徐 慧,陳發(fā)榮,王保娟,王 永,石 磊,陳 洵,常彥磊,時(shí)國強(qiáng),6,張 偉
(1.河北農(nóng)業(yè)大學(xué),河北保定 071001;2.北京艾旗斯德科技有限公司,北京 101102;3.天津市農(nóng)業(yè)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測技術(shù)研究所,天津 300232;4.暨南大學(xué)食品安全與營養(yǎng)研究院,廣東廣州 510632;5.廣州雙螺旋基因技術(shù)有限公司,廣東廣州 510320;6.河北三獅生物科技有限公司,河北石家莊 050011)
沙門氏菌(Salmonella) 是一種常見的食源性致病菌,屬腸桿菌科、革蘭氏陰性腸道桿菌[1],主要寄生于人類和動(dòng)物腸道中,可致食物中毒、慢性腸炎、腸熱癥等[2]。因沙門氏菌經(jīng)常存活于肉制品、蛋類、水產(chǎn)品中,在20℃以上即能大量繁殖,世界各國普遍規(guī)定食品中不得檢出沙門氏菌[3]。根據(jù)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),人攝入含有一定量沙門氏菌(1×106~1×107CFU/g)的動(dòng)物性產(chǎn)品后易引發(fā)細(xì)菌性感染,我國每年細(xì)菌性食物中毒中70%~80%是由沙門氏菌引起的[4-5]。
目前,常用的沙門氏菌檢測方法有傳統(tǒng)方法如國家標(biāo)準(zhǔn)、AOAC等,以免疫學(xué)為基礎(chǔ)的檢測方法如酶聯(lián)免疫法(ELISA)等,以分子生物學(xué)為基礎(chǔ)的檢測方法如聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR) 等[6]。傳統(tǒng)方法培養(yǎng)時(shí)間較長,一般需要3~4 d檢測時(shí)間[7]。ELISA方法從樣品的制備到檢測結(jié)束大概要40~48 h才能完成,且由于使用的多價(jià)血清存在不同程度的交叉反應(yīng),容易產(chǎn)生假陽性[8]。PCR方法需要昂貴的PCR儀器和繁瑣的電泳,故不宜普遍推廣。因此,亟需開發(fā)一種快速檢測食品中沙門氏菌的檢測方法,對于保障我國食品安全具有重要意義。
研究在環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法(LAMP)[9]基礎(chǔ)上,結(jié)合熒光染料SYBR Green I建立的一種實(shí)時(shí)熒光LAMP(RF-LAMP)技術(shù),為實(shí)現(xiàn)沙門氏菌的快速檢測提供了新的思路。
1.1.1 菌株
試驗(yàn)所用菌株包括甲型副傷寒沙門氏菌、乙型副傷寒沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌、腸炎沙門氏菌、單增李斯特氏菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌、普通變形桿菌、蠟樣芽孢桿菌、福氏志賀氏菌、宋內(nèi)氏志賀氏菌、大腸桿菌O157∶H7、產(chǎn)氣莢膜桿菌、阪崎腸桿菌、金黃色葡萄球菌和副溶血性弧菌。
1.1.2 樣品
肉制品,購自保定市某超市。
1.1.3 主要培養(yǎng)基和試劑
營養(yǎng)肉湯和營養(yǎng)瓊脂,北京陸橋技術(shù)股份有限公司提供;Bst DNA聚合酶、MgCl2和dNTPs,大連寶生物工程有限公司提供;熒光試劑,Sigma公司提供;實(shí)時(shí)熒光LAMP內(nèi)、外引物,合成于大連寶生物工程有限公司;DNA提取試劑盒,北京全式金生物技術(shù)有限公司提供。
1.1.4 主要儀器
WH-861型旋渦混合器,太倉市科教器材廠產(chǎn)品;數(shù)顯超級恒溫水浴鍋,金壇市杰瑞爾電器有限公司產(chǎn)品;QYC-200型全溫?fù)u床,上海新苗醫(yī)療器械制造有限公司產(chǎn)品;實(shí)時(shí)熒光監(jiān)測儀,德國ESE Gmbh公司產(chǎn)品;TGL-16G型離心機(jī),上海安亭科學(xué)儀器廠產(chǎn)品。
1.2.1 純菌的培養(yǎng)
取保藏的菌株接種于滅菌的NB液體培養(yǎng)基中,于37℃條件下振蕩培養(yǎng)過夜。
1.2.2 DNA模板的制備
研究采用熱裂解法進(jìn)行DNA模板的提取。取過夜培養(yǎng)的菌懸液1.5 mL于滅菌離心管中,以轉(zhuǎn)速11 000 r/min離心1 min,棄去上清液。加入300 μL無菌蒸餾水洗滌菌體沉淀,重復(fù)2次,然后加入100 μL無菌蒸餾水,使菌體充分振蕩懸?。辉诜兴≈袑⒕鷳乙褐蠓?0 min,然后以轉(zhuǎn)速11 000 r/min離心1 min,將上清液轉(zhuǎn)移至另一新的滅菌離心管中,于-20℃條件下保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 引物設(shè)計(jì)
研究選取Genebank中已經(jīng)公布的沙門氏菌inv基因作為靶基因。
實(shí)時(shí)熒光LAMP所用引物見表1。
表1 實(shí)時(shí)熒光LAMP所用引物
1.2.4 RF-LAMP反應(yīng)體系
總反應(yīng)體系 (25 μL) 包括 2.5 μL 10×Bst buffer,1 μL鎂離子(50 mmol),5 μLdNTPs(2.5 mmol)混合物,1 μLBst酶(8 000 U/mL),1 μL甜菜堿(5 mol),1.5 μL 模板 DNA,0.5 μL SYBR,F(xiàn)IP 和 BIP 引物(10 mmol)各2.5 μL,F(xiàn)3和B3引物(10 mmol)各0.5 μL,無菌雙蒸水補(bǔ)足體積至 25 μL。擴(kuò)增反應(yīng)條件為61℃條件下反應(yīng)1 h。
1.2.5 RF-LAMP的特異性
采用熱裂解法對表1中15株菌進(jìn)行基因組DNA提取。陰性對照用無菌蒸餾水代替模板。按照優(yōu)化好的RF-LAMP反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增來驗(yàn)證該方法的特異性。
1.2.6 RF-LAMP檢測純菌的靈敏度
以編號(hào)為CMCC 50041的腸炎沙門氏菌作為試驗(yàn)菌種進(jìn)行靈敏度和檢出限的檢測。將過夜培養(yǎng)的新鮮菌液進(jìn)行平板菌落計(jì)數(shù),測得菌液濃度為5.6×109CFU/mL。用無菌生理鹽水對其進(jìn)行10倍梯度稀釋,得到連續(xù)稀釋的腸炎沙門氏菌懸液。取1 mL各稀釋梯度的菌懸液提取基因組DNA,并進(jìn)行RFLAMP方法的靈敏度試驗(yàn)。
1.2.7 RF-LAMP檢測人工污染肉制品的檢出限
取25 g經(jīng)國標(biāo)法檢測無沙門氏菌的肉制品加入到225 mL的無菌生理鹽水中,制成勻漿液,取9 mL加到離心管(10 mL) 中,分別將10倍梯度稀釋的菌懸液(5.1×107~5.1×102CFU/mL) 各1 mL加到上述離心管中,混勻,得到不同濃度的菌液勻漿。用1.2.2中所述熱裂解法提取基因組DNA,并用RF-LAMP方法驗(yàn)證人工污染肉制品中沙門氏菌的檢出限。
實(shí)時(shí)熒光LAMP引物特異性的檢測結(jié)果見表2。
從表2中可以看出,用于RF-LAMP特異性試驗(yàn)的15株試驗(yàn)菌株中,4株沙門氏菌檢測結(jié)果為陽性;其他11株非沙門氏菌檢測結(jié)果為陰性,結(jié)果表明該研究建立的方法特異性強(qiáng)。
表2 實(shí)時(shí)熒光LAMP引物特異性的檢測結(jié)果
實(shí)時(shí)熒光LAMP檢測沙門氏菌的靈敏度見圖1。
圖1 實(shí)時(shí)熒光LAMP檢測沙門氏菌的靈敏度
由圖1可以看出,當(dāng)沙門氏菌純培養(yǎng)物濃度為5.6×105CFU/mL~5.6×101CFU/mL時(shí),熒光曲線出現(xiàn)明顯的擴(kuò)增峰,儀器自動(dòng)判定為陽性;當(dāng)濃度為5.6×100CFU/mL時(shí),熒光曲線平緩,未出現(xiàn)擴(kuò)增峰,判定為陰性。因此,研究所建立RF-LAMP檢測沙門氏菌的靈敏度為56 CFU/mL。
實(shí)時(shí)熒光LAMP法人工污染肉制品檢出限的確定見圖2。
從圖2中可以看出,當(dāng)沙門氏菌純培養(yǎng)物濃度為5.6×107CFU/g~5.6×104CFU/g時(shí),熒光曲線出現(xiàn)明顯的擴(kuò)增峰,儀器自動(dòng)判定為陽性;當(dāng)培養(yǎng)物濃度為5.6×103CFU/g時(shí),熒光曲線平緩,未出現(xiàn)擴(kuò)增峰,判定為陰性。因此,研究所建立RF-LAMP檢測人工污染肉制品的檢出限為5.6×104CFU/g。
圖2 實(shí)時(shí)熒光LAMP法人工污染肉制品檢出限的確定
研究建立了一種RF-LAMP方法來快速檢測沙門氏菌,檢測靈敏度為56 CFU/mL,檢測人工污染肉制品中沙門氏菌的檢出限為5.6×104CFU/g。該方法是在LAMP技術(shù)的基礎(chǔ)上,向體系中添加熒光染料,通過觀察是否有峰圖出現(xiàn)就可知道反應(yīng)是否發(fā)生。與PCR方法相比,RF-LAMP可在等溫條件下完成擴(kuò)增,不需要昂貴的PCR儀;與傳統(tǒng)LAMP相比,該方法的靈敏度更高,且避免了傳統(tǒng)LAMP產(chǎn)生的氣溶膠污染。該方法在結(jié)果出現(xiàn)后可直接終止反應(yīng),既節(jié)省時(shí)間又降低了試驗(yàn)成本,同時(shí)避免了繁瑣的電泳。總之,該研究建立的RF-LAMP檢測沙門氏菌方法特異性強(qiáng)、靈敏度高,為沙門氏菌的快速檢測開辟了新途徑,適合在基層檢測機(jī)構(gòu)推廣應(yīng)用。