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        廣西人群LHCGR基因位點(diǎn)rs10495960和rs7579411分布差異性研究

        2020-07-08 09:50:56闕嘉妤龐曉霞覃莉李秀霞施桂玲王俊利
        關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

        闕嘉妤,龐曉霞,覃莉,李秀霞,施桂玲,王俊利

        (1. 右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心,廣西 百色 533000;2. 右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院住培基地技能培訓(xùn)中心,廣西 百色 533000)

        人黃體生成素/人絨毛膜促性腺激素受體(LHCGR)基因?qū)儆贕蛋白偶聯(lián)受體家族,位于2號(hào)染色體的短臂上(2p21),參與正常生殖過程的多個(gè)環(huán)節(jié),主要在性腺上表達(dá),包括女性卵巢卵泡膜細(xì)胞、顆粒細(xì)胞、黃體和間質(zhì)細(xì)胞以及男性睪丸間質(zhì)細(xì)胞和脂肪細(xì)胞,尤其在激素調(diào)節(jié)、性分化、Leydig細(xì)胞發(fā)育中起重要作用。有研究發(fā)現(xiàn)其與相關(guān)生殖疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[1],。有研究表明,多囊卵巢綜合征(PCOS)[2]、 Leydig細(xì)胞發(fā)育不全(LCH)[3]、家族性男性性早熟(FMPP)[4]等生殖疾病與LHCGR多態(tài)性有關(guān)。本研究通過分析LHCGR基因多態(tài)性rs10495960和rs7579411兩位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率在廣西地區(qū)人群中的分布,并與HapMap數(shù)據(jù)庫公布的4類人群(北京人群、日本人群、歐洲人群、非洲人群)的LHCGR 基因多態(tài)性分型數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,探討LHCGR基因多態(tài)性在不同地區(qū)人群中的分布差異,為深入研究LHCGR基因多態(tài)性與相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制提供重要的遺傳學(xué)理論依據(jù)和分子生物學(xué)基礎(chǔ)。

        1 資料和方法

        1.1 研究對象 隨機(jī)選取2018年5月—2019年5月到右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院生殖中心門診就診的健康體檢者573例,其中男274例,女299例,平均年齡(37.86±12.41)歲。所有研究對象相互之間無親緣關(guān)系,且都來自廣西地區(qū),排除心腦血管疾病、感染性疾病及腫瘤患者等。本研究已獲得醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)。

        1.2 方法

        1.2.1 提取DNA 采集研究對象3 ml靜脈血,用乙二胺四乙酸二鉀( EDTAK2) 抗凝,樣本DNA 提取根據(jù)北京天根生化科技有限公司 DNA 提取試劑盒說明書進(jìn)行,基因組 DNA 備用保存于-20℃冰箱。

        1.2.2 制備引物 PCR引物交由上海天昊生物科技有限公司設(shè)計(jì)合成。rs10495960位點(diǎn)的上游引物序列為:GCCGTTCCTCCCTAGGTGCTAA;下游引物序列為:CCCTGTTCTTCTCGGATCCTTTG;延伸引物為:TCTCTCGGGTCAATTCGTCCTTTTTGGTCTCTGATTCTATTCCCGATGG;rs7579411位點(diǎn)上游引物序列為:CTCCAGTCTCCCCCTTGCTAAAGA;下游引物序列為:TGAGATCTGAGAGAGTATGAGGGGTGAA;延伸引物序列為:TCTCTCG

        GGTCAATTCGTCCTT、AGATCTGAGAGAGTATGAGGGGTGATCG。

        1.2.3 基因測序 反應(yīng)體系(10 μl)包含ddH2O 6 μl、純化后多重PCR產(chǎn)物2 μl、連接緩沖液 1 μl、5’連接引物混合液(1 μM)0.4 μl,3’連接引物混合液(2 μM)0.4 μl、高溫連接酶0.25 μl混勻。PCR反應(yīng)條件為:94℃ 1 min,56℃ 4 min,38個(gè)循環(huán),4℃保存?zhèn)溆?。?.5 μl稀釋后的連接產(chǎn)物,與0.5 μl Liz500 SIZE STANDARD,9 μl Hi-Di 混勻,上ABI3730XL測序前95℃變性5 min,用GeneMapper 4.1分析測序結(jié)果。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 19.0軟件對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。采用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算廣西人群LHCGR基因2個(gè)位點(diǎn)的基因型和等位基因,用Hardy-Weinberg定律檢驗(yàn)研究對象是否有代表性。用χ2檢驗(yàn)比較不同組間的分布差異,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 基因型檢測 LHCGR基因rs10495960和rs7579411位點(diǎn)經(jīng) Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),兩位點(diǎn)基因型P值(分別為0.10和0.87 )均>0.05,達(dá)Hardy-Weinberg平衡,表明本研究具有群體代表性。 測序結(jié)果顯示,在廣西地區(qū)人群中,rs10495960位點(diǎn)基因型為GG、GA、AA,rs7579411 位點(diǎn)基因型為CC、CT、TT。見圖1、圖2。

        圖1 LHCGR基因rs10495960測序圖

        圖2 LHCGR基因rs7579411測序圖

        2.2 LHCGR基因rs10495960和rs7579411多態(tài)性在廣西地區(qū)人群中的分布 統(tǒng)計(jì)分析表明,廣西地區(qū)人群中,LHCGR基因rs10495960和rs7579411位點(diǎn)分別以GA/CT基因型多見,其頻率分別為46.07%和47.12%,以G和C等位基因分布頻率最高,各占64.05%和62.65%。rs10495960位點(diǎn)各基因型和等位基因頻率在男、女兩組間分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);rs7579411位點(diǎn)各基因型和等位基因頻率在男、女兩組間分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表1。

        表1 廣西地區(qū)人群LHCGR基因rs10495960(G/A)和rs7579411(C/T)基因型及等位基因頻率分布

        注:表內(nèi)計(jì)數(shù)資料數(shù)據(jù)用[n(%)]表示。

        2.3 LHCGR基因rs10495960和rs7579411位點(diǎn)多態(tài)性在不同地區(qū)種族人群間的比較 如表2所示,廣西地區(qū)人群 rs10495960位點(diǎn)的基因型頻率與HapMap-JPT、HapMap-CEU、HapMap-YRI 相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),與 HapMap-CHB相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);廣西地區(qū)人群 rs10495960位點(diǎn)的等位基因頻率與HapMap-CHB、HapMap-JPT、 HapMap-CEU、HapMap-YRI相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。

        如表3所示,廣西地區(qū)人群rs7579411位點(diǎn)的基因型頻率與HapMap-JPT、HapMap-YRI相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),與 HapMap-CHB、HapMap-CEU相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意(P>0.05);rs7579411位點(diǎn)的等位基因頻率與HapMap-JPT、HapMap-YRI相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),與 HapMap-CHB、HapMap-CEU相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        表2 廣西地區(qū)人群 rs10495960位點(diǎn)多態(tài)性分布頻率與HapMap公布的其他人群比較

        注:①廣西人群:Guangxi,北京人群:HapMap-CHB,日本人群:HapMap-JPT,歐洲人群:HapMap-CEU,非洲人群:HapMap-YRI;②表內(nèi)計(jì)數(shù)資料數(shù)據(jù)用[n(%)]表示。

        表3 廣西地區(qū)人群rs7579411位點(diǎn)多態(tài)性分布頻率與HapMap公布的其他人群比較

        注:①廣西人群:Guangxi,北京人群:HapMap-CHB,日本人群:HapMap-JPT,歐洲人群:HapMap-CEU,非洲人群:HapMap-YRI;②表內(nèi)計(jì)數(shù)資料數(shù)據(jù)用[n(%)]表示。

        3討論

        多囊卵巢綜合征(polysistic ovary syndrome,PCOS)是常見的婦科內(nèi)分泌疾病之一,最新的流行病學(xué)調(diào)查顯示,在我國婦女中,PCOS的患病率高達(dá)5.6%[5]。PCOS臨床主要表現(xiàn)為月經(jīng)稀發(fā)或閉經(jīng)、無排卵性不孕、肥胖及高雄激素血癥,PCOS患者發(fā)生2型糖尿病、代謝綜合征、血脂異常、高血壓及子宮內(nèi)膜癌等疾病的風(fēng)險(xiǎn)增加,嚴(yán)重危害著廣大女性的身心健康和生活質(zhì)量。

        LHCGR基因?qū)に氐淖R(shí)別和結(jié)合起著重要作用,參與Leydig細(xì)胞發(fā)育、激素調(diào)節(jié)、性分化,在生殖內(nèi)分泌疾病的診斷和治療中具有重要意義。LHCGR基因在激素調(diào)節(jié)過程中是促排卵的關(guān)鍵,在PCOS患者的卵巢卵泡中被認(rèn)為是過早表達(dá)的。有研究發(fā)現(xiàn)[6],PCOS患者血漿中伴有LHCGR表達(dá)水平明顯升高,且LHCGR的高表達(dá)與胰島素抵抗相關(guān)。全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)提示LHCGR基因與漢族 PCOS發(fā)病相關(guān)[7],Mutharasan等[8]檢測到歐洲血統(tǒng)婦女中PCOS 與LHCGR基因兩個(gè)位點(diǎn)rs7562215、rs 10495960多態(tài)性的強(qiáng)烈關(guān)聯(lián)。在瑞典和丹麥患者中[9],LHCGR基因中的兩個(gè)位點(diǎn)rs4597581和rs 4953617多態(tài)性與睪丸生殖細(xì)胞癌的風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。羅嘉莉等[10]用Meta分析發(fā)現(xiàn)LHCGR基因rs13405728多態(tài)性與PCOS的發(fā)生相關(guān),但存在種族差異,在亞洲人種中rs13405728與PCOS的發(fā)病相關(guān),在歐美人種中rs13405728與PCOS的發(fā)病無關(guān)聯(lián)。LHCGR基因多態(tài)性位點(diǎn)rs13405728的TC+CC基因型與新疆地區(qū)PCOS有相關(guān)性,可能是新疆地區(qū)PCOS的2個(gè)易感基因位點(diǎn)[11]。PCOS易感基因位點(diǎn)LHCGR在基因rsl3405728位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性參與了肥胖型維族PCOS患者的發(fā)病[12]。失活LHCGR基因突變可能是46,XY原發(fā)閉經(jīng)的常見原因[13]。Zielen AC等[14]發(fā)現(xiàn)在一個(gè)巴基斯坦家族中,LHCGR基因中的一個(gè)新的純合子框架移位變異與原發(fā)性卵巢功能不全有關(guān)。Lu Xuefeng等[15]的研究結(jié)果支持LHCGR的缺陷破壞排卵,但對受精和胚胎發(fā)育沒有影響。由此可見LHCGR基因多態(tài)性與生殖內(nèi)分泌疾病的研究較成熟廣泛,但目前未見報(bào)道LHCGR基因位點(diǎn)rs10495960和rs7579411 多態(tài)性在不同人群分布狀況。

        經(jīng)本實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析,廣西地區(qū)人群中LHCGR基因rs10495960 位點(diǎn)以G/A基因型較為常見(46.07%),等位基因以G 較為常見(64.05%);rs7579411位點(diǎn)則以C/T 基因型為主(47.12%),等位基因以C為主(62.65%)。其中rs10495960位點(diǎn)基因型頻率及等位基因頻率在男女中的分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示廣西地區(qū)人群中 rs10495960位點(diǎn)多態(tài)性分布頻率與性別有關(guān)聯(lián),男女之間存在分布的差異。另外,rs10495960位點(diǎn)基因型頻率、rs7579411位點(diǎn)基因型頻率及兩位點(diǎn)的等位基因頻率與 HapMap-JPT、HapMap-YRI人群比較,分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。這些結(jié)果表明,廣西人群中存在 LHCGR基因 rs10495960和rs7579411位點(diǎn)的多態(tài)性,這些多態(tài)性與其他種族之間存在差異性?;蚨鄳B(tài)性可因自然選擇、生活環(huán)境影響及種族不同等因素作用而存在很大差異,我們研究結(jié)果同樣體現(xiàn)這個(gè)特性?;蚨鄳B(tài)性可影響蛋白的表達(dá)和功能的差異,使得不同種群或個(gè)體之間對某些疾病的發(fā)生發(fā)展存在不同的易感性,這也是疾病藥物治療存在個(gè)體間差異和耐藥性的重要因素之一。因此,本研究有助于我們了解廣西人群中LHCGR基因多態(tài)性的遺傳背景,為今后深入研究PCOS與多態(tài)性關(guān)系提供數(shù)據(jù)支持。

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