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        放線菌在抗生素生產(chǎn)中的應(yīng)用

        2016-04-13 03:15:21管寧河南醫(yī)藥技師學(xué)院
        消費導(dǎo)刊 2016年3期
        關(guān)鍵詞:泰樂基因簇放線菌

        管寧 河南醫(yī)藥技師學(xué)院

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        放線菌在抗生素生產(chǎn)中的應(yīng)用

        管寧河南醫(yī)藥技師學(xué)院

        摘要:放線菌在抗生素生產(chǎn)中具有調(diào)節(jié)作用,可以利用放線菌的基因組來控制抗生素生物合成基因的轉(zhuǎn)錄。在遺傳學(xué)上,對于Mr<1000的分子需要10至50個基因來編碼,而每個抗生素生物合成基因簇約占放線菌基因組的1%,且具有多個不連續(xù)的基因簇,每個基因簇又合成各自的抗生素。因此,探討放線菌在抗生素生產(chǎn)中的應(yīng)用,需要從正負調(diào)控機制來分析。

        關(guān)鍵詞:放線菌抗生素生產(chǎn)調(diào)控機制

        抗生素合成基因簇多位于放線菌的基因組中,在抗生素生產(chǎn)中除了酶類基因,也受到放線菌自身抗性的影響。調(diào)節(jié)基因是具有識別性的基因簇,如灰色鏈霉菌中的鏈霉素基因簇,既有調(diào)節(jié)基因,又有抗性決定子;而對于弗氏鏈霉菌在合成泰樂菌素時,卻需要三個抗性基因和五個調(diào)節(jié)基因。盡管調(diào)節(jié)基因與生物合成并非存在同一基因簇,如糖多孢菌不含紅霉素合成基因簇的調(diào)節(jié)子,也沒有其他基因,而泰樂菌素在合成時則需要同源基因。

        一、放線菌的正向調(diào)節(jié)機制

        抗生素生產(chǎn)中由于受到級聯(lián)調(diào)節(jié)的制約,會激活其他被隱藏的啟動子,并成為轉(zhuǎn)錄抗生素合成的操縱子,來調(diào)節(jié)其代謝。DNA測序技術(shù)利用途徑特異性調(diào)節(jié)蛋白家族“SARPs”,來推測氨基酸序列,如Act IIORF4和Red D,以及Dnr I。SARPs具有途徑專一性調(diào)節(jié)作用,并能夠滅活各自對應(yīng)調(diào)節(jié)基因在抗生素中的合成。我們可以通過DNA片段的克隆功能,來提升抗生素生產(chǎn)水平。由此可見,對于SARPs的途徑特異性,適應(yīng)于對傳統(tǒng)菌種的改良,尤其是專一性調(diào)節(jié)基因的自我克隆,更具有顯著的效果。在整個抗生素生物合成基因簇中,對于每個調(diào)節(jié)蛋白,可以通過轉(zhuǎn)錄分析,來鑒定啟動子,并通過DNA互補技術(shù)來激活。如actII-ORF4基因能夠控制act生物的合成轉(zhuǎn)錄;同樣,對于波賽鏈霉菌dnrI基因,同樣可以控制dnr基因簇的轉(zhuǎn)錄。在這些基因簇中,每個蛋白至少結(jié)合在兩個點上,且形成不同的啟動子對;而對于啟動子來說,由于整個鏈霉素合成基因在轉(zhuǎn)錄中受到strR基因的控制,因此可以通過啟動子來調(diào)節(jié)合成。在工業(yè)抗生素生產(chǎn)上采用多效調(diào)節(jié),在不產(chǎn)抗生素的突變菌株中,多途徑中的功能蛋白,讓突變株失去產(chǎn)孢子能力。這種級聯(lián)調(diào)控要比途徑專一性調(diào)控層次高,也就是說,細胞外誘發(fā)細胞內(nèi)的反應(yīng),能夠?qū)崿F(xiàn)對抗生素的生產(chǎn)調(diào)節(jié)。針對泰樂菌素的合成,弗氏鏈霉菌作為正調(diào)節(jié)基因,顯然與產(chǎn)碳霉素的耐熱鏈霉菌有關(guān),其中tylS基因簇與大環(huán)內(nèi)酯類抗生素有關(guān);當(dāng)tylT基因失去活性,泰樂菌素仍然合成,只是合成量降低,可見,對于泰樂菌素來說,并非是單生物合成途徑有關(guān)的SARPs。同樣,tyLR在tyl基因簇中的調(diào)節(jié)作用上,一方面作為調(diào)節(jié)基因存在,但并未與抗生素合成表現(xiàn)出較大關(guān)聯(lián)度;另一方面,通過tylR的活化作用,tylS促進了tylU的表達,而tylS 與tulU蛋白又共同促進了tylR的產(chǎn)生。

        二、放線菌的負向調(diào)節(jié)機制

        在灰色鏈霉菌合成中,A-因子介導(dǎo)是在級聯(lián)調(diào)節(jié)下完成的,其過程由誘導(dǎo)物來激活adpA,而adpA通過阻遏作用來實現(xiàn)。也就是說,對于灰色鏈霉菌,A-因子是受體,而ArpA蛋白作為多重調(diào)節(jié)基因,主要通過觸發(fā)次級代謝來形成。以泰樂菌素生產(chǎn)為例,對于tylQ是tylR的阻遏物,利用野生型弗氏鏈霉菌tyl基因簇進行反轉(zhuǎn)錄PCR分析,可知tylQ基因被激活,但在泰樂菌素合成中處于沉默狀態(tài)。我們在實驗分析中發(fā)現(xiàn),tylQ菌株不產(chǎn)生泰樂菌素,然而tylQ和tylR在轉(zhuǎn)錄物中并未檢測到。利用tylQ來提升泰樂菌素的產(chǎn)量已經(jīng)產(chǎn)業(yè)化,它能夠從調(diào)節(jié)基因上來改變單個氨基酸殘基,并從抑制典型基序的下游螺旋區(qū)中組氨酸向谷氨酰胺的轉(zhuǎn)換。因此,通過破壞tylQ,促進了tylR的過度表達,也提升了泰樂菌素的產(chǎn)出率。顯然,通過對tylP控制tylQ,發(fā)現(xiàn)GB-結(jié)合蛋白靶標位點的特征,在這個研究基礎(chǔ)上,可以通過可靠靶標位點與FarA的自調(diào)節(jié)結(jié)合位點進行識別。以淡青紫鏈霉菌的工程菌株為例,tylP對tylP和tylQ具有抑制作用,由于tylP和tylQ本身具有“PARE”序列,也受到tylS啟動子的影響,因此,從tylP對tylQ的控制性上,一方面對tylS進行抑制,另一方面通過tylP的自調(diào)節(jié)作用來完成。也就是說,在泰樂菌素生產(chǎn)中,各過程的進行是不完整的,tylS在生產(chǎn)調(diào)節(jié)模式中的作用,可能是正相關(guān),也可能是負相關(guān)。盡管tylS含量會增加,但并不能推測,tylP對tylQ產(chǎn)生抑制作用。

        三、結(jié)語

        從抗生素生產(chǎn)控制來看,對于tylP作為調(diào)節(jié)多基因,與其他天然鏈霉菌一樣,對同源結(jié)合蛋白合成的影響需要進行再驗證?,F(xiàn)在來看,在灰色鏈霉菌生產(chǎn)中,ArpA作為單個靶啟動子,而對于GB-結(jié)合蛋白,對抗生素的生產(chǎn)是否有別的影響。我們通過對抗生素合成期間各調(diào)節(jié)單元之間的關(guān)系進行探討,可以得出基本結(jié)論??股厣a(chǎn)過程中,各基因組可能依據(jù)各自的調(diào)節(jié)階段,共同參與到抗生素的合成中,至于各基因組在具體形成及相互作用中的變化,更需要從詳細的試驗中來梳理。

        參考文獻:

        [1]Miaomiao Liu,Yu Zhang,Ran Ding,Yingxin Gao,Min Yang.Response of activated sludge to the treatment of oxytetracycline production waste stream[J]. Applied Microbiology and Biotechnology . 2013 (19).

        [2]李增波,薛泉宏,梁軍鋒.利用放線菌固態(tài)發(fā)酵生產(chǎn)農(nóng)用抗生素的初步研究[J]. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(08).

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