張曉興,王家建
宮頸癌是最常見(jiàn)的婦科惡性腫瘤之一,其發(fā)病率僅次于乳腺癌,病死率占總癌癥死亡率的第四位,嚴(yán)重危害婦女的身心健康[1]。人乳頭瘤病毒感染被認(rèn)為是引起宮頸癌的主要原因之一[2]。近年來(lái)研究者們熱衷于研究基因多態(tài)性與宮頸癌易感性的研究[3],以期從基因?qū)用娼忉寣m頸癌的發(fā)病機(jī)制。基質(zhì)金屬蛋白酶組織抑制劑(TIMP-2)是基質(zhì)金屬蛋白(MMP)的天然特異性抑制因子,它能夠與相應(yīng)的基質(zhì)金屬蛋白酶結(jié)合來(lái)共同維持基質(zhì)內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定與結(jié)構(gòu)完整性[4],TIMP-2是機(jī)體內(nèi)主要的內(nèi)源性抑制劑。本研究采用病例-對(duì)照的研究方法,通過(guò)Mass ARRAY基因分型的方法檢測(cè) TIMP-2基因上的多態(tài)性位點(diǎn),通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)相關(guān)方法分析其位點(diǎn)多態(tài)性與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系,現(xiàn)報(bào)道如下。
1.1 一般資料 選擇2012年6月至2016年8月浙江省湖州市婦幼保健院婦產(chǎn)科收治的宮頸癌患者280例為病例組,入選條件:(1)所有患者均經(jīng)臨床診斷確診為宮頸癌患者;(2)未經(jīng)過(guò)放射治療和化學(xué)治療;(3)精神狀況良好;(4)研究對(duì)象之間無(wú)直接親屬關(guān)系。對(duì)照組為年齡、性別及種族匹配的同時(shí)期在本院檢驗(yàn)科進(jìn)行體檢的300例健康人群,入選條件:(1)既往無(wú)腫瘤病史、慢性疾病、嚴(yán)重代謝性疾病及內(nèi)分泌失調(diào)等;(2)精神狀況良好;(3)研究對(duì)象之間無(wú)直接親屬關(guān)系。本研究已獲得所有研究對(duì)象的知情同意,符合倫理學(xué)的各項(xiàng)規(guī)定。
1.2 試劑與儀器 全血基因組純化試劑盒(美國(guó)Thermo Fisher公司),iPLEX Gold試劑盒(美國(guó)Sequenom公司);MassARRAY質(zhì)譜儀(美國(guó)Sequenom公司),GeneAmp9700 PCR儀(美國(guó)ABI公司)。
1.3 血樣采集及DNA提取 采集每位研究對(duì)象外周靜脈血5ml,置于EDTA抗凝管中,現(xiàn)場(chǎng)編號(hào)并登記姓名,所有標(biāo)本采集當(dāng)天送回實(shí)驗(yàn)室,置于―70℃冰箱保存,以備DNA提取。采用全血DNA純化試劑盒進(jìn)行DNA提取,操作步驟嚴(yán)格按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。
1.4 基因分型 從NCBI和HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)中查詢TIMP-2基因的多態(tài)性位點(diǎn),選擇在CHB人群最小等位基因頻率≥5%的位點(diǎn),最終確定了TIMP-2基因上的TIMP-2-418G/C和TIMP-2+853G/Al兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)作為本研究中的研究位點(diǎn)。選擇單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),采用Sequenom MassARRAY SNP基因分型技術(shù)對(duì)其進(jìn)行分型。單堿基延伸引物委托上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)公司進(jìn)行設(shè)計(jì)和合成。反應(yīng)在MassArray質(zhì)譜儀中進(jìn)行,基因分型使用Sequenom MassARRAY RS1000軟件進(jìn)行。
1.5 統(tǒng)計(jì)方法 應(yīng)用 SPSS 21.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用精確檢驗(yàn)對(duì)對(duì)照組進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡(HWE)檢驗(yàn),評(píng)估對(duì)照組的可靠性。計(jì)算各位點(diǎn)的等位基因及基因型頻數(shù),采用2檢驗(yàn)比較兩組間各位點(diǎn)的等位基因頻率分布差異是否有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,初步確定檢測(cè)的位點(diǎn)是否與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。應(yīng)用 SNP Stats在線軟件(http://bioinfo.iconcologia.net/snpstats/start.htm)測(cè)定各個(gè) SNP位點(diǎn)基因型與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)。以相對(duì)優(yōu)勢(shì)比()和95%可信區(qū)間()來(lái)評(píng)估SNP與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)結(jié)果TIMP-2-418G/C和TIMP-2+853G/A多態(tài)性位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率分布如表1和表2所示。經(jīng)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)病例組和對(duì)照組人群的基因型頻率分布均符合該定律(>0.05),說(shuō)明選擇的樣本具有代表性。
2.2 TIMP-2基因多態(tài)性位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率分布 TIMP-2-418G/C多態(tài)性位點(diǎn)的等位基因頻率分布在病例組和對(duì)照組差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(>0.05),而基因型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=12.028=0.002);TIMP2+853A/G 位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率分布在病例組和對(duì)照組差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均<0.01),且病例組等位基因G頻率分布明顯高于對(duì)照組。見(jiàn)表1~2。
2.3 TIMP-2基因多態(tài)性與宮頸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)分析 在等位基因模型下,TIMP-2-418G/C多態(tài)性與宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)均不存在相關(guān)性(均>0.05);等位基因模型下,TIMP-2+853G/A多態(tài)性位點(diǎn)的G等位基因與宮頸癌存在相關(guān)性(<0.05),C等位基因與宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)不存在相關(guān)性(> 0.05)。見(jiàn)表3。
2.4 TIMP-2基因多態(tài)性位點(diǎn)在不同遺傳模型下與宮頸癌的相關(guān)性分析 通過(guò)無(wú)條件邏輯回歸模型,引入三種遺傳模型(顯性、隱性和加性),分別計(jì)算各位點(diǎn)等位基因的和95%,衡量各位點(diǎn)風(fēng)險(xiǎn)等位基因?qū)m頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)的效應(yīng)大小,并按照性別、年齡修正。結(jié)果顯示在顯性模型下,TIMP-2+853G/A多態(tài)性位點(diǎn)的最小等位基因G與增加宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)具有相關(guān)性(=0.045);TIMP-2-418G/C多態(tài)性位點(diǎn)在三種遺傳模型下都與宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)(>0.05)。見(jiàn)表4。
表1 TIMP-2基因-418位點(diǎn)基因型頻率及等位基因頻率分布 例(%)
表2 TIMP-2基因+853位點(diǎn)基因型頻率及等位基因頻率分布 例(%)
表3 TIMP-2基因多態(tài)性與宮頸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián) 例(%)
本研究通過(guò)病例-對(duì)照的研究設(shè)計(jì),利用Mass ARRAY技術(shù)檢測(cè)TIMP-2基因的TIMP-2-418G/C與TIMP-2+853G/A多態(tài)性位點(diǎn),并分析該基因的多態(tài)性位點(diǎn)與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。結(jié)果顯示:TIMP2+853A/G多態(tài)性位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率分布在病例組和對(duì)照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,病例組等位基因G頻率分布明顯高于對(duì)照組,顯著增加宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(=0.045)。通過(guò)各位點(diǎn)的基因型頻率比較發(fā)現(xiàn)TIMP-2+853G/A多態(tài)性位點(diǎn)的G/G基因型頻率在病例和對(duì)照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,能顯著增加宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(=0.035)。此外,研究中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)TIMP-2-418G/C多態(tài)性位點(diǎn)與宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性(> 0.05)。
TIMPs(TIMP-1、TIMP-2、TIMP-3 和 TIMP-4)是MMPs主要的天然內(nèi)源性抑制劑,TIMP-2可以抑制任意一種MMPs特異性結(jié)合,是一種相對(duì)分子量為21kd的非糖基化蛋白,含有192個(gè)氨基酸[5]。近年來(lái),許多關(guān)于基因調(diào)控的實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)了MMPs與TIMPs比例失衡在腫瘤發(fā)生發(fā)展中所起重要作用[6]。有研究表明 TIMP2分子在宮頸癌組織中的表達(dá)與組織分化程度和淋巴轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[7-8]。本研究結(jié)果顯示TIMP2+853A/G多態(tài)性位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率在病例組和對(duì)照組的分布具有顯著性差異,能顯著增加宮頸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(=2.35,95%1.24~ 3.15=0.035)。
綜上所述,本研究結(jié)果表明TIMP-2基因多態(tài)性與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)之間存在相關(guān)性,表明TIMP-2基因多態(tài)性在宮頸癌的發(fā)生、發(fā)展中可能起著重要的作用。雖然本研究發(fā)現(xiàn)了TIMP-2基因上與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的多態(tài)性位點(diǎn),但本研究樣本量相對(duì)較少。因此,在后續(xù)的研究中我們?nèi)匀恍枰M(jìn)一步在大量人群中去驗(yàn)證這些多態(tài)性位點(diǎn)及其與宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性;而且沒(méi)有進(jìn)行候選SNP位點(diǎn)的功能學(xué)研究,所以在后續(xù)的研究中還需用功能實(shí)驗(yàn)證候選基因與宮頸癌的相關(guān)性;最后,也需要在不同的人群中去驗(yàn)證這些多態(tài)性位點(diǎn),以期為宮頸癌的臨床診斷及治療提供依據(jù)。
表4 各個(gè)遺傳模型下候選SNP對(duì)宮頸癌患病的風(fēng)險(xiǎn)系數(shù)
現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué)2018年7期