孫新新,鄭家珍,王艷青,蔡世玉,陳雷剛(河北大學(xué)生命科學(xué)院,河北保定071200)
多聚羥基脂肪酸酯(Polyhydroxyalkanoates,PHA)是一類廣泛存在于微生物細(xì)胞內(nèi)的高分子生物聚酯,一般主要作為碳源和能量的貯藏物質(zhì)[1]。目前,已發(fā)現(xiàn)PHAs至少有150種不同的單體結(jié)構(gòu)。PHA的單體結(jié)構(gòu)也多種多樣,其中3-羥基脂肪酸單體包括3-羥基丙酸到3-羥基十六酸的所有成員,還有4-、5-、6-羥基脂肪酸以及含有不飽和鍵、帶有甲基側(cè)鏈或其他功能基團(tuán)的3-羥基脂肪酸作為PHA單體的情況[2]。PHAs生產(chǎn)的關(guān)鍵仍然是獲得高產(chǎn)、高轉(zhuǎn)化率的微生物菌株[3],所以從環(huán)境中篩選出高產(chǎn)野生菌株是研究工作的熱點(diǎn)。目前研究最廣泛的是真養(yǎng)產(chǎn)堿桿菌(Alcaligenes eutropbus)。
聚3-羥基丁酸酯(Polyhydroxybutyrate,PHB)是結(jié)構(gòu)最簡單的PHA成員。1925年Lemoigne[4]首先發(fā)現(xiàn)了聚β-羥基丁酸(PHB)。它具有機(jī)械性能非常類似于傳統(tǒng)的塑料如聚丙烯或聚乙烯,可擠出,模制,紡成纖維,制成薄膜,并與其他合成的聚合物組成雜聚物[5]。它既可以替代石化塑料制作生產(chǎn)與生活用品,又可以作為醫(yī)用材料(如心臟瓣膜、人造血管、縫合線、藥物緩釋與軟組織修復(fù))[6],還是醫(yī)學(xué)組織工程中克隆器官的優(yōu)良支架材料。筆者以苜蓿含羞草根瘤菌以及根際土壤菌為研究材料,通過革蘭氏染色、蘇丹黑染色,篩選得到一株菌為227。
1.1 菌株
1.1.1 菌種來源。海南、廣東、廣西、福建自含羞草分離的根瘤菌株,云南祿豐南苜蓿根瘤菌及獲得的根瘤內(nèi)生菌。
1.1.2 培養(yǎng)基與試劑。YMA培養(yǎng)基組成為:KH2PO40.25 g,K2HPO40.25 g,NaCl 0.1 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,甘露醇10 g,酵母粉0.8 g,瓊脂15 ~18 g,pH 6.5 ~7.0。種子培養(yǎng)基組成為:牛肉膏3 g,蛋白胨10 g,NaCl 5 g,pH 7.0 ~7.2。發(fā)酵培養(yǎng)基組成為:葡萄糖30 g,(NH4)2SO43 g,KH2PO4·12H2O 0.61 g,CaCl20.1 g,K2HPO40.3 g,酵母粉 1 g,HBO35 g/L,Na2MoO45 g/L 4 ml,pH 7.0[7]。PHB 標(biāo)準(zhǔn)品由中國農(nóng)業(yè)大學(xué)提供。稱取3 g蘇丹黑B顆粒(西德serva進(jìn)口分裝),溶到100 ml濃度70%的乙醇中[8],得蘇丹黑B染液。
1.2 方法
1.2.1 活化菌株。將保存的甘油管菌株活化到Y(jié)MA固體培養(yǎng)基,平板倒置28℃培養(yǎng)1~2 d。
1.2.2 初篩。將菌株活化后重新編號1~2 000,轉(zhuǎn)接到Y(jié)MA固體培養(yǎng)基的培養(yǎng)皿中,于28℃培養(yǎng)24~48 h后進(jìn)行革蘭氏染色。
1.2.3 復(fù)篩。采用蘇丹黑染色法將少許細(xì)菌熱固定于載玻片上后,用3 g/L蘇丹黑乙醇溶液染色10~15 min,二甲苯浸泡脫色,再用5 g/L番紅水溶液復(fù)染,置油鏡下觀察,PHB顆粒呈藍(lán)黑色,菌體呈紅色[8]。
1.2.4 PHA的提取。從試管中取一環(huán)菌接種到10 ml發(fā)酵管中,培養(yǎng)20 h。發(fā)酵培養(yǎng)基的裝液量為76 ml,取培養(yǎng)好的種子培養(yǎng)液4 ml,接種量為5%,培養(yǎng)40 h。將發(fā)酵液以8 000 r/min離心10 min,蒸餾水洗滌、離心,然后冰凍備用。將離心獲得的濕菌體懸浮于45 ml蒸餾水中,加入濃度10%NaClO溶液5 ml、濃度10%SDS 5 ml,使其總體積為50 ml,在35 ℃的恒溫水浴中攪拌處理10 min。將處理后的菌液8 000 r/min離心10 min,所獲得的沉淀用蒸餾水和丙酮各洗滌1次,烘干,按照10 ml氯仿/0.2 g干菌體的比例加入氯仿,抽提,過濾,濾液蒸發(fā),除去氯仿,以析出PHB。將析出的PHB再分別用丙酮和乙醇洗滌1次,在60~70℃的條件下烘干,得到白色粉末或薄膜狀PHB[9]。
1.2.5 篩選菌株的確定。
1.2.5.1 GUTC 法提 DNA。用濃度0.9%生理鹽水收集 TY斜面上的菌,每個(gè)斜面取1 ml生理鹽水沖洗菌體,加入到EP管,12 000 r/min離心2 min,離心洗滌3次,棄上清液,加入600 μl GUTC 緩沖液振蕩、搖勻,室溫放置 15 min,12 000 r/min 2 min,棄上清液,加入60 μl硅藻土懸液振蕩,室溫放置 15 min,12 000 r/min 2 min,棄上清液,加入 500 μl GUTC緩沖液振蕩、搖勻,室溫放置15 min,12 000 r/min 2 min,棄上清液,加入600 μl洗滌緩沖液離心洗滌2次,12 000 r/min 2 min,棄上清,加入600 μl濃度75%乙醇離心洗滌1次,12 000 r/min 2 min,棄上清,在超凈工作臺干燥沉淀物(硅藻土變白),加入50 μl TEbuffer 55 ~65 ℃保溫5 ~7 min[10],離心收集上清液至小EP管中。
1.2.5.2 PCR 擴(kuò)增。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,56 ℃ 退火 30s,72 ℃ 延伸 90 s,72 ℃8 min,30 個(gè)循環(huán)。
2.1 初篩 初篩的結(jié)果見圖1。根據(jù)菌體中心未染色的面積的大小,篩得200株。
2.2 復(fù)篩 利用蘇丹黑B染色初篩得到的菌株的結(jié)果見圖2。菌體外圍泛紅、內(nèi)部可見明顯的藍(lán)黑色顆粒的菌株可能是產(chǎn)生PHAs的細(xì)菌,最后篩得一株P(guān)H產(chǎn)生菌。
2.3 菌株227的形態(tài)特征 菌株227桿狀,兩端鈍圓,無芽孢,革蘭氏陰性菌;細(xì)胞大小(0.5 ~0.9)μm ×(1.2 ~3.0)μm;PHB顆粒胞內(nèi)舍嗜蘇丹黑B顆粒,占細(xì)胞大部分空間;菌落濕潤光滑有光澤、邊緣整齊。
2.4 PHB的提取 提取后得到PHB干品,見圖3。
2.5 227菌株16s rDNA測序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)育的分析 測序結(jié)果如下:
將該序列已登陸到GeneBank,注冊號為HM582870.1。將227菌株的16S rDNA序列在NCBI進(jìn)行BLAST,所獲得的同源序列為根瘤菌的16S rDNA序列,其中相似性最高的為伯克霍爾德屬的菌株。227菌株與Burkholderia caribensis,Burkholderia hospita的同源性最高,均為98%,因此確定227菌株屬于伯克霍爾德屬。
(1)研究中,采用革蘭氏染色,進(jìn)行PHB產(chǎn)生菌的篩選。由于根瘤菌為革蘭氏陰性菌,菌體內(nèi)的酯類會呈現(xiàn)出中心亮點(diǎn),類似芽孢狀,呈不規(guī)則狀。經(jīng)蘇丹黑B染色,結(jié)合顯微鏡檢,選出PHB顆粒較大、生長較旺盛的菌株。該方法大大減少了篩選過程中的工作量,而且取得較好的效果。通過革蘭氏染色、蘇丹黑染色篩選得到的菌體更加準(zhǔn)確。
(2)經(jīng)初篩、復(fù)篩獲一高產(chǎn)PHB菌株227,胞內(nèi)積累大量的PHB顆粒,而且發(fā)酵周期短,為今后發(fā)酵條件的進(jìn)一步研究提供保證。
(3)在經(jīng)過生物學(xué)特征研究后,發(fā)現(xiàn)菌株227為伯克霍爾德屬(Burkholderia)。它是根瘤菌中初次發(fā)現(xiàn)的產(chǎn)PHB的菌株。因此,該研究為PHB的產(chǎn)業(yè)化提供了菌株資源,具有很好的應(yīng)用價(jià)值。
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