林豪雨,郭昱顯,林芳芳,孫淑明,盧曉峰,梁偉全,陳春發(fā)
(1.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院甲狀腺乳腺外科,2.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院長江學(xué)者實(shí)驗(yàn)室 廣東 汕頭 515041)
GATA-3啟動子報(bào)告基因載體構(gòu)建及其活性鑒定
林豪雨1,2,郭昱顯2,林芳芳2,孫淑明1,盧曉峰1,梁偉全1,陳春發(fā)1
(1.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院甲狀腺乳腺外科,2.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院長江學(xué)者實(shí)驗(yàn)室廣東汕頭515041)
目的轉(zhuǎn)錄因子GATA-3在人乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中扮演重要的角色,研究其轉(zhuǎn)錄調(diào)控有重要意義.方法從人乳腺癌細(xì)胞系MCF-7提取基因組DNA為模板,以PCR方法擴(kuò)增獲得GATA-3啟動子序列,將片段克隆到pGL3-Basic載體內(nèi),鑒定后通過報(bào)告基因檢測系統(tǒng)檢測GATA-3啟動子報(bào)告基因的熒光素酶活性.結(jié)果雙酶切、基因測序鑒定結(jié)果顯示,成功構(gòu)建了GATA-3啟動子報(bào)告基因,并在MCF-7細(xì)胞內(nèi)鑒定了其具有熒光素酶的表達(dá)活性.結(jié)論本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建了GATA-3啟動子報(bào)告基因載體pGL3-GATA-3pro-Luc,為后續(xù)GATA-3在乳腺癌中表達(dá)及其調(diào)控通路以及以GATA-3為靶標(biāo)的抗腫瘤藥物研究提供了有效工具.
乳腺腫瘤;GATA-3;啟動子;報(bào)告基因
GATA-3屬于GATA轉(zhuǎn)錄因子家族,是乳腺腔上皮細(xì)胞的重要標(biāo)志,在乳腺腔上皮細(xì)胞發(fā)生及維持分化有重要作用[1].GATA-3與ERa同時(shí)高表達(dá)于luminal型乳腺癌細(xì)胞(如MCF-7、T47D),具有高度相關(guān)性,GATA-3對ER有調(diào)控作用,可能是ER通路的重要組成部分[2].多個研究表明GATA-3在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中扮演重要的角色,是乳腺癌良好預(yù)后的指標(biāo),可以通過逆轉(zhuǎn)EMT、改變腫瘤的微環(huán)境,抑制新生血管形成,負(fù)性調(diào)控多個癌基因等抑制乳腺癌的轉(zhuǎn)移[3-4].目前對GATA-3的研究集中在對其下游基因的探討,對其上游基因及調(diào)控機(jī)制報(bào)道較少.本研究旨在明確GATA-3的轉(zhuǎn)錄調(diào)控啟動子區(qū)域,克隆其啟動子區(qū),并鑒定其在人乳腺癌細(xì)胞系MCF-7中的活性.為以后靶向調(diào)節(jié)GATA-3啟動子活性奠定基礎(chǔ).
1.1材料
1.1.1實(shí)驗(yàn)材料
質(zhì)粒pGL3-basic、pGL3-control、pRL-SV40為筆者實(shí)驗(yàn)室保存;E.coli Competent Cells DH5α感受態(tài)細(xì)胞(Takara公司);MCF-7細(xì)胞系購自上海中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會細(xì)胞庫.
1.1.2主要試劑
細(xì)胞培養(yǎng)液:DMEM-HG(Gibco公司);胎牛血清(Hyclone公司);核酸電泳所需材料:DNA ladder(中科瑞泰公司),Agarose(GIBCO公司),1×TBE電泳緩沖液,GelRED(41003 Biotium),6×Loading Buffer(Takara公司);DNA限制性內(nèi)切酶均購自寶生物公司;質(zhì)粒制備試劑盒(minipreparation and maxipreparation)均購自天根生物有限公司(DP103,DP117);FastPfu高保真DNA聚合酶(北京全式金生物技術(shù)有限公司AP221);T4 DNA Ligase(北京全式金生物技術(shù)有限公司FL101);去磷酸化酶CIP(NEB Lot:0621301);膠回收試劑盒(Thermo Scientific GeneJET#K0691),組織、細(xì)胞DNA提取試劑盒(GENSTAR-DNAzol-D104-01),Dula-Luciferas Reporter Assay system試劑盒(Promega公司),Lipofectamine 2000(invitrogen公司)
1.2方法
1.2.1GATA-3啟動子引物設(shè)計(jì)
我們利用美國UCSC Genome Browser網(wǎng)站(http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway)對GATA-3基因進(jìn)行分析,在人GATA-3基因(NC_000010.11)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)-1 200 bp和+200 bp之間設(shè)計(jì)引物,引物設(shè)計(jì)確??寺『蟮牟迦肫尾挥绊慙uciferase的閱讀框.合成由上海生工生物技術(shù)公司完成.上游序列:hGATA-3 pro-F 5'GCGCAAGCTTAGGGCTGG TTTCCTTGACTG 3',酶切位點(diǎn):Hind III.下游序列:hGATA-3 pro-R 5'GCGCCTCGAGGTCACCAGTACCAACCTGGG 3'',酶切位點(diǎn):Xho I(下劃線序列是酶切位點(diǎn)).總長度為1 191 bp.
1.2.2MCF-7細(xì)胞培養(yǎng)
人乳腺癌MCF-7細(xì)胞貼壁培養(yǎng)于含10%胎牛血清、100 U/ml青霉素和100 g/ml鏈霉素的DMEM basic培養(yǎng)基中,置37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中常規(guī)傳代,取對數(shù)生長期細(xì)胞進(jìn)行試驗(yàn).
1.2.3基因組DNA提取
選擇60 cm2培養(yǎng)瓶中聚合度達(dá)到80%的MCF-7細(xì)胞,按照GENSTAR-DNAzol組織、細(xì)胞DNA提取試劑盒方法,提取基因組DNA.-20℃保存?zhèn)溆?
1.2.4GATA-3啟動子擴(kuò)增
以1.2.3提取的DNA為模版PCR,PCR體系如下:5×Buffer 5 μL;2.5 mM dNTP 2.5 μL;20 pmol上游引物1 μL;20 pmol下游引物1 μL;FastPfu DNA聚合酶0.25 μL;DNA模板1 μL;加滅菌水至25 μL.PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5 min,循環(huán)條件:94℃30 s,55-60℃梯度退火溫度45 s,72℃45 s,30個循環(huán),72℃延伸5 min,擴(kuò)增產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳觀察.
1.2.5構(gòu)建GATA-3啟動子pGL3-GATA-3pro-Luc
按照膠回收試劑盒的說明對PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,用Hind III和Xho I進(jìn)行雙酶切;同樣將載體質(zhì)粒pGL3-Basic用Hind III和Xho I進(jìn)行雙酶切,并用去磷酸化酶CIP處理防止其自連;PCR產(chǎn)物與載體的連接反應(yīng)按TransStart T4 DNA Ligase試劑盒說明書進(jìn)行.按照插入片段與載體的摩爾比例為3∶1進(jìn)行連接.連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,37℃培養(yǎng)過夜;次日搖菌提取質(zhì)粒.Hind III和Xho I進(jìn)行雙酶切,陽性克隆命名為pGL3-GATA-3pro-Luc.質(zhì)粒送上海生工生物技術(shù)公司測序鑒定.
1.2.6重組質(zhì)粒pGL3-GATA-3pro-Luc轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞
在24well培養(yǎng)皿中用含有10%FBS無雙抗的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)MCF-7細(xì)胞到匯合度達(dá)60%進(jìn)行轉(zhuǎn)染;采用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染方法分別在每孔中加入海腎熒光素酶質(zhì)粒pRL-SV40作為內(nèi)參,以及分別加入GATA-3啟動子報(bào)告基因pGL3-GATA-3pro-Luc/陰性對照pGL3 basic luc/陽性對照pGL3 control.在37℃,5%的二氧化碳中培養(yǎng).
1.2.7GATA-3啟動子報(bào)告基因活性檢測
上述細(xì)胞轉(zhuǎn)染24 h后裂解細(xì)胞,采用Promega公司的雙熒光報(bào)告基因檢測系統(tǒng)分別檢測實(shí)驗(yàn)組和對照組的螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶(內(nèi)參)活性,以兩者的活性比值作為熒光素酶的相對活性.
2.1GATA-3啟動子基因的PCR擴(kuò)增
利用設(shè)計(jì)的引物以及55-60℃梯度退火溫度(泳道1-6退火溫度遞減)PCR擴(kuò)增得到的產(chǎn)物(圖1),發(fā)現(xiàn)在Marker DL2000的1 000-2 000 bp間靠近1 000 bp左右1-6個泳道均有一條特異的條帶.而我們預(yù)擴(kuò)增的GATA-3啟動子部分大小約1 191 bp(加兩端酶切位點(diǎn)及保護(hù)堿基).因此,從圖片結(jié)果可以看出,PCR擴(kuò)增出來的條帶大小與預(yù)計(jì)的GATA-3部分啟動子大小一致,從而證明GATA-3啟動子已經(jīng)成功擴(kuò)增出來,且無其他非特異性片段,對產(chǎn)物1-6泳道1%瓊脂糖凝膠分離并切膠回收.
2.2GATA-3啟動子載體的構(gòu)建及鑒定
回收經(jīng)Hind III和Xho I雙酶切得到的GATA-3啟動子基因和pGL3-Basic載體的相應(yīng)條帶,經(jīng)T4連接酶連接后轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)菌.37℃培養(yǎng)過夜;次日搖菌提取質(zhì)粒,再以Hind III和Xhol I雙酶切后,重組質(zhì)粒釋放出1 191 bp大小左右的片段(圖2).質(zhì)粒送經(jīng)上海生工生物工程公司測序,結(jié)果用DNAMAN軟件與GenBank基因序列進(jìn)行同源性比較,證實(shí)擴(kuò)增產(chǎn)物為目的基因.構(gòu)建質(zhì)粒載體命名為pGL3-GATA-3pro-Luc.
2.3GATA-3啟動子報(bào)告基因熒光素酶活性的檢測
我們把pGL3-GATA-3pro-Luc轉(zhuǎn)染到MCF-7細(xì)胞中,并設(shè)pGL3 control為陽性對照,pGL3 basic為陰性對照.并共轉(zhuǎn)染相同量的海腎熒光素酶質(zhì)粒pRL-SV40作為內(nèi)參照,以螢火蟲熒光素酶活性/海腎熒光素酶的比值來反應(yīng)報(bào)告基因的驅(qū)動活性.結(jié)果顯示pGL3-GATA-3pro-Luc的相對熒光素酶活性為pGL3 basic的12.8倍(圖3),說明pGL3-GATA-3pro-Luc質(zhì)粒能表達(dá)熒光素酶活性代表GATA-3的啟動子活性.
乳腺癌是全球女性最常見的惡性腫瘤.在歐美國家,其發(fā)病率位于女性惡性腫瘤之首,約占29%,死亡率約為15%,僅次于肺癌,位居第2位[5].乳腺癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制尚未得到十分明確的闡述,現(xiàn)在普遍認(rèn)為其受多種因素與多條信號通路相互作用的結(jié)果.
圖1 55-60℃梯度退火溫度(泳道1-6退火溫度遞減)PCR擴(kuò)增得到的產(chǎn)物
圖3 在MCF-7細(xì)胞株中分別轉(zhuǎn)染了同等劑量的pGL3 basic、pGL3-GATA-3pro-Luc、pGL3 control,以螢火蟲熒光素酶活性/海腎熒光素酶的比值來反應(yīng)報(bào)告基因的驅(qū)動活性.差異倍數(shù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差方式給出(*,p<0.05,t-檢驗(yàn)).
GATA-3作為轉(zhuǎn)錄因子不僅在正常乳腺組織的發(fā)生發(fā)展中起重要的調(diào)節(jié)、促分化作用,而且與乳腺癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān).目前的研究顯示[6],GATA-3在乳腺癌中高表達(dá),是乳腺癌特異性標(biāo)志之一.這一點(diǎn)在Luminal型乳腺癌中更為明顯,并且與較好的預(yù)后相關(guān).Marie-Liesse Asselin-Labat等[7]對luminal型乳腺癌轉(zhuǎn)基因小鼠MMTV-PyMT的研究發(fā)現(xiàn),缺失GATA-3等位基因會導(dǎo)致腫瘤形成明顯加速,而重新過表達(dá)GATA-3則能使這一過程減緩.進(jìn)一步研究表明GATA-3的這一抑癌作用是通過對其下游一種抑癌基因Caspase-14的調(diào)控實(shí)現(xiàn)的。Wei Yang等[8]認(rèn)為GATA-3可以通過逆轉(zhuǎn)EMT的過程抑制乳腺癌轉(zhuǎn)移,而進(jìn)一步的研究表明其逆轉(zhuǎn)是建立在對E-cadherin啟動子水平調(diào)控的基礎(chǔ)上的.Jianwei Sun等[9]認(rèn)為GATA-3能消除轉(zhuǎn)化生長因子TGFβ和Smad4所導(dǎo)致的肌成束蛋白(Fascin)的過表達(dá)從而抑制乳腺癌的侵襲和轉(zhuǎn)移,而Fascin的高表達(dá)是乳腺癌浸潤轉(zhuǎn)移的重要機(jī)制之一.Jonathan Chou等[4]研究表明GATA-3通過調(diào)控microRNA-29b抑制腫瘤的轉(zhuǎn)移,而microRNA-29b可以通過作用于包括VEGFA,ANGPTL4,PDGF,LOX,MMP9,ITGA6,ITGB1和TGFB等一系列靶基因改變腫瘤的微環(huán)境,包括抑制新生血管形成,基質(zhì)破壞,上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)換.從而抑制腫瘤的轉(zhuǎn)移.這一發(fā)現(xiàn)可能為轉(zhuǎn)移性乳腺癌的治療提供新型靶點(diǎn).最近的研究[10]證實(shí)GATA-3在乳腺癌中可通過形成一個轉(zhuǎn)錄抑制因子復(fù)合物GATA-3/G9A/NuRD(MTA3)下調(diào)ZEB2的表達(dá),而鋅指蛋白ZEB2是公認(rèn)的EMT的關(guān)鍵基因之一,從而最終抑制乳腺癌的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移.GATA-3對乳腺腫瘤的抑制作用在眾多研究中得到證實(shí),但是對其上游基因的研究,對GATA-3本身的調(diào)控研究,在國內(nèi)外都報(bào)道較少.
本研究利用PCR方法構(gòu)建了GATA-3啟動子序列,并將其插入到pGL3 basic luc質(zhì)粒載體中,構(gòu)建了GATA-3啟動子報(bào)告基因質(zhì)粒.通過轉(zhuǎn)化擴(kuò)增,篩選出陽性克隆,并通過酶切,測序鑒定及生物學(xué)活性的檢測,結(jié)果表明,本組成功地構(gòu)建了pGL3-GATA-3pro-Luc熒光素酶報(bào)告基因載體,并在MCF-7細(xì)胞內(nèi)鑒定了其熒光素酶的表達(dá).因此,充分證明了本組構(gòu)建的pGL3-GATA-3pro-Luc是具有生物學(xué)功能的,為后續(xù)GATA-3在乳腺癌中表達(dá)及其調(diào)控通路以及以GATA-3為靶標(biāo)的抗腫瘤藥物研究提供了有效工具.
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Construction and Activity Analysis of Luciferase Reporter Gene Vector Containing GATA-3 Promoter
LIN Haoyu1,2,GUO Yuxian2,LIN Fangfang2,SUN Shuming1,LU Xiaofeng1,LIANG Weiquan1,CHEN Chunfa1
(1.DepartmentofThyroidandBreastSurgery,TheFirstAffiliatedHospital,ShantouUniversityMedicalCollege,Shantou515041,Guangdong,China;2.Changjiang Scholar's Lab,Shantou University Medical College,Shantou 515041,Guangdong,China)
Objective:GATA-3 is a transcription factor that plays crucial role in carcinogenesis and development of breast cancer,and thus the investigation of its transcription regulation is important for understanding the mechanism of breast cancer.Methods:The gene fragment of promoter sequence of GATA-3 was amplified from human breast cancer cell line MCF-7 by PCR and was cloned into empty vector pGL3-Basic to construct luciferase reporter gene vectors pGL3-GATA-3pro-Luc,which was amplified by transformation and identified by restriction enzyme digestion,sequencing,and the biological activity detecting.Results:The Slug promoter driven fluorescence protein was effectively expressed in human breast cancer cell line MCF-7.We constructed the luciferase reporter vector pGL3-GATA-3pro-Luc successfully,the expression of luciferase could be detected in human breast cancer cell line MCF-7.Conclusion:Luciferase reporter vector pGL3-GATA-3pro-Luc is constructed successfully.It lays a solid foundation for the research of GATA-3 regulation in breast cancer,and may guide to identify newtargets for breast cancer therapy.
breast neoplasm;GATA-3;Promoter;Reporter gene
R737.9
A
1001-4217(2016)03-0069-06
2015-12-17
林豪雨(1982—),男,廣東汕頭市人,博士生,主治醫(yī)師,汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院甲狀腺乳腺科.主要從事乳腺癌浸潤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究.
陳春發(fā)(1982—),男,廣東汕頭市人,碩士,主治醫(yī)師,汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院甲狀腺乳腺科.主要從事乳腺癌浸潤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究.E-mail:zjgdmc-2001@163.com
廣東省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2015A030313429);廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)基金項(xiàng)目(A2015437)