劉鐵鋼 白辰 鄭子安 萬(wàn)宇翔 徐競(jìng)男 于河 谷曉紅
摘要:目的? 基于腦腸軸與免疫、炎癥、發(fā)熱的關(guān)系,運(yùn)用多源數(shù)據(jù)庫(kù)信息整合法探討銀萊湯干預(yù)腦腸軸相關(guān)靶點(diǎn)的作用機(jī)制,為實(shí)驗(yàn)研究提供靶向性指導(dǎo)。方法? 檢索中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP)及PubChem、David數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建銀萊湯靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),檢索SCI文獻(xiàn)以建立腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)對(duì)銀萊湯靶標(biāo)和腦腸軸靶標(biāo)進(jìn)行對(duì)比分析,獲得銀萊湯干預(yù)腦腸軸潛在靶標(biāo)。結(jié)果? 發(fā)現(xiàn)銀萊湯藥物化學(xué)成分429個(gè),銀萊湯的作用靶標(biāo)689個(gè),腦腸軸相關(guān)靶標(biāo)99個(gè),銀萊湯干預(yù)腦腸軸的潛在靶標(biāo)35個(gè)。結(jié)論? 銀萊湯干預(yù)腦腸軸的靶標(biāo)主要集中在與腦腸肽相關(guān)的酶,主要功能為免疫、炎癥、能量代謝,可參與人體的免疫應(yīng)答、氧化損傷等。
關(guān)鍵詞:溫病學(xué);銀萊湯;小兒肺炎;腦腸軸
中圖分類(lèi)號(hào):R285.5? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A? ? 文章編號(hào):1005-5304(2020)04-0086-06
DOI:10.3969/j.issn.1005-5304.201903238
Discussion on Mechanism of Yinlai Decoction Intervening Brain-gut Axis Based on Multi-source Database Integration
LIU Tiegang, BAI Chen, ZHENG Zian, WAN Yuxiang, XU Jingnan, YU He, GU Xiaohong
Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 100029, China
Abstract: Objective To explore the mechanism of Yinlai Decoction intervening brain-gut axis related targets by using multi-source database information integration method based on the relationship between brain-gut axis and immunity, inflammation and fever; To provide targeted guidance for experimental research. Methods TCMSP, HIT, PubChem, and David database were searched to construct Yinlai Decoction target database. SCI literature was searched to establish brain-gut axis target database. Yinlai Decoction target and brain-gut axis target were compared to obtain potential targets of Yinlai Decoction intervention in brain-gut axis. Results There were 429 chemical constituents in Yinlai Decoction, 689 targets of Yinlai Decoction, 99 targets related to brain-gut axis, and 35 potential targets of Yinlai Decoction in intervening brain-gut axis. Conclusion The targets of Yinlai Decoction intervening brain-gut axis mainly concentrates on the enzymes related to brain-gut peptide. Its main functions are immunity, inflammation and energy metabolism, which can participate in the immune response and oxidative damage of human body.
Keywords: epidemic febrile diseases; Yinlai Decoction; pediatric pneumonia; brain-gut axis
肺炎是兒童呼吸系統(tǒng)常見(jiàn)病,為我國(guó)重點(diǎn)防治的小兒疾病。中醫(yī)治療小兒肺炎可縮短病程、改善癥狀及減少不良反應(yīng)。銀萊湯以肺與胃腸同治法組方,由金銀花、萊菔子、連翹、黃芩、魚(yú)腥草、前胡、瓜蔞組成,治療小兒肺炎療效確切[1]。
研究發(fā)現(xiàn),銀萊湯可調(diào)控機(jī)體血清炎癥因子表達(dá)[2],提高肺組織分泌型免疫球蛋白A含量,調(diào)節(jié)機(jī)體干擾素-γ、白細(xì)胞介素-4及TH1/TH2水平[3]。銀萊湯能降低發(fā)熱大鼠下丘腦中5-羥色胺(5-HT)含量,升高下丘腦中胃饑餓素(Ghrelin)含量[4],5-HT與Ghrelin是腦腸軸的重要介質(zhì)。腦腸軸是中樞神經(jīng)系統(tǒng)與胃腸道功能之間相互作用的雙向調(diào)節(jié)軸,可連接成神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫網(wǎng)絡(luò),與免疫、炎癥、發(fā)熱關(guān)系密切[5]。手太陰肺經(jīng)屬肺絡(luò)大腸,手陽(yáng)明大腸經(jīng)屬大腸絡(luò)肺,肺與大腸互為表里,生理相連,病理相關(guān)。因此,肺炎與腦腸軸之間可能存在關(guān)系。基于前期研究,本課題運(yùn)用多源數(shù)據(jù)庫(kù)信息整合法,探討銀萊湯干預(yù)腦腸軸的作用靶標(biāo),闡述銀萊湯的作用機(jī)制。
1? 資料與方法
1.1? 建立銀萊湯作用靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)
采用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)[6],在“HERB”中檢索獲得銀萊湯各組成藥物(金銀花、萊菔子、連翹、黃芩、魚(yú)腥草、前胡、瓜蔞)的化學(xué)成分?;谒幬锏捏w內(nèi)ADME過(guò)程,以口服生物利用度(OB)≥30%、藥物相似度(DL)≥0.18和小腸上皮吸收率(Caco-2)>-0.4,對(duì)獲得的化合物進(jìn)行活性成分的篩選和預(yù)測(cè)。
通過(guò)PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih. gov/pccompound)[7]檢索各化學(xué)成分的CID號(hào),通過(guò)CID號(hào)在“Pubchem Tool”下的“Chemical Structure Search”,點(diǎn)擊“identity similarity”下的“CID,SMILES,INCHI”檢索各藥物的活性成分。然后,依次通過(guò)“Renfine your results”下的“BioActivity Experiments”和“Action on your results”下的“BioActivity Analysis”對(duì)活性成分進(jìn)行靶點(diǎn)分析。在靶點(diǎn)分析結(jié)果的Sequence GI used in assays中整理GI號(hào),通過(guò)David數(shù)據(jù)庫(kù)(http://david.abcc.ncifcrf.gov/summary.jsp)[8],檢索獲得銀萊湯的作用靶標(biāo)。
將TCMSP、PubChem、David數(shù)據(jù)庫(kù)獲得的銀萊湯靶標(biāo)數(shù)據(jù)合并,建立銀萊湯靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)。
1.2? 建立腦腸軸作用靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)
腦腸軸是在神經(jīng)胃腸病學(xué)發(fā)展的背景下興起的研究熱點(diǎn),針對(duì)腦腸軸靶標(biāo)的研究未成系統(tǒng),目前國(guó)內(nèi)數(shù)據(jù)庫(kù)及Pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)主要為一些常見(jiàn)的腦腸軸靶標(biāo)重復(fù)驗(yàn)證的報(bào)道?;诖?,腦腸軸靶標(biāo)檢索選用SCI文獻(xiàn)。
檢索SCI數(shù)據(jù)庫(kù)(Web of Science,http://www. isiknowledge.com),檢索式為“TS=(brain-gut axis OR brain-gut peptide)”“TS=(intestine AND neuroendocrine)”“TS=(brain AND neuroendocrine)”,對(duì)獲得的文獻(xiàn)進(jìn)行閱讀分析,采用雙人錄入,通過(guò)大范圍初篩和精細(xì)化二輪篩選,采集以蛋白類(lèi)、神經(jīng)遞質(zhì)類(lèi)和酶類(lèi)為主的文獻(xiàn),記錄文獻(xiàn)中與腦腸軸有關(guān)(腦、腸共表達(dá))的靶標(biāo),建立腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)。
1.3? 數(shù)據(jù)庫(kù)匹配
通過(guò)對(duì)銀萊湯靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)與腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行匹配,獲得銀萊湯干預(yù)腦腸軸的潛在靶標(biāo)。運(yùn)用Cytoscape3.6.2構(gòu)建銀萊湯藥物與腦腸軸靶標(biāo)相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。
2? 結(jié)果
共獲得銀萊湯7味藥物的429個(gè)化學(xué)成分,689個(gè)相關(guān)靶標(biāo)。SCI數(shù)據(jù)庫(kù)檢索得到文獻(xiàn)3710篇,腦腸軸相關(guān)靶標(biāo)99個(gè)。通過(guò)對(duì)銀萊湯作用靶標(biāo)與腦腸軸相關(guān)靶標(biāo)進(jìn)行匹配分析,獲得銀萊湯干預(yù)腦腸軸的潛在靶點(diǎn)35個(gè),其中前胡26個(gè)、連翹23個(gè)、金銀花21個(gè)、魚(yú)腥草20個(gè)、瓜蔞16個(gè)、黃芩8個(gè)、萊菔子4個(gè)。根據(jù)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org/)得到35個(gè)靶點(diǎn)的功能。結(jié)果見(jiàn)圖1、表1、表2。
3? 討論
小兒肺炎屬中醫(yī)學(xué)“風(fēng)溫肺熱病”,肺經(jīng)熱邪可“逆?zhèn)餍陌毙纬晌V匕Y,也可順傳胃經(jīng)和大腸經(jīng)[9]。小兒胃腸薄弱,加之飲食不知節(jié)制,易攝入高熱量食物形成胃腸積熱,加重小兒肺炎的發(fā)生發(fā)展[10]。根據(jù)小兒肺炎的傳變規(guī)律,結(jié)合小兒體質(zhì)特點(diǎn),在小兒肺炎肺熱證階段應(yīng)肺與胃腸同治。銀萊湯以金銀花、萊菔子為君,在上清宣太陰肺經(jīng)熱邪,在下清泄陽(yáng)明胃腸積熱;黃芩、連翹、魚(yú)腥草、前胡為臣,清肺瀉火、降氣止咳;瓜蔞為佐使,清降肺胃之火、潤(rùn)腸通便。諸藥相伍,共奏肺與胃腸同治之功。
銀萊湯的肺與胃腸同治,以胃腸疾病與肺系疾病相關(guān)性為基礎(chǔ),消化、呼吸系統(tǒng)疾病均與腦腸軸關(guān)系密切。腦腸軸是中樞神經(jīng)系統(tǒng)與胃腸道功能之間相互作用的雙向調(diào)節(jié)軸。腸道神經(jīng)細(xì)胞數(shù)量比脊髓還多,與大腦的神經(jīng)細(xì)胞數(shù)量相當(dāng),腸與腦之間通過(guò)腦腸軸雙向互通[5]。腦腸軸可以通過(guò)神經(jīng)傳導(dǎo)進(jìn)行連接,由中樞神經(jīng)系統(tǒng)、腸神經(jīng)系統(tǒng)和自主神經(jīng)系統(tǒng)共同支配,神經(jīng)傳導(dǎo)通過(guò)這3個(gè)途徑實(shí)現(xiàn)。腦腸軸的另一個(gè)重要連接是神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫網(wǎng)絡(luò),神經(jīng)內(nèi)分泌細(xì)胞受神經(jīng)遞質(zhì)或激素等物質(zhì)調(diào)節(jié),維持腦腸軸的正常功能。研究表明,腦腸軸作用通路包括內(nèi)臟刺激神經(jīng)傳導(dǎo)通路、腦腸肽、神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫調(diào)節(jié)通路、神經(jīng)-情感通路[11]。腦腸軸各通路的作用均依賴(lài)于腦腸軸靶標(biāo)作為物質(zhì)基礎(chǔ),而目前缺乏針對(duì)腦腸軸靶標(biāo)的全面深入研究。
本研究通過(guò)文獻(xiàn)挖掘發(fā)現(xiàn),腦腸軸的主要靶標(biāo)包括腦腸肽,如Vasoactive intestinal peptide(VIP)、Neuropeptide Y(NPY)、Serotonin (5-HT)、Calcitonin gene related peptide (CGRP)、Angiotensin Ⅱ、Somatostatin、Ghrelin、Cholecystokinin octapeptide(CCK-8)等,還有相關(guān)的酶,如Amylase、Amylin、Glutathione peroxidase、Non-neuronal enolase等,以及神經(jīng)遞質(zhì)和受體,如Gastrin、Dopamine D1 receptor、Dopamine receptor、Somatostatin receptors(SSTR)、GH secretagogue receptor (GHSR)等。腦腸肽是一類(lèi)在腦和胃腸道具有雙重分布的小分子物質(zhì),具有激素和神經(jīng)遞質(zhì)的雙重作用,參與胃腸道功能的調(diào)節(jié)[12]。腦腸肽是腦腸軸的重要作用靶點(diǎn),是研究腦腸軸靶點(diǎn)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),對(duì)探索腦腸軸的臨床指導(dǎo)意義具有重大價(jià)值。有研究表明,血管活性腸肽(VIP)、胃泌素(Gastrin)等腦腸軸靶標(biāo)與肺炎關(guān)系密切,哮喘等疾病發(fā)生時(shí),肺組織中VIP含量明顯降低,氣道上皮及局部炎癥細(xì)胞的VIP受體表達(dá)增多[13]。重癥肺炎患兒血漿Gastrin水平高于對(duì)照組及普通肺炎患兒,且隨著病情的好轉(zhuǎn)其濃度降低[14]。
銀萊湯干預(yù)腦腸軸的潛在靶標(biāo)并不是以腦腸肽為主,而主要是與腦腸肽相關(guān)的酶,如Nitric oxide synthase、Nitric oxide synthase、Neutrophil collagenase、Catalase Pancreatic alpha-amylase、Beta-amylase、Peroxidase/catalase T、Superoxide dismutase、Maltase glucoamylase、Glutathione S-transferase P、Glutathione S-transferase Mu 1、Glutathione S-transferase Mu 2、Glutathione S-transferase 1等;其次是相關(guān)神經(jīng)遞質(zhì)受體,如Sodium-dependent dopamine transporter、Dopamine D1 receptor、Vascular endothelial growth factor receptor 2、Sodium-dependent serotonin transporter、Dopamine receptor、Calcitonin receptor等;而干預(yù)的腦腸肽主要涉及Cholecystokinin、Peptide YY、Proenkephalin-A、Pro-opiomelanocortin (POMC-C)等,相對(duì)較少。銀萊湯干預(yù)腦腸軸靶標(biāo)的主要藥物是金銀花、連翹、前胡,這3味藥物的干預(yù)靶標(biāo)占所有作用靶標(biāo)的82.9%,主要涉及腦腸肽相關(guān)酶和神經(jīng)遞質(zhì)受體。銀萊湯干預(yù)腦腸軸靶標(biāo)的主要功能為炎癥、免疫、能量代謝等,可以參與人體的血糖調(diào)節(jié)、氧化損傷、免疫應(yīng)答等,而靶標(biāo)相關(guān)的疾病有消化系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)等。
隨著信息技術(shù)的發(fā)展,各種以網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的公共信息數(shù)據(jù)庫(kù)影響力日益擴(kuò)大,且不同類(lèi)型數(shù)據(jù)庫(kù)的涵蓋范圍已產(chǎn)生交叉、重疊。因而,交叉引用數(shù)據(jù)庫(kù)之間的相關(guān)信息進(jìn)行跨學(xué)科研究已成為一種可能。將多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的信息資源進(jìn)行整合,不僅能夠在實(shí)驗(yàn)研究之前鎖定實(shí)驗(yàn)指標(biāo),提高研究的靶向性,而且能夠充分利用已有資源,減少重復(fù)研究。
本研究運(yùn)用多源數(shù)據(jù)庫(kù)信息整合方法建立銀萊湯靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)文獻(xiàn)檢索構(gòu)建腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),將二者進(jìn)行對(duì)比互參,獲得銀萊湯干預(yù)腦腸軸的潛在作用靶標(biāo),從數(shù)據(jù)挖掘?qū)用嫣接戙y萊湯調(diào)控腦腸軸的作用機(jī)理。本研究所構(gòu)建的腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),為后續(xù)的腦腸軸研究提供了重要的數(shù)據(jù)支持;構(gòu)建的銀萊湯干預(yù)腦腸軸靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),為銀萊湯的機(jī)制研究提供了靶向性參考,對(duì)于挖掘中醫(yī)藥寶庫(kù)具有重要的指導(dǎo)意義,也為中藥復(fù)方的現(xiàn)代化研究提供了新的方向和途徑。
本研究建立的數(shù)據(jù)庫(kù)基于目前已發(fā)表的研究文獻(xiàn),隨著研究的不斷深入,不排除繼續(xù)發(fā)現(xiàn)大量靶標(biāo)的可能性,而且本研究?jī)H限于藥物可能的干預(yù)靶標(biāo),具體的調(diào)控機(jī)制仍需實(shí)驗(yàn)研究加以探索和證實(shí)。
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(收稿日期:2019-03-19)
(修回日期:2019-04-28;編輯:陳靜)
基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(81403328);北京市科技專(zhuān)項(xiàng)(Z181100006218083)
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