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        SOCS3基因甲基化狀態(tài)與兒童急性淋巴細胞白血病治療反應及預后的相關性

        2020-06-11 03:27:30江傲霜王寧玲劉亢亢吳正玉儲金華楊林海
        安徽醫(yī)科大學學報 2020年5期
        關鍵詞:低水平高水平甲基化

        江傲霜,王寧玲,劉亢亢,吳正玉,儲金華,楊林海

        兒童急性淋巴細胞白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)是兒童惡性腫瘤中最常見類型[1],其發(fā)病機制極其復雜,研究表明白血病的發(fā)生可能與Janus 蛋白質酪氨酸激酶(janus protein tyrosine, JAK)/信號轉導因子和轉錄激活子3(singal transducer and activator of transcription 3, STAT3)信號通路的異常持續(xù)活化有關[2],細胞因子信號轉導抑制因子3(cytokine signaling 3, SOCS3)作為一種可能的抑癌基因,是JAK/STAT3信號轉導通路的重要抑制因子,在多種惡性腫瘤中可發(fā)現(xiàn)SOCS3啟動子區(qū)域的胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點(CpG位點)高甲基化,從而引起SOCS3基因的表達下調或缺失[3]。這些已經(jīng)成為國內(nèi)外針對惡性腫瘤發(fā)病機制及特異性靶向治療的研究熱點,但國內(nèi)外針對SOCS3基因甲基化及轉錄水平與兒童ALL病程和預后的相關性研究少有報道。該研究通過檢測兒童ALL疾病不同階段的SOCS3甲基化及mRNA表達水平,并與正常兒童進行對照研究,以探討其與兒童ALL的治療反應及預后的關系,從而為SOCS3是否能作為兒童ALL特異性靶向治療點提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 病例資料選擇2015年1月~2016年11月就診于安徽醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院兒科血液病區(qū)的新診斷的ALL患兒作為研究對象,納入及排除標準參照文獻[4],共83例ALL患兒納入研究,隨訪時間截止至2018年6月,同時選擇21例健康兒童作為正常對照組。入組ALL患兒均完善骨髓細胞學、免疫分型、染色體核型分析及融合基因檢測(TEL-AML基因、E2A-PBX基因、BCR-ABL基因、MLL基因重排等),根據(jù)初診時臨床及生物學特點,危險度分為低危(low risk, LR)、中危(moderate risk, MR)、高危(high risk, HR)3組,根據(jù)治療第19天和第46天骨髓微小病變殘留水平(minimal residual disease, MRD)調整危險度,按照CCCG-ALL-2015方案進行序貫化療,總療程2.5年。該研究已經(jīng)獲得安徽醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會的批準(N0.201501),根據(jù)赫爾基宣言,所有入組患兒監(jiān)護人均簽署臨床研究知情同意書、化療知情同意書、廢棄標本用于科研同意書,對照組健康兒童在入組前由監(jiān)護人簽署廢棄標本用于科研同意書。

        1.2 骨髓單個核細胞提取用無菌EDTA抗凝管留取ALL患兒和正常兒童骨髓血2 ml,加入Ficoll分離液(天津生物科技有限公司),參照說明書提取骨髓單個核細胞。

        1.3 RNA提取和逆轉錄定量聚合酶鏈式反應(reverse transcriptional quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR)用TRIzol試劑(美國Invitrogen公司)從骨髓標本中提取RNA。用QuantiTect(德國Chiagen GmbH公司)逆轉錄試劑盒將RNA逆轉錄成cDNA。以甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)基因為參照基因,用qRT-PCR進行cDNA定量檢測。SOCS3 mR-NA前引物序列: 5′-CAGCTCCA AGAGCGAGACCA-3′;SOCS3 mRNA后引物序列: 5′-AGAAGCCGCTCTCCTGCAG-3′;內(nèi)參基因GADPH前引物序列: 5′-AATGGAAAT CCCATCACCATCT-3′;GADPH后引物序列:5′-CGCCCCACTTGATTTTGG-3′。根據(jù)數(shù)據(jù)結果運用2-ΔΔCT公式計算mRNA相對表達量。

        1.4 細胞DNA提取及甲基化特異性PCR反應參照DNA 提取試劑盒說明書提取細胞DNA 后,用紫外分光光度計測定DNA 的純度和濃度,取0.5 μg DNA 樣品(A260 nm/280 nm比值在1.7~2.0)進行亞硫酸鹽修飾,按照MethylCodeTM Bisulfite轉化試劑盒(美國Invitrogen公司)說明書對cDNA 進行處理,使抽提到的DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶通過亞硫酸氫鹽處理后全部轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變。SOCS3甲基化水平檢測以亞硫酸氫鈉修飾DNA為模板,采用亞硫酸氫鈉測序法檢測SOCS3基因甲基化水平。用上海Invitrogen公司設計和合成的巢式亞硫酸氫鈉測序PCR引物對CpG島進行擴增。第一輪引物序列,上游為5′-TTGATT TYGTAGGTGAT-3′,下游為5′-ACCTTTATATATATA TATATATATACACATACTC-3′(擴增片段555 bp);第二輪引物序列,上游為5′-GAGTATATAAGAAG GT-3′,下游為5′-TCCTATATATACCC-3′(擴增片段408 bp)。用1.5%瓊脂糖凝膠把PCR 產(chǎn)物電泳后,用凝膠回收試劑盒進行回收純化,然后用氨芐西林耐藥的TA克隆進行連接反應。從每個平板中篩選出10個克隆,接種于2 ml LB培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)過夜。最后送上海Invitrogen公司進行測序,分析測序結果中,○代表未發(fā)生甲基化的CG 位點,●代表發(fā)生甲基化的CG位點。

        1.5 統(tǒng)計學處理采用SPSS 17.0軟件進行統(tǒng)計分析,GraphPad 6.0作為制圖軟件。計數(shù)資料采用百分數(shù)進行卡方檢驗及Fisher 確切概率處理數(shù)據(jù);計量資料采用均數(shù)±標準差表示并用方差分析處理數(shù)據(jù)。采用2-ΔΔCT法計算SOCS3 mRNA水平;采用秩和檢驗法分析SOCS3基因甲基化水平與臨床特點及治療反應的關系;采用Kaplan-Meier曲線繪制總生存率(overall survival, OS)和累積復發(fā)率(cumulative incidence of relapse, CIR)曲線,單因素預后分析采用對數(shù)秩Log-Rank卡方檢驗法,以P<0.05差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 一般結果83例ALL患兒納入研究,男43例,女40例,中位年齡6.2歲(7月~14歲),21例健康兒童作為健康對照組,男13例,女8例,中位年齡6.3歲(10月齡~ 14歲)。ALL患兒組與健康對照組在性別比率及年齡構成比之間差異無統(tǒng)計學意義(P<0.05)。ALL患兒與健康對照組兒童一般臨床資料見表1。

        2.2 兒童ALL化療前后SOCS3 mRNA表達水平83例ALL患兒按照CCCG-ALL-2015方案按序規(guī)范化治療后,9例復發(fā),74例完全緩解。測定83例患兒初診時和健康對照組兒童的SOCS3 mRNA表達水平顯示,初診(1.024±0.584)及復發(fā)組(0.796±0.384)患兒SOCS3 mRNA的表達水平明顯低于健康對照組(3.459±1.118)兒童SOCS3 mRNA的表達水平(P<0.05);完全緩解組患兒SOCS3 mRNA的表達水平基本恢復正常,與初診組SOCS3 mRNA的表達水平差異具有統(tǒng)計學意義(3.021±0.549vs1.024±0.584;P<0.05),而與健康對照組兒童SOCS3 mRNA的表達水平比較差異無統(tǒng)計學意義(3.021±0.549vs3.459±1.118;P>0.05)。

        2.3 SOCS3基因甲基化狀態(tài)與治療反應的相關性運用甲基化特異性PCR檢測初診組、復發(fā)組、完全緩解組及健康對照組兒童的SOCS3基因甲基化水平,結果顯示:初診組、復發(fā)組、完全緩解組患兒的SOCS3基因甲基化水平檢測陽性率不等,而健康對照組兒童SOCS3基因甲基化均未檢出。初診組、復發(fā)組、完全緩解組ALL患兒的SOCS3基因甲基化水平明顯高于健康對照組(P<0.05);初診組及復發(fā)組ALL患兒的SOCS3基因甲基化水平明顯高于完全緩解組(Z=4.539、3.044;P<0.05),見表2、圖1。

        表1 ALL及健康對照組兒童一般臨床資料

        復發(fā):定義為骨髓幼稚細胞≥20%,或髓外有白血病細胞浸潤證據(jù);完全緩解:定義為外周血中性粒細胞計數(shù)≥1.0×109/L、血小板計數(shù)≥100×109/L及血紅蛋白濃度≥90 g/L,骨髓幼稚細胞≤5%,且無髓外白血病浸潤的任何證據(jù)。

        表2 ALL組和對照組患者SOCS-3基因甲基化的表達水平

        與健康對照組比較:*P<0.05;與緩解組比較:#P<0.05

        2.4 ALL患兒初診時SOCS3基因甲基化高水平組和低水平組臨床特點比較按照中位數(shù)法將初診組83例患兒SOCS3 基因甲基化水平分為高水平組和低水平組,高水平組中位甲基化密度為31.14%(25.32%~48.52%),低水平組中位甲基化密度為15.22%(0~25.19%),比較SOCS3基因甲基化高水平組和低水平組ALL患兒在年齡、性別、初診外周血白細胞計數(shù)及骨髓原始幼稚細胞、危險度分組、免疫分型、細胞遺傳學改變、治療反應中的差異。結果顯示,初診SOCS3甲基化高水平組有更高的外周血白細胞計數(shù),與低水平組之間的差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。SOCS3甲基化高水平組有更多的中高危組病例,兩組比較差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。此外,SOCS3甲基化高水平組的復發(fā)病例高于SOCS3甲基化低水平組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),而化療后SOCS3甲基化高水平組與低水平組比較,其治療完全緩解率差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表3。

        圖1 ALL患兒化療前后SOCS3基因甲基化水平

        A:健康對照組;B:初診組;C:復發(fā)組;D:完全緩解組;○代表未發(fā)生甲基化的CG 位點;●代表發(fā)生甲基化的CG 位點

        將包括初診年齡、外周血白細胞計數(shù)、危險度分組、SOCS3 基因甲基化分組納入Cox比例風險模型進行多因素分析,結果表明:初診外周血白細胞計數(shù)>50×109/L、SOCS3 基因甲基化高水平組患兒復發(fā)率高,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05),相對危險度及95%置信區(qū)間分別為2.348(1.331~4.142)、0.397(0.209~0.751)。

        2.5 SOCS3基因甲基化水平與預后的相關性基于SOCS3基因甲基化水平的42個月總生存率(overall survival, OS)和累積復發(fā)率(cumulative incidence of relapse, CIR)的Kaplan-Meier曲線見圖3,SOCS3基因甲基化高水平組CIR明顯高于低水平組(P<0.05);而SOCS3基因甲基化高、低水平組總生存率之間差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。

        3 討論

        SOCS3作為負性調節(jié)JAK/STAT信號轉導通路的重要抑制蛋白之一,在胰腺癌、乳腺癌、肝癌等多種實體腫瘤中發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞中均有SOCS3的表達下調[5-7]。 為探討SOCS3在兒童ALL不同病程中的變化,本研究采用qRT-PCR技術檢測了ALL患兒不同病程SOCS3 mRNA的表達水平,結果顯示,初診及復發(fā)階段SOCS3 mRNA的表達水平明顯低于健康對照組兒童,完全緩解階段SOCS3 mRNA的表達水平基本恢復正常。以上結果證實SOCS3也參與了兒童ALL的發(fā)生和發(fā)展,其表達水平與兒童ALL治療反應密切相關。SOCS3在復發(fā)狀態(tài)的再次減低,提示SOCS3 mRNA的表達水平在病程中的再次減低可能作為評估體內(nèi)殘留腫瘤細胞水平升高的指標,但其特異性有待進一步研究。

        表3 初診組ALL患兒SOCS3 基因甲基化高水平組和低水平組臨床特點比較

        圖3 ALL患兒SOCS3基因甲基化高、低水平組的生存分析A:累積復發(fā)率比較;B:總生存率比較;與低水平組比較:*P<0.05

        針對SOCS3在惡性腫瘤中的低表達分子機制引起眾多學者的關注和興趣,本課題組前期研究結果表明小兒ALL初診階段SOCS3的表達水平與STAT3的水平呈負相關,SOCS3在ALL兒童中的低表達可以導致ALL中STAT3的異常持續(xù)活化[4],然而,SOCS3基因表達下降的原因尚不清楚。在基因表達調控的研究中表明,最常見的基因修飾是DNA甲基化,在多種惡性腫瘤中均存在基因啟動子啟動子區(qū)域甲基化改變[8],且研究表明SOCS3的異常甲基化有助于JAK/STAT信號轉導通路的異常激活,從而影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及侵襲過程[2]。本研究組運用甲基化特異性PCR檢測初診組、復發(fā)組、完全緩解組即代表兒童ALL不同病程階段的SOCS3基因啟動子區(qū)域甲基化水平,探討SOCS3基因表達降低的可能機制。結果顯示ALL患兒不同病程的SOCS3基因甲基化水平明顯高于健康對照組,提示SOCS3甲基化引起的SOCS3基因表達下調對兒童ALL的發(fā)生和發(fā)展具有重要意義。

        有關學者在針對肝細胞癌的研究中發(fā)現(xiàn),SOCS3表達與腫瘤分化程度、血管浸潤及復發(fā)有關,SOCS3甲基化在腫瘤組織中的頻率和強度都有所增加,SOCS 3甲基化與肝細胞癌患者不良的臨床結局顯著相關,SOCS3表達水平及SOCS 3甲基化水平可作為評估肝癌預后的相關指標[7]。在本課題組前期研究中發(fā)現(xiàn)SOCS3高表達組具有更高的外周血白細胞計數(shù)、乳酸脫氫酶水平及更多的預后不良基因病例[9]。為進一步討論SOCS3甲基化對SOCS3表達及ALL患兒治療反應及預后的影響,本研究針對SOCS3甲基化水平與治療反應及預后的相關性作出分析,結果顯示SOCS3甲基化水平的差異與兒童ALL初診外周血白細胞計數(shù)、疾病危險度相關。SOCS3甲基化低水平組患兒具有更高的外周血白細胞計數(shù),且具有更多的中危組和高危組病例。

        本研究中患兒初診時SOCS3甲基化水平升高,完全緩解后較前減低,復發(fā)后再次升高,提示SOCS3甲基化水平可反映白血病負荷程度,結合42個月隨訪結果顯示SOCS3甲基化高水平組復發(fā)率明顯高于低表達水平組,提示SOCS3甲基化水平與復發(fā)明顯相關,多因素分析提示SOCS3甲基化水平是影響復發(fā)率的重要危險因素之一。相關研究表明SOCS3通過調控STAT3參與腫瘤的發(fā)生及演進,SOCS3高度甲基化從而促使SOCS3基因沉默,無法負性調節(jié)JAK2/STAT3通路,從而促使STAT3的過度激活,誘發(fā)慢性炎癥有關的細胞因子,如IL-6、M-CSF、COX2等,這些因子又通過相關受體激活間質細胞中的STAT3,STAT3在腫瘤細胞和腫瘤基質細胞之間形成反饋環(huán),促進炎性腫瘤微環(huán)境的形成,從而增強腫瘤的侵襲和轉移[10-11]。該研究證實了這一過程,提示SOCS3高度甲基化參與兒童ALL復發(fā)過程,SOCS3甲基化水平能否作為監(jiān)測復發(fā)后患兒治療療效的指標也是本課題組進一步的研究方向。但SOCS3甲基化高水平組和低水平組的總生存率之間差異無統(tǒng)計學意義,分析原因可能是與完成整個CCCG-ALL-2015方案療程停藥的患者較少、隨訪時間較短相關。SOCS3甲基化水平是否能作為評估兒童ALL的遠期預后指標有待繼續(xù)跟蹤隨訪觀察。

        該研究表明SOCS3基因高度甲基化導致SOCS3基因表達下調,與兒童ALL的發(fā)生、發(fā)展、復發(fā)密切相關,這一結果啟發(fā)我們應用去甲基化試劑恢復體內(nèi)SOCS3表達功能,從而重新實現(xiàn)對JAK/STAT信號轉導通路的負性調節(jié)作用,抑制腫瘤細胞增殖,促進凋亡,可能有助于控制兒童ALL的惡化趨勢。SOCS3基因能否作為治療兒童ALL的新靶點有待研究組進一步探究。

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