亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        鴨骨骼肌TNNI1基因CpG島區(qū)甲基化與mRNA差異表達(dá)

        2019-01-04 01:21:48姬改革束婧婷單艷菊屠云潔巨曉軍劉一帆
        江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報 2018年6期
        關(guān)鍵詞:甲基化試劑盒位點

        姬改革,束婧婷,單艷菊,章 明,屠云潔,巨曉軍,劉一帆

        (江蘇省家禽科學(xué)研究所,江蘇 揚州 225125)

        在肌肉的收縮過程中,肌鈣蛋白(Troponin I ,TnI)是重要的調(diào)節(jié)因子,定位于橫紋肌,能夠和肌動蛋白結(jié)合,抑制肌球蛋白ATP酶的活性,使肌肉保持松弛的狀態(tài)。TnI基因包含3種亞型[1],分別為慢速骨骼肌型肌鈣蛋白或肌鈣蛋白I 1基因(TNNI1);快速骨骼肌型肌鈣蛋白I(Fast skeletal muscle troponin I)或肌鈣蛋白I 2基因(TNNI2)和心肌型肌鈣蛋白 I( Cardiac troponin I)或肌鈣蛋白I 3基因(TNNI3)。TNNI1和TNNI2在發(fā)育的早期,肌肉生成過程中可以相互轉(zhuǎn)換,共同表達(dá),之后分別被限制在慢和快肌纖維中表達(dá)[2-3]。TNNI3在心肌的表達(dá)具有特異性[4-5]。

        骨骼肌肌纖維類型是影響肌肉品質(zhì)的重要因素,通常認(rèn)為慢肌比例較高的肉品質(zhì)相對較好。在哺乳動物上的研究結(jié)果表明[6],TNNI1基因在成年動物慢肌纖維中特異性的表達(dá),在肉品質(zhì)和脂肪沉積方面具有重要的作用。在雞上[7],有研究者發(fā)現(xiàn)TNNI1基因在蛋雞肌肉中的表達(dá)量顯著高于肉雞。關(guān)于TNNI1的研究多集中在哺乳動物,家禽方面相關(guān)的研究較少。課題組前期研究發(fā)現(xiàn),TNNI1基因可能在鴨肌肉發(fā)育中具有重要的作用。在人上的研究發(fā)現(xiàn)[8],與肌纖維類型相關(guān)的MYH7B、MYH7、MYH8、MYH3等基因的CpG位點的甲基化程度在快收縮型肌纖維和慢收縮性肌纖維上具有顯著差異。DNA甲基化是指在DNA序列沒有發(fā)生改變的情況下,相應(yīng)的基因表達(dá)發(fā)生改變,導(dǎo)致可遺傳的表型變化。通常由DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶催化,將 S-腺苷甲硫氨酸提供的甲基轉(zhuǎn)移到胞嘧啶第5位C上,形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)。基因啟動子區(qū)在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中具有重要作用,因此了解基因啟動子區(qū)CpG位點在不同組織中的甲基化程度,有助于揭示基因在不同組織差異表達(dá)的調(diào)控機理。本研究擬采用染色體步移技術(shù)克隆鴨TNNI1基因啟動子區(qū)序列,采用生物信息學(xué)方法分析其序列特征,采用熒光定量PCR技術(shù)檢測TNNI1基因在不同類型肌肉(胸肌和腿肌)組織中的差異表達(dá)情況,采用BSP技術(shù)檢測基因啟動子區(qū)DNA甲基化水平差異,以期為進(jìn)一步探討鴨TNNI1基因在肌肉發(fā)育中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗動物

        所用試驗動物高郵鴨來自江蘇省高郵鴨集團(tuán)種鴨群,隨機選取健康的處于上市日齡(70日齡)的高郵鴨公母各5只。放血屠宰后,分離胸肌和腿肌組織,立即放入液氮速凍,然后轉(zhuǎn)入-80 ℃冰箱保存。用于核酸的提取。

        1.2 試劑

        DNA提取試劑盒、pGM-T克隆試劑盒、SuperReal熒光定量試劑盒、QuantScript RT Kit購自天根生化科技有限公司,染色體步移試劑盒Genome Walking kit、TaqMax、DL2000 Marker均購自TaKaRa公司,EpiTect? Bisulfite kit購自Qiagen公司,瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒Gel Extraction kit、質(zhì)粒小提試劑盒plasmid Mini Kit購自中美泰和公司。DH5α感受態(tài)細(xì)胞為本實驗室保存。

        1.3 試驗方法

        1.3.1 基因5′側(cè)翼區(qū)的克隆 按照DNA提取試劑盒的說明書,提取高郵鴨胸肌肌肉組織DNA。因鴨TNNI1基因DNA序列(NCBI登錄號:NW_004676592.1)信息尚不完善,存在多個GAP區(qū)域,采用染色體步移的方法進(jìn)行TNNI1基因5′側(cè)翼區(qū)的克隆。染色體步移采用TaKaRa公司的染色體步移試劑盒,按照試劑盒的說明書進(jìn)行。

        首先需要對已知序列進(jìn)行驗證。根據(jù)鴨TNNI1基因序列(NCBI登錄號:NW_004676592.1),在TNNI1基因的CDS區(qū)設(shè)計引物P1,以基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR擴增。用1 %瓊脂糖凝膠對PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,并將擴增片段連接到pGM-T載體,鑒定為陽性的克隆送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行序列測定。獲得的序列比對正確后,設(shè)計2條特異性引物SP1、SP2,進(jìn)行下一步的延伸。以設(shè)計的2條特異性引物SP1、SP2和試劑盒提供的通用引物進(jìn)行熱不對稱PCR反應(yīng)。反應(yīng)體系和條件參照說明書。以鴨基因組DNA為模板進(jìn)行第一輪PCR反應(yīng),引物為SP1和試劑盒中的通用引物AP1~AP4,試驗特異性反應(yīng)的溫度為65 ℃,延伸時間為3 min。第一輪反應(yīng)的PCR產(chǎn)物稀釋10倍后,作為第二輪PCR反應(yīng)的模板進(jìn)行第二輪PCR反應(yīng),引物為SP2和試劑盒中的通用引物AP1~AP4。分別取2輪PCR反應(yīng)的產(chǎn)物5 μl,用1%瓊脂糖凝膠對PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,選擇清晰的電泳條帶進(jìn)行膠回收純化,將回收純化的DNA連接至pGEM-T載體,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆于含氨芐抗性的LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)過夜,進(jìn)行PCR鑒定。將鑒定正確的質(zhì)粒送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行序列測定。本試驗所用的引物見表1。

        表1鴨基因PCR擴增引物

        Table1PrimersforduckTNNI1genePCR

        引物名稱 引物序列 (5'→3') 片段長度(bp)用途P1-FCGAAGCCACGATGCCAGAG1 094染色體步移P1-RGAGCTGGCTCAGGGACSP1CTCACCCACACCTCCCTGC2 239染色體步移SP2ACAGGGGTCTCGAGCACT2 192染色體步移TNNI1-FCTGCACGAGAAGGTTGAG109熒光定量檢測TNNI1-RGCAGGTCAAGCACTTTGATβ-actin-FCAAATGCTTCTAAACCG-GAC151熒光定量檢測β-actin-RAACCTTCACCATTC-CAGTTTTBSP-FTGTATATAAGAGGGGATTTGT-GT324甲基化引物BSP-RACTTCTCCCCAAAC-CTCTCT

        1.3.2 序列分析 采用在線軟件BDGP(http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html)預(yù)測核心啟動子區(qū);利用在線軟件AliBaba (http://www.gene-regulation.com/pub/programs/alibaba2/index.html?)進(jìn)行啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點分析;利用在線軟件MethPrimer(http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer/methprimer.cgi)預(yù)測基因啟動子區(qū)CpG島。

        1.3.3 CpG島甲基化水平檢測 提取高郵鴨胸肌和腿肌組織DNA,測定濃度后,取500 ng DNA,用亞硫酸鹽對DNA進(jìn)行處理,樣本DNA未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U),經(jīng)PCR擴增最終變?yōu)樾叵汆奏?T),而甲基化的胞嘧啶則不變。處理的DNA純化后,以此DNA為模板,進(jìn)行BSP-PCR擴增反應(yīng)。采用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測目的條帶,鑒定正確后,將BSP-PCR產(chǎn)物與T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α后,涂板,隨機挑取單克隆,用PCR法進(jìn)行鑒定,鑒定為陽性菌的進(jìn)行測序,每個轉(zhuǎn)化板至少挑10個陽性克隆,用BiQ_Analyzer分析軟件對DNA序列和測序序列進(jìn)行比對,判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化,統(tǒng)計分析各個位點的甲基化程度。

        1.3.4 熒光定量PCR檢測 Trizol法提取高郵鴨胸肌和腿肌組織總RNA,瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測質(zhì)量和濃度。檢測合格后,取2 μg總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA。以管家基因β-肌動蛋白基因(β-actin)為內(nèi)參,檢測TNNI1基因的相對表達(dá)量。熒光定量PCR擴增采用SYBR Green I法,反應(yīng)總體積20.0 μl,反應(yīng)體系如下:2×SYBR Green Realtime PCR Master Mix 10.0 μl,上下游引物各0.4 μl(10 μmol/L),cDNA模板2.0 μl,50×Rox Reference Dye 0.4 μl,加ddH2O 6.8 μl補足20.0 μl。反應(yīng)條件為:95 ℃ 2 min;95 ℃ 20 s,60 ℃ 20 s,72 ℃ 60 s,共35個循環(huán);95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s。每次反應(yīng)均設(shè)空白樣品為陰性對照,每個樣品設(shè)置3個重復(fù)。相對定量的結(jié)果采用2-△△Ct法進(jìn)行處理。

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        運用SPSS 20.0軟件中的t檢驗和Bivariate Correlation進(jìn)行差異顯著性檢驗和相關(guān)性分析。所有數(shù)據(jù)均以“均值±標(biāo)準(zhǔn)差”表示。

        2 結(jié) 果

        2.1 鴨基因5′側(cè)翼區(qū)擴增

        根據(jù)染色體步移試劑盒的說明,首先要對編碼區(qū)已知序列進(jìn)行驗證。以鴨基因組DNA為模板,以P1為引物,進(jìn)行PCR擴增,擴增得到1條特異性條帶,如圖1,結(jié)果與預(yù)測片段大小相一致,與引物源序列(NW_004676592.1)一致性為99%,說明驗證的已知序列正確,可以據(jù)此已知序列設(shè)計特異性引物進(jìn)行側(cè)翼序列的擴增。分別以根據(jù)已知序列設(shè)計的特異性引物SP1和SP2和試劑盒中的通用引物AP1~AP4進(jìn)行2輪熱不對稱PCR反應(yīng),第二輪PCR有清晰的條帶(圖1),切膠回收,并進(jìn)行測序。

        M:DNA 分子量標(biāo)準(zhǔn),DL2000;1:CDS區(qū)已知序列擴增結(jié)果;2:5′側(cè)翼區(qū)序列擴增結(jié)果。圖1 鴨基因5′側(cè)翼區(qū)PCR擴增Fig.1 PCR products of duck TNNI1 gene 5′ flanking sequence

        2.2 生物信息學(xué)分析

        經(jīng)NCBI BLAST比對,獲得的5′側(cè)翼區(qū)序列片段長度為2 078 bp,與鴨(NW-004676592.1)TNNI1基因啟動子序列同源性達(dá)97%,表明所擴增序列來源正確。使用在線軟件BDGP對啟動子核心區(qū)域進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該序列存在4處的核心區(qū)域(表2),其中最有可能的核心啟動子區(qū)是核心區(qū)1,而核心區(qū)1和核心區(qū)2,核心區(qū)2和核心區(qū)3之間存在區(qū)域重疊現(xiàn)象,灰色背景的堿基代表轉(zhuǎn)錄起始位點。

        表2鴨基因核心啟動子區(qū)域預(yù)測

        Table2PredictionofcorepromoterregionofduckTNNI1gene

        核心區(qū)起始位點終止位點分值啟動子序列(5'→3')1-1 916-1 8660.99GCCTGTGGTTTAATACTCCCCCTCCGCCGCCGGGCCCCGCAGT-GCGCGGC2-1 890-1 8400.80 CCGCCGGGCCCCGCAGTGCGCGGCTCCGCTGACACCAGGCACCAC-CGAGG3-1 858- 18080.83 CACCAGGCACCACCGAGGTAAGAGGGGGCCCGGCCCCGGCTGT-GCTGCGG4-529-4790.90 TTGGGGTTGTTTAAAATGTTTCCCAAATTCGTGGGGATGCAAAAGGTTGA

        斜體的堿基代表轉(zhuǎn)錄起始位點。

        使用在線AliBaba 2.1程序,搜素 TRANSFAC 4.0 數(shù)據(jù)庫,對獲得的TNNI1基因5′側(cè)翼區(qū)序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)多個Sp1(Specificity Protein 1)結(jié)合位點,CCAAT增強子結(jié)合蛋白(CCAAT/enhancer binding proteins, C/EBPs)結(jié)合位點。還預(yù)測到了E-box、SP1、八聚體結(jié)合蛋白-1 (Octamer binding protein-1,Oct-1)、核因子KB (Nuclear Factor-kB,NF-KB)、GATA1(GATA binding protein 1)、生肌調(diào)節(jié)因子MRF4(Myogenic regulatory factor 4)等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。經(jīng)在線軟件Methprimer 對啟動子區(qū)CpG進(jìn)行預(yù)測(Criteria used: Island size>100, GC Percent>50.0,Obs/Exp>0.6),結(jié)果顯示,在-2 032至-1 833處存在1個200 bp的CpG島,在-206至-87處存在1個120 bp的CpG島(圖2)。預(yù)測的啟動子核心區(qū)1、核心區(qū)2、核心區(qū)3位于-2 032至-1 833處的CpG島內(nèi),其中部分CpG位點正好位于預(yù)測的核心啟動子區(qū)內(nèi)。對CpG島(-2 032~-1 833 bp)進(jìn)行分析(圖3),發(fā)現(xiàn)其存在3個Sp1結(jié)合位點,1個CCAAT增強子結(jié)合蛋白(C/EBPs)結(jié)合位點,同時發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子如維甲類X受體β(Retinoid X receptor beta,RXR-beta)、叉頭框轉(zhuǎn)錄因子M1 (forkhead box M1,HNF-3)、NF-KB、c-Myc(Transcriptional regulator Myc-like)等的結(jié)合位點。

        圖2 鴨基因5′側(cè)翼序列CpG島預(yù)測結(jié)果Fig.2 Prediction of CpG island in duck TNNI1 gene 5′ flanking sequence

        數(shù)字代表核苷酸位置(以ATG為+1),加粗字體和加方框的序列代表預(yù)測的轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點,下劃線代表預(yù)測的核心啟動子位置,灰色背景序列為BSP檢測的CpG位點,順序依次為1~14。圖3 鴨基因5′側(cè)翼區(qū)CpG島轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測結(jié)果Fig.3 Prediction of transcription factor binding sites in duck TNNI1 gene 5′ flanking sequence CpG island

        2.3 高郵鴨基因表達(dá)水平

        高郵鴨胸肌和腿肌組織TNNI1基因 mRNA 表達(dá)水平如圖4所示,腿肌組織TNNI1基因表達(dá)量顯著高于胸肌近9倍,二者差異極顯著(P<0.01)。

        **表示胸肌和腿肌組織基因表達(dá)差異極顯著(P < 0.01)。圖4 鴨胸肌和腿肌組織TNNI1 mRNA表達(dá)情況Fig.4 The mRNA expression of TNNI1 in the breast and leg muscles of ducks

        2.4 DNA甲基化分析

        鴨TNNI1基因啟動子區(qū)BSP擴增序列位于-1 964 bp至-1 641 bp區(qū)域內(nèi),全長序列為324 bp,包含整個預(yù)測的核心啟動子區(qū),共有14個CpG位點。從圖5A中可以看出,總體上,胸肌的甲基化水平為52.66%,腿肌的甲基化水平為57.04%,二者差異不顯著(P>0.05)。比較各CpG位點的甲基化水平,從圖5B中可以看出,胸肌和腿肌各個CpG位點的甲基化水平在胸肌和腿肌中均無顯著差異(P>0.05)。啟動子區(qū)各CpG位點的甲基化水平與TNNI1基因的mRNA 表達(dá)量進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果如表3所示,胸肌中CpG2、CpG6、CpG7、CpG11、CpG12、CpG13、CpG14與腿肌中CpG4、CpG5、CpG6、CpG7、CpG8、CpG10、CpG11、CpG12位點的甲基化水平與mRNA表達(dá)量均呈正相關(guān)(P>0.05),其余各位點甲基化水平與mRNA 表達(dá)量呈負(fù)相關(guān)(P>0.05);其中,胸肌CpG4甲基化程度與mRNA表達(dá)量呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05)。

        3 討 論

        課題組前期通過RNA-Seq技術(shù)對不同品種不同日齡的鴨胸肌組織進(jìn)行了差異表達(dá)基因的篩選,通過GO和KEGG分析發(fā)現(xiàn)TNNI1基因在品種間各個時間點都具有顯著差異,推測TNNI1基因可能在鴨早期骨骼肌生長發(fā)育中具有重要作用。

        圖5 鴨基因啟動子區(qū)CpG島的總體甲基化水平(A)和單個位點的甲基化水平(B)Fig.5 Overall methylation level (A) and single locus methylation level (B) of CpG island in the promoter region of duck TNNI1 gene

        表3鴨基因mRNA表達(dá)量與啟動子區(qū)CpG島單個位點的甲基化水平的相關(guān)性

        Table3CorrelationanalysisbetweenTNNI1genemRNAexpressionandmethylationlevelofthesinglesiteofCpGislandinthepromoterregion

        CpG位點相關(guān)系數(shù)胸肌腿肌P值胸肌腿肌1-0.066-0.1060.9340.89420.207-0.1050.7930.8953-0.042-0.1480.9580.8524-0.9970.2780.003**0.7225-0.1940.4700.8060.53060.2070.4770.7930.52370.4440.0630.7560.9378-0.5820.2780.4180.7229-0.395-0.0550.6050.94510-0.8640.7050.1360.295110.7590.4190.4520.724120.0420.5150.9580.485130.944-0.6930.0770.307140.156-0.7000.8440.300

        為進(jìn)一步深入研究其表達(dá)調(diào)控機制,本研究成功克隆了鴨TNNI1基因上游5′側(cè)翼區(qū)序列2 078 bp。已有的研究結(jié)果表明[9],在人TNNI1基因啟動子的上游并未發(fā)現(xiàn)TATA-box和CAAT-box;在豬上[10],研究發(fā)現(xiàn)TNNI1基因啟動子上游同時存在TATA-box和CAAT-box調(diào)控元件,另外還預(yù)測到了E-box、SP1、Oct-1、NF-KB、GATA1/2/3、AP1等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。本研究采用生物信息學(xué)技術(shù),分析鴨TNNI1基因啟動子上游序列發(fā)現(xiàn),與豬上的研究結(jié)果一致,該序列存在多個C/EBP結(jié)合位點,另外還發(fā)現(xiàn)了SP1、RXR-beta、MRF4、GATA1、NF-KB、c-Myc等多個轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點。在人和豬的啟動子區(qū)均未發(fā)現(xiàn)CpG島(轉(zhuǎn)錄起始位點前3 000 bp)的存在。在鴨TNNI1基因啟動子區(qū)-2 032~-1 833和-206~-87處各發(fā)現(xiàn)了1個200 bp和120 bp的CpG島,推測鴨TNNI1基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控方式可能與哺乳動物存在差異。

        通過軟件預(yù)測分析,TNNI1基因啟動子區(qū)包含了4個核心區(qū),其中-1 916~-1 808區(qū)域內(nèi)含3個候選核心啟動子區(qū)。預(yù)測的核心啟動子區(qū)正好位于CpG島(-2 032~-1 833)內(nèi)。CpG島是易于發(fā)生甲基化的區(qū)域,啟動子區(qū)DNA甲基化能夠影響轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合,改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu),調(diào)控基因表達(dá)。分析發(fā)現(xiàn)CpG島所在的區(qū)域有1個C/EBP和3個SP1結(jié)合位點,另外還包含了RXR-beta、HNF-3、NF-KB、c-Myc等轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點。C/EBPalp與基因轉(zhuǎn)錄效率關(guān)系密切[11]。SP1能和GC盒相結(jié)合,也能與轉(zhuǎn)錄因子如YY1、TBP結(jié)合,參與基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控[12]。目前還沒有TNNI1基因啟動子區(qū)DNA序列甲基化影響基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面的報道。

        與胸肌相比,腿肌因為承擔(dān)更多的運動功能,肌肉中慢肌纖維的比例高于胸肌。定量檢測的結(jié)果表明,TNNI1基因mRNA表達(dá)量在胸肌和腿肌中呈顯著差異,與哺乳動物中TNNI1基因在慢肌纖維中特異性表達(dá)[6]是一致的。采用亞硫酸氫鹽測序法檢測CpG島中各CpG位點的甲基化程度,發(fā)現(xiàn)胸肌和腿肌的CpG島的總體甲基化水平無顯著差異。推測,預(yù)測的核心啟動子區(qū)CpG島的甲基化修飾可能不是影響鴨TNNI1 基因在不同類型肌肉組織差異表達(dá)的主要調(diào)控因素,可能存在其他的如組蛋白修飾、miRNA干擾等的調(diào)控方式。CpG島中各個位點的甲基化水平與mRNA表達(dá)量進(jìn)行相關(guān)性分析,胸肌CpG4位點的甲基化程度與mRNA表達(dá)量呈顯著負(fù)相關(guān),這與通常認(rèn)為的,甲基化程度越高,基因表達(dá)會被抑制的觀點是一致的。CpG4位點正好位于轉(zhuǎn)錄因子c-Myc的結(jié)合區(qū)域內(nèi)。c-Myc能夠抑制肌肉細(xì)胞的終端分化,而YY1的持續(xù)表達(dá)能夠促進(jìn)c-Myc的表達(dá)[13];NF-KB能夠通過調(diào)節(jié)YY1和肌纖維相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄沉默調(diào)節(jié)骨骼肌成肌細(xì)胞的分化。對啟動子區(qū)序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)啟動子區(qū)存在3個NF-KB和2個YY1的結(jié)合位點。CpG4位點可能通過甲基化修飾,影響相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合,參與鴨TNNI1基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程。

        本研究克隆獲得鴨TNNI1基因5′側(cè)翼區(qū)序列2 078 bp,預(yù)測分析發(fā)現(xiàn)其含有2個CpG島,其中1個CpG島(-2 078~-1 695)位于核心啟動子區(qū),存在多個調(diào)控元件和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,其總體甲基化水平與TNNI1基因表達(dá)水平無顯著相關(guān),其中CpG4位點可能通過甲基化修飾,影響鴨TNNI1基因在胸肌中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。

        猜你喜歡
        甲基化試劑盒位點
        鎳基單晶高溫合金多組元置換的第一性原理研究
        上海金屬(2021年6期)2021-12-02 10:47:20
        CLOCK基因rs4580704多態(tài)性位點與2型糖尿病和睡眠質(zhì)量的相關(guān)性
        二項式通項公式在遺傳學(xué)計算中的運用*
        GlobalFiler~? PCR擴增試劑盒驗證及其STR遺傳多態(tài)性
        GoldeneyeTM DNA身份鑒定系統(tǒng)25A試劑盒的法醫(yī)學(xué)驗證
        鼻咽癌組織中SYK基因啟動子區(qū)的甲基化分析
        胃癌DNA甲基化研究進(jìn)展
        基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化
        遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:58:49
        全甲基化沒食子兒茶素沒食子酸酯的制備
        牛結(jié)核病PCR診斷試劑盒質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的研究
        av资源在线看免费观看| 91精品国产乱码久久中文| 校园春色日韩高清一区二区| 老熟女富婆激情刺激对白| 久久精品夜色噜噜亚洲a∨| 国产免费人成视频在线观看| 亚洲精品国产成人无码区a片| 99re在线视频播放| 国产成人精品三上悠亚久久| 一区二区三区蜜桃在线视频| 日本一区二区在线播放| 亚洲视频免费在线观看| 天天摸夜夜摸摸到高潮| 狠狠色成人综合网| 两个人看的www中文在线观看| 国产成人九九精品二区三区| 69堂在线无码视频2020| 国产精品髙潮呻吟久久av| 人成综合视频在线播放| 欧美三级不卡在线观看| 国产精品卡一卡二卡三| 中文字幕Aⅴ人妻一区二区苍井空| 久久久久久国产福利网站| av在线不卡一区二区| 欧美怡春院一区二区三区| 久久婷婷成人综合色| 国产人成无码中文字幕| 国产日韩三级| 一区二区三区国产天堂| 国产精品专区第一页天堂2019| 中文字幕人妻无码一夲道| 欧美在线专区| 国产91精品清纯白嫩| 国产三级不卡一区不卡二区在线 | 亚洲色图片区| 久久和欧洲码一码二码三码| 国产乱子伦精品免费女| 亚洲一区二区丝袜美腿| 日本一二三四区在线观看| 国产男女无遮挡猛进猛出| 亚洲欧洲日产国码无码AV一|