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        淺析PCR技術(shù)的原理及食品檢測應(yīng)用

        2015-05-30 10:48:04熊娟蔡大川張志軍黃啟紅
        中外食品工業(yè) 2015年1期
        關(guān)鍵詞:食品檢驗應(yīng)用

        熊娟 蔡大川 張志軍 黃啟紅

        摘要:上世紀(jì)80年代中期,分子生物學(xué)領(lǐng)域誕生了一項新技術(shù),稱作DNA體外擴增法,簡稱為PCR技術(shù)。該技術(shù)具有特異性強、靈敏度高、擴增快速準(zhǔn)確等優(yōu)點,自誕生之日起,其實用性在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)、食品檢驗等領(lǐng)域得到了很好的印證。本文重點介紹一下PCR技術(shù)在食品檢驗中的應(yīng)用。

        關(guān)鍵詞:PCR 原理與技術(shù) 食品檢驗 應(yīng)用

        中圖分類號:TS207 文獻標(biāo)識碼:A 文章編號:1672-5336(2015)02-0038-01

        1 引言

        上世紀(jì)80年代中期,分子生物學(xué)領(lǐng)域誕生了一項新技術(shù),稱作DNA體外擴增法,簡稱為PCR技術(shù)。其基本原理是在生物體的體外,對指定DNA雙鏈片斷進行擴增。第一步:挑選出指定DNA雙鏈片斷,人工合成指定DNA雙鏈片斷端頭鄰近序列互補的寡核苷酸片斷,將該互補片段稱作引物(Primer),引物也是雙鏈結(jié)構(gòu),分作左端引物和右端引物。第二步:加熱指定DNA雙鏈片斷,使之發(fā)生變性,分裂成單鏈,把左右引物與之分別配對進行互補結(jié)合。第三步:在DNA聚合酶和4種dNTPs底物的共同作用下,引物沿模板DNA鏈按5/→3/方向延伸,合成DNA雙鏈,這個步驟被稱為DNA多聚酶鏈反應(yīng)。第四步:以新合成的DNA雙鏈作為擴增模板,重復(fù)DNA多聚酶鏈反應(yīng)步驟。歷經(jīng)25~35次循環(huán),可將DNA序列擴增到近百萬倍。該技術(shù)具有特異性強、靈敏度高、擴增快速準(zhǔn)確等優(yōu)點,自誕生之日起,其實用性在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)、食品檢驗等領(lǐng)域得到了很好的印證。

        2 PCR技術(shù)在食品檢測方面的應(yīng)用

        2.1 PCR技術(shù)的檢測原理

        PCR技術(shù)最根本的鑒定依據(jù)是生物的DNA結(jié)構(gòu)具有唯一性。在食品檢測中,起到鑒定標(biāo)準(zhǔn)模板作用的是引物,從理論上說,①如果引物來自DNA保守區(qū),則在擴增之后,所有被檢測對象都含有DNA保守區(qū)的片段;②如果引物來自DNA特異區(qū),則在擴增之后,所有被檢測對象都含有DNA特異區(qū)的片段。以上兩種理論依據(jù)就是PCR技術(shù)的檢測原理。

        在實際應(yīng)用中,人工有選擇地截取DNA片段,使用DNA多聚酶鏈反應(yīng),可以在2~3小時之內(nèi)達到常規(guī)檢測需要數(shù)天才能達到的培養(yǎng)效果,另外還省去了繁瑣的種屬鑒定等工作,簡化了檢測流程。

        2.2 PCR技術(shù)的操作程序

        (1)待檢樣品的濃集(增菌)。食品中待檢的微生物群落濃度一般都是比較低的,達不到檢測要求。這就需要進行待檢微生物的濃集。

        (2)核酸的提取。為了實現(xiàn)PCR擴增,必須提取待檢樣品的核酸。常用的處理方法包括:加熱、反復(fù)凍融、化學(xué)裂解。

        (3)PCR擴增。在擴增過程中,最關(guān)鍵的莫過于引物,它直接關(guān)系到PCR檢測的成敗。擴增需要20—40個反應(yīng)循環(huán),每個循環(huán)都由高溫變性、低溫退火、適溫延伸組成。高溫時,氫鍵打開,雙鏈變?yōu)閱捂?,生成擴增模板;低溫時,左引物和右引物分別與模板DNA的2條單鏈做互補結(jié)合,完成配對;適溫時,在聚合酶作用下,4種三磷酸脫氧核苷(A、T、G、C)按堿基互補配對原則不斷進行配對添加,按5/→3/方向自動合成新的DNA雙鏈片段。

        變性溫度一般需保持在94℃左右,如果待擴增區(qū)域DNA的G+C含量太高,則可考慮適當(dāng)提高變性溫度。

        退火溫度與引物的G+C含量有關(guān),根據(jù)公式:Ta=4×(G+C)+2×(A+T)-5。

        延伸溫度一般需保持在72℃左右,此時DNA聚合酶的聚合速度約1000(堿基)/min。

        (4)擴增產(chǎn)物的檢測。常用的檢測方法為瓊脂糖凝膠電泳法,瓊脂糖質(zhì)量分?jǐn)?shù)在0.8%~2%之間。待分離DNA片斷的分子量越小,所需瓊脂糖質(zhì)量分?jǐn)?shù)則越大,反之亦然。

        3 PCR技術(shù)用于食品檢測的優(yōu)缺點

        3.1 PCR技術(shù)的優(yōu)點

        傳統(tǒng)檢測方法多采用平板培養(yǎng)法,通過菌落計數(shù)來判斷菌體濃度。傳統(tǒng)方法的優(yōu)點是操作簡單,其最大的缺點是消耗的時間太長,檢測周期一般在3——10天。

        PCR技術(shù)的最大優(yōu)點就是檢測速度快,使用特異區(qū)擴增檢測,只要在幾個小時內(nèi)成功擴增,即可檢驗并判斷出待檢測樣品的種類,非常迅捷、靈敏。

        3.2 PCR技術(shù)的缺點

        任何事物都不是完美的,PCR技術(shù)一樣存在缺點,正是這些缺點的存在,導(dǎo)致其不能完全取代傳統(tǒng)檢測法。其主要缺點包括:(1)假陽性問題。核酸受到污染而造成假陽性的問題,是PCR技術(shù)的最大缺點。這個缺點來自擴增本身,在擴增的過程中,即使只有一個污染源,結(jié)果也會出現(xiàn)成十萬成百萬倍的污染現(xiàn)象,造成檢測結(jié)果出現(xiàn)陽性,稱之為假陽性。

        防止假陽性問題,目前只有做好隔離這一種辦法。(2)假陰性問題。假陽性問題來自PCR技術(shù)本身,假陰性問題則來自待測樣品。食品成分復(fù)雜,其中多種成分發(fā)生了復(fù)雜的化學(xué)反應(yīng),不能排除模板液中帶有某種或某些抑制PCR反應(yīng)的成分。防止假陰性問題的辦法是設(shè)置陽性對照環(huán)節(jié)。(3)定量檢測困難。由于影響PCR產(chǎn)率的原因比較多,在定量檢測方面不能提供較為精準(zhǔn)的數(shù)據(jù),導(dǎo)致PCR技術(shù)無法勝任定量檢測。直至目前,尚沒有實質(zhì)性的突破與進展,限制了PCR技術(shù)在檢測方面的應(yīng)用范圍。

        4 結(jié)論

        PCR檢測有一定的局限性,但是,其高靈敏度的檢測反應(yīng)、明顯的特異性辨別、快速簡便的檢測流程,是其它檢測方法所不能替代的。相信隨著生物技術(shù)的快速進步,PCR檢測技術(shù)的應(yīng)用范圍會越來越廣泛。

        參考文獻

        [1]常玉華,仇農(nóng)學(xué).基于PCR技術(shù)快速檢測食品微生物的原理方法與應(yīng)用[J].農(nóng)產(chǎn)品加工,2011(11).

        [2]張澤民,李曼.PGR技術(shù)在轉(zhuǎn)基因食品檢測中的應(yīng)用與發(fā)展趨勢[J].農(nóng)牧產(chǎn)品工程,2011(7).

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