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        內(nèi)蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的分離鑒定

        2015-12-16 07:43:54劉紅新任艷張冬蕾楊彥榮劉文俊孫天松
        中國(guó)乳品工業(yè) 2015年10期
        關(guān)鍵詞:馬奶錫林郭勒乳酸菌

        劉紅新,任艷,張冬蕾,楊彥榮,劉文俊,孫天松

        (內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,呼和浩特010018)

        0 引言

        酸馬奶(koumiss)是中亞地區(qū)傳統(tǒng)的發(fā)酵馬乳飲料,又稱“馬奶酒”[1]。它以新鮮馬奶為原料,經(jīng)乳酸菌和酵母菌共同發(fā)酵而成,具有獨(dú)特的風(fēng)味和豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值[2]。蒙醫(yī)藥典中也曾記載酸馬奶能開(kāi)胃、祛濕、解毒潤(rùn)膚等功效[3]。酸馬奶之所以具有與馬奶不同的功效,主要由于其微生物菌群以酵母菌群和乳酸菌群為主。乳酸菌是指發(fā)酵碳水化合物產(chǎn)生乳酸的一類革蘭氏陽(yáng)性、不產(chǎn)芽孢、過(guò)氧化氫酶陰性的一類細(xì)菌的總稱[4],在人體內(nèi)具有諸多益生作用[5]。

        本研究采用實(shí)驗(yàn)室純培養(yǎng)的方法分離、鑒定錫林郭勒地區(qū)傳統(tǒng)酸馬奶中的乳酸菌,通過(guò)16S rDNA序列分析的方法對(duì)乳酸菌分離株進(jìn)行鑒定,并分析其優(yōu)勢(shì)菌群,保護(hù)我國(guó)益生菌資源,為傳統(tǒng)酸馬奶的篩選和開(kāi)發(fā)利用提供參考。

        1 實(shí)驗(yàn)

        1.1 材料

        1.1.1 樣品來(lái)源

        本研究中27份酸馬奶樣品由實(shí)驗(yàn)室的研究人員于2014年7月16日—2014年7月18日在內(nèi)蒙古錫林郭勒的不同地區(qū)采集。樣品采集后低溫保存,帶回實(shí)驗(yàn)室于-80℃超低溫保藏,進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

        1.1.2 培養(yǎng)基與試劑

        培養(yǎng)基:MRS固體培養(yǎng)基,MRS液體培養(yǎng)基,M17固體培養(yǎng)基,M17液體培養(yǎng)基。

        實(shí)驗(yàn)所用試劑:PBS保護(hù)液,PBS緩沖液,脫脂乳保護(hù)劑,提取DNA所用試劑,PCR擴(kuò)增和電泳檢測(cè)所用試劑[6]。

        1.1.3 儀器與設(shè)備

        便攜式冰箱,溫度計(jì),便攜式PH計(jì),采樣箱等。

        ZHJH-C1214C型超凈工作臺(tái),TGL-168高速臺(tái)式離心機(jī),HWS28型電熱恒溫水浴鍋,AR2202CN型電子天平,KDC-1044型低速離心機(jī),LRH-250生化培養(yǎng)箱,BX50型光學(xué)顯微鏡,HA-300M型全自動(dòng)高壓蒸汽滅菌器,SP-650型全自動(dòng)高壓干熱滅菌器,WD-9405B型水平搖床,LL-6SFPY型真空冷凍干燥機(jī),PTC-200梯度基因擴(kuò)增儀;DYY-12型電泳儀,GDS-8000型凝膠成像儀,ND-1000型微量紫外分光光度計(jì)等。

        1.2 方法

        1.2.1 樣品采集

        本試驗(yàn)在采集乳樣品時(shí)采用直接取樣法。先將容器中的發(fā)酵乳制品充分混勻,再用移液槍吸取1.5 mL樣品至裝有滅菌中和劑(內(nèi)含0.5 g,CaCO3:淀粉=1∶50,質(zhì)量比)的2.5 mL無(wú)菌螺口凍存管中,混勻后標(biāo)記樣品號(hào)并作記錄,封口保存。最后將采集的乳樣置于4℃便攜式冰箱中以維持其低溫狀態(tài),盡快帶回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行乳酸菌的分離純化等實(shí)驗(yàn)。

        1.2.2 樣品中乳酸菌的計(jì)數(shù)

        乳酸菌計(jì)數(shù)根據(jù)參考文獻(xiàn)[7]采用傾注培養(yǎng)法。計(jì)數(shù)即為每mL樣品的菌落數(shù)。

        1.2.3 樣品中乳酸菌的分離純化及保存

        分別吸取 0.2 mL稀釋度為10-5,10-6,10-7稀釋液于MRS固體培養(yǎng)基上涂布后置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中厭氧培養(yǎng)48 h,待菌落形成后,隨機(jī)挑取形態(tài)學(xué)特征各不相同的單個(gè)菌落于相應(yīng)的液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24 h。將不純的菌株在MRS固體培養(yǎng)基上劃線分離,37℃培養(yǎng)48 h,如此反復(fù)2~3次,直至鏡檢結(jié)果為純的單菌后編號(hào)并接種于相應(yīng)液體培養(yǎng)基進(jìn)行擴(kuò)培和傳代。

        選取過(guò)氧化氫陰性、革蘭氏陽(yáng)性的純培養(yǎng)物,將此培養(yǎng)物暫定為乳酸菌,加入質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%谷氨酸鈉的脫脂乳保護(hù)劑,混勻后置于-80℃保存?zhèn)溆?。同時(shí),另一份樣品進(jìn)行DNA提取和后續(xù)鑒定實(shí)驗(yàn)。

        1.3 16S rDNA序列分析

        1.3.1 總DNA的提取及純度的檢測(cè)

        采用液氮反復(fù)凍融-CTAB法提取乳酸菌基因組DNA[8]。再用ND-1000型微量紫外分光光度計(jì)測(cè)其濃度以及OD260/280值。再用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

        1.3.2 16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增

        16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增引物序列為

        FA-27F:5'-GCAGAGTTCTCGGAGTCACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',

        RA-1495R:5'-AGCGGATCACTTCACACAGGACTACGGCTACCTTGTTACGA-3'[9]。

        PCR擴(kuò)增體系(模板為上述DNA稀釋液):5 μL10×EasyTaq Buffer(+Mg2+);4 μL High Pure dNTPs(2.5 mmol/L);1.5 μL 引物 FA-27F(濃度 10 mmol/L);1.5 μL 引 物 RA-1495R(10 mmol/L);0.5 μL EasyTaq DNA polymerase(5 U/μL);2 μL DNA 模板(質(zhì)量濃度100 ng/μL);35.5 μL ddH2O。

        PCR擴(kuò)增循環(huán)參數(shù)為:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,58 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,30個(gè)循環(huán);72℃末端延伸10 min。

        擴(kuò)增完畢后,取約2 μL的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),若在1 500 bp處有清晰的擴(kuò)增條帶且無(wú)拖尾、彌散現(xiàn)象,則PCR擴(kuò)增成功[10]。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送往上海美吉生物公司進(jìn)行純化和DNA測(cè)序。

        1.4 同源性分析

        將測(cè)序得到的DNA序列運(yùn)用SeqMan(DNAStar 5.01)軟件進(jìn)行序列拼接后,再利用NCBI中的BLAST將拼接好的序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中已鑒定的乳酸菌16S rDNA序列進(jìn)行同源性分析,將待鑒定菌株序列與同源性最高的模式菌株序列應(yīng)用MEGA 4.0(http://www.megasoftware.net)軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),進(jìn)行遺傳進(jìn)化研究。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 乳酸菌分離株的菌落形態(tài)及細(xì)胞形態(tài)特征

        根據(jù)乳酸菌的形態(tài)學(xué)特征[11-12],初步從27個(gè)酸馬奶樣品中共分離出83株疑似乳酸菌的菌株。經(jīng)過(guò)革蘭氏染色、過(guò)氧化氫酶反應(yīng),均為革蘭氏陽(yáng)性,過(guò)氧化氫陰性菌[13]。初步將83株菌定為乳酸菌。

        2.2 乳酸菌計(jì)數(shù)結(jié)果

        錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的活菌數(shù)如表1所示。

        由表1可以看出,酸馬奶樣品中乳酸菌數(shù)在4.44~8.99 mL-1(對(duì)數(shù)值)之間。平均值為(6.09±0.13)mL-1(對(duì)數(shù)值)。其中XM3,XM4,XM14等樣品中乳酸菌活菌數(shù)低于106/mL-1,低于酸奶國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)。大部分菌株的活菌數(shù)高于106mL-1,符合新的酸奶國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)和國(guó)家衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn),有利于進(jìn)一步分離與研究。由于本次采樣,并未按照特定時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行,是隨機(jī)采樣,有的地點(diǎn)樣品發(fā)酵和貯藏時(shí)間長(zhǎng),有的樣品發(fā)酵和貯藏時(shí)間短,所以其中乳酸菌活菌數(shù)量存在較大差異。李道敏,劉開(kāi)永等人[14]對(duì)木糖醇酸奶發(fā)酵、貯藏期間質(zhì)量變化做過(guò)研究,閆志國(guó)[15]對(duì)發(fā)酵乳在貯藏期間的理化性質(zhì)的變化也做過(guò)詳細(xì)報(bào)道,均闡述自然發(fā)酵乳制品中微生物隨著發(fā)酵和貯藏時(shí)間的延長(zhǎng),乳酸菌種屬和數(shù)量有較大的變化。

        表1 內(nèi)蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌計(jì)數(shù)結(jié)果 mL-1

        2.3 乳酸菌分離鑒定結(jié)果

        2.3.1 DNA提取和PCR擴(kuò)增結(jié)果

        DNA濃度和OD260/280值的測(cè)定:提取83株乳酸菌的DNA并測(cè)其濃度以及OD260/280值,OD260/280值在1.8~2.0之間即為純DNA樣品。將DNA原液稀釋至濃度為100 ng/μL后進(jìn)行16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增結(jié)果經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,可以觀察到在大約1 500 bp的位置處有一條清晰明亮的條帶,并且無(wú)拖尾、彌散現(xiàn)象,未發(fā)現(xiàn)明顯非特異擴(kuò)增現(xiàn)象,說(shuō)明分析菌株的16S rRNA基因擴(kuò)增成功。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送于上海美吉生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。

        圖1 部分分離菌DNA瓊脂糖凝膠電泳

        2.3.2 16S rRNA基因同源性比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建

        將測(cè)序獲得的16S rRNA基因序列通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST進(jìn)行同源序列比對(duì)分析,若同源性高于99%則可直接將其歸為此種模式株菌種,選取部分具有代表性的菌株用 MEGA 4.0(http://www.megasoftware.net)軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。分離株與模式株系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)見(jiàn)圖2(選取部分作圖):

        圖2 內(nèi)蒙古錫林郭勒地區(qū)代表性分離株的16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

        由圖2可以看出,所有分離株聚為2個(gè)大的類群,一個(gè)類群為桿菌,一個(gè)類群為球菌,IMAU11650(KR858843)與模式菌Enterococcus durans ATCC19432(AJ276354)聚為一類,同源性分別為100%,將其鑒定為 Enterococcus durans。IMAU11655(KR858848)與模式菌Enterococcus faecium ATCC19434(AJ301830)聚為一類,同源性為100%,因此將歸其為Enterococcus faecium。IMAU11642(KR858836)與模式菌Enterococcus devriesei CCM7299(AJ891167)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為Enterococcus devriesei。IMAU11152(KR858806)與模式菌Enterococcus faecalis JCM5803(AB012212)聚為一類,同源性為100%,故鑒定為Enterococcus faecalis。IMAU11668(KR858860)與模式菌Enterococcus italicus DSM 15952(AJ582753)聚為一類,同源性為 100%,故將其鑒定為Enterococcusitalicus。IMAU11124(KR858778)與模式菌Lactococcus lactis subsp.lactis ATCC19435(AB100803)聚為一類,同源性為100%,故鑒定為L(zhǎng)actococcus lactis subsp.Lactis。IMAU11138(KR858792)與模式菌Streptococcus parauberis DSM6631(AY584477)聚為一類,同源性為99%,故將其歸為為Streptococcus parauberis。IMAU11641(KR858835)與模式菌Lactobacillus plantarum ATCC14917(AJ965482)聚為一類,同源性為100%,故將其鑒定為L(zhǎng)actobacillus plantarum。IMAU11674(KR858866)與模式菌Lactobacillus diolivorans DSM14421(AF264701)聚為一類,同源性為100%,故將其鑒定為L(zhǎng)actobacillusdiolivorans。IMAU11656(KR858849)與Lactobacillus casei ATCC393(AF469172)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為L(zhǎng)actobacillus casei。 IMAU11657(KR858850)與模式菌Lactobacillus paracasei ATCC25302(D79212)聚為一類,同源性為100%,因此將其鑒定為L(zhǎng)actobacillus paracasei。IMAU11644(KR858838)與模式菌Lactobacillus helveticus ATCC15009(AM113779)聚為一類,同源性分別為99%,故鑒定為 Lactobacillus helveticus。IMAU11126(KR858780)與模式菌 Lactobacillus kefiranofaciensDSM 5016(AM113781)聚為一類,同源性為99%故,將其鑒定為L(zhǎng)actobacillus kefiranofaciens。IMAU11158(KR858812)與模式菌 Leuconostoc pseudomesenteroides ATCC12291(AB023237)聚為一類,同源性分別為99%,故鑒定為L(zhǎng)euconostoc pseudomesenteroides。IMAU 11125(KR858779)與模式菌Leuconostoc mesenteroides NCFB529(AB023244)聚為一類,同源性為99%,故將其鑒定為L(zhǎng)euconostoc mesenteroides。根據(jù)16S rDNA序列分析,分離的83株菌中,49株菌與模式菌株的同源性達(dá)到99%,34株菌與模式菌株的同源性達(dá)到100%。

        2.4 錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的優(yōu)勢(shì)菌種分析

        乳酸菌的分布結(jié)果如表2所示。

        表2 內(nèi)蒙古錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中乳酸菌的分離結(jié)果

        由表2可以看出,27份酸馬奶樣品中分離出的83株乳酸菌疑似菌株,經(jīng)16S rDNA序列測(cè)定和同源性分析鑒定,分屬于5個(gè)屬15個(gè)種或亞種。其中錫林郭勒地區(qū)的優(yōu)勢(shì)菌群為L(zhǎng)actococcus lactis subsp.lactis,占總分離株的34%。近幾年,孫天松[16]等人對(duì)新疆地區(qū)酸馬奶進(jìn)行分離鑒定,其優(yōu)勢(shì)菌種為L(zhǎng)actobacillus helveticus。劉芳、都立輝[17]等人對(duì)內(nèi)蒙古酸馬奶多樣性進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)Lactococcus lactis為優(yōu)勢(shì)菌群。魏艷、曾小群[18]等人對(duì)新疆酸馬奶中乳酸菌分離鑒定,結(jié)果表明優(yōu)勢(shì)菌群為發(fā)酵乳桿菌和干酪乳桿菌。由此可見(jiàn)不同地區(qū)酸馬奶優(yōu)勢(shì)菌種不同,即使同一地區(qū)采樣時(shí)間、貯藏時(shí)間不同,結(jié)果也會(huì)有差異。

        3 結(jié)論

        本研究對(duì)27份錫林郭勒地區(qū)酸馬奶樣品進(jìn)行乳酸菌的分離鑒定,共分離出83株乳酸菌。通過(guò)16S rDNA序列同源性分析,將83株乳酸菌鑒定為5個(gè)屬,15個(gè)種或亞種,分別屬于乳桿菌屬、乳球菌屬、明串珠菌屬、腸球菌屬、鏈球菌屬。其中Lactococcus lactis subsp.Lactis為錫林郭勒地區(qū)酸馬奶中的優(yōu)勢(shì)菌種,占總分離株的34%。

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