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        北京地區(qū)萵苣中番茄斑萎病毒的鑒定

        2018-01-11 03:39:17陳東亮李明遠(yuǎn)李雪梅王玲玲4黃叢林
        中國蔬菜 2018年1期
        關(guān)鍵詞:西花萵苣進(jìn)化樹

        陳東亮李明遠(yuǎn)李雪梅王玲玲,4黃叢林*

        (1北京市農(nóng)林科學(xué)院,北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心,北京 100097;2北京市功能花卉工程技術(shù)研究中心,北京 100097;3農(nóng)業(yè)基因資源與生物技術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100097;4西藏農(nóng)牧學(xué)院,西藏林芝860000)

        萵苣(Lactuca sativaL.)是一種世界性的蔬菜,也是我國最常見的蔬菜種類之一,在我國南北各地廣泛栽植,是一種非常重要的經(jīng)濟(jì)作物。病毒病是萵苣生產(chǎn)過程中常見的病害,由于其發(fā)病快、防治難,往往造成巨大損失。目前已知有十余種植物病毒可以為害萵苣(Moreno & Fereres,2012;Ciuffo et al.,2016),其中番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)由于傳播范圍廣、防治困難而日益成為萵苣生產(chǎn)中危害嚴(yán)重的病害之一。

        TSWV為布尼亞病毒科(Bunyaviridae)番茄斑萎病毒屬(Tospovirus),已知至少可以感染84個科的1 090種植物,是目前已知的寄主范圍最廣的植物病毒之一(Parrella et al.,2003)。TSWV危害巨大,對一些農(nóng)作物甚至?xí)斐蓺缧缘膿p失,是辣椒(Capsicum annuum)、番茄(Lycopersicon esculentum)、 煙 草(Nicotiana tabacum)、 菊 花(Chrysanthemum morifolium)等經(jīng)濟(jì)作物重點(diǎn)防疫的病害。自1915年在澳大利亞發(fā)現(xiàn)至今,TSWV已傳播到了全球大部分國家,成為一種全球性的植物病害。

        1986年,首次在我國境內(nèi)發(fā)現(xiàn)TSWV(許澤永 等,1986),隨后的十幾年其傳播范圍主要集中于云南、四川及廣東部分地區(qū)(蘇大昆 等,1987;許澤永 等,1989;姚革,1992),并未發(fā)展為全國性的病害。與此同時,我國也將TSWV列入了《進(jìn)境植物檢疫性有害生物名錄》,加強(qiáng)了入境植物該病毒的檢疫防疫工作,有效防止了TSWV進(jìn)一步的擴(kuò)散。但近幾年,伴隨國外引種和國內(nèi)資源的流通,TSWV擴(kuò)散速度加快,天津、北京、山東、海南等地均報(bào)道發(fā)現(xiàn)TSWV(李飛 等,2012;邱樹亮 等,2012;高葦 等,2016;車海彥 等,2017;李潔 等,2017)。

        2017年3月,筆者在北京市順義區(qū)發(fā)現(xiàn)溫室內(nèi)栽培的萵苣疑似發(fā)生了嚴(yán)重的病毒病。經(jīng)RT-PCR檢測、序列測定與生物信息學(xué)分析,證實(shí)其病原物為TSWV。進(jìn)一步基于TSWV核殼體(nucleocapsid protein,NP)基因序列構(gòu)建了國內(nèi)外不同地區(qū)TSWV的系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析了不同國家、不同地區(qū)間TSWV的進(jìn)化關(guān)系,為進(jìn)一步研究TSWV傳播機(jī)制、制定防控措施奠定了基礎(chǔ)。

        表1 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹使用的TSWV NP基因序列信息

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集及薊馬的檢測

        2017年4月,于北京市順義區(qū)北郎中村種植萵苣的溫室內(nèi)采集具有葉片黃化褪綠、枯死、矮化等癥狀的萵苣葉片,用干凈的保鮮袋包裹后放置于冰盒中,帶回北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心實(shí)驗(yàn)室,于-80 ℃保存?zhèn)溆?。同時,收集病害溫室?guī)в兴E馬的萵苣葉片,裝入保鮮袋后帶回實(shí)驗(yàn)室,于顯微鏡下觀察薊馬蟲體特征。

        1.2 TSWV特異序列的克隆

        病樣總RNA的提取使用全式金RNA提取試劑盒。采用Promega反轉(zhuǎn)錄試劑盒制備樣品cDNA。利用Primer STAR高保真酶(Takara)進(jìn)行TSWVNP基因特異序列的擴(kuò)增,引物設(shè)計(jì)和RT-PCR反應(yīng)程序參考Chung等(2006)的方法。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,純化回收并連接于克隆載體pGEM-T easy(Promega,USA),熱激轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α后,挑取陽性克隆送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。

        1.3 序列分析與進(jìn)化樹的構(gòu)建

        利用DNASTAR軟件進(jìn)行序列的拼接和初步處理。利用MEGA 4軟件,采用鄰接法(neighbour joining)構(gòu)建不同來源TSWVNP基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹。系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建使用的其他TSWVNP序列均下載自美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI) 數(shù) 據(jù) 庫, 序列GenBank登錄號、發(fā)生地區(qū)、寄主等信息如表1所示。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 病害調(diào)查

        感病萵苣主要表現(xiàn)為:葉片斑駁褪綠,植株矮化,生長緩慢,部分肉質(zhì)莖部有明顯條狀黑斑,嚴(yán)重時整株死亡(圖1)。這與最近云南地區(qū)報(bào)道的TSWV引起的萵苣類蔬菜病害特征類似(鄭寬瑜等,2015)。經(jīng)初步統(tǒng)計(jì),溫室內(nèi)具有明顯褪綠發(fā)黃、矮化等病癥的萵苣植株達(dá)到25%以上。與此同時,溫室內(nèi)伴有薊馬的大量發(fā)生,經(jīng)顯微鏡下觀察鑒定為西花薊馬(Frankliniella occidentalis)(圖2)。西花薊馬為入侵物種,近幾年在國內(nèi)多地大面積暴發(fā),造成嚴(yán)重?fù)p失,同時西花薊馬還是TSWV最主要的傳播介質(zhì)?;诓『μ卣骱臀骰ㄋE馬的發(fā)生,初步推測此次發(fā)現(xiàn)的萵苣病害是由TSWV引起的病毒病。

        圖1 感病萵苣病害癥狀

        圖2 萵苣上發(fā)現(xiàn)的西花薊馬

        2.2 RT-PCR檢測

        利用TSWV特異引物,對發(fā)病溫室采集的7個表型明顯的萵苣樣本進(jìn)行RT-PCR檢測。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(圖3),7個樣本均在預(yù)期位置出現(xiàn)了清晰的條帶;以無菌水為模板的陰性對照未出現(xiàn)該條帶,表明這7個樣品均受到TSWV的侵染。

        圖3 TSWV的RT-PCR檢測結(jié)果

        PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)回收純化,連接到克隆載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后,每個樣本取3個克隆進(jìn)行測序。共得到2條大小為777 bp的高度保守序列(BLZ01和BLZ02),2條序列間存在2個堿基的差異。NCBI BLASTN分析顯示,這2條序列與已報(bào)道的TSWVNP基因序列高度相似,一致性高達(dá)98%~99%,其中與西班牙分離的TSWVNP基因(GenBank登錄號:FR693152)一致性最高,僅相差2~4個堿基。將這2個基因序列在NCBI進(jìn)行登錄,登錄號分別為MF139144和MF139145。RTPCR檢測和測序結(jié)果進(jìn)一步證明了本次發(fā)現(xiàn)的萵苣病害的病原為TSWV。

        2.3 不同來源TSWV的遺傳多樣性分析

        基于NP基因序列,構(gòu)建本試驗(yàn)分離的萵苣TSWV與國內(nèi)外其他地區(qū)已知TSWV的系統(tǒng)進(jìn)化樹。由圖4可知,國內(nèi)已報(bào)道的其他地區(qū)分離的TSWV明顯聚集在一起,并進(jìn)一步與日本、韓國的部分TSWV株系聚合在一起,表明中國早期TSWV可能由日本、韓國等地傳入,之后在云南、重慶等地逐漸擴(kuò)散。本試驗(yàn)中分離鑒定的萵苣TSWV與國內(nèi)已報(bào)道株系差異較大,而與西班牙等國外株系聚合較緊密,表明本次發(fā)現(xiàn)的萵苣TSWV并非由云南、重慶等國內(nèi)地區(qū)傳入,很有可能是由國外直接傳入北京的。

        圖4 基于NP基因序列的TSWV系統(tǒng)進(jìn)化樹

        3 結(jié)論與討論

        TSWV寄主范圍廣泛,甚至能侵染一些常見的田間雜草,從而使得病源清除困難、傳播速度快、防治困難。自1915年首次發(fā)現(xiàn),TSWV已擴(kuò)散到了全球大部分國家和地區(qū),是名副其實(shí)的全球性植物病害,被列為世界十大植物病害之一。TSWV主要通過薊馬傳播,薊馬生活周期短、繁殖速度快、寄主范圍廣、適宜性強(qiáng)、極易形成抗藥性,防治難度較大。其中,西花薊馬是TSWV最高效的傳播媒介。西花薊馬在我國也屬于國外入侵的有害生物,同時也是我國入境檢疫的有害生物,國內(nèi)最早關(guān)于西花薊馬的報(bào)道見諸于2003年(張友軍 等,2003)。近幾年,西花薊馬在我國大面積暴發(fā),已成為部分地區(qū)常見的蟲害(張友軍 等,2011)。西花薊馬的擴(kuò)散也加速了TSWV的傳播,本試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)TSWV的溫室及其周邊長期存在薊馬為害,經(jīng)顯微鏡下觀察確定為入侵物種西花薊馬,西花薊馬可能是本次TSWV暴發(fā)的主要媒介。

        病毒病一旦感染極難防治。為了及時發(fā)現(xiàn)、盡早防治,研究人員開發(fā)了多種針對TSWV快速檢測的方法,比如酶聯(lián)免疫法(Sherwood et al.,1989)、電鏡檢測法(張仲凱 等,2004)、LAMP 法(Wu et al.,2016)、RT-PCR 法(Pappu et al.,1996)等。其中,RT-PCR法由于操作簡便、靈敏度高、特異性強(qiáng)、檢測速度快、成本低等特點(diǎn)而被廣泛應(yīng)用于植物病毒的快速檢測。本試驗(yàn)結(jié)合病癥特征和RTPCR檢測,確診了是由TSWV引起的北京順義萵苣病害。同時,基于TSWV NP基因序列,對國內(nèi)外TSWV的遺傳多樣性進(jìn)行分析,從系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出,發(fā)生在我國云南、廣州等地的TSWV親緣關(guān)系都比較近,且與韓國、日本等國的部分株系表現(xiàn)出較近的關(guān)系,表明我國南方、西南地區(qū)的TSWV可能最早是由韓國、日本等地傳入的。這與20世紀(jì)80年代、90年代昆明、廣州等地大力發(fā)展花卉種植產(chǎn)業(yè),自日本、韓國引進(jìn)優(yōu)良花卉品種的歷史背景相符合。本試驗(yàn)中分離的TSWV與我國已知的TSWV親緣關(guān)系較遠(yuǎn),而與西班牙等國外報(bào)道的株系在進(jìn)化關(guān)系上較為接近,表明本次發(fā)現(xiàn)的TSWV極可能是在引種過程中直接從國外帶入的新病毒株系。近幾年,國內(nèi)外品種交流愈加頻繁,也增大了有害生物隨之帶入的風(fēng)險(xiǎn)。本試驗(yàn)在北京地區(qū)首次報(bào)道TSWV為害重要經(jīng)濟(jì)作物萵苣,也為進(jìn)一步加強(qiáng)TSWV的檢疫、防疫工作敲響了警鐘。

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