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        椰子織蛾CSP基因的克隆與序列分析

        2019-08-10 04:20:00袁遠(yuǎn)高熹喜超楊志新雷騰云張連根朱家位
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年3期
        關(guān)鍵詞:序列分析基因克隆

        袁遠(yuǎn) 高熹 喜超 楊志新 雷騰云 張連根 朱家位

        摘要:利用rapid-amplification of cDNA ends(RACE)技術(shù),克隆獲得了1條椰子織蛾(Opisina aremosella)的全長(zhǎng)化感蛋白基因序列。該基因全長(zhǎng)為561 bp,開放閱讀框全長(zhǎng)為393 bp,3′和5′端非編碼序列分別為48、120 bp,編碼130個(gè)氨基酸,所編碼蛋白質(zhì)的理論分子量為14.8 ku,等電點(diǎn)為5.85。同源性比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),椰子織蛾化感蛋白基因氨基酸序列有4個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn)且與其他昆蟲化感蛋白基因在氨基酸的水平上相似性不高。除與棉紅鈴蟲(Pectinophora gossypiella)相似度達(dá)71%外,與其他昆蟲相比,均低于10%。SignalP預(yù)測(cè)顯示,椰子織蛾化感蛋白基因所編碼的前20個(gè)氨基酸為信號(hào)肽序列(MAMKYLIVLSCVLAAAIVAG)。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,椰子織蛾化感蛋白與稻縱卷葉螟(Cnaphalocrocis medinalis)、亞洲玉米螟(Ostrinia furnacalis)和家蠶(Bombyx mori)化感蛋白1、2、3、4聚為同一族,與家蠶化感蛋白1、2、3、4的進(jìn)化程度最近。這為深入研究昆蟲化學(xué)感受蛋白、揭開昆蟲與環(huán)境化學(xué)信息聯(lián)系的規(guī)律奠定理論基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞:椰子織蛾;化感蛋白;基因克隆;序列分析;系統(tǒng)進(jìn)化樹

        中圖分類號(hào): S433.4? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A? 文章編號(hào):1002-1302(2019)03-0043-03

        高度發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)對(duì)昆蟲與環(huán)境中的化學(xué)信息聯(lián)系具有重要作用。昆蟲在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中,發(fā)展演變出復(fù)雜的化學(xué)信息感受機(jī)制。例如,在覓食、尋偶、產(chǎn)卵等行為中,通過(guò)敏銳的嗅覺、味覺、觸覺等功能,感受各種環(huán)境化學(xué)因子的刺激,從而進(jìn)行精巧的化學(xué)通信,以適應(yīng)環(huán)境選擇,保持種群繁衍[1]。昆蟲發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)功能的發(fā)揮是基于昆蟲各種感器淋巴液中分布著大量的化學(xué)感受蛋白(chemosensory proteins,簡(jiǎn)稱CSPs)和氣味結(jié)合蛋白(odorant-binding proteins,簡(jiǎn)稱OBPs)。環(huán)境中的氣味分子與各種嗅覺相關(guān)蛋白結(jié)合后,被運(yùn)送至嗅覺神經(jīng)末梢,從而引發(fā)以嗅覺功能為主的各種化學(xué)感受反應(yīng)[2-3]。自1994年McKenna等首次在黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)觸角中發(fā)現(xiàn)2種與傳統(tǒng)的氣味結(jié)合蛋白無(wú)論在結(jié)構(gòu)還是在功能上都有明顯差別的蛋白后,研究者們隨后相繼又在多個(gè)目的昆蟲如雙翅目、直翅目、半翅目、膜翅目、鱗翅目、鞘翅目、脈翅目等中鑒定了大量編碼CSP的基因[4-6]。由于此類蛋白主要存在于昆蟲各種化學(xué)感受器,與感受環(huán)境化學(xué)刺激有關(guān),所以又稱之為昆蟲化學(xué)感受蛋白(chemosensory protein,簡(jiǎn)稱CSP)。CSP種類具有多樣性,表達(dá)部位也不僅僅局限于感受器官,昆蟲CSP在身體各部分的表達(dá)分布具有全面性,種類具有多樣性,種間種內(nèi)分布具有普遍性,而且在雌雄蟲中均有表達(dá),這些特點(diǎn)易于適應(yīng)接受復(fù)雜的環(huán)境化學(xué)刺激信息,承擔(dān)復(fù)雜的化學(xué)感受功能[7]。CSP在昆蟲行為中扮演著重要角色,故對(duì)其進(jìn)行深入研究,這不僅能闡明昆蟲化學(xué)感受蛋白的作用機(jī)制,更有助于深入解析昆蟲與環(huán)境信息交流本質(zhì),為進(jìn)一步開拓害蟲防治和益蟲利用新途徑提供了重要基礎(chǔ)。

        目前,有關(guān)昆蟲化學(xué)感受蛋白的研究主要集中于一些較常見的農(nóng)業(yè)害蟲,如煙粉虱、棉花粉蚧、西花薊馬等。對(duì)于椰子織蛾化感蛋白基因的研究相對(duì)來(lái)說(shuō)就很少了,但其危害性卻不容忽視。2013年8月,我國(guó)首次在海南省萬(wàn)寧市興隆鎮(zhèn)華僑農(nóng)場(chǎng)的椰林中發(fā)現(xiàn)椰子織蛾(Opisina aremosella Walker),風(fēng)險(xiǎn)分析表明,該蟲在我國(guó)屬于高度危險(xiǎn)性有害生物,風(fēng)險(xiǎn)值(R值)達(dá)2.20[8]。鑒于椰子織蛾危害的嚴(yán)重性,于2014年被國(guó)家林業(yè)局列為林業(yè)危險(xiǎn)性有害生物[9]。目前,國(guó)內(nèi)對(duì)椰子織蛾的基因研究較少,僅有關(guān)于形態(tài)特征、生物生態(tài)學(xué)及生物防治方面的介紹性報(bào)道[10-11]。因此,本研究對(duì)椰子織蛾的化感蛋白進(jìn)行克隆和序列分析,旨在探索椰子織蛾感知外界環(huán)境化學(xué)信號(hào)的作用機(jī)制,為今后對(duì)該蟲防治提供新思路和新途徑、研究昆蟲與環(huán)境之間信息聯(lián)系的本質(zhì)規(guī)律奠定分子基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試蟲

        椰子織蛾于2016年采自海南椰子樹,于云南農(nóng)業(yè)大學(xué)實(shí)驗(yàn)室以香蕉葉片為寄主培養(yǎng),待羽化至成蟲收集作為試驗(yàn)材料。

        1.2 總RNA的抽提

        總RNA的抽提采用TRIZOL試劑盒(Invitrogen)提取。

        1.3 RACE

        以新鮮抽提的椰子織蛾總RNA為材料,利用Clontech公司的SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit,合成3′和5′ RACE cDNA模板,以合成的cDNA為模板,參照RACE試劑盒說(shuō)明書克隆該基因的5′端和3′端序列。PCR采用Advantage 2 PCR kit(Clontech)。PCR反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,60 ℃退火50 s,72 ℃延伸2.5 min,循環(huán)40次;72 ℃延伸10 min。1%瓊脂糖檢測(cè)PCR擴(kuò)增結(jié)果,對(duì)目的條帶進(jìn)行切膠回收后并純化。用TA克隆法連接pGEM-T-easy載體(Promega),轉(zhuǎn)化宿主菌為DH5α。在X-Gal和IPTG的存在下,經(jīng)藍(lán)白斑篩選,挑陽(yáng)性克隆于金思特科技(南京)有限公司測(cè)序。

        1.4 序列分析

        核苷酸序列的翻譯和氨基酸序列的比對(duì)分析分別使用GENETYX-MIN 5.1和ClustalX 1.83軟件[12],蛋白信號(hào)肽的預(yù)測(cè)使用SignalP在線分析工具[13],結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)采用M Motifscan[14],分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建采用MEGA 4.0進(jìn)行[15]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 cDNA克隆及序列分析

        將3′和5′ RACE擴(kuò)增所得目的基因片段進(jìn)行拼接,共得椰子織蛾化感蛋白基因的全長(zhǎng)序列為561 bp,開放閱讀框全長(zhǎng)為393 bp,命名為OarCSP(圖1)。3′和5′端非編碼序列分別為48、120 bp,該基因編碼130個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量和等電點(diǎn)分別為14.80 ku和5.85。SignalP預(yù)測(cè)顯示,該蛋白的前20個(gè)氨基酸為信號(hào)肽序列(MAMKYLIVLSCVLAAAIVAG)。結(jié)構(gòu)分析表明,OarCSP氨基酸序列中潛在1個(gè)酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(diǎn)(TGCE72-75)、2個(gè)N-豆蔻?;稽c(diǎn)(GQKYTD20-25和GCEKCT73-78)、2個(gè)蛋白質(zhì)激酶C磷酸化位點(diǎn)(TDK24-26和TPR121-123)和1個(gè)酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn)(TGK110-112)。

        2.2 同源性比較和進(jìn)化分析

        應(yīng)用ClustalX對(duì)OarCSP與其他昆蟲化感蛋白的氨基酸進(jìn)行序列比對(duì)。由圖2可知,OarCSP氨基酸序列具有4個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn),與鱗翅目其他昆蟲相似性不高,其中與棉紅鈴蟲(Pectinophora gossypiella)、桃蛀螟(Conogethes punctiferalis)、茶尺蠖(Ectropis obliqua)、稻縱卷葉螟(Cnaphalocrocis medinalis)和菜粉蝶(Pieris rapae)的相似性分別為71%、5%、9%、6%、8%。應(yīng)用MEGA 4.0鄰接法(neighbor-joining,簡(jiǎn)稱NJ)對(duì)OarCSP與鱗翅目其他昆蟲CSP氨基酸序列進(jìn)行分子進(jìn)化分析,構(gòu)建NJ進(jìn)化樹(圖3)。結(jié)果顯示,鱗翅目夜蛾科、蠶蛾科、螟蛾科的化感蛋白聚為2個(gè)族,OarCSP與化感蛋白OfurCSP、CmedCSP1、BmorCSP1、BmorCSP2、BmorCSP3、BmorCSP4同源性高,聚為一族。

        該分析所用20個(gè)鱗翅目昆蟲化感蛋白的GenBank登錄號(hào)如下:HassCSP[煙青蟲(Helicoverpa assulta)],ABB91378.1;OfurCSP[亞洲玉米螟(O. furnacalis)],BAV56805.1;CmedCSP1[稻縱卷葉螟(Cnaphalocrocis medinalis)],AIX97823.1;CmedCSP2,ALT31606.1;MbraCSP[甘藍(lán)夜蛾(Mamestra brassicae)],AAF71289.1;MsepCSP[黏蟲(Mythimna separata)],JAV45867.1;AipsCSP1[小地老虎(Agrotis ipsilon)],AGR39577.1;AipsCSP2,AAP57460.1;AdisCSP(Athetis dissimilis),ALJ93810.1;SexiCSP[甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)],AKT26484.1;HarmCSP1[棉鈴蟲(Helicoverpa armigera)],AAK53762.1;HarmCSP2,AFR92097.1;CaurCSP[臺(tái)灣稻螟(Chilo auricilius)],AIU68827.1;HzeaCSP[美洲棉鈴蟲(Helicoverpa zea)],AAN63675.1;BmorCSP1[家蠶(Bombyx mori)],NP_001037052.1;BmorCSP2,AAV34688.1;BmorCSP3,AFF18000.1;BmorCSP4,AFD97753.1;SlitCSP[斜紋夜蛾(Spodoptera litura)],ALJ30219.1。

        3 結(jié)論與討論

        在研究昆蟲對(duì)環(huán)境化學(xué)因子刺激感受機(jī)制的過(guò)程中,起初的研究重點(diǎn)是對(duì)氣味的感受機(jī)制,昆蟲化學(xué)感受蛋白的研究源于對(duì)昆蟲氣味結(jié)合蛋白的研究。然而,人們發(fā)現(xiàn)昆蟲對(duì)環(huán)境化學(xué)因子刺激的許多行為反應(yīng)并不能用氣味結(jié)合蛋白和氣味感受機(jī)理來(lái)解釋,直到20世紀(jì)90年代CSP的發(fā)現(xiàn),才為昆蟲對(duì)環(huán)境化學(xué)因子刺激感受機(jī)理開辟了新的途徑。本研究利用RACE技術(shù),從椰子織蛾中克隆獲得1個(gè)CSP基因,根據(jù)其cDNA序列推導(dǎo)的氨基酸序列表明,OarCSP具有昆蟲化感蛋白的典型特征:相對(duì)分子量小,為14.80 ku,N-端存在20個(gè)氨基酸左右的信號(hào)肽,具有4個(gè)保守的半胱氨酸位點(diǎn)和典型的化感蛋白結(jié)構(gòu)域,這體現(xiàn)了不同昆蟲化感蛋白在進(jìn)化過(guò)程中的保守性。通常,每一種昆蟲中都存在多個(gè)化感蛋白基因,特別是近年來(lái)隨著基因組學(xué)的迅猛發(fā)展,許多化感蛋白已迅速地從昆蟲基因組中被發(fā)掘,如從黑腹果蠅、岡比亞按蚊(Anopheles gambiae)、意大利蜜蜂和家蠶的基因組中分別獲得4、8、6、22個(gè)化感蛋白基因,且有假基因的存在。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),CSP編碼基因數(shù)目在各昆蟲物種中都少于化學(xué)感受受體(OR或GR)和OBP編碼基因數(shù),還有很多化感蛋白沒有被發(fā)現(xiàn)[16],據(jù)此可知,更多的椰子織蛾化感蛋白基因有待克隆獲得。多序列同源性分析表明,OarCSP與同目的昆蟲相似性均較低,這主要是因?yàn)槠窕械鞍變H在家蠶、小地老虎、棉鈴蟲、煙青蟲等少數(shù)鱗翅目昆蟲中報(bào)道,尤其是在織蛾科鮮有報(bào)道的緣故。此外,這體現(xiàn)了不同昆蟲物種在生物演變過(guò)程中化感蛋白的進(jìn)化現(xiàn)象,也反映了不同昆蟲之間化感行為的多樣性,這可能是不同昆蟲在適應(yīng)不同環(huán)境中接受復(fù)雜化學(xué)信息刺激的進(jìn)化結(jié)果。經(jīng)分子進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),OarCSP與化感蛋白OfurCSP、CmedCSP1、BmorCSP1、BmorCSP2、BmorCSP3、BmorCSP4聚為同一族,表明它們應(yīng)為同一家族,尤其是OarCSP與家蠶化感蛋白BmorCSP1、2、3和4的進(jìn)化程度最近,它們之間的組織表達(dá)分布、生理功能等應(yīng)相似。

        昆蟲與環(huán)境之間的化學(xué)通信對(duì)于昆蟲生存和繁殖至關(guān)重要,昆蟲CSP遍布幾乎所有感受器,起到感受、溶解、運(yùn)輸、傳導(dǎo)環(huán)境化學(xué)刺激因子的作用[17]。其對(duì)昆蟲感知外界化學(xué)環(huán)境的變化具有關(guān)鍵作用。通過(guò)研究CSP開發(fā)害蟲產(chǎn)卵忌避劑等“昆蟲行為防治劑”,以及益蟲利用新技術(shù)等一直是國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn)和目標(biāo)。通過(guò)掌握昆蟲對(duì)環(huán)境化學(xué)刺激的分子感受機(jī)制,闡明昆蟲行為反應(yīng)的本質(zhì),有利于提高益蟲利用和害蟲治理效率。但要明確昆蟲化學(xué)感受蛋白的化學(xué)信息轉(zhuǎn)換、信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程,還要對(duì)昆蟲化感蛋白進(jìn)行深入研究,才能為防治害蟲和利用益蟲提供新思路和新途徑。本研究克隆獲得椰子織蛾氣化感蛋白OarCSP的基因全長(zhǎng)序列,為深入研究昆蟲化學(xué)感受蛋白,揭開昆蟲與環(huán)境化學(xué)信息聯(lián)系的規(guī)律奠定理論基礎(chǔ)。

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