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        2016年山東地區(qū)10株H9N2亞型禽流感病毒HA基因的遺傳演化分析

        2018-09-12 11:11:48邵明辰王友令
        家禽科學(xué) 2018年9期
        關(guān)鍵詞:糖基化毒株禽流感

        邵明辰,王友令

        (1.山東魯南牧工商有限公司,山東 滕州 277500;2.山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所,山東 濟(jì)南 250100)

        禽流感(AI)由A型禽流感病毒引發(fā)的高度接觸性傳染病,它不但能造成養(yǎng)禽業(yè)的巨大經(jīng)濟(jì)損失,還對人類公共衛(wèi)生安全構(gòu)成威脅[1]。禽類感染禽流感病毒(Avian Influenza Virus,AIV)后,癥狀可表現(xiàn)為非顯性感染、亞臨診感染,或輕度呼吸道疾病,產(chǎn)蛋量下降直至急性全身致死性疾病等多種形式。禽流感病毒屬于正粘病毒科、流感病毒屬的A型流感病毒,為分節(jié)段的、單股、負(fù)鏈 RNA病毒,每個(gè)RNA片段都是由核蛋白包被形成RNPs復(fù)合體,RNPs是由基質(zhì)蛋白(M)構(gòu)成完整的膜包裹[2]。雖然家禽感染低致病性AIV的發(fā)病率、死亡率低,但可引起產(chǎn)蛋量下降,造成免疫抑制,造成養(yǎng)禽業(yè)巨大的經(jīng)濟(jì)損失。

        H9N2禽流感病毒呈世界性分布,其按地區(qū)可分為北美和歐亞兩個(gè)種系[3]。我國于1994年首次公開報(bào)道,但未波及全國[4]。HA基因是A型流感病毒致病性的主要影響因子,主要通過HA識別宿主細(xì)胞的特異性受體,從而吸附于細(xì)胞表面,以吞噬小體的形式進(jìn)入細(xì)胞質(zhì),膜融合后釋放病毒的RNP[5]。HA蛋白識別受體結(jié)合位點(diǎn)是感染的第一步,也是比較關(guān)鍵的一步。HA蛋白能識別兩種類型的受體,分別為α-2,3-半乳糖和α-2,6-半乳糖連接的唾液酸[6]。

        為了解2016年山東地區(qū)H9N2亞型禽流感病毒HA基因的變異情況及探討其是否發(fā)生了重組,特選取所分離的10個(gè)H9N2亞型禽流感病毒分離株,對其HA基因進(jìn)行測序,分析其遺傳演化規(guī)律,為山東地區(qū)H9N2禽流感的防控提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 毒株 10株H9N2亞型禽流感病毒流行株由山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所按照參考文獻(xiàn)中的方法進(jìn)行分離、鑒定及純化[1]。其毒株代表號依次為 A-CK-SD-XT31-2016-H9N2、A-CK-SD-XT33-2016-H9N2、A-CK-SD-XT34-2016-H9N2、A-CKSD-XT35-2016-H9N2、A-CK-SD-XT39-2016-H9N2、A-CK-SD-XT43-2016-H9N2、A-CK-SDXT44-2016-H9N2、A-CK-SD-XT46-2016-H9N2、ACK-SD-MHS3-2016-H9N2、A-CK-SD-MHS5-2016-H9N2。

        1.2 主要試劑 SPF雞和雞胚均由山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所SPF雞研究中心提供。Trizol、DNA回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、pMD18-T Vector、限制性內(nèi)切酶和一步法RT-PCR試劑盒均購自大連寶生物有限公司。

        1.3 引物合成 參考GenBank上已發(fā)表的H9N2亞型禽流感病毒HA基因序列,利用Oligo6.0軟件設(shè)計(jì)了一對引物,由上海生工生物工程有限公司合成,用于擴(kuò)增HA基因全長序列。

        H9上游引物(H9F)∶

        5'-CACCATGGAAACAATATATCACTAMT-3';

        H9下游引物(H9R)∶

        5'-CTATATACAAATGTTGCRYCT-3'。

        引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。預(yù)期擴(kuò)增的HA基因大小為1687bp,編碼560個(gè)氨基酸。

        1.4 擴(kuò)增 病毒RNA的提取及HA基因的RTPCR擴(kuò)增按照Trizol試劑盒說明書提取病毒RNA,取適量DEPC處理的超純水溶解RNA。RTPCR采用大連寶生物工程有限公司的一步法提取試劑盒說明書進(jìn)行操作。

        1.5 PCR產(chǎn)物的克隆與序列分析 將PCR產(chǎn)物克隆測序,拼接所得HA基因序列,并結(jié)合GenBank上已發(fā)表的8株H9N2禽流感病毒株的HA基因序列(毒株具體信息及登錄號詳見表1),用MEGA5.0分別對其進(jìn)行遺傳演化分析,繪制系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹,從而對上述毒株的HA、NA基因分子遺傳變異情況進(jìn)行分析。

        表1 下載毒株的基本信息及登錄號

        2 結(jié)果與分析

        2.1 HA基因遺傳分析 用 MEGA5.0對參考序列和本實(shí)驗(yàn)所得10個(gè)H9N2病毒分離株HA基因進(jìn)行遺傳演化分析,得到的進(jìn)化樹見圖1。

        10株H9N2亞型AIV的HA基因的cDNA全序列,全長1742bp,ORF全長為1683個(gè)核苷酸,位置為34~1716位核苷酸,編碼560個(gè)氨基酸。將10個(gè)分離株與GenBank上發(fā)表的參考毒株進(jìn)行核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比較,10個(gè)分離株與BJ94參考毒株HA基因的核苷酸之間的同源性為89.1%~91.3%,氨基酸之間的同源性為90.0%~93.4%;與 A/chicken/Zhejiang/HJ/2007(G57分支)參考毒株HA基因的核苷酸之間的同源性為89.1%~91.3%,氨基酸之間的同源性為93.6%~97.0%;而分離株之間的HA基因核苷酸同源性為94.1%~99.8%,氨基酸序列之間的同源性為94.3%~100%。

        所有分離株的HA裂解位點(diǎn)均為RSSR↓GLF,有 6~8個(gè)潛在的糖基化位點(diǎn)(N-X-T/S,X 為除 P外的氨基酸),XT39毒株在 218~220位和313~315位出現(xiàn)糖基化位點(diǎn)雙缺失,XT205和XT208毒株在218~220位糖基化位點(diǎn)缺失,XT33和MHS3毒株在551~553位潛在糖基化位點(diǎn)缺失。10株分離株構(gòu)成HA唾液酸受體結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸在191位非常保守,為N(天冬酰胺),與經(jīng)典的禽流感國內(nèi)分離株一致。10株分離株中有3株在198位上變異為A (丙氨酸),6株變異為T(蘇氨酸),1株變異為M(甲硫氨酸)三種形式。10株分離毒在234位受體結(jié)合位點(diǎn)均為L(亮氨酸),具有與哺乳動物唾液酸a,2-6受體結(jié)合的特征,該類毒株的流行在公共衛(wèi)生上應(yīng)值得重視。從進(jìn)化樹分析可知,10個(gè)分離株同屬于歐亞分支中的A/Chicken/Beijing/1/1994(A/Duck/Hong-Kong/Y280/97)亞群,與近年在中國的雞群中流行的由A/chicken/Zhejiang/HJ/2007為代表的新的基因型(G57分支)遺傳關(guān)系最近[7],推測是由其進(jìn)化演變而來。

        圖1 10個(gè)H9N2病毒分離株HA基因進(jìn)行遺傳演化分析進(jìn)化樹

        3 討論

        HA基因是A型流感病毒致病性的主要影響因子。HA裂解位點(diǎn)氨基酸序列是決定禽流感病毒致病性和毒力強(qiáng)弱的關(guān)鍵因素之一。HA蛋白識別受體結(jié)合位點(diǎn)是感染的第一步,也是比較關(guān)鍵的一步。本研究中10個(gè)毒株HA基因裂解位點(diǎn)氨基酸序列為RSSR↓GLF,不存在多個(gè)連續(xù)堿性氨基酸插入,具有低致病性病毒分子特征。Steinhauer[8]發(fā)現(xiàn)流感病毒表面血凝素HA蛋白上第183、190和226位氨基酸是關(guān)鍵的受體結(jié)合位點(diǎn),與病毒的受體結(jié)合特性和宿主特性相關(guān)。本研究中10個(gè)毒株HA受體結(jié)合位點(diǎn)的第149、198、234位氨基酸也存在變異。10個(gè)毒株有6~8個(gè)潛在的糖基化位點(diǎn),10株分離株構(gòu)成HA唾液酸受體結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸在191位非常保守,為N(天冬酰胺),與經(jīng)典的禽流感國內(nèi)分離株一致。10株分離株中有3株在198位上變異為A (丙氨酸),6株變異為T(蘇氨酸),1株變異為M(甲硫氨酸)三種形式。另外有9株病毒在313位氨基酸處出現(xiàn)了一個(gè)新的潛在的糖基化位點(diǎn)。新增糖基化位點(diǎn)的出現(xiàn)可能改變病毒的抗原性并影響受體結(jié)合特性而感染新的宿主。

        Sun等[9]對2003~2008年6年間中國北方不同地區(qū)的22株禽源和豬源H9N2毒株分析后也發(fā)現(xiàn),同一時(shí)期不同地區(qū)病毒株之間同源性較高,但較早期病毒均有不同程度的變異和進(jìn)化。楊婧等[10]對2005年以后的H9N2HA和NA基因同源性關(guān)系研究發(fā)現(xiàn),H9N2HA和NA基因的變異情況與地域無相關(guān)性,與時(shí)間呈一定的相關(guān)性。由此表明,H9N2發(fā)生變異與時(shí)間呈現(xiàn)一定的相關(guān)性,與地域無關(guān)。本研究中,從進(jìn)化樹分析可知,10株H9N2分離毒HA基因呈現(xiàn)出與分離時(shí)間相近的同源性關(guān)系。

        H9N2禽流感病毒在亞洲普遍存在,由于較低的致病性,對人類健康產(chǎn)生的威脅也較低,致使公眾的警惕性不高[11]。Butt等[12]發(fā)現(xiàn)2003年香港感染人類的H9N2禽流感毒株A/Human/Hong Kong/2108/03其HA蛋白的226位即為亮氨酸(L),而從家禽體內(nèi)分離到的H9N2禽流感毒株A/Gf/Hong Kong/nt184/03其HA蛋白的226位則為谷氨酸(Q)。本研究中,10株H9N2禽流感病毒的226位氨基酸,均為亮氨酸(L),呈現(xiàn)出典型的人流感受體結(jié)合特性。由此表明2016年山東地區(qū)H9N2具有對哺乳動物的感染性有增高的趨勢,易感染人類,有一定的公共衛(wèi)生危害,因此需要提高對其的重視度。另外還需提防H9N2與其他流感病毒的重組或者抗原漂移現(xiàn)象,以防制造出新流感病毒的風(fēng)險(xiǎn)。已有研究報(bào)道證實(shí)感染人的H5N2、H10N8、H7N9的6個(gè)內(nèi)部基因均來自H9N2亞型禽流感病毒[13]。綜上所述,應(yīng)該加強(qiáng)重視低致病性的H9N2亞型禽流感病毒,防止其打破原有的種間屏障直接傳播給人類和低等哺乳動物,以進(jìn)一步降低其公共危害。

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