(rèn)為,小麥籽粒發(fā)芽會嚴(yán)重影響降落值等,對蛋白質(zhì)質(zhì)量的影響大于對蛋白質(zhì)含量的影響,對面粉品質(zhì)的影響在品種間存在差異。晏本菊等[2]也認(rèn)為,降落值是影響四川省小麥加工品質(zhì)的主要因素之一,是受年份天氣情況影響最大的品質(zhì)性狀。國家級品種試驗的品質(zhì)分析僅采用降落值高于200 s的樣品,把降落值低于200 s的樣品視為芽麥,本研究根據(jù)測試樣品的混合點(diǎn)數(shù)推測在長江上游麥區(qū)小麥穗發(fā)芽普遍存在,且品種間穗發(fā)芽抗性有較大差異,具高穗發(fā)芽抗性的品種較少。如果將參試品種的全部樣品混合用于品質(zhì)分析,那么符合中筋標(biāo)準(zhǔn)的品種數(shù)量會更少。對長江上游麥區(qū)的品質(zhì)育種,提高穗發(fā)芽抗性是改良的關(guān)鍵。

        本研究檢測的TaPHS1是位于3AS上的主效抗穗發(fā)芽基因[13],該基因啟動子區(qū)的序列突變是穗發(fā)芽抗性的主要原因[14],但我們試了多次,其分型結(jié)果不理想,本研究結(jié)果僅為該基因第646堿基G/A SNP的KASP標(biāo)記結(jié)果。TaSdr-A1位于2A染色體上,一個SNP的差異與發(fā)芽指數(shù)高度相關(guān),具有抗性的TaSdr-A1a在中國地方品種中頻率很高[15]。在本研究中,這兩個位點(diǎn)不能很好區(qū)分長江上游區(qū)試品種(系)的穗發(fā)芽抗性,對TaPHS1位點(diǎn)基因型還需要進(jìn)一步檢測其啟動子區(qū)及其他位置的SNP才能得到判斷,也需要進(jìn)一步開發(fā)其他控制穗發(fā)芽的位點(diǎn)。

        3.1.2 長江上游小麥品種蛋白質(zhì)數(shù)量和質(zhì)量指標(biāo)的不均衡嚴(yán)重影響該區(qū)小麥品質(zhì)

        粗蛋白質(zhì)含量是蛋白質(zhì)數(shù)量指標(biāo),穩(wěn)定時間是蛋白質(zhì)質(zhì)量指標(biāo),而濕面筋含量與蛋白質(zhì)的數(shù)量和質(zhì)量均相關(guān)。胡學(xué)旭等[28-29]認(rèn)為,我國小麥從加工品質(zhì)指標(biāo)來看,品質(zhì)類型間互相交錯,強(qiáng)筋不強(qiáng),弱筋不弱;弱筋小麥蛋白質(zhì)和濕面筋含量逐年上升,使弱筋特性逐漸下降。強(qiáng)筋小麥的沉降值逐年下降,而弱筋小麥呈上升趨勢,導(dǎo)致強(qiáng)、弱筋小麥品質(zhì)下降。從本研究結(jié)果看,長江上游麥區(qū)小麥品質(zhì)現(xiàn)狀是弱筋品種少,大部分中筋品種的蛋白質(zhì)數(shù)量和質(zhì)量不均衡,導(dǎo)致適合優(yōu)質(zhì)面條、饅頭加工的品種較少,而傳統(tǒng)的適合釀酒用的小麥品種因蛋白質(zhì)含量的提高等,也逐漸不能滿足釀酒企業(yè)的需求。

        適宜的栽培措施可影響蛋白質(zhì)數(shù)量。本研究中,對照品種川麥42和15個試驗二年品種的品質(zhì)結(jié)果表明,部分品種在適宜的地點(diǎn)和栽培條件下,可望生產(chǎn)完全達(dá)標(biāo)的中筋小麥或弱筋小麥。本研究中的81個不完全達(dá)標(biāo)的中筋品種(系)中,有38個粗蛋白質(zhì)含量達(dá)到中筋及以上,而穩(wěn)定時間為弱筋的品種(系),為高數(shù)量低質(zhì)量型品種;有14個粗蛋白質(zhì)含量為弱筋,而穩(wěn)定時間為中筋的品種,為低數(shù)量高質(zhì)量型(表6)。針對蛋白質(zhì)數(shù)量和質(zhì)量不均衡的品種,可調(diào)整栽培方式,將38個高數(shù)量、低質(zhì)量型品種的粗蛋白質(zhì)含量降到12%以下,14個低數(shù)量、高質(zhì)量型品種的粗蛋白質(zhì)含量提高到12%以上,從而提高長江上游麥區(qū)中筋小麥品質(zhì)。而在遺傳改良上,將提高穗發(fā)芽和提高穩(wěn)定時間(前38個品種)或降低穩(wěn)定時間(后14個品種)設(shè)為品質(zhì)改良目標(biāo),也能提高該區(qū)小麥品質(zhì)。

        3.2 KASP標(biāo)記檢測基因型在育種中的意義

        明確育種群體和育成品種中關(guān)鍵性狀的基因型,是育種家進(jìn)行品種改良和分子育種的基礎(chǔ),KASP標(biāo)記提供了一種高通量檢測基因型的方法。Rasheed等[6]開發(fā)了70個小麥已克隆基因的KASP標(biāo)記用于小麥育種材料的基因型檢測,涉及光周期等多個性狀;中國農(nóng)科院作科所夏先春老師實驗室在繼續(xù)開發(fā)更多已克隆基因的KASP標(biāo)記(董亞超私人通信)。

        目前,有些KASP標(biāo)記的有效性還需要在育種群體中進(jìn)一步驗證,主要有以下兩個原因。首先,一個基因的SNP較多,對基因單倍型的清楚認(rèn)識是KASP標(biāo)記應(yīng)用于育種的基礎(chǔ)。KASP標(biāo)記是根據(jù)基因內(nèi)某個SNP設(shè)計的,單個SNP不能完全代表基因型,育種家需要尋找適合自己育種群體的單倍型用于基因型選擇。如本研究中檢測的TaPHS1位點(diǎn),在其啟動子區(qū)-222,編碼區(qū)646和666位置的SNP對穗發(fā)芽抗性都很重要[14];本研究使用的Glu-A1位點(diǎn)的KASP標(biāo)記是依據(jù)該位點(diǎn)第1883堿基處的InDel開發(fā)的標(biāo)記,而沒有依據(jù)該位點(diǎn)1594堿基處G/A單堿基的差異,故不能區(qū)分1和2*亞基[10]。其次,某些位點(diǎn)等位基因的復(fù)雜性使分子標(biāo)記的準(zhǔn)確率有待進(jìn)一步驗證。如本研究檢測的小麥低分子量麥谷蛋白亞基等位基因Glu-A3g、Glu-B3g和Glu-A3d三個分子標(biāo)記的結(jié)果還需驗證。

        小麥品質(zhì)是復(fù)雜性狀,不僅受遺傳控制,也受環(huán)境影響。本研究的5個品質(zhì)指標(biāo)中,面團(tuán)穩(wěn)定時間與遺傳關(guān)系較為緊密,也受環(huán)境影響;而容重和粗蛋白質(zhì)含量、濕面筋含量和吸水率4個性狀受環(huán)境影響更大??刂破焚|(zhì)性狀(如穗發(fā)芽抗性)的基因很多,本研究用的20個標(biāo)記是目前與小麥籽粒性狀和品質(zhì)性狀較緊密的KASP標(biāo)記,還有很多基因的KASP標(biāo)記有待開發(fā)(如已克隆的高低分子量麥谷蛋白亞基的多個等位基因)。本研究僅僅針對部分位點(diǎn)進(jìn)行了檢測,因而不能解釋品質(zhì)的差異。期待加強(qiáng)基礎(chǔ)研究,克隆更多基因,更好地認(rèn)識基因與性狀和環(huán)境的關(guān)系;更期望進(jìn)一步將已有的功能標(biāo)記轉(zhuǎn)化為KASP或STARP(semi-thermal asymmetric reverse PCR)[30]標(biāo)記,開發(fā)更多好用的分子標(biāo)記,使基礎(chǔ)研究的成果更好地應(yīng)用于育種實踐。

        4 結(jié) 論

        對2012-2018共7年109個試驗品種和對照品種在長江上游麥區(qū)國家級品種試驗里的品質(zhì)數(shù)據(jù)表明,(1)所有品種的測試樣的平均混合點(diǎn)率為0.66;(2)多數(shù)品種籽粒的商品分級在四級以上;(3)按照品種審定標(biāo)準(zhǔn),在109個品種中,101個是中筋品種,其中有81個品種沒完全達(dá)到中筋分類指標(biāo);(4)穗發(fā)芽和蛋白質(zhì)數(shù)量和質(zhì)量指標(biāo)不均衡是長江上游麥區(qū)的突出問題,品質(zhì)改良應(yīng)以增強(qiáng)穗發(fā)芽抗性和改良穩(wěn)定時間為主要目標(biāo)。

        對109個品種20個位點(diǎn)的KASP標(biāo)記檢測,發(fā)現(xiàn)以下基因型是占多數(shù)的基因型:TaPHS1位點(diǎn)的RioBlanco type基因型,TaSdr-A1位點(diǎn)的A1b基因型,TaGW2-6B位點(diǎn)的Hap-1,2,3基因型,TaGS-D1位點(diǎn)的D1a基因型,TaGs2-B1位點(diǎn)的B1a基因型,Tabas位點(diǎn)的B1a基因型,TaSus2-2A位點(diǎn)的Hap-A基因型,TaSus1-7A位點(diǎn)的Hap-1,3,5基因型,TaSus1-7B位點(diǎn)的Hap-T基因型,TaGS5-A1位點(diǎn)的A1b基因型,TaGASR-A1位點(diǎn)的H1g基因型,Pina-D1位點(diǎn)的D1a基因型,Pinb-D1位點(diǎn)的D1a基因型,Pinb2-v2位點(diǎn)的B2a基因型,Glu-A1位點(diǎn)的1/2*基因型,Glu-D1位點(diǎn)2+12基因型,非Glu-A3g基因型,非Glu-B3g基因型,非Glu-A3d基因型,非1BL·1RS易位。

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