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        基于Cd2+脅迫的小桐子根系生長模型構(gòu)建與可視化仿真

        2015-04-29 21:26:08段曉凡等
        安徽農(nóng)業(yè)科學 2015年24期
        關(guān)鍵詞:脅迫

        段曉凡等

        摘要

        為探討Cd2+(鎘)脅迫對小桐子根系生長的影響,通過盆栽試驗研究Cd2+脅迫下小桐子根系生長情況,結(jié)合根系幾何拓撲結(jié)構(gòu)及根系幾何模型SimRoot,構(gòu)建 Cd2+脅迫下的小桐子根系生長模型,利用根系生長模擬系統(tǒng)對該模型進行可視化仿真,用實測結(jié)果對仿真結(jié)果進行驗證,結(jié)果顯示該模型可較好地反映小桐子根系在Cd2+脅迫下的生長情況。

        關(guān)鍵詞虛擬植物;Cd2+脅迫; 小桐子根系;生長模型;可視化仿真

        中圖分類號S126文獻標識碼A文章編號0517-6611(2015)24-271-03

        虛擬植物技術(shù)是采用計算機仿真技術(shù)來模擬植物在三維空間中生長的狀況[1],虛擬植物的研究涉及到植物的根、枝、葉等生長過程[2]。根作為植物從土壤環(huán)境中吸收水分、養(yǎng)分、礦物質(zhì)等的重要器官,研究其生長狀況有著非常重要的意義;但植物根系一般生長于地下,具有不可見性及復雜性,不能直接觀測到其生長狀況,借助于計算機圖形學技術(shù)對植物根系生長進行生長[3-5],可以更好地研究植物根系生長過程。

        小桐子也叫麻風樹(Jatropha carcas L.),是一種非常具有經(jīng)濟價值的生物柴油原料樹種。其根系生長旺盛,有利于緩解土壤退化、沙化以及森林的退化[6-7],研究其根系生長過程有著非常重要的意義。

        鎘(Cd)是一種重金屬,其濃度對許多植物的生長都有影響[8-10],同樣,其對小桐子的生長也有一定的影響。筆者為探討Cd2+脅迫對小桐子根系生長影響情況,通過盆栽試驗對小桐子根系各參數(shù)進行測量和分析,根據(jù)小桐子根系的幾何拓撲結(jié)構(gòu),應用根系幾何模型SimRoot,構(gòu)建Cd2+脅迫時小桐子根系生長模型,并應用小桐子根系可視化生長模擬系統(tǒng)進行虛擬仿真實驗。

        1試驗材料及試驗方案

        1.1試驗材料

        試驗采用盆栽方式,試驗于2013年4月~7月在昆明理工大學現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程學院智能控制溫室中進行,以小桐子幼苗為試驗材料。選取大小基本一致的小桐子種子若干,進行消毒處理后,置于人工培養(yǎng)箱培養(yǎng)至發(fā)芽,再用水培法培養(yǎng),至幼苗期改為盆栽試驗,移栽至溫室。培養(yǎng)一個月后,挑選生長狀況基本一致的小桐子進行不同的Cd2+脅迫處理。盆栽試驗使用直徑為15 cm,高為13 cm的塑料花盆,每盆均控制相同的土壤容重。移栽完成后所有盆內(nèi)均澆水至田間持水量。試驗期間管理措施保持一致,培養(yǎng)幼苗30 d,待其生長穩(wěn)定后開始盆栽試驗。

        1.2試驗方案設(shè)計

        試驗處理設(shè)置4個鎘脅迫梯度,Cd2+溶液用CdCl2配制:①0 mmol/L Cd2+(即對照實驗);②0.1 mmol/L;③0.2 mmol/L;④0.5 mmol/L。

        為了保證試驗的準確度,各梯度設(shè)10個重復處理。

        1.3 獲取測定參數(shù)

        從培育的小桐子幼苗中選取200盆長勢基本一致的小桐子進行不同濃度的鎘脅迫處理。試驗處理第一天,用濃度為0 mmol/L(即蒸餾水)、0.1 mmol/L、0.2 mmol/L及0.5 mmo/L的Cd2+(CdCl2溶液)澆灌至飽和,每5 d對小桐子幼苗進行取樣處理,測量其根長、分根數(shù)、根夾角等相關(guān)參數(shù)進行。

        2小桐子根系構(gòu)型及模型構(gòu)建

        2.1小桐子根系構(gòu)型

        小桐子根系如圖1所示。從圖中可以看出,小桐子的根系由主根、側(cè)根組成;主根較粗壯,向地下生長,起固定作用,除主根外,小桐子的根系還有向側(cè)面方向生長的一級側(cè)根,一級側(cè)根上另生長有二級側(cè)根和三級側(cè)根等。二級側(cè)根、三級側(cè)根相對于主根與一級側(cè)根,較細小,對植物生長意義不大,故該研究僅以主根與一級側(cè)根為研究對象。

        根據(jù)以上分析,可以確定小桐子的拓撲結(jié)構(gòu)為倒向的樹形拓撲[5],因此在描述小桐子根系的拓撲結(jié)構(gòu)時,使用倒向放置的樹形拓撲結(jié)構(gòu)進行分析。小桐子根系拓撲結(jié)構(gòu)見圖2。小桐子的拓撲結(jié)構(gòu)由根、主干和旁枝組成,主根由根起始節(jié)點開始沿軸向生長,每生長一段距離,會分生一條側(cè)根,經(jīng)過多次分生后,到根終止節(jié)點停止生長。側(cè)根生長規(guī)律與主根基本相似,從主根起始節(jié)點開始生長,生長期間不斷分生二級側(cè)根[11]。

        該研究依據(jù)小桐子根系的生長特點,定義了2種類型的根,分別為:0級(主根)、1級(一級側(cè)根)。采用11個參數(shù)對拓撲結(jié)構(gòu)和幾何結(jié)構(gòu)進行描述:根類型數(shù)量,根數(shù)、根系類型,首次分根長度,最大分根數(shù)目,分根長度間隔,首次分根時間,分根時間間隔,分根與主根的夾角,直徑生長參數(shù),是否規(guī)則拓撲。

        2.2小桐子根系模型構(gòu)建

        根據(jù)SimRoot模型[13],在構(gòu)建小桐子根系生長模型時,可以從根的生長 (RootGrowth)與分根(Rooting or Branching)兩方面來描述。

        2.2.1

        根的生長。根的生長模型包括:軸向生長、徑向生長及根尖生長方向3個參數(shù)。據(jù)Lungley等[14]提出的根的生長模型來建立相應數(shù)學模型。

        軸向生長模型如下:

        lsegment=α×ΔT

        (1)

        式中,α為根軸的軸向生長速率;ΔT為時間增量步長。

        徑向生長模型為:

        rsegment=α×l

        (2)

        式中,α為根徑向生長速率;l為根所求半徑位置的根段與根尖之間的距離長度。

        根尖生長方向模型為:

        DN=DN-1+DG+DN

        (3)

        式中,DN-1為上段根尖余弦方向;DG為α;DN為隨機方向系數(shù)。

        2.2.2

        分根。根據(jù)空間幾何知識,分根活動可以從分根時機及位置、分根數(shù)量、分根的初始生長方向3個方面來確定。

        分根時機及位置模型如下:

        Pnewroot=Pthissegment+[Lthissegment-(len-l)]×Dthissegment

        (4)

        式中, Pnewroot為新根空間坐標向量;Pthissegment為新根在父軸上的那段起始位置的空間坐標向量;Lthissegment為新根在父軸上那段距離基端的長度;Dthissegment為新根在父軸上那段的方向向量;len為生根位置距離陸父根基部的長度。

        分根數(shù)量模型為:

        k=N,(randbranch=0)

        k=N×rand(),(randbranch=1)

        (5)

        式中,N為最大分根數(shù)量。

        新根生長方向模型為:

        u″=R[u,α]×u′=R[u,α]×R[u,β]×u

        (6)

        式中,α為新根生長徑向角度;β為新根生長軸向角度。

        3Cd2+脅迫的小桐子根系可視化仿真

        將試驗獲取的具體數(shù)據(jù)帶入以上模型得到小桐子在各濃度Cd2+脅迫下的生長模型。將模型輸入根系模擬系統(tǒng)[12],設(shè)定生長時間后,得到Cd2+脅迫下的可視化生長仿真圖像。

        由圖3可知,隨著Cd2+濃度增加,根系生長速度及分根數(shù)量均減??;當Cd2+濃度達到0.5 mmol/L時,減小幅度明顯。

        4模型驗證

        為了驗證模型精度,將可視化仿真結(jié)果與培育30 d后各濃度Cd2+脅迫下小桐子根系主根長度進行對比,對模型進行驗證。

        表1為生長30 d時主根長度仿真結(jié)果與實測結(jié)果的對比。

        由表1可知,模型模擬主根長與實測值相比誤差較小,說明該模型可以較好地反映不同濃度Cd2+脅迫下小桐子根系的生長過程。

        5結(jié)論

        該研究通過在不同濃度Cd2+脅迫下對小桐子幼苗進行

        盆栽試驗,測量不同濃度Cd2+脅迫下的小桐子根系生長參

        數(shù),結(jié)果顯示,隨著Cd2+濃度增加,根系生長速度及分根數(shù)量均減小;當Cd2+濃度達到0.5 mmol/L時,減小幅度明顯;應用根系幾何模型SimRoot,構(gòu)建了不同濃度Cd2+脅迫下的小桐子根系生長模型,將該模型輸入前期開發(fā)的根系可視化模擬系統(tǒng),設(shè)定運行時間為30 d,對小桐子根系生長進行可視化仿真;將仿真結(jié)果與與實測結(jié)果進行對比,結(jié)果顯示,該模型可以較好地反映出Cd2+脅迫下小桐子根系的生長過程。

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