陳霞 丁勁峰
摘? 要:短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)又稱微衛(wèi)星DNA(micro satellite DNA),是一類廣泛存在于人類基因組中的DNA多態(tài)性基因座。它由2-6堿基對(duì)構(gòu)成核心序列,呈串聯(lián)重復(fù)排列。STR基因位點(diǎn)長(zhǎng)度一般在100~300bp之間。因個(gè)體間DNA片斷長(zhǎng)度或DNA序列差異而成高度多態(tài)性,在基因傳遞過(guò)程中遵循孟德?tīng)柟诧@性方式遺傳。因其基因片段短、擴(kuò)增效率高、判型準(zhǔn)確等特點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和親子鑒定等領(lǐng)域。該文報(bào)道在法醫(yī)物證鑒定實(shí)踐過(guò)程中一例2個(gè)STR基因突變的單親親子鑒定,目前這兩個(gè)位點(diǎn)突變的報(bào)道尚不多,以期在后續(xù)實(shí)踐過(guò)程中提供更多有研究?jī)r(jià)值的參考。
關(guān)鍵詞:法醫(yī)物證學(xué)? STR? Y染色體? 突變
中圖分類號(hào):D919 ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-3791(2020)06(a)-0187-02
1? 案例
1.1 簡(jiǎn)要案情
因公安戶籍登記需要,基層派出所委托本鑒定機(jī)構(gòu)對(duì)自稱是孩子父親的男子(31歲)與孩子(報(bào)4月齡)進(jìn)行親子鑒定,孩子生母2月前離家出走,下落不明。按照規(guī)范采集兩者指尖末梢血樣。
1.2 檢驗(yàn)結(jié)果
采用Identifiler-PLUS試劑盒(美國(guó))直接擴(kuò)增檢測(cè),發(fā)現(xiàn)二者在D3S1358等位基因座不符合遺傳規(guī)律,取平均突變率u=0.002[1],按照司法部親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范(SF/Z JD0105001-2010)(以下簡(jiǎn)稱規(guī)范)及公安部法庭科學(xué)DNA親子鑒定規(guī)范(GA/T 965-2011),計(jì)算CPI值為214.2019,達(dá)不到認(rèn)定父權(quán)的標(biāo)準(zhǔn),但也不能排除。根據(jù)規(guī)范要求,采用AGCU Expressmarker 22試劑盒(無(wú)錫中德美聯(lián))重新檢測(cè)常染色體STR檢測(cè),并采用AGCU 21+1 STR試劑盒(無(wú)錫中德美聯(lián))增加常染色體位點(diǎn)檢測(cè),并用Yfier Direct試劑盒(美國(guó))進(jìn)行二者Y-STR檢測(cè),在已檢測(cè)的39個(gè)常染色體STR及16個(gè)Y-STR中,發(fā)現(xiàn)D3S1358、D17S301兩個(gè)等位基因座不符合遺傳規(guī)律。
按規(guī)范對(duì)突變基因座進(jìn)行親權(quán)指數(shù)(PI)、累積親權(quán)指數(shù)(CPI)和親權(quán)概率(W)計(jì)算[2]。各STR基因座分型結(jié)果和PI值計(jì)算結(jié)果見(jiàn)表1。
2? 討論
STR突變是DNA在復(fù)制過(guò)程中,DNA聚合酶發(fā)生滑脫導(dǎo)致核心序列重復(fù)次數(shù)發(fā)生改變所致,中國(guó)人常用的STR基因座平均突變率為0%~0.492%[3]。因?yàn)镾TR基因突變比較罕見(jiàn),兩個(gè)等位基因同時(shí)突變的發(fā)生的概率更低,但在以往文獻(xiàn)報(bào)道中也是有出現(xiàn),此例中疑父與小孩有2個(gè)常染色體不符合遺傳規(guī)律,且經(jīng)一步突變均可形成,即D3S1358基因座,疑父為18,小孩為17,D17S301位點(diǎn),疑父為13,小孩為12,但生母未參與鑒定的情況,報(bào)道較少,認(rèn)定難度較大[4,5]。
親子鑒定中,僅有少數(shù)STR(通常1~2個(gè))基因座違反遺傳規(guī)律時(shí),通常要考慮是突變,還是近親干擾。當(dāng)疑父與孩子的生父具有較近的血緣關(guān)系時(shí),應(yīng)避免錯(cuò)誤認(rèn)定父權(quán)的風(fēng)險(xiǎn)。在排除近親及雙胞胎的前提下,當(dāng)父親與孩子在基因遺傳中確實(shí)出現(xiàn)基因突變時(shí),應(yīng)避免出現(xiàn)錯(cuò)誤排除父權(quán)的風(fēng)險(xiǎn)。
根據(jù)規(guī)范要求,若有基因座不符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律,不能為了獲得較高的PI值,將檢測(cè)到的不符合遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記刪除,應(yīng)該增加檢測(cè)STR基因座的數(shù)量,也可以通過(guò)補(bǔ)充小孩母親樣本,確定突變來(lái)源。如鑒定父子關(guān)系時(shí),可增加檢測(cè)Y染色體遺傳標(biāo)記,在鑒定母女關(guān)系時(shí),可以增加檢測(cè)線粒體DNA(mt-DNA)遺傳標(biāo)記,但其基因頻率不能采用概率累乘,所有的全部線粒體DNA(mt-DNA)基因座應(yīng)作為一個(gè)整體,用其單倍型頻率帶入計(jì)算。綜合分析得出意見(jiàn)。
此例中,在常規(guī)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)一個(gè)STR基因座不符合遺傳規(guī)律,在小孩生母無(wú)法提供樣本的情況下,通過(guò)增加常染色體STR位點(diǎn)及Y-STR基因座的檢測(cè),雖又發(fā)現(xiàn)D17S301等位基因不符合遺傳規(guī)律,但計(jì)算CPI,已達(dá)到認(rèn)定親權(quán)的標(biāo)準(zhǔn),故基于目前已知的條件和DNA檢測(cè)結(jié)果,支持被檢測(cè)男子和孩子存在親緣關(guān)系。
綜上,STR基因座違反遺傳規(guī)律的案例雖少見(jiàn),但已為人們所關(guān)注,在個(gè)別STR基因座違反遺傳規(guī)律的案例應(yīng)該謹(jǐn)慎對(duì)待,可要求生母參與鑒定及增加檢測(cè)基因座,計(jì)算CPI值,按規(guī)范標(biāo)準(zhǔn)判定,必要時(shí)還應(yīng)及時(shí)與委托單位或者被鑒定人進(jìn)行溝通,了解其個(gè)人與家庭成員情況,盡可能避免鑒定差錯(cuò)。
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