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        miR-15b-5p靶向CDK4抑制脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖

        2019-03-27 06:26:04張曉楠馮浩白雪應(yīng)曼曼孫勝男寧宏
        關(guān)鍵詞:檢測

        張曉楠,馮浩,白雪,應(yīng)曼曼,孫勝男,寧宏

        (中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院眼科,沈陽 110001)

        脈絡(luò)膜黑色素瘤是成人最常見的原發(fā)性眼內(nèi)惡性腫瘤,具有高轉(zhuǎn)移率和死亡率,超過90%的患者會發(fā)生肝轉(zhuǎn)移,平均生存時間為7個月。作為黑色素瘤中最致命的一類,脈絡(luò)膜黑色素瘤患者即使接受過治療,仍然有約50%會發(fā)生轉(zhuǎn)移,10年生存率約為50%[1-3]。視力喪失是脈絡(luò)膜黑色素瘤的主要危害之一,超過1/3的患者需要摘除眼球[4]。脈絡(luò)膜黑色素瘤的早期診斷和治療是提高患者生存率的關(guān)鍵。對脈絡(luò)膜黑色素瘤發(fā)生發(fā)展機制的深入研究將有助于發(fā)現(xiàn)新的診斷和治療方法。

        腫瘤的發(fā)生常表現(xiàn)為失控性的細胞增殖。細胞周期依賴性激酶 (cyclin-dependent kinases,CDKs) 連續(xù)地激活和抑制則是增殖調(diào)控的關(guān)鍵因素。眾多研究表明,P16-cyclinD-CDK4/6-RB 通路在脈絡(luò)膜黑色素瘤的發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用,但探討CDK4與脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖的研究卻鮮有報道。同時,多種微小RNA (microRNAs,miRNAs) 也被證實與脈絡(luò)膜黑色素瘤密切相關(guān)。miR-15b-5p是一種與腫瘤發(fā)生發(fā)展相關(guān)的miRNA,它能夠與靶基因mRNA的3’UTR區(qū)結(jié)合,通過抑制靶基因的表達發(fā)揮功能,且它在多種疾病中發(fā)揮的生物學(xué)功能不盡相同。目前尚未見關(guān)于miR-15b-5p調(diào)節(jié)脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖的報道。

        因此,本研究從關(guān)鍵基因CDK4入手,參考miRNAs調(diào)控機制,檢測miR-15b-5p與CDK4的靶向調(diào)控作用,進而探究miR-15b-5p在脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞惡性增殖中的作用。

        1 材料與方法

        1.1 雙熒光素酶報告檢測

        將miR-15b-5p與CDK4 3’UTR結(jié)合區(qū)域的野生型 (WT) 序列和突變型 (MT) 序列插入至pMIR-REPORT熒光素酶質(zhì)粒中,合成pMIR- REPORT Luciferase-CDK4-3’UTR (WT) 和pMIR- REPORT Luciferase-CDK4-3’UTR (MT) 2種質(zhì)粒,用海腎熒光素酶質(zhì)粒pmirGLO作為對照 (以上質(zhì)粒由和元生物公司合成提供) 。將細胞分為4組: (1) WT+nc組,共轉(zhuǎn)染CDK4 3’UTR野生型質(zhì)粒與negative control RNA; (2)WT+mi組,共轉(zhuǎn)染CDK4 3’UTR野生型質(zhì)粒與mir-15b-5p mimics; (3) MT+nc組,共轉(zhuǎn)染CDK4 3’UTR突變型質(zhì)粒與negative control RNA; (4) MT+mi組,共轉(zhuǎn)染CDK4 3’UTR突變型質(zhì)粒與miR-15b-5p mimics。在質(zhì)粒和RNA共轉(zhuǎn)染293T細胞72 h后,使用雙熒光素酶報告檢測試劑盒 (美國Promega公司) 檢測熒光強度。

        1.2 細胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染

        人眼侵襲性脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞系MUM-2B購自上海拜力生物技術(shù)有限公司,在含有5%CO2的37℃培養(yǎng)箱中使用含10%的胎牛血清的MEM培養(yǎng)基(美國HyClone公司) 培養(yǎng)。microRNA negative control(nc) ,miR-15b-5p mimics,microRNA inhibitor nc,miR-15b-5p inhibitor由蘇州吉瑪基因公司合成。使用lipofectamineTM3000 (美國Life Technologies Corporation公司) 轉(zhuǎn)染RNA。將上述RNA和lipofectamine3000分別與無血清培養(yǎng)基混合,再將2種混合物相互混合,靜置15 min,加入到更換新鮮培養(yǎng)基的細胞中。

        1.3 實時熒光定量PCR

        使用總RNA提取試劑盒 (miRcute miRNA Isolation Kit,北京天根生化科技有限公司天根) 提取總RNA;使用微量分光光度計 (英國BioDrop公司) 檢測RNA的質(zhì)量和純度;使用miRNA PCR試劑盒 (Hairpin-itTMmicroRNA and U6 snRNA Normalization RTPCR Quantitation Kit,蘇州吉瑪基因公司) 完成反轉(zhuǎn)錄和qRT-PCR;使用PCR儀 (LightCycler 480Ⅱ,瑞士Roche 公司) 檢測熒光。采用2-ΔΔCt法分析結(jié)果。以上操作均按照各自試劑操作手冊進行。

        1.4 Western blotting

        使用RIPA 裂解緩沖液 (上海碧云天生物技術(shù)公司) 提取總蛋白,使用BCA蛋白檢測試劑盒 (上海碧云天生物技術(shù)公司) 檢測蛋白濃度。以每孔20 μg蛋白上樣,10% SDS-PAGE電泳,將蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜 (美國BIO-RAD公司) ,用5%脫脂牛奶封閉2 h,加入CDK4抗體 (1︰1 000,ab108357,美國Abcam公司)和GAPDH抗體 (1︰5 000,5174s,美國Cell Signaling Technology公司) 于4 ℃孵育過夜。TBST清洗3次,于37 ℃孵育二抗 (ZB-2301,山羊抗兔1︰5 000,北京中山金橋生物技術(shù)有限公司) 1 h。使用ECL試劑 (美國Pierce公司) 在發(fā)光儀MicroChemi4.2 (以色列DNR公司) 上檢測條帶的熒光亮度。

        1.5 CCK-8細胞增殖實驗

        采用CCK-8試劑盒( 日本Dojindo公司) 檢測細胞增殖能力。將轉(zhuǎn)染24 h后的細胞接種于96孔板中(3×103/孔) ,分別于0、24、48和72 h每孔加入混合有10 μL CCK8試劑的100 μL培養(yǎng)基,于37 ℃孵育2 h后,使用酶標儀( Model 680,美國Bio-Rad公司) 檢測450 nm波長吸光度( optical density,OD) 值。

        1.6 細胞周期檢測

        細胞轉(zhuǎn)染12 h后更換新鮮培養(yǎng)基,再培養(yǎng)48 h后用胰酶消化收集細胞,使用PBS重懸細胞并用70%乙醇固定24 h。檢測前每管細胞用500 μL PI/RNase常溫避光染色30 min。使用流式細胞儀FACSCalibur (美國BD公司) 檢測。使用cellQuest Pro分析檢測結(jié)果。

        1.7 統(tǒng)計學(xué)分析

        采用SPSS 20.0和GraphPad Prism 7.0軟件進行統(tǒng)計分析與作圖。每個結(jié)果重復(fù)3次。使用兩樣本t檢驗比較2組數(shù)據(jù)。P < 0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 miR-15b-5p與CDK4的結(jié)合情況

        利用生物信息學(xué)網(wǎng)站Targetscan 7.0進行分析,發(fā)現(xiàn)miR-15b-5p的種子序列與CDK4的3’UTR區(qū)域含有匹配的區(qū)段。使用雙熒光素酶報告實驗驗證二者具有直接結(jié)合的位點及結(jié)合能力 (結(jié)合序列見圖1A) 。4組細胞熒光素酶相對活性結(jié)果如圖1B所示,WT+mi組熒光素酶活性 (0.880 7±0.025 67) 明顯低于WT+nc組 (1.141 0±0.033 69) ,差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (P < 0.01) 。而MT+nc組與MT+mi組的熒光素酶活性(0.980 7±0.048 09,0.968 0±0.0268 9),則無統(tǒng)計學(xué)差異 (P = 0.696 4) 。

        圖1 雙熒光素酶報告實驗驗證miR-15b-5p與CDK4 mRNA的3’-UTR區(qū)域直接結(jié)合Fig.1 Dual-luciferase assay result showed that CDK4 was a direct target of miR-15b-5p

        2.2 miRNA的轉(zhuǎn)染效率

        通過實時熒光定量PCR檢測miR-15b-5p表達水平。如圖2所示,mimics組miR-15b-5p的相對表達量為nc組的389.3% (P < 0.000 1) ,提示轉(zhuǎn)染mimics能有效增加miR-15b-5p表達水平;同時,inhibitor組miR-15b-5p的相對表達量為inhibitor nc組的3.166%(P < 0.000 1) ,提示轉(zhuǎn)染inhibitor能有效減低miR-15b-5p表達水平。

        圖2 實時熒光定量PCR檢測miR-15b-5p表達水平Fig.2 The expression level of miR-15b-5p detected using QRT-PCR

        2.3 CDK4蛋白的表達量

        通過Western blotting檢測CDK4蛋白的表達量,結(jié)果如圖3所示,與nc組相比,mimics組CDK4蛋白條帶的相對灰度值升高(0.610±0.079),差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (P < 0.01) ;與inhibitor nc組相比,inhibitor組CDK4蛋白條帶的相對灰度值降低(1.331±0.099),差異有統(tǒng)計學(xué)意義( P < 0.05) 。

        2.4 miR-15b-5p對脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖的影響

        用CCK-8實驗測定細胞增殖能力,結(jié)果如圖4所示,轉(zhuǎn)染72 h時nc組與mimics組的相對OD值分別為2.486±0.075 19和1.671±0.044 61,差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (P < 0.001) ,與nc組相比,mimics組細胞的增殖能力下降;細胞轉(zhuǎn)染72 h時,inhibitor nc組與inhibitor組的相對OD值分別為3.300±0.095 89和4.513±0.189 20,差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (P < 0.01) ,與inhibitor nc組相比,inhibitor組細胞的增殖能力升高。

        圖3 Western blotting檢測CDK4蛋白表達量Fig.3 The expression level of CDK4 detected by Western blotting

        圖4 CCK-8檢測miR-15b-5p對脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖的影響Fig.4 The effect of miR-15b-5p on the proliferation of choroidal melanoma cells detected by CCK-8

        2.5 miR-15b-5p對脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞周期的影響

        使用流式細胞術(shù)檢測各組細胞周期情況。如圖5所示,mimics組細胞G1期的比例[( 81.79±0.750 2) %]較nc組[ ( 75.98±0.499 7) %]增加,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P < 0.01) ;inhibitor組細胞G1期比例[( 70.82±1.013 0) %]較inhibitor nc組[( 76.36±0.978 4) %]減少,差異有統(tǒng)計學(xué)意義( P < 0.05) 。

        3 討論

        脈絡(luò)膜黑色素瘤的發(fā)生存在多種機制,如基因突變、染色體缺失或易位以及信號通路的異常激活等。研究[5-8]發(fā)現(xiàn),脈絡(luò)膜黑色素瘤中,p16的甲基化失活較為常見,cyclin D1呈高表達,促進CDK4磷酸化Rb;Rb的磷酸化可以釋放轉(zhuǎn)錄因子E2F1,促進細胞周期從G1期向S期推進,進而促進細胞的惡性增殖。這些證據(jù)都表明,p16-cyclinD-CDK4/6-RB通路與脈絡(luò)膜黑色素瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。CDK4作為通路中的核心分子,很有可能發(fā)揮了重要的作用。雖然一些關(guān)于遺傳易感性的研究[9-10]發(fā)現(xiàn)脈絡(luò)膜黑色素瘤中沒有CDK4的可遺傳突變發(fā)生,但這并不能排除包含miRNA機制在內(nèi)的一些表觀遺傳學(xué)機制參與CDK4對脈絡(luò)膜黑色素瘤發(fā)生發(fā)展調(diào)節(jié)的可能性。

        圖5 流式細胞術(shù)檢測miR-15b-5p對脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞周期的影響Fig.5 The effect of miR-15b-5p on the cell cycle of choroidal melanoma cells detected by flow cytometry

        miRNA是一類長約22個核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈RNA分子,其功能是與靶基因mRNA的3’UTRs互補性結(jié)合,從而反向調(diào)控靶基因的表達。目前發(fā)現(xiàn)異常的miRNA表達與包括癌癥在內(nèi)的許多疾病有關(guān),而功能實驗顯示miRNA既可以作為抑癌基因,也可作為癌基因發(fā)揮作用[11]。研究[12-13]表明,miRNAs在脈絡(luò)膜黑色素瘤患者的血清、玻璃體和腫瘤標本中都存在異常表達,許多miRNAs的生物學(xué)作用也進一步被驗證[14-16]。因而miRNAs在脈絡(luò)膜黑色素瘤進程中起著重要的作用。

        本研究將人眼侵襲性脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞系作為研究對象,通過體外實驗探討miR-15b-5p靶向CDK4抑制脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖的作用。雙熒光素酶報告實驗證明,CDK4是miR-15b-5p的直接靶點。在脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞系MUM-2B中轉(zhuǎn)染4組miRNA (nc,miR-15b-5p mimics,inhibitor nc,miR-15b-5p inhibitor) ,實時熒光定量PCR結(jié)果證實轉(zhuǎn)染有效,Western blotting結(jié)果證明miR-15b-5p能夠負向調(diào)節(jié)CDK4的蛋白表達。上述結(jié)果共同證明在脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞系中miR-15b-5p能夠靶向抑制CDK4的表達。應(yīng)用CCK-8進一步對細胞增殖能力進行檢測,結(jié)果表明miR-15b-5p能夠抑制脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖。流式細胞術(shù)結(jié)果證明,miR-15b-5p能夠造成脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞發(fā)生G1期阻滯。這一結(jié)果與p16-cyclinD-CDK4/6-RB通路主要在G1期發(fā)揮作用的理論一致。以上結(jié)果共同證明了miR-15b-5p能夠通過調(diào)節(jié)CDK4的表達,抑制p16-cyclinD-CDK4/6-RB通路,進而抑制脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞增殖。

        miR-15b-5p已被報道與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展相關(guān),但其發(fā)揮的生物學(xué)功能卻不盡相同。一方面,miR-15b-5p作為腫瘤的抑制因子發(fā)揮著多種作用,如誘導(dǎo)細胞死亡、抑制增殖、拮抗轉(zhuǎn)移、重新調(diào)節(jié)代謝、破壞染色體穩(wěn)定性、誘導(dǎo)腫瘤相關(guān)炎癥等[17-18]。另一方面,miR-15b-5p又扮演促癌角色,與皮膚黑色素瘤的發(fā)生和不良預(yù)后相關(guān)[19],且復(fù)發(fā)患者的血清miR-15b-5p的水平隨時間顯著升高[20]。miRNA在腫瘤中的具體作用與其靶基因密切相關(guān),即使相同的miRNA作用于不同的靶基因也有可能呈現(xiàn)出完全不同的生物學(xué)功能。雖然脈絡(luò)膜黑色素瘤與皮膚黑色素瘤有許多相似之處,但其中深入的發(fā)生發(fā)展機制仍有可能存在巨大的差別。本研究證明miR-15b-5p在脈絡(luò)膜黑色素瘤中通過調(diào)控CDK4的表達而發(fā)揮抑癌作用。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)miR-15b-5p可靶向調(diào)節(jié)CDK4在脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞系MUM-2B細胞中的表達,從而抑制脈絡(luò)膜黑色素瘤細胞的生長。為探索脈絡(luò)膜黑色素瘤的分子治療靶點提供了實驗依據(jù),為脈絡(luò)膜黑色素瘤的治療提供了一種新的可能。

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