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        Ⅰ群禽腺病毒套式PCR檢測方法的建立與應用

        2019-07-06 06:11:18朱小甫吳旭錦尚紅梅
        中國動物傳染病學報 2019年3期
        關鍵詞:套式病料心包

        朱小甫,吳旭錦,高 睿,尚紅梅

        (1.咸陽職業(yè)技術學院畜牧獸醫(yī)研究所 動物疫病分子生物學診斷實驗室,咸陽 712000;2.楊凌職業(yè)技術學院,楊凌 712100;3.咸陽市動物疫病預防控制中心,咸陽 712000)

        2015年6月以來,我國多個省雞場中出現了一種新發(fā)疾病,以心包積液和肝臟腫大為主要病征,暫被命名為“心包積液-肝炎綜合征”,目前研究認為其病原為Ⅰ群禽腺病毒(Fowl adenovirus,FAdV)[1]。FAdV病毒粒子直徑為70~90 nm,無囊膜,呈正二十面體對稱結構,核酸為雙股DNA。Ⅰ群FAdV分為A、B、C、D、E共5個種,根據交叉中和試驗可再進一步分為不同的血清型[2]。心包積液-肝炎綜合征可水平傳播,亦能垂直傳播,種雞群感染會導致商品雞群質量低劣,死淘率增加,造成較大經濟損失[3]。2016年,咸陽職業(yè)技術學院畜牧獸醫(yī)研究所調查發(fā)現,陜西省部分雞場存在疑似心包積液-肝炎綜合征病例,為了給臨床提供快速、靈敏的診斷技術手段,咸陽職業(yè)技術學院動物疫病分子生物學診斷實驗室建立了Ⅰ群FAdV套式PCR(nested PCR,nPCR)檢測方法,經過實驗室初步驗證,該方法具有良好的靈敏性和特異性。

        1 材料和方法

        1.1 病毒FAdV HM15株為分離自陜西省商洛市某蛋雞場野毒株,基因測序確定為血清4型腺病毒(FAdV-4),由動物疫病分子生物學診斷實驗室保存;新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)、傳染性法氏囊炎病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)、傳染性喉氣管炎病毒(Infectious laryngotracheitis virus,ILTV)、馬立克氏病病毒(Marek's disease virus,MDV)、雞痘病毒(Fowlpox virus,FPV)均為瑞普生物商品疫苗毒株。

        1.2 病料分別來自咸陽、銅川、寶雞、渭南、和西安市雞場,由動物疫病分子生物學診斷實驗室采集或由雞場送檢疑似心包積液-肝炎綜合征病例的肝臟,共計35份。分別進行研磨處理,13 000×g離心10 min,收集上清液,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 主要試劑DNAiso Reagent、RNAiso plus、rTaq酶、dNTP等分子生物學試劑均為寶生物工程(大連)有限公司產品;其他化學試劑為國產分析純。

        1.4 引物設計與合成參考GenBank上發(fā)表的FAdV基因序列(登錄號:NC001720、EU979370、GU188428),針對FAdV六鄰體Hexon基因設計并合成了2對引物,序列分別為FAdV-1F:5'-TCAACCACCACCGTAACTG-3'(19802-19820),FAdV-1R:5'- GGGAGTTGTTTGTGTACAT-3'(2 0 9 5 6-2 0 9 3 8);F A d V-2 F:5'-CACTTACGAGTGGGTCCTCAGA-3'(19935-19956),FAdV-2R:5'- CCGGTGTCGTTAAC AACG -3'(20684-20667)。由生工生物工程(上海)有限公司合成,超純水稀釋至20 μmol/L,冷凍保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.5 FAdV DNA的提取取FAdV HM15株雞胚培養(yǎng)物上清液100 μL置于1.5mL無菌離心管中,加入DNAiso Reagent 800 μL,混勻后靜置10 min,充分裂解病毒;加入-20℃保存的無水乙醇600 μL,混勻后沉淀10 min;4℃、13 000×g離心10 min,輕輕倒去上清,加入-20℃保存的70%乙醇1 mL,輕輕顛倒數次清洗,棄去上清液,倒置在無菌濾紙上自然干燥;干燥后用40 μL超純水充分吹打溶解,在微量分光光度計上測定DNA的含量。

        1.6 FAdV nPCR方法的建立以已測定濃度的DNA溶液為模板,采用不同的擴增體系和條件進行PCR,確定最佳方案。套式PCR反應第1次擴增體系:DNA 2.0 μL,10×Buffer 2.5 μL,dNTP1.0 μL,FAdV-1F、FAdV-1R各0.5 μL,梯度增加rTaqDNA聚合酶用量(0.25~1.0 μL),用超純水補至總體積25.0 μL。反應條件:95℃預變性5 min;94℃變性50 s,退火溫度1℃上升速度由55℃遞增至58℃,時間1 min,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。套式PCR反應第2次擴增時,取2.0 μL第1次擴增產物作為模板,引物更換為FAdV-2F、FAdV-2R,其他成分與第1次擴增相同。條件預設為95℃預變性5 min;94℃變性50 s,退火溫度按1℃上升速度由55℃遞增至58℃,時間1 min,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。反應完成后取5.0 μL PCR產物進行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,觀察結果,篩選出最佳反應體系和擴增條件。

        1.7 FAdV nPCR方法靈敏性檢測10倍梯度稀釋DNA溶液至10-10,用建立的nPCR方法擴增稀釋后DNA模板,PCR產物進行1.5%瓊脂糖凝膠電泳。

        1.8 FAdV nPCR方法特異性檢測按照RNAiso plus操作說明提取NDV與IBDV核酸并反轉錄獲得cDNA;提取ILTV、MDV、FPV的DNA,以cDNA或DNA為模板,采用建立的nPCR方法檢測,PCR產物進行瓊脂糖凝膠電泳。

        1.9 病料中FAdV的檢測用建立的nPCR檢測方法對收集的35份疑似心包積液-肝炎綜合征病料進行檢測。

        2 結果與討論

        2.1 FAdV nPCR方法的建立本研究針對Ⅰ群FAdV六鄰體Hexon基因設計了2對引物,通過改變反應體系中酶的用量和反應退火溫度,確定了最佳反應體系和擴增條件。套式PCR反應第1次擴增體系:DNA 2.0 μL,10×Buffer 2.5 μL,超純水17.0 μL,dNTP 2.0 μL,FAdV-1F、FAdV-1R各0.5 μL,rTaqDNA聚合酶0.5 μL,總體積25.0 μL。最佳反應條件:95℃預變性5 min;94℃變性50 s,52℃退火1 min,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。套式PCR第2次擴增反應體系:第1次擴增產物模板2.0 μL,引物為FAdV-2F、FAdV-2R,其余成分同第1次PCR反應。最佳反應條件:95℃預變性5 min;94℃變性50 s,58℃退火1 min,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。電泳結果顯示目的條帶清晰(圖1)。

        圖1 FAdV nPCR檢測結果Fig.1 The result of nPCR for FAdV

        智海東等[4]制備了FAdVⅠ型瓊脂擴散抗原,檢測其效價和特異性后,利用該抗原對人工感染雞沉淀抗體的變化以及血清樣本進行了檢測,為FAdV感染的血清學檢測提供了一種簡便易行的方法。韋悠等[5]采用過濾法及蔗糖梯度密度離心法制備FAdV1型,以全病毒作為ELISA包被抗原,建立了兩種檢測腺病毒抗體的ELISA檢測方法。張明明等[6]采用PCR方法擴增了FAdV基因組右末端末端重復序列片段和開放閱讀框8片段,對雞鴨鵝A型FAdV進行了PCR檢測和分析。袁萬哲等[7]根據禽腺病毒4型(FAdV-4)Hexon基因核苷酸序列,設計用于擴增FAdV-4的PCR引物,建立了FAdV-4 PCR檢測方法,最低核酸檢出量為12.9 pg。

        2.2 FAdV nPCR方法的靈敏度、特異性試驗和病料的檢測微量紫外分光光度計測定HM15株DNA濃度為312 ng/μL,按10倍濃度梯度稀釋至10-10,用建立的方法進行套式PCR。結果顯示,10-1~10-8稀釋度均出現750 bp特異性條帶,套式PCR檢測方法的檢測靈敏度為3.12×10-6ng/μL,說明本方法靈敏度較高(圖2)。

        圖2 FAdV nPCR靈敏度試驗結果Fig.2 Sensitivity test of nPCR for FAdV

        用所建立的nPCR方法對NDV、IBDV、ILTV、MDV、FPV和HM15株 cDNA/DNA進行擴增,結果發(fā)現,僅HM15株擴增出預期目的條帶(750 bp),其他5種常見禽病毒均為陰性(圖3),表明該方法能特異性地擴增Ⅰ群FAdV目的基因。

        收集35份疑似心包積液-肝炎綜合征的組織病料分別提取總DNA,用建立的nPCR方法進行檢測。結果在26份病料中擴增出目的條帶,陽性率為74.3%(圖4)。

        心包積液-肝炎綜合征是新近流行的雞群傳染病,3~4周齡肉雞發(fā)病較多,在蛋雞中主要發(fā)生于3~10周齡,甚至有報道顯示300日齡蛋雞也可感染[8]。研究認為,引起心包積液-肝炎綜合征的病原為Ⅰ群禽腺病毒血清4型(FAdV-4)。1987年巴基斯坦安卡拉地區(qū)最早發(fā)現該病,因而又名安卡拉病[9]。進行準確診斷是防控心包積液-肝炎綜合征的前提條件,本研究建立的nPCR方法靈敏度較高,特異性強,為診斷Ⅰ群FAdV感染提供了有力的技術手段。同時,對臨床樣品的檢測結果提示在陜西省雞場中存在Ⅰ群FAdV的感染,應引起足夠重視。

        圖3 FAdV nPCR檢測方法特異性試驗結果Fig.3 Specificity test for FAdV by nPCR

        圖4 部分組織病料檢測結果Fig.4 Detection result of FAdV from samples by nPCR

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