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        一種改進的心臟核磁共振圖像多步配準方法

        2016-05-14 22:39:06余軍陳雪周勇攀
        軟件導刊 2016年5期
        關鍵詞:核磁共振成像

        余軍 陳雪 周勇攀

        摘要:提高核磁共振成像速度的研究方興未艾。基于k-t的成像技術比如k-t SENSE和k-t PCA,利用成像序列在時間維度上的冗余性,能夠?qū)⒉蓸蛹铀俦忍岣叩?倍以上。由于它們利用成像序列的時間冗余性,對成像對象的運動特別敏感,不能移除運動導致的偽影,從而造成重構圖像在空間域的模糊。為了使基于k-t的成像技術能夠運用于具有較大運動場合的成像對象,研究了一種改進的圖像配準方法,通過多步配準來完成仿射變換。實驗結果表明,該方法比傳統(tǒng)的仿射變換配準精度更高。

        關鍵詞:核磁共振成像;圖像配準;仿射變換

        DOIDOI:10.11907/rjdk.161091

        中圖分類號:TP317.4

        文獻標識碼:A 文章編號:1672-7800(2016)005-0207-03

        0 引言

        核磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI) 是一種傅立葉成像技術,與傳統(tǒng)的基于X射線的成像技術(如計算機斷層掃描,Computed tomography ,CT)不同,MRI利用射頻脈沖作用下水分子中的氫元素在磁場中產(chǎn)生共振的現(xiàn)象來成像[1]。其特點是多參數(shù)和高對比度成像,并且可以在任意方位斷層,提供豐富的診斷信息。由于人體生理和物理局限性,在同一時刻只能采集到圖像的一個傅立葉編碼系數(shù),所以成像速度較慢。

        并行成像(Parallel Imaging) [2-3]是已經(jīng)獲得臨床應用的快速成像方法,PI并不采集所有重構需要的k-space數(shù)據(jù),而是根據(jù)預先設計的采樣模式,采集整個k-space 的一部分,從而減少采樣時間。比如SENSE、GRAPPA和SPIRiT,利用k-space數(shù)據(jù)的空間冗余特性,使用多個感應線圈以減少成像需要采集的k-space值。由于PI以每幀獨立的方式重構,所以PI對成像對象的運動不敏感,加速率一般只有2-3倍[4]?;趉-t的成像技術利用成像序列在時間維度上的冗余性,進一步提高數(shù)據(jù)采集的加速比。k-t SENSE和k-t PCA利用低分辨率圖像訓練時間基函數(shù),并使用這些時間基函數(shù)調(diào)整重構[5-6];壓縮傳感(Compressed Sensing, CS),比如Sparse MRI和k-t SLR,利用重構圖像的變換稀疏性調(diào)整重構,這些方法能夠在8倍以上采樣加速比下移除圖像偽影[7-8]。由于是利用成像序列的時間冗余,所以對成像對象的運動特別敏感,不能移除運動導致的偽影,造成重構圖像模糊。

        圖像配準技術能夠?qū)⒊上駥ο笾械年P注區(qū)域在空間上對齊[9],從而提高重構圖像的變換稀疏性,使得基于k-t 的成像技術能夠運用于具有較大運動場合的成像對象,提高了MRI技術的適應性。然而對于一般配準問題而言,模型的靈活性與結果的精確性是相互矛盾的。模型選取越靈活,自由度越大,結果的精度就越低。本文采用多步配準的方法來提高配準的精確度。首先進行靈活性較差的粗模型配準,得到的解大致接近真實解。然后通過限制粗模型中的參數(shù),進行靈活性較大的精配準,得到更加接近真實的解。仿真數(shù)據(jù)和真實數(shù)據(jù)的實驗結果表明,這種方法的精確度比傳統(tǒng)的一步配準精確度更高。

        1 基本原理與算法流程

        1.1 基本原理

        配準過程通常涉及兩幅圖像,一副圖像為參考圖像,另一幅圖像為浮動圖像。配準的目的是根據(jù)給定的相似性度量求得一個變換,通過這個變換,可以將浮動圖像變換后與參考圖像在空間上對齊。配準算法常常將圖像轉(zhuǎn)換到物理空間內(nèi)執(zhí)行,而通常被表述為一個優(yōu)化過程,即通過搜索求得最優(yōu)的空間變換參數(shù)值,可用下式表達:

        在配準過程中,變換模型選取越靈活,自由度會越大,但卻導致結果精確度不高。心臟運動可以近似看成仿射運動,其自由度較大,若采用傳統(tǒng)的仿射變換模型來處理,配準精確度就不高。為了保證模型的靈活性并提高配準的精度,本文對仿射變換模型進行了改進,采用多步配準方法完成配準過程,即先進行平移變換,再進行剛體變換,最后進行仿射變換。從理論上分析,先經(jīng)過平移變換模型配準,可以使平移分量的參數(shù)大致接近真實解。再用平移變換模型的配準結果進行剛體變換,由于平移分量與真實解接近,在搜索最優(yōu)解的過程中可以限制平移分量的取值,使解的搜索范圍縮小,得到的配準結果比直接進行剛體變換結果要精確。最后在剛體變換配準的基礎上進行靈活性更大的仿射變換配準,既可以保證模型的靈活性,又可以提高配準精度。對于仿射運動配準可采用如下公式表示:

        其中,φt、φr、φa分別表示平移變換、剛體變換、仿射變換,S'表示經(jīng)過多步變換后的圖像。在具體配準時,將平移變換后的結果作為剛體變換的輸入,然后將剛體變換后的結果作為仿射變換的輸入,最后完成仿射運動糾正。

        1.2 算法流程

        配準的目的是使成像對象中的關注區(qū)域在空間上對齊,可用圖像分割的方法獲取心臟局部圖像。先對局部圖像進行配準以減少計算量,然后再將得到的空間變換作用于原始圖像。核磁共振成像形成的是圖像序列,配準時要考慮多幅圖像間的配準。多幅圖像前后兩幅圖像的差別較小,若都以第一幅圖像作為參考圖像,則由于后面的圖像與第一幅差距較大導致配準結果不好。本文先將圖像序列中的前后兩張圖像進行兩兩配準,得到的變換關系依次替換成與第一幅圖像的變換關系,再以第一幅圖像作為參考圖像,用變換關系依次得到配準結果,最終求得多幅圖像配準后的圖像序列。

        多步配準法流程如圖1所示。

        2 實驗結果與分析

        為了方便分析,用仿真數(shù)據(jù)對多步剛體變換與傳統(tǒng)的剛體變換進行比較。首先選取一張測試圖像,對該圖像作一系列剛體變換,得到測試圖像序列,這里,剛體變換參數(shù)已知。然后分別用多步配準方法與傳統(tǒng)的剛體變換配準方法對測試圖像序列進行配準。實驗中選用的測試圖像大小為256×256 pixel,圖像序列為32幅圖像,如圖2所示。選用的相似性度量為基于互信息的相似性度量函數(shù),優(yōu)化方法為One Plus One Evolutionary,插值方法選用線性插值法。配準后的參數(shù)比較結果如圖3所示。

        圖3表示剛體變換的3個參數(shù)配準結果比較,其中圖3(a)、圖3(b)、圖3(c)分別表示x分量、y分量和旋轉(zhuǎn)角度分量的配準結果。橫坐標軸表示各幅圖像在圖像序列中的位置,縱坐標軸表示參數(shù)的值,x、y分量的單位為像素,旋轉(zhuǎn)角度分量的單位為度。從圖3中可以看出,用多步配準方法得到的解更接近真實值。

        進一步對圖3中的數(shù)據(jù)求均方根誤差(RMSE),可得多步配準方法與傳統(tǒng)配準方法的對比數(shù)據(jù),如表1所示。

        從表1可以看出,多步配準方法的配準結果要優(yōu)于傳統(tǒng)的配準方法。

        下面選取人自由呼吸時的心臟核磁共振圖像序列進行實驗,圖4所示為圖像序列中的兩張圖像。

        首先用圖像分割的方法獲取心臟局部圖像序列,圖5所示為對應心臟部分的局部圖像。

        分別用多步仿射變換和傳統(tǒng)的仿射變換完成配準過程。由于原始仿射變換參數(shù)不確定,為了便于觀察配準結果,從每幅圖像中選擇中心一列組成一幅圖像,實驗結果如圖6所示。

        由于選取的是圖像序列中心一列組成的圖像,因此配準結果的好壞可以通過比較圖像中每一列得到。從圖6(a)可知,各列的心臟部分沒有對齊,說明原始圖像序列存在運動,從圖6(b)和圖6(c)的對比可以看出,每一列的中心部分大致對齊,說明多步仿射變換和傳統(tǒng)的仿射變換都能在一定程度上糾正心臟的運動,而且多步仿射變換效果更好。不足之處是心臟的運動復雜,仿射變換不一定能準確反映心臟的運動。

        3 結語

        為了使基于k-t 的成像技術能夠運用于具有較大運動場合的成像對象,提高核磁共振成像技術的適應性,本文研究了一種改進的圖像配準方法,通過多步配準來提高配準的精確度。從測試圖像和真實的核磁共振圖像實驗結果可以看出,多步仿射配準方法得到的配準結果要優(yōu)于傳統(tǒng)的仿射變換。但是,從表1中能夠看出角度分量的誤差比平移分量的誤差高。在進一步的研究中,可以在優(yōu)化時將角度分量和平移分量進行圓化處理,以使它們的誤差相對一致。下一步可對更為復雜的變換比如變形體的運動開展研究。

        參考文獻:

        [1]張小明. MRI 原理[M].成都: 四川科技出版社,2004.

        [2]GRISWOLD, MARK A.Partially parallel imaging with localized sensitivities (PILS)[J].Magnetic Resonance in Medicine, 2000, 44(4):602-609.

        [3]BYDDER M.Optimization of sensitivity encoding with arbitrary k-space trajectories[J].Magnetic Resonance Imaging, 2007, 25(8):1123-1129.

        [4]LUSTIG,MICHAEL.SPIRiT:Iterative self-consistent parallel imaging reconstruction from arbitrary k-space[J].Magnetic Resonance in Medicine,2010,64(2):457-471.

        [5]TSAO,JEFFREY.k-t BLAST and k-t SENSE: Dynamic MRI with high frame rate exploiting spatiotemporal correlations[J].Magnetic Resonance in Medicine, 2003, 50(5):1031-1042.

        [6]SCHMIDT, JOHANNES F M.Iterative k-t principal component analysis with nonrigid motion correction for dynamic three-dimensional cardiac perfusion imaging[J].Magnetic Resonance in Medicine, 2014, 72(1): 68-79.

        [7]LUSTIG, MICHAEL.Sparse MRI: the application of compressed sensing for rapid MR imaging[J].Magnetic Resonance in Medicine, 2007, 58(6): 1182-1195.

        [8]LINGALA S G.Accelerated dynamic MRI exploiting sparsely and low-rank structure: k-t SLR[J].IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30(5): 1042-1054.

        [9]宋禮智.圖像配準技術及其應用研究[D].上海: 復旦大學,2010.

        (責任編輯:杜能鋼)

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