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        人LC3B基因的真核表達及鑒定

        2015-11-29 08:31:44董倩徐小潔紀貝貝范忠義梁迎春王濤葉棋濃胡毅
        生物技術(shù)通訊 2015年5期
        關(guān)鍵詞:溶酶體印跡培養(yǎng)液

        董倩 ,徐小潔,紀貝貝,范忠義,梁迎春,王濤,葉棋濃,胡毅

        1.解放軍總醫(yī)院 腫瘤內(nèi)一科,北京 100853;2.軍事醫(yī)學科學院 生物工程研究所,北京 100850

        自噬是真核生物細胞內(nèi)特有的一種“自食”的現(xiàn)象。目前普遍認為自噬是一種應激調(diào)控和防御機制,其實質(zhì)是細胞通過胞內(nèi)降解來維持細胞穩(wěn)態(tài)的過程[1],即雙層膜包裹部分胞質(zhì)、細胞內(nèi)需要降解的大分子物質(zhì)(如錯誤折疊的蛋白質(zhì))、細胞器(如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、線粒體)等形成自噬體,它再與附近的溶酶體融合形成自噬溶酶體,通過水解酶來降解所包裹的內(nèi)容物,產(chǎn)生氨基酸、ATP、核酸、脂肪酸、糖等來維持細胞生存[2-3]。研究發(fā)現(xiàn)自噬對腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及治療等具有多方面的影響[4],但其分子機制仍然在不斷探索中。

        自噬發(fā)生的重要生物學標志是微管相關(guān)蛋白LC3Ⅱ或LC3B。微管相關(guān)蛋白1 輕鏈3(microtubule associated protein 1 light chain 3,簡稱LC3)是酵母Atg8 的同源蛋白[5],可作為自噬發(fā)生的重要檢測標志之一[6]。已證實哺乳動物LC3 有LC3A、LC3B 和LC3C 共3 種亞型,各具有不同的功能[7],其中LC3B與自噬發(fā)生相關(guān),常被作為標記物。一般情況下,通過蛋白質(zhì)印跡及免疫熒光等實驗觀察LC3B蛋白水平的變化,可間接判斷自噬是否發(fā)生。在此,我們擬構(gòu)建LC3B 的真核表達載體,同時驗證LC3B的生物活性,為進一步探討細胞自噬奠定基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        人胚腎細胞293T、大腸桿菌DH5α、pcDNA3.0載體(本實驗室保存);HA Beads、HRP 標記的抗HA標簽鼠單克隆抗體(Sigma公司);VigoFect(威格拉斯生物技術(shù)有限公司);限制性內(nèi)切酶、DNA 連接酶、PCR 試劑(TaKaRa 公司);PCR 回收試劑盒、質(zhì)粒提取、膠回收試劑盒(Promega 公司);DMEM、小牛血清(Gibco公司);引物由北京賽百盛生物技術(shù)有限公司合成;測序由北京奧科生物技術(shù)有限責任公司完成。

        1.2 人LC3B基因編碼序列的擴增

        以人乳腺文庫為模板,根據(jù)文獻報道的LC3編碼序列設(shè)計上游引物(5'-CGGGATCCATGCCGTCGGAGA AGACCTTCA-3')和下游引物(5'-CGGAATTCTTACAC TGACAATTTCATCC-3'),并在上、下游引物中分別引入BamHⅠ、EcoRⅠ酶切位點,按以下條件PCR擴增人LC3B的編碼序列:預變性(95℃,5 min);變性(95℃,30 s)、退火(56℃,30 s)、延伸(72℃,30 s),30個循環(huán);延伸(72℃,7 min)。擴增產(chǎn)物于4℃保存,經(jīng)10 g/L瓊脂糖凝膠電泳后,用DNA膠回收試劑盒回收目的片段。

        1.3 HA-LC3B重組質(zhì)粒的構(gòu)建和鑒定

        回收擴增產(chǎn)物,用BamHⅠ和EcoRⅠ雙酶切,暴露出帶有粘性的末端,用T4DNA 連接酶于16℃將PCR 回收片段與載體pcDNA3.0-HA 進行連接過夜,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,于選擇性LB 固體培養(yǎng)基(含氨芐西林)上生長,隨機挑克隆,37℃培養(yǎng),取微量菌液保存,剩余菌液提取質(zhì)粒,并用BamHⅠ和EcoRⅠ雙酶切鑒定,酶切產(chǎn)物于20 g/L 瓊脂糖凝膠中電泳,約400 bp 處有條帶者表明目的片段插入成功,構(gòu)建成功的克隆由北京奧科生物公司測序。

        1.4 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染和Western印跡檢測

        按本實驗室方法進行轉(zhuǎn)染。293T 細胞于含1‰雙抗、10%胎牛血清的DMEM 培養(yǎng)液中培養(yǎng),將其接種于6 cm 皿中,于37℃、5% CO2細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h 后進行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染時以細胞密度達到80%~90%為宜,轉(zhuǎn)染前1 h 換液。將重組質(zhì)粒(5 μg)與NaCl(200 μL)混合,VigoFect 與NaCl 混合5 min,再將以上2種溶液混勻,室溫靜置15 min,把混合物加到已接種293T 細胞的6 cm 皿中,同時轉(zhuǎn)染空載體pcDNA3.0-HA 作為對照組,于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),4~6 h 后更換為正常DMEM 培養(yǎng)液,24 h 后收集細胞,用1×PBS 洗1 次,室溫3000 r/min 離心5 min,吸棄上清,將上樣緩沖液(2×SDS)加入沉淀中,沸水浴15 min,室溫12 000 r/min 離心2 min,上清液經(jīng)SDS-PAGE 后電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,用脫脂奶粉(5%)封閉1 h,加入HRP 標記的抗HA 標簽鼠單克隆抗體,室溫孵育1 h,TBST 洗膜3 次,每次5 min,化學發(fā)光法顯色3 min,暗室壓片顯影。

        1.5 細胞免疫共沉淀實驗

        293T 細胞培養(yǎng)于含1‰雙抗、10%胎牛血清的DMEM 培養(yǎng)液中,接種于6 cm 皿,分別將空載體HA+Flag-Atg4B、重組質(zhì)粒HA-LC3B 與Flag-Atg4B共轉(zhuǎn)染其中,于37℃、5% CO2細胞培養(yǎng)箱中,4~6 h后更換為正常DMEM 培養(yǎng)液,24 h 后收集細胞,用1×PBS洗1次,加入用0.5 mL 1×PBS刮下的細胞,收集入EP 管,4℃、3000 r/min 離心5 min,棄上清,加入0.5 mL 中鹽IP 緩沖液混勻細胞,置冰上30 min,于冰上行超聲波裂解,4℃、12 000 r/min 離心10 min,取上清與HA Beads 于4℃旋轉(zhuǎn)結(jié)合4 h 以上,4℃、3000 r/min 離心5 min,棄上清,再次用中鹽IP緩沖液漂洗,加入與HA Beads 等量的上樣緩沖液(2×SDS),煮沸15 min,12 000 r/min 離心2 min,上清液經(jīng)SDS-PAGE 后電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,用脫脂奶粉(5%)封閉1 h,加入HRP 標記的抗HA 標簽鼠單克隆抗體,室溫孵育1 h,TBST 洗膜3 次,每次5 min,化學發(fā)光法顯色3 min,暗室壓片顯影。

        2 結(jié)果

        2.1 人LC3B編碼序列的克隆

        以人乳腺文庫為模板PCR 擴增LC3B 的編碼序列,獲得目的片段約400 bp,與預期相符(圖1)。

        2.2 重組質(zhì)粒HA-LC3B的構(gòu)建與鑒定

        用BamHⅠ和EcoRⅠ酶切重組質(zhì)粒HA-LC3B,經(jīng)10 g/L 瓊脂糖電泳后顯示2 條片段,其中一條約400 bp,而酶切空載體只出現(xiàn)1 條片段,與預期結(jié)果相符(圖2)。重組質(zhì)粒的測序顯示插入片段的DNA序列與人LC3B基因的編碼序列完全一致,從而證明重組質(zhì)粒HA-LC3B構(gòu)建成功(序列略)。

        2.3 Western印跡檢測融合蛋白的表達

        圖1 目的基因LC3B的PCR擴增

        將構(gòu)建的重組質(zhì)粒HA-LC3B 和空載體分別轉(zhuǎn)染293T 細胞,4~6 h 后更換為正常DMEM 培養(yǎng)液,24 h后提取細胞蛋白,行SDS-PAGE 檢測HA-LC3B蛋白的表達。結(jié)果顯示,對293T 細胞轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒HA-LC3B 后,用HA-HRP 抗體,在相對分子質(zhì)量約16×103處可見明顯的特異性條帶,表明重組蛋白HA-LC3B能在293T細胞中正確表達(圖3)。

        2.4 細胞免疫共沉淀實驗結(jié)果

        據(jù)報道LC3B 可與Atg4B 蛋白相互作用[8],據(jù)此可檢測HA-LC3B 融合蛋白的生物學活性。細胞免疫共沉淀實驗結(jié)果表明,在符合Atg4B 蛋白(相對分子質(zhì)量約47 000)的位置顯示特異性條帶(圖4),而HA 空載體蛋白在同一位置無條帶,說明HA-LC3B蛋白與Atg4B 蛋白能特異地相互作用,且其結(jié)構(gòu)及生物學功能并不受HA標簽的影響。

        3 討論

        上世紀50 年代,de Duve 通過電鏡觀察到自噬體結(jié)構(gòu)[9]。自噬現(xiàn)象對于細胞生長是柄雙刃劍,過多或過少都會影響細胞生長。細胞自噬是一個動態(tài)發(fā)展的過程,由一系列自噬相關(guān)蛋白(Atg 蛋白)介導完成[10],其中Atg8 泛素樣蛋白修飾過程對自噬體的形成必不可少[11]。LC3 是在哺乳動物細胞中發(fā)現(xiàn)的酵母Atg8 的同源體,分為Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型位于胞質(zhì)中,為可溶性蛋白,Ⅱ型則位于自噬體膜上。在自噬過程中,LC3Ⅰ與磷脂酰乙醇胺結(jié)合后形成LC3Ⅱ即LC3B,被聚集招募結(jié)合于自噬體膜上。自噬體與溶酶體融合形成自噬溶酶體,LC3B 在自噬溶酶體內(nèi)將被降解。LC3B 的含量與自噬體的數(shù)量成正相關(guān),因此,細胞中LC3B的含量變化可以直接反映自噬的發(fā)生過程[12]。已知人類LC3的3種亞型中LC3B與自噬密切相關(guān)[7],利用生化技術(shù)如Western 印跡檢測LC3B 水平常作為監(jiān)測自噬水平的有效方法[10,13-14]。同時,在自噬過程中Atg4B的作用也不容忽視[15]。

        圖2 重組質(zhì)粒HA-LC3B的BamHⅠ/EcoRⅠ雙酶切電泳圖譜

        圖3 Western印跡檢測融合蛋白HA-LC3B的表達

        圖4 細胞免疫共沉淀實驗檢測HA-LC3B和Atg4B的相互作用

        綜上,我們構(gòu)建了HA-LC3B 真核表達載體,并證實Atg4B 可與LC3B 相互作用。LC3B 在真核細胞中的成功表達,為今后研究細胞自噬奠定了基礎(chǔ)。

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