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        基于支持向量機的類風濕關(guān)節(jié)炎早期診斷模型構(gòu)建及其效果評價

        2015-03-10 02:19:48何蛟賈治林
        山東醫(yī)藥 2015年8期
        關(guān)鍵詞:診斷模型類風濕分類器

        何蛟,賈治林

        (大連醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,遼寧大連116011)

        類風濕關(guān)節(jié)炎(RA)是一種以關(guān)節(jié)滑膜炎癥為特征的慢性自身免疫性疾病,其可造成骨侵蝕和關(guān)節(jié)破壞,最終導(dǎo)致關(guān)節(jié)畸形[1]。該病目前診斷基于關(guān)節(jié)病變、血清抗體檢測、滑膜炎及急性期反應(yīng)物等指標,不利于疾病的早期診斷。支持向量機(SVM)是由Vapnik提出的一種基于統(tǒng)計學習理論和線性分類思想的學習方法[2],該方法已經(jīng)在圖像識別、信息處理和基因圖譜識別等方面[3,4]顯示了其良好的應(yīng)用效果。近年來,SVM已經(jīng)開始應(yīng)用于臨床預(yù)測診斷方面的研究。例如,在胎兒體質(zhì)量的預(yù)測[5]、鼻咽癌患者生存狀態(tài)的預(yù)測[6]、乳腺癌預(yù)后的預(yù)測[7]、人體血液微量元素含量輔助癌癥診斷[8]、腦梗死的預(yù)測[9]、非小細胞肺癌[10]以及肝細胞癌診斷中的研究[11]。本研究構(gòu)建基于SVM的RA早期診斷模型,并對其預(yù)測效果進行評價。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象 收集2011年12月~2013年4月住院的RA患者240例(RA組)、其他風濕免疫病患者180例(非RA組)作為研究對象。RA組男94例、女146例,年齡(54.8±14.6)歲,均符合1987年美國風濕協(xié)會(ACR)修訂的RA診斷標準。非RA組男89例、女91例,年齡(49.2±11.8)歲。

        1.2 方法

        1.2.1 早期診斷模型構(gòu)建方法 采用ELISA法測定抗環(huán)瓜氨酸多肽(CCP)抗體,采用免疫比濁法測定類風濕因子(RF)。支持向量機采用不同的內(nèi)積核函數(shù)將形成不同的算法,核函數(shù)主要有線性核函數(shù)、多項式核函數(shù)、高斯徑向基核函數(shù)、Sigmoid核函數(shù)等,本研究采用高斯徑向基核函數(shù),其形式為K (‖x-xc‖)=exp{-‖x-xc‖2/(2×σ)2)},其中xc為核函數(shù)中心,σ為函數(shù)的寬度參數(shù)。根據(jù)以上原理,采用SVM對RA進行分類預(yù)測,分別將訓(xùn)練集和測試集中患者的RF和抗CCP抗體值及其所屬類別輸入LIBSVM(http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/),對訓(xùn)練集訓(xùn)練并構(gòu)造決策平面,對每個患者進行判別歸類。

        1.2.2 診斷模型效果檢驗方法 采用五次交叉驗證法。將420個樣本數(shù)據(jù),隨機分為5組,每次取出1組作為預(yù)測樣本,其余的作為訓(xùn)練樣本。采用靈敏度(Sen)、特異度(Spe)和總準確率(Q)來評價分類器的性能,其計算公式分別為Sen=TP/(TP+ FN)、Spe=TN/(TN+FP)、Q=(TP+TN)/(TP+ FN+TN+FP)。式中,TP表示在測試集中被正確判斷的患者個數(shù),F(xiàn)N表示在測試集中被錯判為非患者的患者個數(shù),TN表示在測試集中被正確判斷的非患者個數(shù),F(xiàn)P表示在測試集中被錯判為患者的非患者個數(shù)。Sen越大,表明對患者的識別能力越強;Spe越大,則表明其對非患者的判別效果越好。采用Matthews相關(guān)系數(shù)(MCC)來評價此分類器模型的平衡性能。MCC公式:

        其范圍為[-1,1],值越大,則分類器模型的性能越好。采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件。RF、抗CCP抗體和SVM的Q、Sen、Spe比較,采用χ2檢驗。P≤0.05為差異具有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        SVM仿真診斷Q為85.48%,高于RF(70.71%)和抗CCP抗體(84.05%)。

        五次交叉驗證結(jié)果顯示,SVM仿真診斷實驗的Sen為88.33%、Spe為81.67%,MCC值為0.702 65,說明模型性能較好。RF診斷結(jié)果顯示其Sen為74.17%、Spe為66.11%,抗CCP抗體診斷結(jié)果顯示其Sen為78.75%、Spe為91.11%。三者Sen、Spe比較,P均<0.01。見表1。

        表1 SVM五次交叉驗證結(jié)果及RF、抗CCP抗體診斷結(jié)果

        3 討論

        3.1 SVM算法原理 SVM建立在統(tǒng)計學習理論的VC維理論以及結(jié)構(gòu)風險最小原理基礎(chǔ)之上,針對模式識別中的兩類線性可分問題,即幾條分割線都能正確地將兩類樣本分開,都能保證使經(jīng)驗風險為最小,這樣的分割線有無限多條。為使統(tǒng)計學習理論得出的置信范圍最小,就必須找到一條最優(yōu)分類線使兩類樣本的間隙最大,在更高維的空間中稱為最優(yōu)分類平面(見圖1),其中H1、H2分別為各類中離分類線(平面)最近的樣本且平行于分類線(平面)的直線(平面),它們之間的距離叫做分類間隔(Margin)。

        圖1 SVM最優(yōu)分類平面模式圖

        在低維的空間里(如二維空間)無法將各數(shù)據(jù)進行先行分類,如將其映射到更高維的空間(如三維空間),就可以找到一個分類面,實現(xiàn)線性可分。SVM的核心思想是通過一個非線性映射,將一個線性不可分的空間映射到一個高維的線性可分的空間。通過內(nèi)積核函數(shù)定義的非線性變換,將輸入空間變換到一個高維空間,并在這個空間中求最優(yōu)分類超平面,形成樣本分類的決策規(guī)則,如圖2。

        圖2 SVM的基本原理

        3.2 基于VSM的RA早期診斷模型的構(gòu)建 本研究結(jié)果顯示,SVM仿真診斷實驗的Q為85.48%,Sen為88.33%,Spe為81.67%,整體預(yù)測準確程度較單獨測定RF和抗CCP抗體時高,且差異具有統(tǒng)計學意義。目前,RA的診斷采用1987年或2009年ACR修訂的診斷標準,并不利于疾病的早期診斷。本研究結(jié)果顯示,單獨測定 RA診斷的 Q為70.71%,這與夏文娟等[12]的研究相近。但由于其他風濕病也可檢測出RA陽性,導(dǎo)致其Spe較差。抗CCP抗體診斷的Q為84.05%,高于RF,且其Spe明顯高于RF,這與Sun等[13]的結(jié)果一致。目前,臨床上常采用聯(lián)合檢測RF和抗CCP抗體的方法提高早期診斷準確率,多項研究[12~15]都表明該方法具有較好的敏感度和特異度,對降低漏診率和改善預(yù)后具有較高價值。

        郭宙等[9]采用了7種常用的模式分類器預(yù)測腦梗死的結(jié)果顯示,SVM分類器的效果較人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)、貝葉斯(Bays)和K鄰近法(K-NN)等其他分類器穩(wěn)定,模型推廣能力較強。本研究顯示,VSM仿真診斷實驗的預(yù)測正確率較高,且MCC值較大,說明模型推廣效果較好,具有一定的使用價值。但是,還需要進一步增加特征屬性(如家族史、不良生活習慣和潮濕環(huán)境等常見危險因素),逐步完善RA早期診斷模型,提高其預(yù)測能力。

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