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        藏族高原適應(yīng)性相關(guān)研究及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用展望

        2018-02-21 19:38:45黃美莎唐光峰李彩霞
        刑事技術(shù) 2018年6期
        關(guān)鍵詞:藏族人法醫(yī)學(xué)藏族

        黃美莎 ,江 麗 ,劉 京 ,唐光峰 ,許 杰 ,王 玲 ,趙 慧 ,李彩霞 ,,*

        (1. 山西醫(yī)科大學(xué),太原 030001;2. 公安部物證鑒定中心,北京市現(xiàn)場物證檢驗(yàn)工程技術(shù)研究中心,法醫(yī)遺傳學(xué)公安部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,現(xiàn)場物證溯源技術(shù)國家工程實(shí)驗(yàn)室,北京 100038;3. 山東省泰安市公安局,山東泰安 271000)

        伴隨不同國家或區(qū)域間的人員流動(dòng)顯著增加,涉外反恐、跨區(qū)域流動(dòng)作案等復(fù)雜案件逐年增多。如果能夠通過現(xiàn)場遺留DNA的分析獲取人員身份、種族和地域來源等信息,將能對案件定性、偵辦等提供重要的科學(xué)線索,至少也可縮小偵察范圍,便于現(xiàn)場勘查、警情處理和人員調(diào)動(dòng)等工作的開展。

        單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是基因組中單個(gè)堿基變異形成的一種多態(tài)性,廣泛分布在基因組的編碼區(qū)和非編碼區(qū),蘊(yùn)含大量與人的表型特征等相關(guān)的信息,可用于群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、疾病關(guān)聯(lián)研究等。在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,SNPs是常用的一種祖先信息位點(diǎn)(ancestry informative markers,AIMs),可用于DNA供者的族群地域推斷[1],目前國內(nèi)外報(bào)道了大量的AIMs組合用于區(qū)分歐、東亞、非洲等洲際大跨度人群及混合人群[2-4],但是,對于東亞地區(qū)尤其是我國亞人群的族群推斷體系罕有報(bào)道。藏族是典型的高原人群,其全基因組關(guān)聯(lián)分析研究發(fā)現(xiàn)EPAS1、EGLN1、PPARA等基因與藏族人群的高原適應(yīng)性有關(guān),這些基因上有大量的SNP位點(diǎn),在高原和平原人群之間存在頻率差異[5-17],藏族人群高原適應(yīng)性遺傳機(jī)理的研究對于其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用具有重要的基礎(chǔ)作用。

        1 藏族人群高原適應(yīng)性相關(guān)研究

        1.1 高原適應(yīng)性相關(guān)生理機(jī)能變化

        藏族人群約在兩萬年前就定居于青藏高原(海拔3000~5000 m),是典型的高原人群。我國境內(nèi)藏族人口約680萬,主要分布在西藏自治區(qū)、四川、云南以及青海、甘肅等地。另外,尼泊爾、巴基斯坦、印度、不丹等國境內(nèi)也分布著藏族人群。藏語屬于漢藏語系藏緬語族藏語支。平原人初入高海拔地區(qū)(海拔大于等于3000 m)會(huì)出現(xiàn)高原反應(yīng),表現(xiàn)為頭痛、睡眠障礙、惡心、嘔吐、胸悶、氣短、心悸等。相反,即便是久居低海拔地區(qū)的藏族人到海拔3700 m時(shí)心率也無明顯變化[18]。低海拔地區(qū)的人群進(jìn)駐高原后,機(jī)體通過血紅蛋白濃度代償性增高來適應(yīng)低氧環(huán)境,血紅蛋白的過度增高會(huì)導(dǎo)致血液粘稠,進(jìn)而易患慢性高原病(chronic mountain sickness, CMS)。藏族人群世居于高海拔地區(qū),與進(jìn)駐高原的平原人相比具有較高的血氧飽和度、較高的靜息肺通氣量、缺氧時(shí)較弱的肺血管收縮反應(yīng)以及低水平的血紅蛋白濃度[19-21],這一系列改變有效地保證了高原人群的正常生活。與同樣居住高海拔地區(qū)的安第斯山人相比,兩者具有不同的適應(yīng)機(jī)制,相關(guān)研究表明,同一海拔情況下藏族人的靜息肺通氣量比安第斯山人高一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差,但是藏族人的血紅蛋白濃度比安第斯山人低一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差。西藏、青海、四川、云南以及印度藏族的ABO血型分布也具有差異性[22]。這些都反映了高原適應(yīng)具有明顯的地域差異,也表明了青藏高原地區(qū)藏族的獨(dú)特性。

        1.2 高原適應(yīng)性相關(guān)基因研究

        藏族人在高原適應(yīng)方面具有遺傳學(xué)基礎(chǔ)[6-8,10,16]。缺氧誘導(dǎo)因子通路(hypoxia-inducible factor (HIF)pathway)是機(jī)體調(diào)控氧平衡的主要信號通路,也是藏族高原適應(yīng)的關(guān)鍵信號通路。在藏族人群中,HIF通路通過對血紅蛋白、血管形成及舒縮等血液相關(guān)基因的調(diào)控,提高了血紅蛋白的攜氧能力;通過對能量代謝相關(guān)基因(糖酵解酶類、乳酸脫氫酶A、單羧基轉(zhuǎn)運(yùn)體4等)的下調(diào),降低了機(jī)體新陳代謝水平,減少氧與能量的消耗;通過對免疫相關(guān)基因調(diào)節(jié),防止炎癥反應(yīng),使細(xì)胞避免損傷[23]。全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),在HIF通路上發(fā)現(xiàn)大量候選基因在高原和平原人之間存在差異,例如:EGLN1、EPAS1、PPARA、HMOX2、HBG、HBG2、PKLR 等[14,17],其中,EGLN1和EPAS1兩個(gè)基因位于HIF通路的上游,對于藏族人的高原適應(yīng)作用比較顯著[5]。EPAS1(Endothelial PAS Domain Protein 1)定位于人染色體2p16-21上,序列長度約為90kb,直接調(diào)控EPO(紅細(xì)胞生成素)的表達(dá),在低氧環(huán)境下能夠促進(jìn)EPO的合成進(jìn)而提高血紅蛋白濃度,基因突變后對缺氧引起血紅蛋白升高反應(yīng)遲鈍。有學(xué)者研究認(rèn)為受到自然選擇的EPAS1基因可能來源于一種原本生活在歐亞大陸西伯利亞地區(qū)的古老人群丹尼索瓦人的基因滲入,藏族人群90%以上攜帶有此序列的基因,漢族人群中這一基因的比例較小[9]。EGLN1(egl nine homolog 1)是一種雙加氧酶的氧感受器,對EPAS1具有負(fù)向調(diào)控作用,基因突變后提高EGLN1酶的活性,從而促進(jìn)EPAS1的降解,在低氧環(huán)境下EPO的表達(dá)減少[10]。藏族人因?yàn)镋GLN1、EPAS1等基因上存在大量的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),對低氧誘導(dǎo)的反應(yīng)相對遲鈍,血紅蛋白濃度即使在高海拔情況下依然保持相對穩(wěn)定的水平,進(jìn)而與平原漢族相比不易患高原病[15]。Laura等[24-25]對西藏的藏族人群和安第斯山人群的高原適應(yīng)機(jī)制進(jìn)行了比較分析,西藏藏族人群高原適應(yīng)性相關(guān)基因主要為EPAS1和EGLN1,而安第斯山人群與高原適應(yīng)最相關(guān)的基因?yàn)镻RKAA1和NOS2A,研究表明西藏藏族人群和安第斯山人群高原適應(yīng)候選基因存在差異。

        1.3 高原適應(yīng)相關(guān)SNP研究

        全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)了大量藏族人群與平原人群之間存在有顯著差異的SNP位點(diǎn)。Huerta-Sanchez等[9]通過對各40個(gè)藏、漢族個(gè)體的EPAS1基因重測序發(fā)現(xiàn)了一種獨(dú)特的單倍型,這種單倍型由5個(gè)SNPs位點(diǎn)形成,即rs115321619、rs73926263、rs73926264、rs73926265、rs55981512,此單倍型(AGG AA)只存在于藏族人和丹尼索瓦人中,而在40個(gè)漢族個(gè)體中均未檢出;EPAS1上的rs1562453在西藏藏族、青海藏族與漢族間等位基因頻率具有顯著差異,但是在云南藏族和漢族間等位基因頻率差異不顯著,這進(jìn)一步說明了同屬高海拔的藏族也存在地域的差異性,說明高原環(huán)境對世居人群EPAS1基因有選擇作用[26];此外,EPAS1上的rs13419896、rs4953354和1868092在藏族與非藏族人群間具有顯著差異[13]。Xiang等[10]通過EGLN1基因重測序技術(shù)共檢測到185個(gè)差異位點(diǎn),其中rs18699510(D4E)是一種非同義突變,其在藏族與平原人群間顯示出非常大的分布差異,在藏族和漢族人之間的FST值達(dá)到0.709,藏族人中的平均檢出率為70.9%,而在漢族、日本、歐洲和非洲等平原人群中非常稀少,檢出率僅為0.56%~2.27%,是典型的自然選擇差異位點(diǎn),具有類似特點(diǎn)的SNP位點(diǎn)還有rs12097901。通過單倍型網(wǎng)絡(luò)分析,在EPAS1和EGLN1基因上還發(fā)現(xiàn)了大量與平原人群有差異的單倍型[10]。再者,EPAS1和EGLN1上存在有與急性高山?。╝cute mountain sickness, AMS) 相 關(guān) 的 SNPs位 點(diǎn)。EPAS1上 的rs4953348位點(diǎn)多態(tài)性與AMS發(fā)病易感性相關(guān),GG(鳥苷酸純合子)基因型頻率在病例組中遠(yuǎn)高于其對照組值(53.8%vs38.4%),并且藏族人群中的腺苷酸A等位基因占主導(dǎo)[27],平原漢族人群攜帶GG基因型則患AMS的風(fēng)險(xiǎn)大[28]。EGLN1上的rs480902的TT(胸腺嘧啶核苷酸純合子)基因型在AMS患者中頻率高于高原藏族人群[29],以上研究說明平原漢族中AMS易感人群攜帶的SNP位點(diǎn)基因型頻率要高于藏族人群。

        2 法醫(yī)學(xué)應(yīng)用展望

        用一組群體間基因頻率差異顯著的DNA多態(tài)性位點(diǎn)可以進(jìn)行人群遺傳結(jié)構(gòu)的區(qū)分[1]。法醫(yī)學(xué)群體來源推斷相關(guān)研究[2-4]的一般策略如下:首先,使用高通量SNP檢測技術(shù)對人群間頻率差異顯著的SNPs位點(diǎn)進(jìn)行大量選擇,例如全基因組芯片技術(shù)和新一代測序技術(shù)等,或者通過文獻(xiàn)報(bào)道獲得差異性位點(diǎn)。然后,對差異性位點(diǎn)進(jìn)行群體間遺傳多態(tài)性及遺傳結(jié)構(gòu)比較分析。最終,進(jìn)行種族推斷復(fù)合檢測體系的構(gòu)建。本項(xiàng)目組此前就構(gòu)建了27重SNP復(fù)合檢測體系,用于歐洲、非洲、亞洲人群的遺傳結(jié)構(gòu)分析和個(gè)體的種族推斷[2]。

        上述相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)了高原適應(yīng)基因中存在藏族與其他人群間頻率差異顯著的SNPs位點(diǎn),這些位點(diǎn)是依據(jù)群體來源推斷策略進(jìn)行法醫(yī)學(xué)DNA群體信息特征刻畫研究的理論前提。目前,法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域已有研究報(bào)道,對高原適應(yīng)基因的人群差異性SNPs位點(diǎn)進(jìn)行復(fù)合體系構(gòu)建和多態(tài)性評估。例如,楊鑫等[30]基于EPAS1和EGLN1中的10個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs12907901、rs13419896、rs150877473、rs1562453、rs1 86996510、rs2491406、rs2491407、rs4953360、rs4953361、rs758962),利用SNaPshot 多重分析試劑盒獲得了518名甘肅、青海無關(guān)藏族個(gè)體和134名平原漢族無關(guān)個(gè)體的等位基因分型。基于基因頻率分析發(fā)現(xiàn),藏漢人群在4個(gè)SNPs位點(diǎn)上存在顯著差異(rs150877473、rs1562453、rs186996510、rs7589 621),此研究采用SNaPshot技術(shù)[31]基于PCR-CE平臺進(jìn)行復(fù)合體系構(gòu)建。我國公安系統(tǒng)大部分物證鑒定實(shí)驗(yàn)室配備有3130、3500等毛細(xì)管電泳儀,而SNaPshot技術(shù)操作簡單,可快速掌握,故易于普及和推廣??傊?,將藏族特異性SNPs位點(diǎn)用于法醫(yī)學(xué)種族推斷研究無論在理論還是技術(shù)上均具有可行性。

        3 結(jié)論

        綜上所述,生活在高原地區(qū)的藏族以其獨(dú)特的生理機(jī)能變化適應(yīng)了高原低氧環(huán)境,由于自然選擇等因素,在EPAS1、EGLN1等基因上存在有大量為高原人群所特有的差異位點(diǎn)。據(jù)此,通過高通量的SNP檢測技術(shù)篩選出高原與平原人群間差異顯著的這些高信息量位點(diǎn),進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、未知個(gè)體種族推斷等法醫(yī)學(xué)研究,具可行性。

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