楊鑫苗,張永強(qiáng)
1北京醫(yī)院腫瘤內(nèi)科/國家老年醫(yī)學(xué)中心,北京100730
2中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院研究生院,北京1007300
微小RNA(microRNA,miRNA)是一類廣泛存在于動(dòng)物、植物、病毒體內(nèi)的可在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因表達(dá)的小分子RNA。自1993年首個(gè)miRNA被發(fā)現(xiàn)以來,人們陸續(xù)在自然界中發(fā)現(xiàn)了超過3萬種miRNA;而且發(fā)現(xiàn)這些miRNA參與細(xì)胞的增殖、分化、凋亡及機(jī)體的免疫調(diào)節(jié)和發(fā)育等過程,在心血管系統(tǒng)疾病、腫瘤、內(nèi)分泌代謝系統(tǒng)疾病中均具有重要意義。近年來研究發(fā)現(xiàn),miRNA在乳腺癌、肺癌、結(jié)直腸癌、肝癌、腎癌、子宮內(nèi)膜癌等多種實(shí)體腫瘤中表達(dá)紊亂[1],提示miRNA可能參與腫瘤的發(fā)生與發(fā)展過程。此外,miRNA可作為腫瘤篩查的標(biāo)志物,在腫瘤早期發(fā)現(xiàn)、療效監(jiān)測和評價(jià)、預(yù)后判斷等方面發(fā)揮作用。另一方面,miRNA也可以參與腫瘤耐藥的形成,改變腫瘤細(xì)胞對化療、放療的敏感性,具有潛在的腫瘤治療作用。
Lee等[2]在研究秀麗隱桿線蟲時(shí),通過定位克隆法發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)miRNA相關(guān)基因lin-4,并觀察到其在不同的階段能夠調(diào)控胚胎的發(fā)育。Reinhart等[3]在對線蟲的研究中發(fā)現(xiàn)了miRNA let-7,其在線蟲幼蟲向成蟲發(fā)育的過程中發(fā)揮調(diào)控作用。此后,人們利用生物分子學(xué)技術(shù)不斷探索新的miRNA,目前人類基因組中已確定的miRNA超過2000種。
miRNA的合成過程復(fù)雜,miRNA基因首先在細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄生成含有幾百或幾千個(gè)核苷酸的初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(pri-miRNA);隨后pri-miRNA在細(xì)胞核內(nèi)經(jīng)過RNAaseⅢ內(nèi)切酶家族成員Drosha和其伴侶分子DGCR8所形成的復(fù)合物的作用,被剪切成約含有70個(gè)核苷酸的miRNA前體分子(premiRNA),該前體具有莖環(huán)結(jié)構(gòu),且成熟的miRNA基因多成簇分布于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的3'或5'端,這與多個(gè)miRNA共同調(diào)節(jié)同一mRNA的翻譯或降解有關(guān);緊接著pre-miRNA在轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白Exporting-5的作用下,從細(xì)胞核轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)中[4];在細(xì)胞質(zhì)中,premiRNA經(jīng)過核糖核酸酶Dicer的作用被剪切成為成熟的雙鏈miRNA,在解旋酶的作用下,雙鏈miRNA的一條鏈很快被降解,另一條鏈則形成具有活性的成熟miRNA,成熟miRNA與核糖核蛋白體結(jié)合,組成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RNA induced silencing complex,RISC)[5]。RISC通過與靶mRNA不同程度地結(jié)合,引起靶mRNA的降解或抑制其翻譯,調(diào)控基因的表達(dá)。
腫瘤的早期發(fā)現(xiàn)對降低患者的復(fù)發(fā)率,提高生存率及改善預(yù)后具有重要意義。因此,尋找有意義的腫瘤標(biāo)志物,提高腫瘤的早期檢出率,是臨床面臨的一個(gè)難題。miRNA在血液、尿液、漿膜腔積液等內(nèi)穩(wěn)定存在,且不易被分解破壞,因而其有望成為腫瘤早期篩查的標(biāo)志物。
Chen等[6]對53例早期乳腺癌患者、40例乳腺良性腫瘤患者及49例健康者的血清樣本進(jìn)行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)早期乳腺癌患者血清中miRNA-21、miRNA-152的表達(dá)明顯上調(diào),且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提示兩者均有可能作為乳腺癌早期篩查的指標(biāo)。另有研究發(fā)現(xiàn),早期前列腺癌患者血清中 miRNA-125b、miRNA-221/miRNA-222、let-7b等的表達(dá)下調(diào),而miRNA-25、miRNA-93的表達(dá)上調(diào),這為臨床篩查早期前列腺癌提供了可能[7]。Jin等[8]選取46例Ⅰ期非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者和42例健康者的血清樣本,通過實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative realtime polymerase chain reaction,qRT-PCR)技術(shù)對比健康者、肺腺癌患者和肺鱗癌患者血清中miRNA的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miRNA-181-5p、miRNA-30a-3p、miRNA-30e-3p、miRNA-361-5p在肺腺癌患者血清中的表達(dá)具有高度特異性,而miRNA-10b-5p、miRNA-15b-5p、miRNA-320b在肺鱗癌患者血清中的表達(dá)具有特異性,提示上述miRNA可作為早期識(shí)別NSCLC的特異性標(biāo)志物,并且對NSCLC的分型具有重要價(jià)值。為了進(jìn)一步檢驗(yàn)上述miRNA序列在早期診斷NSCLC中的精確性,研究者隨機(jī)選取了60例血清樣本(其中包括17例健康者的血清樣本和43例NSCLC患者的血清樣本),利用qRT-PCR技術(shù)檢測各血清樣本中miRNA-181-5p、miRNA-361-5p的表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)miRNA-181-5p、miRNA-361-5p聯(lián)合檢測可鑒別出31例肺腺癌患者的血清,其曲線下面積達(dá)0.936;同樣的,聯(lián)合檢測miRNA-10b-5p、miRNA-320b可鑒別出11例肺鱗癌患者的血清,其曲線下面積為0.911。證明上述miRNA作為NSCLC早期篩查的指標(biāo)具有較高的準(zhǔn)確性。有研究對比了正常結(jié)腸(normal colonic,N)、管狀腺瘤(tubular adenoma,ADT)、絨毛狀管狀腺瘤(tubulovillous adenoma,ADTV)和結(jié)腸癌(colorectal cancer,CRC)匹配的組織與外周血中循環(huán)miRNA的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與ADT和ADTV患者相比,CRC患者外周血中miRNA-149*、miRNA-3196、miRNA-4687的表達(dá)異常;而與健康者相比,CRC患者外周血中miRNA-612、miRNA-1296、miRNA-933、miRNA-937、miRNA-1207的表達(dá)異常。同樣,該研究還發(fā)現(xiàn)miRNA在上述4種組織中的表達(dá)情況與在外周血中的表達(dá)一致,這進(jìn)一步提示循環(huán)miRNA可以作為腫瘤篩查的標(biāo)志物[9]。
miRNA還可以作為腫瘤進(jìn)展、轉(zhuǎn)移的標(biāo)志物,從而更好地評估腫瘤患者的療效、鑒別復(fù)發(fā)及判斷預(yù)后。Tsukamoto等[10]通過檢測結(jié)直腸癌患者外周血、原發(fā)灶腫瘤組織、肝轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織中miRNA-21的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)在上述3種標(biāo)本中,miRNA-21的表達(dá)均明顯上調(diào),提示外周血與腫瘤組織中miRNA-21的表達(dá)具有一致性。同時(shí),該研究還發(fā)現(xiàn),miRNA-21高表達(dá)的直腸癌患者的無病生存期(disease-free survival,DFS)和總生存期(overall survival,OS)均短于miRNA-21低表達(dá)患者,提示外周血miRNA-21是Ⅱ、Ⅲ期結(jié)直腸癌患者DFS、OS的獨(dú)立預(yù)測因素,同時(shí)也是Ⅳ期結(jié)直腸癌患者總生存的預(yù)測因子。Chanudet等[11]研究發(fā)現(xiàn),相比于健康者和Ⅰ期腎透明細(xì)胞癌患者,miRNA-150在Ⅲ、Ⅳ期腎透明細(xì)胞癌患者血清中表達(dá)失調(diào),提示miRNA-150可作為腎癌進(jìn)展至晚期的標(biāo)志物。有研究發(fā)現(xiàn),嗅素蛋白4(olftactomedin 4,OLFM4)可以抑制三陰性乳腺癌的侵襲、轉(zhuǎn)移[12]。Xiong等[13]利用miRNA數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn),OLFM4的上游物質(zhì)為miRNA-103,其通過作用于OLFM4的3'-UTR末端從而下調(diào)OLFM4的表達(dá),在三陰性乳腺癌患者體內(nèi)可以檢測到miRNA-103的高表達(dá),其表達(dá)程度與三陰性乳腺癌患者的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移及臨床分期有關(guān);單因素與多因素分析結(jié)果均顯示,miRNA-103是三陰性乳腺癌患者預(yù)后的負(fù)性預(yù)測因子。
miRNA代謝酶類的缺失也可以作為惡性腫瘤的預(yù)后評價(jià)指標(biāo)。Khoshnaw等[14]利用免疫組織化學(xué)法檢測了乳腺原位癌組織、早期浸潤性乳腺癌組織、伴有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的乳腺癌組織以及正常乳腺組織中Dicer酶的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與正常乳腺組織相比,Dicer酶在乳腺癌組織中的表達(dá)逐漸缺失,且其在原位癌中的表達(dá)缺失較少,在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中的表達(dá)缺失較重。在轉(zhuǎn)移性乳腺癌組織中,Dicer酶的缺失程度與影響乳腺癌患者預(yù)后的因素有關(guān),如更高級別的病理分級、激素受體的缺失、乳腺癌易感基因1(breast cancer susceptibility gene 1,BRCA1)蛋白的低表達(dá)以及短的DFS,而這在人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)陽性轉(zhuǎn)移性乳腺癌中相關(guān)性更顯著,提示Dicer酶的表達(dá)情況可作為評估HER2陽性乳腺癌預(yù)后的一項(xiàng)獨(dú)立指標(biāo)。
然而miRNA在外周血中的濃度極低,這提高了循環(huán)miRNA的檢測難度;同時(shí),僅有少數(shù)研究顯示循環(huán)miRNA與組織miRNA的表達(dá)一致。另有大量研究發(fā)現(xiàn),miRNA在腫瘤組織與外周血中的表達(dá)并不具有一致性,提示非腫瘤因素,如免疫細(xì)胞、血細(xì)胞、組織細(xì)胞同樣可以分泌某些腫瘤miRNA。因此,尚需要大規(guī)模的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來印證已發(fā)現(xiàn)的miRNA的臨床意義。
miRNA的多態(tài)性及表達(dá)失調(diào)均會(huì)影響其下游靶mRNA的功能,如果該影響涉及到藥物吸收、分布、代謝相關(guān)通路上的關(guān)鍵分子,導(dǎo)致藥物作用失調(diào),將是細(xì)胞產(chǎn)生耐藥性的基礎(chǔ)。腫瘤細(xì)胞耐藥的形成是影響腫瘤治療效果及預(yù)后的重要因素。腫瘤細(xì)胞耐藥機(jī)制的形成主要包括以下幾個(gè)方面:①miRNA干擾DNA化學(xué)修飾相關(guān)基因,影響表觀調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的某些關(guān)節(jié)酶如DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)的表達(dá)。②miRNA可以影響DNA損傷修復(fù)能力,這一點(diǎn)在鉑類藥物的耐藥機(jī)制中尤為重要。③miRNA調(diào)節(jié)一系列耐藥相關(guān)基因和蛋白的表達(dá),如多藥耐藥基因 1(multidrug resisitance gene 1,MDR1)、多藥耐藥相關(guān)蛋白(multidrug resistance-related protein,MRP)。④miRNA影響ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族,ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是一類利用三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)水解釋放的能量,逆濃度梯度通過細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)化合物的蛋白,如P-糖蛋白、乳腺癌耐藥蛋白(breast cancer resistance protein,BCRP)等。⑤miRNA影響一些信號(hào)通路的正常轉(zhuǎn)導(dǎo),如Ras-促分裂原活化的蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)信號(hào)通路。
研究發(fā)現(xiàn),部分miRNA如miRNA-181a[15]、miRNA-218[16-17]、miRNA-196a[18]等,可以預(yù)測腫瘤的耐藥性。Hu等[16]在兩種乳腺癌耐藥細(xì)胞株MCF-7/A02和CALDOX中檢測到miRNA-218的表達(dá)降低,而異位表達(dá)miRNA-218后,兩種細(xì)胞重新獲得了對蒽環(huán)類和紫杉類藥物的敏感性。然而,通過RNA干擾機(jī)制先行下調(diào)生存素(BIRC5)后,再上調(diào)miRNA-218的表達(dá)則可以使兩種細(xì)胞再次獲得耐藥性。這提示miRNA-218可以通過促進(jìn)BIRC5的表達(dá)而提高乳腺癌細(xì)胞對蒽環(huán)類、紫杉類化療藥物的敏感性。Lin等[17]運(yùn)用四唑鹽比色法(methyl thiazolyl tetrazolim,MTT)、流式細(xì)胞術(shù)對比了食管癌細(xì)胞系Eca9706與鉑類耐藥細(xì)胞Eca9706-CisR的細(xì)胞活性和凋亡率,結(jié)果發(fā)現(xiàn)鉑類耐藥細(xì)胞Eca9706-CisR的miRNA-218表達(dá)明顯下調(diào),而增強(qiáng)miRNA-218表達(dá)則可以增加耐藥細(xì)胞對鉑類藥物的敏感性,抑制細(xì)胞的活性,促進(jìn)細(xì)胞凋亡;進(jìn)一步運(yùn)用qRT-PCR技術(shù)發(fā)現(xiàn),miRNA-218作用的直接靶點(diǎn)為BIRC5。
一項(xiàng)針對乳腺癌細(xì)胞耐藥機(jī)制的研究發(fā)現(xiàn),miRNA-200a高表達(dá)可以增強(qiáng)乳腺癌細(xì)胞系對吉西他濱、紫杉醇、順鉑等化療藥物的耐藥性,減少化療藥物誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞凋亡,而抑制miRNA-200a表達(dá)則可以改善吉西他濱耐藥乳腺癌細(xì)胞的藥物敏感性;進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),敲降TP53INP1和YAP1可以模擬miRNA-200a高表達(dá)的細(xì)胞模型,而TP53INP1與miRNA-200a的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)[19],表明miRNA-200a與腫瘤細(xì)胞的耐藥性有關(guān),而TP53INP1和YAP1可能為其作用靶點(diǎn)。
腫瘤耐藥性已經(jīng)成為根治腫瘤的主要難題,miRNA在調(diào)節(jié)腫瘤耐藥性方面起著重要作用。通過分析敏感細(xì)胞和耐藥腫瘤細(xì)胞miRNA表達(dá)譜的差異,找到可以影響藥物治療效果的miRNA,有助于深入認(rèn)識(shí)腫瘤耐藥機(jī)制,為尋找更為特異的耐藥靶點(diǎn)及個(gè)體化治療提供依據(jù)。
一種miRNA可以有幾十個(gè)靶點(diǎn),調(diào)控多種腫瘤細(xì)胞的多條信號(hào)通路,最終改變腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)特性。腫瘤的主要生物學(xué)特征均涉及miRNA表達(dá)水平的變化。隨著實(shí)體腫瘤發(fā)病率的不斷增高,腫瘤的治療成為現(xiàn)代醫(yī)學(xué)亟待解決的問題之一。以miRNA為靶點(diǎn)的一系列類似物或抑制劑的合成,通過調(diào)控相應(yīng)miRNA的表達(dá),減弱腫瘤細(xì)胞的增殖能力,抑制腫瘤轉(zhuǎn)移,有望成為惡性腫瘤治療的新策略。其調(diào)控機(jī)制主要有如下幾種:抗miRNA寡核苷酸鏈(anti-miRNA oligonucleotide,AMO)[20]、miRNA拮抗鏈[21]。目前,miRNA模擬物以及攜帶miRNA的脂質(zhì)體、可降解的生物材料(如多聚陽離子聚胺酯-短支-聚乙烯亞胺)、藥物介導(dǎo)的miRNA改變等治療方法已取得一定的進(jìn)展,但這些方法均有一定的局限性,使其無法在臨床大規(guī)模應(yīng)用[22-24]。
生物體內(nèi)的miRNA數(shù)量龐大,遠(yuǎn)不止理論上的飽和值,其作用機(jī)制復(fù)雜,絕大多數(shù)miRNA的功能仍未明確?,F(xiàn)代生物科學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展、基因組測序工程的加快推進(jìn)、蛋白衍生技術(shù)的發(fā)展為進(jìn)一步探索miRNA的功能提供了幫助。隨著miRNA功能不斷得到明確,與此相關(guān)的腫瘤診斷和治療逐漸成為可能。如何將已有的研究成果運(yùn)用于腫瘤的篩選、診治和預(yù)后評估,仍需要大量的實(shí)驗(yàn)研究。隨著一系列腫瘤耐藥基因的發(fā)現(xiàn),miRNA介導(dǎo)的耐藥性概念的提出為惡性實(shí)體腫瘤患者的個(gè)體化治療帶來了希望。所有基于miRNA治療的策略無論是單獨(dú)應(yīng)用或是與傳統(tǒng)藥物聯(lián)合,均具有良好的發(fā)展前景。設(shè)計(jì)安全而穩(wěn)定的miRNA靶點(diǎn)激動(dòng)劑或拮抗劑,尋找合適的miRNA轉(zhuǎn)運(yùn)方式,將現(xiàn)有研究結(jié)果轉(zhuǎn)換為有意義的臨床結(jié)論,使miRNA成為腫瘤治療的新靶點(diǎn),將是未來研究的熱點(diǎn)方向。
由于miRNA具有多樣性,仍然存在諸多問題亟待解決:如目前針對miRNA自身調(diào)節(jié)的機(jī)制研究甚少,miRNA與其他非編碼RNA的相互作用則更是少有研究;miRNA的檢測花費(fèi)巨大,目前尚處于實(shí)驗(yàn)階段,無法大規(guī)模運(yùn)用于臨床;以miRNA為靶點(diǎn)的治療是否可能引起其他基因的突變,從而誘發(fā)新的疾病,目前尚無確切結(jié)論。miRNA在實(shí)體腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的作用,值得深入思考和研究。
近年來,隨著人們對外泌體的研究不斷深入,miRNA作為其內(nèi)在載體,其功能不斷得到闡明。miRNA參與惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展的各個(gè)階段,在腫瘤的早期診斷、判斷治療效果、判斷轉(zhuǎn)移等方面均具有重要價(jià)值。未來循環(huán)miRNA可能成為腫瘤診斷與判斷療效、評估預(yù)后的標(biāo)志物。miRNA功能的明確也為腫瘤治療提供了新途徑。因此,尋找腫瘤相關(guān)miRNA并深入研究其作用機(jī)制將對腫瘤患者的診斷和治療有著重要意義。