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        基于R的食管癌預(yù)后獨(dú)立危險(xiǎn)因素分析和列線圖建立

        2021-09-23 10:45:35魏凌華徐成振
        電腦知識(shí)與技術(shù) 2021年24期
        關(guān)鍵詞:列線圖危險(xiǎn)因素食管癌

        魏凌華 徐成振

        摘要:目的:預(yù)測(cè)食管癌的預(yù)后獨(dú)立危險(xiǎn)因素,建立食管癌患者的列線圖。方法:在SEER數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選符合條件的食管癌患者數(shù)據(jù),調(diào)用rms包中的cph()函數(shù),獲得預(yù)后獨(dú)立危險(xiǎn)因素;根據(jù)納入的各種因素,通過(guò)調(diào)用nomogramEx包中的nomogram()函數(shù)建立食管癌患者列線圖。結(jié)果:共納入2010年至2016年期間的6847例食管癌患者,根據(jù)Cox回歸分析發(fā)現(xiàn),放療是食管癌患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。通過(guò)列線圖可以獲得食管癌患者的個(gè)體化的生存概率。結(jié)論:在R中可以簡(jiǎn)單快捷的實(shí)現(xiàn)食管癌患者的預(yù)后獨(dú)立危險(xiǎn)因素的分析和列線圖的建立,為不同食管癌患者提供合適的治療方式。

        關(guān)鍵詞:R;食管癌;預(yù)后;危險(xiǎn)因素;列線圖

        Abstract: Objective:To predict the independent risk factors for the prognosis of esophageal cancer, and to establish the nomogram of patients with esophageal cancer.Methods:The data of patients with esophageal cancer were screened in SEER database, and the independent prognostic risk factors were obtained by calling the cph() function in RMS package; according to the included factors, nomograms of patients with esophageal cancer were established by calling the nomograms() function in nomogramex package.Results:A total of 6847 patients with esophageal cancer from 2010 to 2016 were included. According to Cox regression analysis, radiotherapy was an independent risk factor for the prognosis of patients with esophageal cancer. The individual survival probability of patients with esophageal cancer can be obtained by nomogram.Conclusion:In R, we can analyze the independent prognostic risk factors and establish nomogram of patients with esophageal cancer, and provide appropriate treatment for different patients with esophageal cancer.

        Key words: R; esophageal cancer; prognosis; risk factors; nomogram

        食管癌是一種預(yù)后較差的惡性腫瘤,在全球范圍內(nèi),食管癌的發(fā)病率位于惡性腫瘤的第六位,死亡率位于惡性腫瘤第八位[1]。雖然在過(guò)去的40年內(nèi)食管癌的5年期生存率從5%提到了19%[2],但食管癌的整體預(yù)后仍然較差,且治療后的并發(fā)癥發(fā)病率較高[3]。首先,食管癌的發(fā)病因素很多,年齡、性別、種族、飲食習(xí)慣、生活環(huán)境等均對(duì)其有影響[4]。其次,療效不是很理想,現(xiàn)有的治療方式很多,有外科手術(shù)、放療、化療、輔助治療以及以手術(shù)為主的綜合治療等方式,由于腫瘤的大小、位置以及患者自身的條件各不相同,采用的治療方式也不盡相同,治療的結(jié)果也不理想[5]。

        由美國(guó)癌癥聯(lián)合委員會(huì)與國(guó)際抗癌聯(lián)盟制定的TNM分期系統(tǒng)[[6],是目前全球應(yīng)用最廣的腫瘤分期標(biāo)準(zhǔn),目的在于了解患者所處的病程,根據(jù)病程來(lái)制定治療方案、判斷患者的預(yù)后和療效。TNM分期系統(tǒng)最新版本是由國(guó)際抗癌聯(lián)盟(UICC)和美國(guó)癌癥聯(lián)合會(huì)(AJCC)于2015年聯(lián)合發(fā)布的第8版[6],由于本研究的數(shù)據(jù)取得時(shí)間是2010至2016年,因此仍采用2009年的第7版[7],具體的TNM分期詳情見(jiàn)表1。

        1 資料與方法

        1.1 資料來(lái)源

        SEER(surveillance,epidemiology and end results;監(jiān)測(cè),流行病學(xué)和最終結(jié)果)數(shù)據(jù)庫(kù)建立于1973年,由美國(guó)國(guó)家癌癥研究所(NCI)資助[8]。用于記錄患者的人口學(xué)(種族、性別、年齡、婚姻狀態(tài))、腫瘤(病理類型、分化程度、組織學(xué)類型)、病理、治療方式(手術(shù)、放療、化療等)和預(yù)后(總體生存率、疾病特定死亡率、死亡原因)等信息。

        1.2 數(shù)據(jù)的納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

        本研究的數(shù)據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn):(1)患者年齡在18歲至80歲;(2)患者確診時(shí)間在2010年至2016年期間;(3)患者發(fā)病為食管癌且為單原發(fā)癌。

        本研究的排出標(biāo)準(zhǔn):(1)種族中變量是Unknown的;(2)性別中有Unknown的;(3)病例組織學(xué)中分級(jí)為Unknown的;(4)發(fā)病部位不是胸段的(胸段部位:C15.3-Upper third of esophagus,C15.4-Middle third of esophagus,C15.5-Lower third of esophagus);(5)手術(shù)中編號(hào)為99的;(6)生存時(shí)間為Unknown和0的;(7)婚姻狀態(tài)為Unknown的;(8)AJCC TNM分期中不是T1(T1,T1a,T1b,T1NOS)、T2、T3和T4(T4,T4a,T4b)期的;(9)區(qū)域淋巴結(jié)是NX、NA和Blank(s);(10)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移狀態(tài)為NA和Blank(s);(11)放療是None/Unknown和(Recommended, unknown if administered)的。

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