王 慶, 辛 瑜, 楊海麟, 仝艷軍, 王 武
(江南大學(xué) 工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 無(wú)錫214122)
肌氨酸氧化酶 (Sarcosine oxidase,EC.1.5.3.1,SOX)屬于黃素蛋白氧化酶類(lèi),以FAD為輔因子,催化肌氨酸中N-甲基的氧化還原[1]。檢測(cè)血清或尿液中肌酐的含量,是判斷腎功能的一項(xiàng)重要指標(biāo),而SOX則是此項(xiàng)檢測(cè)的關(guān)鍵診斷用酶之一[2],在酶法測(cè)定中,肌酐轉(zhuǎn)化為肌氨酸,然后在肌氨酸氧化酶(SOX)的作用下分解成甘氨酸、甲醛和H2O2[3],催化機(jī)理見(jiàn)圖1。
圖1 肌酐降解酶系的催化機(jī)理Fig.1 Catalysis in creatinine degradation enzyme system
現(xiàn)代臨床檢測(cè)肌酐的方法主要是基于上述酶促反應(yīng)機(jī)理。SOX的酶學(xué)性質(zhì)將在很大程度上影響它的應(yīng)用價(jià)值[4]。作為典型的、以共價(jià)結(jié)合FAD為輔因子的SOX,其輔基與酶蛋白的復(fù)合狀態(tài)直接影響到此類(lèi)酶的活性與特異性[5]。為SOX脫去輔基再?gòu)?fù)合的研究并不多見(jiàn),解決共價(jià)結(jié)合型輔基的脫除尤為困難[6-7]。本研究探索出采用不含輔因子FAD的SOX包涵體復(fù)性的方法,對(duì)肌氨酸氧化酶進(jìn)行脫輔基以及與天然輔基的復(fù)合,探究如何在復(fù)性的過(guò)程中添加輔因子[8],促使酶蛋白本體在正確折疊的過(guò)程中螯合輔因子,并呈現(xiàn)出酶學(xué)活性[9]。研究SOX酶蛋白與不同的、潛在的輔基之間存在著什么樣的關(guān)系,對(duì)改造乃至提高此類(lèi)黃素酶的催化特性,將提供有意義的參考價(jià)值[10]。
E.coli BL21(DE3)/pET28a-soxopB:由作者所在實(shí)驗(yàn)室保存[11]。
1.2.1 種子培養(yǎng)基(g/L)胰蛋白胨10,酵母提取物 5,氯化鈉 10,瓊脂 20;pH 7.5。
1.2.2 發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L)胰蛋白胨10,酵母膏5,KH2PO42,K2HPO4·3H2O 4,NH4Cl 0.2, (NH4)2SO41.2,Na2HPO4·12H2O 7,MgSO4·7H2O 1, 葡萄糖 0.5;甘油10 mL/L。121℃下滅菌20min。
1.2.3 乳糖誘導(dǎo)液(g/L) 乳糖200;115℃滅菌30 min。
β-巰基乙醇、FAD (黃素腺嘌呤二核苷酸)、FMN(黃素腺嘌呤單核苷酸)、肌氨酸氧化酶、FMN(黃素腺嘌呤單核苷酸):Sigma 公司;Tryptone、Yeast Extract、GSH、GSSG、核黃素、卡那霉素、牛血清蛋白(BSA)、辣根過(guò)氧化物酶:上海Sangon公司;尿素等其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.4.1 SOX包涵體的制備粗提取將新鮮活化菌種接種于LB發(fā)酵培養(yǎng)基(含1%卡那霉素),在 37℃、200 r/min的搖床中振蕩培養(yǎng)8 h后,加入終濃度為5%的乳糖誘導(dǎo)劑誘導(dǎo) 16 h,然后離心去上清液,在20 mmol/L Tris-HCl(pH值8.0)緩沖液中進(jìn)行冰浴超聲波破碎,破碎完成后于8 000 r/min離心15 min,棄去上清液,得到肌氨酸氧化酶包涵體。
1.4.2 SOX包涵體的溶解將洗滌后的包涵體加入到 20 mmol/L Tris-HCl(pH 值 8.0,含 8 mol/L尿素,15 mmol/L β-巰基乙醇)配制的溶解液中,在200 r/min的搖床中過(guò)夜,過(guò)夜后10 000 r/min離心15 min,取離心后的上清液即為肌氨酸氧化酶包涵體溶解液。
1.4.3 SOX包涵體的透析復(fù)性將SOX包涵體變性溶解液置入透析袋中進(jìn)行復(fù)性,通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)先探究復(fù)性的基本條件:如蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度、溫度、氧化還原態(tài)、pH、時(shí)間等,確定SOX透析復(fù)性的最適條件后,加入輔基FAD復(fù)性,并按一定的時(shí)間間隔取樣測(cè)酶活性。
1.4.4 SOX脫輔基蛋白與輔酶復(fù)合的條件將SOX包涵體變性溶解液置入透析袋中,按照實(shí)驗(yàn)前期探索的最佳復(fù)性條件進(jìn)行,如蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度0.3 g/L,透析液pH 8.5,溫度4℃,氧化還原值(GSH/GSSG)為2,復(fù)性時(shí)間為24 h等,加入的輔因子換為FMN、核黃素(均為4 mg),另外設(shè)置不添加任何輔因子的作為對(duì)照,比較不同天然輔基與SOX蛋白復(fù)合后酶活、結(jié)構(gòu)與熱穩(wěn)定性的變化。
1.5.1 蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度采用考馬斯亮藍(lán)法測(cè)定質(zhì)量濃度,以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)物,按照標(biāo)準(zhǔn)方法進(jìn)行測(cè)定。
1.5.2 酶偶聯(lián)分光光度法測(cè)定SOX酶活力以肌氨酸為底物,按照文獻(xiàn)[12]進(jìn)行測(cè)定。
2.1.1 變性可溶蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度對(duì)SOX后期復(fù)性的影響用變性液將包涵體的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度調(diào)制為 0.05、0.1、0.2、0.3、0.5、0.8 mg/mL, 要使溶解液中尿素的濃度不能改變,否則會(huì)導(dǎo)致復(fù)性過(guò)程中蛋白質(zhì)的沉淀。在室溫下(15℃)透析開(kāi)始時(shí)透析外液中加入6 mol/L的尿素,并添加過(guò)量的FAD,加入氧化還原態(tài)(GSH/GSSG)比值為 3的GSH與GSSG,以后每隔4小時(shí)將透析外液中尿素的濃度遞減2 mol/L(每次換液時(shí)都需要添加4 mg的FAD),復(fù)性結(jié)束后取樣測(cè)定SOX的比酶活,見(jiàn)圖2。
圖2 蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度對(duì)復(fù)性后SOX比酶活的影響Fig.2 Effects of protein concentration on the specific activity of refolded SOX
從圖2可以看出,在蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.1mg/mL時(shí)復(fù)性后的酶比活性最高,變性蛋白質(zhì)的質(zhì)量濃度越低,越有利于復(fù)性。但初始蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度太低,復(fù)性后的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度也比較低,不利于活性蛋白質(zhì)的回收。且在蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.8 mg/mL時(shí)蛋白質(zhì)產(chǎn)生部分沉淀,所以蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度不宜過(guò)高,但考慮到后期工作的復(fù)雜性,復(fù)性時(shí)蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度不能過(guò)低,所以取0.3 mg/mL。
2.1.2 復(fù)性時(shí)間對(duì)SOX比酶活的影響使包涵體的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.3 mg/mL,室溫下(15℃)首次透析時(shí)在透析外液中加入6 mol/L的尿素,以后每隔不同時(shí)間(1、2、4、6、8 h)將透析外液中尿素的濃度遞減2 mol/L(每次換液時(shí)都需要添加2 mg的FAD),加入氧化還原態(tài) (GSH/GSSG)比值為3的GSH與GSSG,復(fù)性結(jié)束后取樣測(cè)定SOX的比酶活,見(jiàn)圖3。
圖3 復(fù)性時(shí)間與復(fù)性后SOX比酶活的關(guān)系Fig.3 Relation of renaturation time to the specific activity of refolding SOX
由圖3可知,復(fù)性時(shí)間為24 h比酶活比較高,到了32 h,比酶活雖然還在增長(zhǎng)但幅度比較小,而且酶復(fù)性時(shí)間太久,SOX蛋白質(zhì)分子之間聚集,活性容易下降,故應(yīng)選擇復(fù)性時(shí)間為24 h為宜,即每隔6小時(shí)更換不同濃度的復(fù)性緩沖液。
2.1.3 復(fù)性溫度對(duì)SOX比酶活的影響使包涵體的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.3 mg/mL,首次透析時(shí)在透析外液中加入6 mol/L的尿素,以后每隔6小時(shí)將透析外液中尿素的濃度遞減2 mol/L(每次換液時(shí)都需要添加2 mg的FAD),加入氧化還原態(tài)(GSH/GSSG)比值為3的GSH與GSSG,透析24 h后取樣測(cè)定SOX的比酶活,研究3個(gè)復(fù)性溫度對(duì)SOX重折疊的影響,見(jiàn)圖4。
圖4 不同溫度對(duì)復(fù)性后SOX比酶活的影響Fig.4 Effect of different temperatures on the specific activity after refolding of SOX
由圖4可知,在4℃條件下復(fù)性的SOX的活性和質(zhì)量回收率均高于在15℃和25℃下復(fù)性的SOX。導(dǎo)致這種現(xiàn)象出現(xiàn)的原因是SOX變性溶解液在重折疊的過(guò)程中,分子內(nèi)部的疏水基團(tuán)有機(jī)會(huì)暴露在外界環(huán)境中,分子內(nèi)部或者不同分子之間的疏水基團(tuán)時(shí)時(shí)刻刻都在發(fā)生布朗運(yùn)動(dòng),溫度升高時(shí)布朗運(yùn)動(dòng)加劇,導(dǎo)致暴露在外的水基團(tuán)互相碰撞形成了不正確的折疊造成聚集的產(chǎn)生。而低溫時(shí)布朗運(yùn)動(dòng)速度慢,疏水基團(tuán)就不容易發(fā)生接觸形成聚集體。
2.1.4 透析液pH對(duì)SOX比酶活的影響復(fù)性透析液的pH值必須在7.0以上,可以促進(jìn)二硫鍵的正確形成[13],在前面的研究條件下,使透析液的pH分別為 7.0、7.5、8.0、8.5 和 9.0,加入氧化還原態(tài)(GSH/GSSG)比值為3的GSH與GSSG,在4℃下復(fù)性24 h(每次換液時(shí)都需要添加2 mg的FAD),結(jié)束后測(cè)定蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度和活性,考察透析液pH值對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)性的影響,見(jiàn)圖5。
圖5 透析液pH對(duì)復(fù)性后SOX比酶活的影響Fig.5 Effect of dialysis pH on the specific activity of refolding SOX
研究顯示,透析液pH為8.5的條件下復(fù)性效果最好,而導(dǎo)致這種現(xiàn)象的原因是SOX變性溶解液在重折疊的過(guò)程中,分子內(nèi)部的二硫鍵的正確折疊起著非常重要的作用,而過(guò)高或過(guò)低的pH會(huì)影響二硫鍵的狀態(tài),二硫鍵復(fù)性時(shí)最適宜的復(fù)性pH值一般為8.0~9.0,結(jié)合實(shí)驗(yàn)結(jié)果選擇pH為8.5較為適宜。
2.1.5 透析液氧化還原態(tài)(GSH/GSSG)對(duì)復(fù)性SOX的影響氧化還原電勢(shì)對(duì)于形成正確的二硫鍵非常必要。氧化還原電勢(shì)過(guò)小,二硫鍵不會(huì)產(chǎn)生;氧化還原電勢(shì)過(guò)高,二硫鍵的形成容易出問(wèn)題。首先確定GSSG濃度為1 mmol/L,分別加入GSH,使其與GSSG 摩爾比為 0.25、0.5、1、2、3、5, 考 察 GSH 與GSSG比例對(duì)SOX復(fù)性的影響,見(jiàn)圖6。
圖6 氧化還原環(huán)境對(duì)復(fù)性后SOX比酶活的影響Fig.6 Redox environment after refolding SOX specific activity
圖6顯示,在添加2 mmol/L的GSH條件下復(fù)性效果有明顯提高,因此選擇GSH/GSSG為2。
2.2.1 圓二色譜檢測(cè)不同輔基與脫輔基SOX的復(fù)合通過(guò)上述透析復(fù)性得知,在復(fù)性的過(guò)程中添加2 mg的FAD作為輔基可以使酶結(jié)構(gòu)正確折疊,使得315位的Cys與FAD輔因子通過(guò)二硫鍵結(jié)合。為了判斷不同天然輔基與脫輔基蛋白的復(fù)合是否成功[14],在透析復(fù)性過(guò)程中分別加入4 mg不同的輔基,如FAD、FMN、核黃素,不加任何黃素輔基的設(shè)為空白,采用CD分析不同天然輔基與肌氨酸氧化酶脫輔基蛋白復(fù)合前后二級(jí)結(jié)構(gòu)的變化,不同天然輔基與酶復(fù)合的圓二色譜見(jiàn)圖7。
圖7 不同天然輔基與肌氨酸氧化酶脫輔基蛋白復(fù)合的CD分析Fig.7 CD analysis on SOX protein complexed with different natural cofactors
圓二色譜分析脫輔酶蛋白與天然輔基復(fù)合后的二級(jí)結(jié)構(gòu)特征峰與游離酶相比完整性降低,酶分子內(nèi)部α-螺旋和β-折疊比例降低,二級(jí)結(jié)構(gòu)有所變化,其中添加類(lèi)似物為FAD與FMN的二級(jí)結(jié)構(gòu)峰的完整性沒(méi)有太大變化,酶活相差不大;而核黃素和未加任何天然輔基的二級(jí)結(jié)構(gòu)峰的完整性發(fā)生巨大變化,α螺旋和β-折疊比例大幅度降低,酶活相差比較大,說(shuō)明酶的二級(jí)結(jié)構(gòu)遭到破壞,SOX酶分子處于變性狀態(tài)。
2.2.2 FTIR分析SOX復(fù)合度的變化采用FTIR分析不同天然輔基與肌氨酸氧化酶脫輔基蛋白復(fù)合前后其官能團(tuán)的變化,判斷不同天然輔基與脫輔基蛋白的復(fù)合是否成功。不同天然輔基與酶復(fù)合的紅外光譜圖譜見(jiàn)圖8。
圖8 不同天然輔基與肌氨酸氧化酶脫輔基蛋白復(fù)合的FTIR分析Fig.8 FTIR analysisofdifferentnaturalcofactor complexed with SOX apoprotein
由圖8,未添加任何配體的SOX分子中2 500 cm-1左右處出現(xiàn)巰基(-SH)伸縮振動(dòng)峰,該特征峰在經(jīng)過(guò)復(fù)性后明顯增強(qiáng),說(shuō)明無(wú)輔基酶分子中可能生成另一個(gè)二硫鍵,使酶分子結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,復(fù)性未成功[15];添加FAD與FMN作為配體的酶分子波峰結(jié)構(gòu)未發(fā)生比較大的變化,輔基的加入促進(jìn)了酶的正確折疊,結(jié)合酶活可證明FAD作為輔基與SOX復(fù)性成功,而FMN與脫輔基蛋白不能很好的結(jié)合,復(fù)性不完全。核黃素在2 100 cm-1左右處出現(xiàn)羧基(—COO—)中C=O伸縮振動(dòng)峰,此特征峰強(qiáng)度在復(fù)合酶中明顯降低,說(shuō)明羧基載體中羧基含量降低,穩(wěn)定性下降。3 100 cm-1是NH伸縮振動(dòng),此特征峰強(qiáng)度在復(fù)合酶中明顯降低,說(shuō)明氨基載體中氨基含量降低,結(jié)合酶活顯示只能少部分復(fù)性成功。
2.2.3 DSC分析比較SOX游離酶與復(fù)性酶的熱變性利用DSC技術(shù),分析SOX游離酶與復(fù)性酶其熱變性溫度Tm的變化,分析兩者的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。
如圖9所示,游離酶和復(fù)性酶出現(xiàn)了單一的吸熱峰,該吸熱峰則表示分子在升溫過(guò)程中構(gòu)象改變伴隨著能量變化。游離酶和修飾酶的熱變性溫度Tm分別為64.03℃和44.6℃,相同的升溫速率,復(fù)性酶的Tm值比游離酶大約降低20℃;與游離酶相比,瓦解復(fù)性酶的天然結(jié)構(gòu)要花費(fèi)更少的能量;兩者數(shù)據(jù)表示,復(fù)性后的SOX酶分子變得不穩(wěn)定,容易受外界影響。
圖9 游離酶與重構(gòu)酶的DSC分析Fig.9 DSC thermograms of SOX without cofactor and SOX refolded
作者利用不含輔因子的肌氨酸氧化酶(SOX)包涵體,通過(guò)透析復(fù)性處理,確定了較為合適的條件:酶蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.3 g/L,透析液pH為8.5時(shí),溫度 4℃,最佳的氧化還原態(tài)(GSH/GSSG)GSH/GSSG值為2,以及復(fù)性時(shí)間為24 h時(shí),SOX酶蛋白的復(fù)性效果相對(duì)較好。
研究進(jìn)一步比較了各種天然輔基與SOX酶蛋白的復(fù)合,發(fā)現(xiàn)外加FAD(非共價(jià)的情況下)與脫輔酶蛋白復(fù)合后,酶活性高;二級(jí)結(jié)構(gòu)與原酶接近,酶活是原酶的50%;與原酶的α-螺旋與β-折疊的二級(jí)結(jié)構(gòu)相似度達(dá)80%。FMN的效果次之,酶活是原酶的30%,α-螺旋與β-折疊的二級(jí)結(jié)構(gòu)相似度為50%;而加入核黃素后SOX酶分子處于變性狀態(tài),其對(duì)SOX酶的復(fù)性和酶活皆為負(fù)影響。