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        黏蛋白MUC5B啟動(dòng)子rs35705950多態(tài)性與特發(fā)性肺纖維化易感性的研究*

        2020-04-07 11:35:20茍安栓吳長東汪海濤常峪文周明明
        關(guān)鍵詞:肺纖維化等位基因多態(tài)性

        茍安栓,吳長東,汪海濤,常峪文,周明明

        (新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院 1.呼吸與危重醫(yī)學(xué)二科,2.重癥醫(yī)學(xué)一科,3.健康管理中心,新疆 烏魯木齊 830001)

        特發(fā)性肺纖維化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)是一種進(jìn)行性纖維化的肺部疾病,多發(fā)于老年人,且病變部位局限于肺部,目前病因未明,生存期約3~5年,預(yù)后較差[1]。肺纖維化是一種二次打擊疾病,環(huán)境暴露與宿主遺傳相互作用導(dǎo)致肺損傷,目前認(rèn)為多種基因在IPF 發(fā)病過程中起重要作用。其中黏蛋白基因MUC5B啟動(dòng)子rs35705950 G>T 多態(tài)性被認(rèn)為是與IPF 發(fā)病相關(guān)的重要遺傳因素[2]。目前在高加索人群(意大利、法國、英國)[3-5]、中國漢族部分人群[6]已有報(bào)道,但結(jié)果不完全一致。本文采用PCR-直接測(cè)序法對(duì)新疆地區(qū)維吾爾族患者M(jìn)UC5B啟動(dòng)子rs35705950 位點(diǎn)基因多態(tài)性與IPF 發(fā)病的相關(guān)性進(jìn)行初步探討。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        本研究采用基于人群的病例-對(duì)照的研究方法,參照2011年ATS/ERS/JRS/ALAT 聯(lián)合發(fā)布的《特發(fā)性肺纖維化診療指南》中的臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)[7],選取2015年 6月—2018年6月新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院呼吸科與重癥醫(yī)學(xué)二科確診維吾爾族IPF 患者88 例為IPF 組。其中,男性53 例,女性35 例;年齡58~77 歲,平均(66.92±5.80)歲;除外已知的繼發(fā)性肺纖維化、腫瘤、結(jié)核病,以及自身免疫性結(jié)締組織疾病相關(guān)的間質(zhì)性肺炎。對(duì)照組88 例,納入標(biāo)準(zhǔn):與IPF 1∶1 配對(duì)的新疆地區(qū)維吾爾族人群,性別相同;年齡55~80 歲,平均(66.30±6.06)歲;無間質(zhì)性肺疾病病史,主要來自急診或門診就診及健康管理中心體檢的無慢性疾病患者。

        1.2 方法

        IPF 組與對(duì)照組患者分別抽取外周靜脈血3 ml,置于含有2%乙二胺四乙酸二鈉(EDTA)100 μl的一次性試管中,用于DNA 抽提;置于-20℃冰箱冷凍保存,常規(guī)酚-氯-仿-異戊醇抽提法提取基因組DNA。采用PCR-直接測(cè)序法檢測(cè)MUC5B 啟動(dòng)子rs35705950 G>T 多態(tài)性,擴(kuò)增引物序列參照文獻(xiàn)[6],NCBI Accession:1241221,正向引物5'-GC CCATCCCTGCTTTGTG-3',反向引物5'-CACCTCTGCA TCAGCGAGATAG-3'。PCR 反應(yīng)總體積25 μl,配置如下:正向引物1.5 μl,反向引物1.5 μl,10×PCR 反應(yīng) 緩沖液[含(NH4)SO4]2.5 μl,dNTP mixture 1.2 μl,Taq DNA聚合酶0.2 μl,DNA模板2.0 μl,2.5 μl MgCl2。PCR 擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸30 s,最后3 個(gè)步驟,共35 個(gè)循環(huán),最后72℃繼續(xù)延伸5 min。PCR 擴(kuò)增片段976 bp。PCR 產(chǎn)物送鼎國生物技術(shù)股份有限公司進(jìn)行DNA 測(cè)序。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        數(shù)據(jù)分析采用SPSS 19.0 統(tǒng)計(jì)軟件,計(jì)數(shù)資料以例或例(%)表示,基因型分布是否符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律及兩組間基因型和等位基因頻率分布的差異比較采用χ2檢驗(yàn)。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,比較采用t檢驗(yàn)。計(jì)算比值比(O^R)和95%可信區(qū)間(95% CI)評(píng)價(jià)突變基因型及突變等位基因頻率與IPF 的相對(duì)危險(xiǎn)度。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組人群分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡

        MUC5B啟動(dòng)子rs35705950 位點(diǎn)各種基因型在IPF 組和對(duì)照組人群的分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡(P>0.05),具有群體代表性。

        2.2 兩組年齡、性別和吸煙史的比較

        兩組年齡、性別比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(年齡:t=0.699,P=0.485,性別:χ2=0.000,P=1.000);IPF組有吸煙史48 例,對(duì)照組有吸煙史52 例,兩組比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(吸煙史:χ2=0.371,P=0.543)。

        2.3 MUC5B 啟動(dòng)子rs35705950 G>T 多態(tài)性及PCR-直接測(cè)序分析結(jié)果

        MUC5B啟動(dòng)子rs35705950 G>T 多態(tài)性及PCR-直接測(cè)序分析結(jié)果見圖1。

        2.4 MUC5B 啟動(dòng)子rs35705950 G>T 基因型、等位基因頻率及發(fā)生IPF 相對(duì)危險(xiǎn)度分析結(jié)果

        IPF 組與對(duì)照組中的GT 突變基因型和野生GG基因型構(gòu)成比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);兩組等位基因G 和等位基因T 的差異,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

        圖1 MUC5B 啟動(dòng)子rs35705950 G>T 多態(tài)性

        表1 兩組MUC5B 啟動(dòng)子rs35705950 基因型、等位基因的分布及相對(duì)危險(xiǎn)度 例(%)

        3 討論

        IPF 是一種以增強(qiáng)的細(xì)胞外基質(zhì)沉積為特征,進(jìn)行性、最終致命的慢性間質(zhì)性肺病[8]。肺纖維化是基因調(diào)控(異常肺泡上皮細(xì)胞周期的基因調(diào)控及細(xì)胞凋亡)與環(huán)境壓力相結(jié)合的遺傳傾向,包括暴露于已知的纖維材料[9-10],因此認(rèn)為遺傳因素在間質(zhì)性肺疾病發(fā)生中可能起重要作用。研究發(fā)現(xiàn),位于MUC5B啟動(dòng)子的SNP(rs35705950)被證實(shí)與家族性肺間質(zhì)病和IPF相關(guān)性最強(qiáng),存在于34%的家族性肺間質(zhì)病和38%的IPF,僅有9%存在于正常對(duì)照,并被認(rèn)為是這2 種疾病的危險(xiǎn)等位基因[4]。

        目前研究證實(shí),黏蛋白基因MUC5B在氣道黏液纖毛清除、調(diào)節(jié)氣道炎癥、防御肺部感染方面發(fā)揮重要保護(hù)作用[11]。PLANTIER 等[12]對(duì)IPF 時(shí)細(xì)支氣管末端氣腔特征進(jìn)行了從形態(tài)學(xué)到轉(zhuǎn)錄因子及信號(hào)傳導(dǎo)系統(tǒng)相關(guān)性的一系列研究,發(fā)現(xiàn)MUC5B表達(dá)失控參與肺纖維化的形成。該研究發(fā)現(xiàn),在肺組織中rs35705950 明顯導(dǎo)致IPF 患者高表達(dá)MUC5B免疫組織化學(xué)染色顯示在IPF 時(shí),黏蛋白基因MUC5B在微小蜂窩組織部位積聚,蜂窩囊壁化生的上皮細(xì)胞內(nèi)也有補(bǔ)丁樣染色,同時(shí)在蜂窩囊腔中有黏液栓沉積。而過多的黏蛋白基因MUC5B潴留在肺泡和蜂窩組織內(nèi)會(huì)損害宿主的防御功能,從而導(dǎo)致因吸入物質(zhì)沉積,肺清除能力下降而引起的肺損傷,另外,過多的黏蛋白基因MUC5B在呼吸性細(xì)支氣管末端沉積會(huì)影響損傷肺泡的修復(fù),正常肺泡的修復(fù)機(jī)制失敗,最終持續(xù)膠原沉積,瘢痕形成,肺結(jié)構(gòu)破壞,隨著時(shí)間的推移,最終導(dǎo)致終末期肺纖維化的組織重塑和纖維化。

        MUC5B基因位于染色體11p15 的保守簇,主要調(diào)控氣道黏蛋白MUC5B合成。一項(xiàng)來自美國華盛頓大學(xué)對(duì)1 例臨床確診IPF 的61 歲歐美男性患者尸體全基因組測(cè)序研究發(fā)現(xiàn),在MUC5B啟動(dòng)子區(qū)并未發(fā)現(xiàn)除rs35705950 以外其他相鄰的序列變異,也未發(fā)現(xiàn)其他稀少及新發(fā)現(xiàn)遺傳性變型。rs35705950 位于MUC5B啟動(dòng)子區(qū),干擾DNA 酶與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),上調(diào)MUC5B表達(dá)。表明MUC5B啟動(dòng)子區(qū)單核苷酸多態(tài)性可能是與IPF 發(fā)病相關(guān)的重要遺傳因素[2]。BORIE 等[3]報(bào)道一項(xiàng)包括法國、意大利人在內(nèi)的前瞻性隊(duì)列研究及Meta分析結(jié)果,MUC5B啟動(dòng)子G>T多態(tài)性與IPF 發(fā)病相關(guān)。WANG 等[6]對(duì)163 例IPF 患者M(jìn)UC5B啟動(dòng)子G>T 多態(tài)性分析,結(jié)果顯示我國漢族人群IPF 患者中,T 等位基因的頻率為3.33%,高于正常對(duì)照組,分層分析顯示,該變異與中國老年男性IPF 患者遺傳易感性相關(guān)。

        本文通過采用PCR-直接測(cè)序的方法對(duì),按照1∶1 配對(duì)IPF 組與對(duì)照組進(jìn)行MUC5B啟動(dòng)子位點(diǎn)基因多態(tài)性與IPF 發(fā)病的相關(guān)性進(jìn)行初步探討。結(jié)果顯示,兩組的GT 突變基因型和野生GG 基因型構(gòu)成差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,兩組等位基因G 和T 差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。誠然,本研究存在一定局限性,樣本量偏少,且未進(jìn)一步設(shè)立非IPF 特發(fā)性間質(zhì)性肺炎對(duì)照研究,今后將進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量,并從IPF 環(huán)境暴露及遺傳因素交互作用分析,以及其他IPF 易感基因的確定方面尋找更多證據(jù),并希望最終能夠從黏蛋白基因MUC5B功能及表達(dá)的研究中進(jìn)一步證實(shí)遺傳易感性在IPF 發(fā)病的作用。

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