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        線粒體基因組D環(huán)區(qū)基因突變與結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤的相關(guān)性研究

        2020-04-23 03:32:56范希景傅媛方莉萍項曦王金華浮苗
        浙江臨床醫(yī)學(xué) 2020年3期
        關(guān)鍵詞:突變率堿基結(jié)節(jié)性

        范希景 傅媛 方莉萍 項曦 王金華 浮苗

        線粒體DNA(mtDNA)特別是非編碼控制區(qū)(D-loop 區(qū))突變在宮頸癌、乳腺癌、胃癌、結(jié)直腸癌、肝細胞癌、肺癌和腎細胞癌中均有發(fā)現(xiàn),是腫瘤研究領(lǐng)域中的熱點[1-2]。線粒體除提供能量和產(chǎn)生活性氧(ROS)外,還參與細胞凋亡,其D-loop 區(qū)含有控制mtDNA 復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的調(diào)控序列[3]。甲狀腺腫瘤有逐年增高的趨勢,其發(fā)病機制和治療引起廣泛關(guān)注[4]。結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤雖是良性病變,但有合并癌及癌變的可能性。本文探討mtDNA D-loop 區(qū)突變在結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤致病機制中的作用。

        1 材料與方法

        1.1 標本來源 選取2018 年4 月至2019 年4 月本院無遺傳關(guān)系的結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者74 例,均由>2位病理醫(yī)師診斷。排除其他組織、臟器腫瘤;糖尿病、高血壓;已接受放化療和藥物治療;與線粒體突變有關(guān)疾病者。男女比例約1 ∶2,平均年齡(47.41±10.59)歲。收集同一患者的腫瘤組織和附近正常組織(距離腫瘤組織>5cm),以及外周靜脈血2ml。本項目經(jīng)本院倫理委員會批準,所有患者均簽署知情同意書。

        1.2 方法 (1)DNA 抽提:提取組織和血液細胞總DNA,使用DNA 提取試劑盒(天根有限公司,中國)。(2)PCR 擴增:設(shè)計用于擴增mtDNA D-loop 區(qū)域的引物序列,L15975F: 5'-CTCCACCATTAGCACCCAAAGC-3',H794R: 5'-AGGCTAAGCGTTTTGAGCTG-3'。使用PCR擴增試劑盒(TaKaRa,日本)進行PCR,在PCR 反應(yīng)管中依次加入下列物質(zhì):2×PCR Premix 25μl,上游引物1μl,下游引物1μl,模板DNA2μl,滅菌雙蒸水補足至終體積為50μl。PCR 擴增:95℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,57℃退火30s,72℃延伸40s,35 個循環(huán);72℃延伸4min 擴增。取2μl 反應(yīng)產(chǎn)物,在1.5%的瓊脂糖凝膠上進行電泳。對于擴增效果良好且足量的樣品,進一步進行純化和測序。(3)測序:委托杭州擎科生物公司進行測序,所有樣品均進行雙向測序。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 18.0 統(tǒng)計學(xué)軟件。計量資料以(±s)表示,用t 檢驗;計數(shù)資料以n 表示,用卡方檢驗,P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 PCR 擴增結(jié)果 所有結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤組織、瘤旁正常組織和外周血均擴增出1543bp 片段,見圖1。

        2.2 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者mtDNA D-loop 區(qū)多態(tài)性變化 本研究中74 例結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者,共發(fā)現(xiàn)107(303-309 按一個點)個多態(tài)性變異,人均變異數(shù)為1.45 個,所有變異均有報道,如A73G,G103A,A263G 等。劍橋序列中303-309 位點共有7 個C 堿基,稱之為C7,在303-309 位點會插入或缺失若干個C 堿基,插入一個C 堿基即C8,兩個C 堿基為C9,以此類推;另外也會在523 缺失A 堿基,524 位點缺失C堿基。有10 例標本出現(xiàn)以上多態(tài)性改變,見表1。

        圖1 mtDNA D環(huán)擴增產(chǎn)物瓊脂凝膠電泳圖

        表1 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤mtDNA D-loop 區(qū)部分多態(tài)性變化

        2.3 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者mtDNA D-loop 區(qū)點突變 13 例患者攜帶mtDNA D-loop 區(qū)點突變,突變率為17.57%(13/74),出現(xiàn)A-C,T-C,delAC、G-C 等基突變,異質(zhì)性為38.46%(5/13)。其中10 例患者均攜帶HVR-I 區(qū)(16024~16324)和HVR-II 區(qū)(63~322)兩個高變區(qū)突變,其中HVR-II 區(qū)占53.85%(7/13)。見表2,圖2。

        表2 甲狀腺腫瘤患者 mtDNA D-loop 區(qū)點突變

        圖2 測序結(jié)果堿基替換圖

        2.4 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者臨床資料分析 mtDNA D-loop 區(qū)突變組與非突變組比較,各臨床指標差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表3。

        表3 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者臨床資料分析(±s)

        表3 結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者臨床資料分析(±s)

        注:T3代表三碘甲狀腺氨酸,T4代表甲狀腺素,TSH代表促甲狀腺素,F(xiàn)T3代表游離三碘甲狀腺原氨酸,F(xiàn)T4代表三碘甲狀腺氨酸

        臨床指標 mtDNA D-loop非突變患者(n=61)mtDNA D-loop突變患者(n=13) P值性別比(男∶女) 21∶41 2:11 >0.05年齡 45.72±11.33 50.32±12.66 >0.05有家族史例數(shù) 4 1 >0.05腫瘤大?。╟m2) 5.24±5.07 6.22±4.23 >0.05 T3 1.57±0.30 1.62±0.08 >0.05 T4 113.80±26.02 108.67±13.4 >0.05 TSH 1.45±0.86 1.32±0.97 >0.05 FT3 4.38±0.41 4.29±0.63 >0.05 FT4 13.16±2.4 12.54±2.21 >0.05

        3 討論

        線粒體基因組特別易發(fā)生突變,是由于細胞器中產(chǎn)生高水平的活性氧(ROS)和低水平的錯配修復(fù)基因(MMR)[5-6],且D-loop 區(qū)是人類線粒體基因組中最可變部分[7]。研究發(fā)現(xiàn),尤其是HVR-I 和HVR-II這兩個高變區(qū),堿基替換率高于mtDNA 其他區(qū)域6~8倍[8]。然而,目前對mtDNA 突變位點的研究大多在惡性腫瘤中,國內(nèi)外研究人員已在直腸癌、胃癌、甲狀腺乳頭狀癌及乳腺癌中檢測到相應(yīng)的mtDNA 突變,突變率最高達61%[9-11]。

        本研究對74 例結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤患者mtDNA D-loop 區(qū)測序發(fā)現(xiàn)107 個多態(tài)性位點,人均變異數(shù)為1.45 個。mtDNA nt303~309 區(qū)域是D-loop 區(qū)最常發(fā)生變異的區(qū)域,插入或缺失1~3 個PloyC 結(jié)構(gòu)[12]。在nt303~309 區(qū)域有9 例標本均存在1~3 個堿基C 插入的多態(tài)性改變。nt303~309 區(qū)域是負責RNA-DNA 的形成,從而開始mtDNA 的復(fù)制,這個區(qū)域的一些嚴重突變可能對腫瘤細胞的生長有一定的影響[13]。Maximo V 等[14]檢測突變率分別達50%(15/30)和47.6%(17/36),這些高頻突變反映甲狀腺腫瘤mtDNA 的不穩(wěn)定性。Ding 等[15]在101 例甲狀腺腫瘤(含結(jié)節(jié)性甲狀腺腫、腺瘤和甲狀腺乳頭狀癌)的檢測中發(fā)現(xiàn)在瘤前病變中突變即存在,并隨腫瘤的發(fā)生而增加。本研究中檢出13 例攜帶mtDNA D-loop 區(qū)點突變,突變率為17.57%(13/74),主要集中在兩個高變區(qū)(HVR-I和HVR-II),其中HVR-II 區(qū)占53.85%(7/13),突變是A-C、T-C 等轉(zhuǎn)換,通常導(dǎo)致其相應(yīng)蛋白質(zhì)的中度或高度保守氨基酸的變化。這些數(shù)據(jù)表明mtDNA突變可能在結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤的發(fā)生中起重要作用,鑒于mtDNA 突變存在于良性多結(jié)節(jié)增生中,其可能參與腫瘤發(fā)展的早期階段。

        本研究中發(fā)現(xiàn)有5 例結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤攜帶異質(zhì)性突變,提示突變細胞具有選擇性生長優(yōu)勢,在腫瘤細胞增殖過程中逐漸在數(shù)量上占優(yōu)。由于mtDNA 分子在細胞內(nèi)的復(fù)制優(yōu)勢,突變可能會被放大,mtDNA 擴增后的細胞由于其克隆生長優(yōu)勢可能會占據(jù)整個種群[16]。通過分析D-loop 區(qū)突變狀態(tài)和臨床病理特征間的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)D-loop 區(qū)突變組與非突變組在年齡、性別、是否有家族史、腫瘤大小、以及甲狀腺五項功能檢測差異無統(tǒng)計學(xué)意義。這可能是腫瘤發(fā)展過程中的一個早期事件,在腫瘤演變的全過程中持續(xù)存在。

        綜上所述,本研究確定了D-loop 區(qū)在結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤中是一個具有高度多態(tài)性和較高突變率的區(qū)域。雖然,mtDNA D-loop 區(qū)突變和臨床病理參數(shù)間無相關(guān)性,但能夠為mtDNA D-loop 區(qū)突變和結(jié)節(jié)性甲狀腺腫瘤的發(fā)病機制提供一定的基礎(chǔ)。mtDNA 在腫瘤發(fā)生過程中的變異,有望成為腫瘤診斷、預(yù)后和治療新的靶生物標志物。

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