趙盼,劉真,管靜芝,袁龍,舒彬,尹斌
(1河北北方學院研究生部,河北張家口075000;2中國人民解放軍第309醫(yī)院)
miR-155靶向調(diào)控SP1、E2F2 mRNA轉(zhuǎn)錄水平的功能驗證
趙盼1,劉真2,管靜芝2,袁龍2,舒彬2,尹斌2
(1河北北方學院研究生部,河北張家口075000;2中國人民解放軍第309醫(yī)院)
目的 觀察微小RNA155(miR-155)對端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(hTERT)調(diào)控相關(guān)蛋白特異性蛋白1(SP1)及轉(zhuǎn)錄因子E2F2重組質(zhì)粒表達的影響,為進一步研究miR-155調(diào)控腫瘤細胞hTERT表達的機制提供實驗基礎。方法 采用生物信息學預測軟件TargetScan和Miranda預測SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR是否是人miR-155的作用靶點。針對SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR設計互補的兩條寡核苷酸,包括目標序列(即SP1、E2F2野生型序列)及突變序列(SP1-mu、E2F2-mu),構(gòu)建SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR報告基因載體pMIR-SP1、pMIR-E2F2、pMIR-SP1-mu和pMIR-E2F2-mu。培養(yǎng)HEK-293細胞,采用脂質(zhì)體法將SP1和E2F2的野生型和突變型pMIR-Luc質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染HEK-293細胞24 h。將細胞分為SP1空白對照組、SP1目標序列組、SP1突變序列組、E2F2空白對照組、E2F2目標序列組、E2F2突變序列組,均加入0.2 μg重組質(zhì)粒、0.01 μg對照質(zhì)粒和0.375 μL寡核苷酸,培養(yǎng)24 h。采用雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)檢測雙熒光素酶活性,以螢火蟲熒光素酶活性值(F)/海腎熒光素酶活性值(R)比值評價miR-155與SP1及E2F2 mRNA 3′-UTR結(jié)合效果。結(jié)果 在線預測結(jié)果示,SP1 mRNA 3′-UTR和E2F2 mRNA 3′-UTR均有與miR-155完全互補配對的序列,確定二者均為miR-155的靶基因。經(jīng)鑒定,SP1和E2F2報告基因重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。SP1目標序列組F/R低于SP1空白對照組及SP1突變序列組(P均<0.05),E2F2目標序列組F/R低于E2F2空白對照組及E2F2突變序列組(P均<0.05)。結(jié)論 成功構(gòu)建了SP1和E2F2報告基因重組質(zhì)粒,證實miR-155能夠靶向結(jié)合SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR,在轉(zhuǎn)錄后水平抑制SP1和E2F2的表達。
特異性蛋白1;E2F2轉(zhuǎn)錄因子;微小RNA155;熒光素酶報告基因;人端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶;質(zhì)粒
端粒位于真核生物線狀染色體末端,是維持染色體完整性與穩(wěn)定性的重要結(jié)構(gòu)。端粒酶是細胞內(nèi)具有延長端粒作用的逆轉(zhuǎn)錄酶,可保持端粒伸縮的動態(tài)平衡,彌補DNA復制過程中端粒末端的消耗[1]。端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(hTERT)是端粒酶的主要結(jié)構(gòu)之一,與端粒酶活性有關(guān)[2]。近年研究發(fā)現(xiàn),hTERT在癌組織及癌前病變組織中高表達,而在正常組織中低表達或不表達[3]。hTERT轉(zhuǎn)錄位點上游的核心啟動子中有與多種轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的位點,與不同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合后可激活或抑制hTERT表達。特異性蛋白1(SP1)和轉(zhuǎn)錄因子E2F2是與細胞周期調(diào)控有關(guān)的轉(zhuǎn)錄激活因子,能夠調(diào)控hTERT的表達[4,5]。微小RNA(miRNA)是一類廣泛存在于真核細胞中的內(nèi)源性非編碼RNA,參與基因轉(zhuǎn)錄后表達的調(diào)控,其中miRNA155(miR-155)在多種腫瘤組織中高表達,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。但miR-155是否通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子SP1、E2F2進而調(diào)控hTERT的表達,目前尚不明確。2015年3~10月,我們構(gòu)建了SP1及E2F2 mRNA的3′端非翻譯區(qū)(3′-UTR)報告質(zhì)粒并轉(zhuǎn)染人胚腎HEK-293細胞,與miR-155共培養(yǎng),觀察miR-155對SP1和E2F2重組質(zhì)粒表達的影響,為進一步研究miR-155調(diào)控腫瘤細胞hTERT表達的機制提供實驗基礎。
1.1 試劑與儀器 大腸桿菌感受態(tài)DH5α、對照質(zhì)粒pRL-TK和人胚腎HEK-293細胞由解放軍第309醫(yī)院結(jié)核病研究所孫衛(wèi)國博士惠贈。miR-155模擬物(miR-155 mimics)、miRNA對照劑(miRNA-control)(上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司);寡核苷酸片段(Invitrogen公司);限制性內(nèi)切酶SpeⅠ、Hind Ⅲ、Apa I和T4 DNA連接酶(大連Takara生物有限公司);Dual-Luciferase報告基因檢測系統(tǒng)(Promega公司);LipofectmineTM2000和Opti-MEM?Ⅰ不含血清的優(yōu)化培養(yǎng)基(Promega公司);低溫連接儀(珠海黑馬醫(yī)學儀器有限公司);IMS-30全自動雪花制冰機(雪科電器有限公司);恒溫培養(yǎng)振蕩器(上海智城分析儀器制造有限公司);瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(美國Omega Bio-Tek公司);質(zhì)粒中量制備試劑盒(AxyGen公司);Gen5酶標儀(美國Bio-Tek公司);低溫臺式高速離心機(德國Eppendorf公司);CO2恒溫細胞培養(yǎng)箱(日本SANYO公司)。
1.2 SP1、E2F2 mRNA 3′-UTR與miR-155靶基因互補性預測 采用生物信息學預測軟件TargetScan和Miranda,預測SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR是否是人miR-155的作用靶點。以SP1、E2F2 mRNA 3′-UTR二者與miR-155的結(jié)合序列至少各存在7個互補結(jié)合位點,作為判定SP1和E2F2為人miR-155靶基因的標準。
1.3 SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR報告基因載體的構(gòu)建及鑒定 在TargetScan網(wǎng)站獲取SP1 mRNA 3′-UTR和E2F2 mRNA 3′-UTR與miR-155相結(jié)合的堿基序列,分別對SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR設計互補的兩條50~60 nt寡核苷酸,包括目標序列(即SP1、E2F2野生型序列)及突變序列(SP1-mu、E2F2-mu),分別在5′端添加SpeⅠ和HindⅢ酶切位點,以備后續(xù)連接,同時插入ApaⅠ酶切位點,作為后續(xù)鑒定的位點。序列如下(下劃線部分為SpeⅠ或HindⅢ酶切位點):SP1正義鏈為5′-CTAGTGGGCCCCATGGAAGAGAGAGCCATGAAGCATTAAAATGC-ATGGTGTTGAGAAGA-3′,SP1反義鏈為5′-AGCTTC-TTCTCAACACCATGCATTTTAATGCTTCATGGCTCT-CTCTTCCATGGGGCCCA-3′;SP1-mu正義鏈為5′-CT-AGTGGGCCCCATGGAAGAGAGAGCCATGAGTAGC-GCGAATGCATGGTGTTGAGAAGA-3′,SP1-mu反義鏈為5′-AGCTTCTTCTCAACACCATGCATTCGCGCTACTCATGGCTCTCTCTTCCATGGGGCCCA-3′;E2F2正義鏈為5′-CTAGTGGGCCCCACTTTTTAGAAAAGT-TTGTAGCATTAAGCTGGTTTAAAATATGAAGA-3′,E2F2反義鏈為5′-AGCTTCTTCATATTTTAAACCAGCT-TAATGCTACAAACTTTTCTAAAAAGTGGGGCCCA-3′;E2F2-mu正義鏈為5′-CTAGTGGGCCCCACTTTTTA-GAAAAGTTTGTCTAGCGGCGCTGGTTTAAAATATG-AAGA-3′,E2F2-mu反義鏈為5′-AGCTTCTTCATAT-TTTAAACCAGCGCCGCTAGACAAACTTTTCTAAAA-AGTGGGGCCCA-3′。寡核苷酸鏈兩兩互補進行退火,作為與pMIRREPORTTM Luciferace質(zhì)粒(為攜帶熒光素酶基因的載體,以下簡稱為pMIR-Luc質(zhì)粒)連接的目的片段。將空載體pMIR-Luc質(zhì)粒(SpeⅠ或HindⅢ)雙酶切后,與插入的各目的序列連接過夜。連接完成后,將連接產(chǎn)物重組質(zhì)粒pMIR-Luc-SP1、pMIR-Luc-SP1-mu、pMIR-Luc-E2F2和pMIR-Luc-E2F2-mu分別轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸埃希菌DH5α進行擴增,挑取陽性單克隆菌落搖菌過夜,構(gòu)建SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR報告基因載體pMIR-SP1、pMIR-E2F2、pMIR-SP1-mu和pMIR-E2F2-mu。質(zhì)粒抽提并進行酶切鑒定后,送至北京博艾永華生物科技公司測序。
1.4 細胞培養(yǎng) HEK-293細胞貼壁培養(yǎng)于含10%胎牛血清的1640培養(yǎng)基,放置于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱進行培養(yǎng)。取對數(shù)生長期細胞進行實驗。
1.5 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染及分組 采用脂質(zhì)體法將SP1和E2F2的野生型和突變型pMIR-Luc質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染HEK-293細胞24 h。轉(zhuǎn)染前24 h,將對數(shù)生長期的HEK-293細胞消化脫壁后,調(diào)整細胞懸液密度至2×105/mL,接種于96孔板,每孔加無抗1640培養(yǎng)基100 μL,37 ℃培養(yǎng)至細胞密度約培養(yǎng)孔面積的75%~80%時開始轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染分組:SP1空白對照組、SP1目標序列組、SP1突變序列組、E2F2空白對照組、E2F2目標序列組、E2F2突變序列組,每組均設3個復孔,用25 μL Opti-MEM?Ⅰ培養(yǎng)基稀釋LipofectamineTM2000脂質(zhì)體0.5 μL,輕柔混合,室溫靜置5 min,然后按每孔量用25 μL Opti-MEM?Ⅰ培養(yǎng)基稀釋0.2 μg重組質(zhì)粒、0.01 μg對照質(zhì)粒pRL-TK和0.375 μL寡核苷酸(SP1空白對照組加入pMIR-SP1質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miRNA-control 0.375 μL;SP1目標序列組加入pMIR-SP1質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miR-155 mimics 0.375 μL;SP1突變序列組加入pMIR-SP1-mu質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miR-155 mimics 0.375 μL;E2F2空白對照組加入pMIR-E2F2質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miR-control 0.375 μL;E2F2目標序列組加入pMIR-E2F2質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miR-155 mimics 0.375 μL;E2F2突變序列組加入pMIR-E2F2-mu質(zhì)粒0.2 μg、pRL-TK質(zhì)粒0.01 μg、miRNA-155 mimics 0.375 μL),分別將各組50 μL最終混合物混勻室溫孵育20 min后,加至含細胞和培養(yǎng)基的培養(yǎng)孔,輕柔震蕩培養(yǎng)板混勻,37 ℃、5%CO2條件下孵育細胞,4 h后更換完全1640培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)至24 h。
1.6 miR-155與SP1及E2F2 mRNA 3′-UTR結(jié)合效果檢測 采用雙熒光素酶活性檢測實驗。取各組轉(zhuǎn)染后細胞,依據(jù)Dual-Luciferase報告基因檢測試劑盒說明書,使用酶標儀Gen5檢測各孔細胞螢火蟲熒光素酶活性值(F)與海腎熒光素酶活性值(R),以F/R值作為各孔細胞的相對活性值。
2.1SP1、E2F2mRNA3′-UTR與miR-155靶基因的互補性TargetScan及Miranda在線預測結(jié)果示,SP1mRNA3′-UTR和E2F2mRNA3′-UTR均有與miR-155完全互補配對的序列,其中miR-155與SP1mRNA3′-UTR的98~105位點結(jié)合、與E2F2mRNA3′-UTR的1540~1547位點結(jié)合,其互補結(jié)合序列均在7個位點以上,預測二者均為miR-155的靶基因。
2.2SP1、E2F2mRNA3′-UTR報告基因載體鑒定結(jié)果 酶切鑒定示,SP1、E2F2mRNA3′-UTR重組質(zhì)粒均被成功線性化,出現(xiàn)大小6 500bp左右的條帶。測序結(jié)果證實在SP1、E2F2mRNA3′-UTR中插入的目的片段與設計片段完全相符,見圖1。
圖1 SP1、E2F2 mRNA 3′-UTR報告基因載體測序結(jié)果
2.3 miR-155與SP1 mRNA 3′-UTR結(jié)合效果檢測 SP1空白對照組、SP1目標序列組、SP1突變序列組F/R分別為3 744.93±48.96、2 852.31±340.65、4 356.38±690.45,SP1目標序列組F/R低于SP1空白對照組及SP1突變序列組(P均<0.05),SP1空白對照組與SP1突變序列組差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
2.4 miR-155與E2F2 mRNA 3′-UTR結(jié)合效果檢測 E2F2空白對照組、E2F2目標序列組、E2F2突變序列組F/R分別為3 640.64±611.93、2 103.35±137.12、3 066.05±245.93,E2F2目標序列組F/R低于E2F2空白對照組及E2F2突變序列組(P均<0.05),E2F2空白對照組與E2F2突變序列組差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
端粒酶激活是腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵因素之一。正常人體只有造血細胞、干細胞和成纖維細胞等具有端粒酶活性,而在惡性腫瘤細胞中端粒酶則廣泛存在。hTERT是決定端粒酶活性的關(guān)鍵因素,也是端粒酶的限速亞單位,它的表達受多種轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控,與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。SP1是由Kadonaga等[6]發(fā)現(xiàn)的細胞轉(zhuǎn)錄因子,參與細胞的生長分化、癌基因與抑癌基因的調(diào)控、細胞周期調(diào)控等多種生物學進程,與凋亡、腫瘤轉(zhuǎn)移及侵襲關(guān)系密切。研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子SP1能與hTERT啟動子特異性結(jié)合,明顯增加轉(zhuǎn)錄活性[4],被認為是hTERT強大的轉(zhuǎn)錄激活因子。轉(zhuǎn)錄因子E2F2屬于E2F轉(zhuǎn)錄因子家族,參與細胞周期的調(diào)控并發(fā)揮重要作用,通過調(diào)節(jié)細胞周期中靶基因的轉(zhuǎn)錄,從而調(diào)控細胞的增殖[7]。E2F家族可根據(jù)其在細胞周期中的作用分為兩大類:激活轉(zhuǎn)錄作用的激活子和抑制轉(zhuǎn)錄作用的抑制子,其中E2F2是轉(zhuǎn)錄激活因子[7,8]。E2F2作為轉(zhuǎn)錄因子能夠在體外和體內(nèi)的增殖肝細胞中調(diào)節(jié)hTERT的差異性表達[5]。
miRNA自發(fā)現(xiàn)以來,由于其對基因的靶向調(diào)控和在生物學中的重要作用而成為研究熱點[9~11]。miRNA可通過互補結(jié)合特定的mRNA 3′-UTR,從而降解目的mRNA,或抑制其轉(zhuǎn)錄后蛋白質(zhì)翻譯,負向調(diào)控靶基因的表達水平[12]。miRNA可與多種靶基因結(jié)合,一種miRNA可能調(diào)控千百種靶基因。研究發(fā)現(xiàn),miRNA對于腫瘤發(fā)生發(fā)展的調(diào)控發(fā)揮重要的作用,其中miR-155被證實在多種腫瘤組織中高表達,參與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及侵襲。研究發(fā)現(xiàn),miR-155可能通過結(jié)合多種靶基因來抑制腫瘤的發(fā)生,miR-155在肝細胞癌中高表達,通過上調(diào)癌基因胰島素樣生長因子Ⅱ、胰島素樣生長因子I型受體和下調(diào)抑癌基因胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白3,促進肝細胞癌的增殖和遷移[13]。miR-155可通過抑制叉頭狀轉(zhuǎn)錄因子O1增加ROS的產(chǎn)生,從而促進非小細胞肺癌的細胞增殖[14]。miR-155還可靶向結(jié)合X連鎖凋亡抑制蛋白,調(diào)控順鉑誘導的卵巢癌細胞凋亡,是增加卵巢癌干預效果的潛在治療靶點[15]。
目前研究已證實,miRNA能夠通過調(diào)控hTERT的表達來影響端粒及腫瘤的生長,如miR-1182在轉(zhuǎn)錄后水平通過與hTERT的開放閱讀框相結(jié)合,調(diào)控hTERT的表達,抑制胃癌細胞的增殖和轉(zhuǎn)移[16]。Kasiappan等[17]研究表明,在卵巢惡性腫瘤中miR-498低表達,miR-498能與hTERT的3′UTR靶向結(jié)合,抑制hTERT的mRNA水平,這可能是miRNA調(diào)節(jié)端粒酶的新機制。因此,研究miRNA在hTERT調(diào)控中的作用,對于進一步明確腫瘤的發(fā)生發(fā)展、診斷、治療及預防具有重要意義。
目前,miRNA調(diào)控hTERT的具體機制及轉(zhuǎn)錄因子在該調(diào)控通路中發(fā)揮的作用尚未見報道。報告基因?qū)嶒炇茄芯縨iRNA對靶基因調(diào)控最常用的方法。本研究采用Targetscan在線預測方法,發(fā)現(xiàn)miR-155與轉(zhuǎn)錄因子SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR互補配對,提示miR-155在mRNA序列水平可與SP1和E2F2互補結(jié)合并調(diào)控二者的表達;轉(zhuǎn)染后SP1目標序列組F/R低于SP1空白對照組及SP1突變序列組,表明miR-155能與SP1互補結(jié)合,抑制SP1 mRNA的表達;轉(zhuǎn)染后E2F2目標序列組F/R低于E2F2空白對照組及E2F2突變序列組,表明miR-155能與E2F2互補結(jié)合,抑制E2F2 mRNA的表達,以上結(jié)果表明,SP1和E2F2均是miR-155直接調(diào)控的靶基因。
綜上所述,本研究成功構(gòu)建了SP1和E2F2報告基因重組質(zhì)粒,證實miR-155能夠靶向結(jié)合SP1和E2F2 mRNA 3′-UTR,在轉(zhuǎn)錄后水平抑制SP1和E2F2的表達,為后續(xù)研究miR-155靶向調(diào)控腫瘤細胞hTERT的表達提供了實驗依據(jù)。
[1] Blackburn EH. Switching and signaling at the telomere[J]. Cell, 2001,106(6):661-673.
[2] Bodnar AG, Ouellete M, Frolkis M, et al. Extension of life-span by introduction of telomerase into normal human cells[J]. Science, 1998,279(5349):349-352.
[3] Dhaene K, Wauters J, Weyn B, et al. Expression profile of telomerase subunits in human pleural mesothelioma[J]. J Pathol, 2000,190(1):80-85.
[4] Deeb D, Brigolin C, Gao X, et al. Induction of apoptosis in pancreatic cancer cells by CDDO-Meinvolves repression of telomerase through epigenetic pathways[J]. J Carcinog Mutagen, 2014,5:177.
[5] Sirma H, Kumar M, Meena JK, et al. The promoter of human telomerase reverse transcriptase is activated during liver regeneration and hepatocyte proliferation[J]. Gastroenterology, 2011,141(1):326-337.
[6] Kadonaga JT, Carner KR, Masiarz FR, et al. Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain[J]. Cell, 1987,51(6):1079-1090.
[7] Slansky JE, Farnham PJ. Introduction to the E2F family: protein structure and gene regulation[J]. Curr Top Microbiol Immunol, 1996,208(1):1-30.
[8] DeGregori J, Johnson DG. Distinct and overlapping roles for E2F family members in transcription, proliferation and apoptosis[J]. Curr Mol Med, 2006,6(7):739-748.
[9] Liu Z, Wang D, Hu Y, et al. MicroRNA-146a negatively regulates PTGS2 expression induced by Helicobacter pylori in human gastric epithelial cells[J]. J Gastroenterol, 2013,48(1):86-92.
[10] Xiao B, Liu Z, Li BS, et al. Induction of microRNA-155 during Helicobater pylori infection and its negative regulatory role in the inflammatory respons[J]. J Infect Dis, 2009,200(6):916-925.
[11] 田偉,張娟,王利娜.miR-181c在膠質(zhì)母細胞瘤組織中的表達變化及其對腫瘤細胞侵襲、遷移能力的影響[J]. 山東醫(yī)藥,2016,56(27):1-4.
[12] Hernandez YG, Lucas AL. MicroRNA in pancreatic ductal adenocarcinoma and its precursor lesions[J]. World J Gastrointest Oncol, 2016,8(1):18-29.
[13] El Tayebi HM, Waly AA, Assal RA, et al. Transcriptional activation of the IGF-Ⅱ/IGF-1R axis and inhibition of IGFBP-3 by miR-155 in hepatocellular carcinoma[J]. Oncol Lett, 2015,10(5): 3206-3212.
[14] Hou L, Chen J, Zheng Y, et al. Critical role of miR-155/FoxO1/ROS axis in the regulation of non-small cell lung carcinomas[J]. Tumour Biol, 2016,37(4):5185-5192.
[15] Chen W, Huang L, Hao C, et al. MicroRNA-155 promotes apoptosis in SKOV3, A2780, and primary cultured ovarian cancer cells[J]. Tumour Biol, 2016,37(7):9289-9299.
[16] Zhang D, Xiao YF, Zhang JW, et al. miR-1182 attenuates gastric cancer proliferation and metastasis by targeting the open reading frame of hTERT[J]. Cancer Lett, 2015,360(2):151-159.
[17] Kasiappan R, Shen Z, Tse AK, et al. 1,25-Dihydroxyvitamin D3suppresses telomerase expression and human cancer growth through microRNA-498[J]. J Biol Chem, 2012,287(49):41297-41309.
國家自然科學基金資助項目(81170329);全軍醫(yī)學科技青年培育項目(15QNP049);解放軍309醫(yī)院院管課題(2014MS-001)。
管靜芝(E-mail: jzjz1970@hotmail.com)
10.3969/j.issn.1002-266X.2016.46.009
R730.231
A
1002-266X(2016)46-0035-04
2016-05-14)