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        甘肅冬小麥品種(系)面筋強(qiáng)度、黃色素含量和PPO活性相關(guān)基因的分子檢測

        2015-02-20 06:11:49周喜旺宋建榮岳維云張耀輝曹世勤呂莉莉劉鴻燕
        關(guān)鍵詞:黃色素氧化酶位點(diǎn)

        周喜旺,宋建榮,岳維云,張耀輝,曹世勤,呂莉莉,劉鴻燕,

        王娜1,南海1,趙尚文1

        (1.甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,甘肅 天水 741000; 2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,甘肅 蘭州 730070)

        甘肅冬小麥品種(系)面筋強(qiáng)度、黃色素含量和PPO活性相關(guān)基因的分子檢測

        周喜旺1,宋建榮1,岳維云1,張耀輝1,曹世勤2,呂莉莉1,劉鴻燕1,

        王娜1,南海1,趙尚文1

        (1.甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,甘肅 天水741000; 2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,甘肅 蘭州730070)

        摘要:為了明確甘肅冬小麥品種(系)中品質(zhì)相關(guān)基因的分布狀況,提高品質(zhì)育種效率,以141份小麥品種(系)為材料,利用高分子量麥谷蛋白亞基1Dx5的特異PCR標(biāo)記、與黃色素含量相關(guān)的八氫番茄紅素合酶(phytoene synthase,Psy)基因Psy-A1的標(biāo)記YP7A及多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)活性基因Ppo-A1的標(biāo)記PPO18分別進(jìn)行1Dx5、Psy-A1和Ppo-A1的基因型檢測.結(jié)果表明:含1Dx5基因的材料56份,分布頻率為39.7%;Psy-A1位點(diǎn)存在Psy-A1a和Psy-A1b 2種等位變異類型,分布頻率分別為62.4%和37.6%;Ppo-A1位點(diǎn)存在Ppo-A1a和Ppo-A1b 2種等位變異類型,分布頻率分別為42.6%和57.4%.1Dx5、Psy-A1和Ppo-A1的基因類型在不同地區(qū)分布頻率存在明顯差異,1Dx5和Psy-A1b基因在天水地區(qū)頻率最高,分別為51.0%和40.8%;Ppo-A1b基因在慶陽地區(qū)頻率最高,為77.8%,Psy-A1a基因在3地區(qū)的分布頻率明顯高于Psy-A1b基因.參試材料中,聚合1Dx5、Psy-A1b和Ppo-A1b基因的材料有19份,這些材料可作親本資源,在小麥品種面筋強(qiáng)度和面粉色澤的改良中加以利用.

        關(guān)鍵詞:普通小麥;1Dx5;黃色素;多酚氧化酶活性;分子檢測

        第一作者:周喜旺(1978-),女,助理研究員,研究方向為小麥遺傳育種.E-mail:zhouxiwang1208@163.com

        Molecular detection of genes associated with gluten strength,

        yellow pigment content and PPO activity of winter

        wheat cultivars (lines) in Gansu Province

        ZHOU Xi-wang1,SONG Jian-rong1,YUE Wei-yun1,ZHANG Yao-hui1,CAO Shi-qin2,

        LYU Li-li1,LIU Hong-yan1,WANG Na1,NAN Hai1,ZHAO Shang-wen1

        (1.Tianshui Institute of Agricultural Sciences,Tianshui 741000,China;2.Institute of Plant Protection,

        Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070,China)

        Abstract:In order to define the distribution of genes related to quality traits and improve breeding efficiency,3 gene specific markers for HMW-GS 1Dx5,Psy-A1 and Ppo-A1 genes were used to detect the allelic variations at these loci in 141 Gansu wheat cultivars and advanced lines.The results indicated that the frequency of 1Dx5 gene was 39.7%,the frequencies of Psy-A1a genotype with high yellow pigment content and Psy-A1b genotype with low yellow pigment content at Psy-A1 locus were 62.4% and 37.6%,respectively;the frequencies of Ppo-A1a genotype with high PPO activity and Ppo-A1b genotype with low PPO activity at Ppo-A1 locus were 42.6% and 57.4%,respectively.Significant differences among 1Dx5,Psy-A1 and Ppo-A1 were found in different areas,1Dx5 and Psy-A1b were distributed mainly in Tianshui area,with frequency of 51.0% and 40.8%,respectively;Ppo-A1b had highest frequency of 77.8% in Qingyang area.The frequency of Psy-A1a was obviously higher than that of Psy-A1b in three areas.19 materials contented desired gene for 1Dx5 and alleles for Psy-A1b and Ppo-A1b,thus it is essential to combine the desired genes in a variety to improve the processing quality of Gansu winter wheat.The markers used in this study were all gene-specific,with good stability and high accuracy,and they can be efficiently applied in molecular marker-assisted breeding for wheat quality improvement.

        Key words:common wheat;1Dx5;yellow pigment;polyphenol oxidase activity;molecular detection

        小麥?zhǔn)鞘澜缟献钪匾募Z食作物之一,近年來,隨著人們生活水平的日益提高,消費(fèi)者對小麥品質(zhì)提出了更高的要求,目前,國內(nèi)外已將品質(zhì)改良作為小麥育種的重要目標(biāo)之一.

        高分子量麥谷蛋白亞基對面團(tuán)粘彈性有重要影響[1-2].Glu-D1位點(diǎn)等位基因1Dx5+1Dy10編碼的5+10亞基與高面筋強(qiáng)度密切相關(guān),是所有高分子量麥谷蛋白亞基中對面包烘烤品質(zhì)貢獻(xiàn)最大的亞基[3].目前,Ovidio[4]等和Smith[5]等已分別開發(fā)了1Dx5和1Dy10位點(diǎn)特異的PCR標(biāo)記,由于1Dx5和1Dy10緊密連鎖,可利用1Dx5基因的標(biāo)記檢測來判斷5+10亞基的有無.黃色素是小麥籽粒中最重要的天然素,有研究報道小麥籽粒黃色素含量與面制食品的白度呈高度負(fù)相關(guān)[6],與面團(tuán)黃度的相關(guān)系數(shù)高達(dá)0.8~0.9[7].Miskelly等[8]研究表明,黃色素含量主要受基因型控制,遺傳力為0.68.Parker等[9]、Elouafi等[10]研究表明,黃色素含量受多個基因位點(diǎn)的調(diào)控,但位于第7同源群上的QTL效應(yīng)最大.He等[11]克隆了位于小麥7A染色體上的基因Psy-A1,并開發(fā)出相應(yīng)的功能標(biāo)記YP7A,此標(biāo)記能較好地區(qū)分7AL染色體上控制黃色素含量高、低的等位基因Psy-A1a和Psy-A1b.研究發(fā)現(xiàn),多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)催化的化學(xué)反應(yīng)是引起面團(tuán)或面條顏色變褐的主要原因[12],從而影響面制品的外觀品質(zhì)和營養(yǎng)價值[13-14].面粉中PPO的含量雖僅占籽粒中總PPO含量的3%[15],但可以解釋面制品顏色變異的50%~70%[16],通過遺傳育種途徑選擇低PPO活性的小麥品種是改良小麥面制食品顏色變褐的主要措施.張立平等[17]發(fā)現(xiàn)染色體2AL和2DL上存在控制PPO活性的主效QTL,其貢獻(xiàn)率分別為37.9%~50.0%和25.0%~29.1%.Sun 等[18]開發(fā)出了位于2AL染色體上的功能標(biāo)記PPO18.此標(biāo)記能有效區(qū)分小麥2AL染色體上控制高、低PPO活性的等位基因Ppo-A1a和Ppo-A1b.以上特異標(biāo)記的開發(fā),為小麥種質(zhì)資源及品種(系)中相關(guān)基因的快速、準(zhǔn)確檢測提供了可能.

        目前,國內(nèi)學(xué)者利用上述標(biāo)記,并取得了較好的研究結(jié)果.但以甘肅冬小麥品種(系)為試驗材料進(jìn)行品質(zhì)性狀方面檢測尚未見報道.基于此,作者選用部分甘肅冬小麥品種(系)進(jìn)行品質(zhì)性狀相關(guān)基因的分子檢測,旨在明確研究材料所含的基因種類及其相關(guān)品質(zhì)狀況,篩選有價值的小麥種質(zhì),為小麥品質(zhì)育種提供親本材料;并進(jìn)一步驗證相關(guān)標(biāo)記的有效性和實用性,以期利用分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù)加快小麥品質(zhì)改良的步伐.

        1材料與方法

        1.1供試材料

        試驗所用141份小麥品種和育成新品系的名稱和來源見附表1,由甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所小麥中心提供.每份材料選取籽粒飽滿種子,播種于直徑9 cm的黑色營養(yǎng)缽內(nèi),2葉1心期采集新鮮葉片用于基因組DNA的提取.

        1.2基因組DNA的提取

        參考文獻(xiàn)[19-20]用CTAB法提取小麥基因組DNA,紫外分光光度計檢測DNA質(zhì)量及濃度,并稀釋到50 ng/μL.

        1.3特異性分子標(biāo)記

        1Dx5的特異PCR標(biāo)記及YP7A、PPO18標(biāo)記的引物序列及相關(guān)信息見表2,所用引物由北京賽百盛公司合成.

        1.4PCR擴(kuò)增及聚丙烯酰胺凝膠電泳

        PCR擴(kuò)增及凝膠電泳所用試劑均購于北京天根生化科技公司.1Dx5、YP7A和PPO18標(biāo)記的PCR反應(yīng)體系均為10 μL,其中2 μL ddH2O、5 μL 2×MasterMix、上下游引物各1 μL、模板DNA(50 ng/μL)1 μL.3個標(biāo)記的擴(kuò)增程序分別參照表1相關(guān)文獻(xiàn),略有改動.1Dx5的擴(kuò)增程序為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,58 ℃退火45 s,72 ℃延伸1 min,共35個循環(huán);72 ℃延伸10 min.YP7A的擴(kuò)增程序為:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,65 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共35個循環(huán);72 ℃延伸10 min.PPO18的擴(kuò)增程序為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,65 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,共35個循環(huán);72 ℃延伸10 min.擴(kuò)增產(chǎn)物用8.0%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,采用緩沖體系為1×TBE溶液,電壓180 V,擴(kuò)增產(chǎn)物電泳1 h,銀染顯色后,置于白熾燈箱上用數(shù)碼相機(jī)拍照.

        表1 甘肅141份小麥品種(系)品質(zhì)性狀相關(guān)基因分子檢測結(jié)果

        “+”表示檢測到1Dx5基因,“-”:表示未檢測到1Dx5基因; YP7A檢測到194 bp片段,以“1”表示,231 bp片段,以“2”表示;PPO18檢測到685 bp片段,以“1”表示,876 bp片段,以“2”表示.

        表2 用于檢測品質(zhì)性狀相關(guān)基因的分子標(biāo)記及其引物序列

        2結(jié)果與分析

        2.11Dx5基因檢測結(jié)果

        1Dx5基因的特異PCR標(biāo)記是顯性標(biāo)記,含該基因的材料,可擴(kuò)增得到450 bp的特異片段,不含1Dx5基因的材料,無此片段.從圖1可以看出,利用PCR標(biāo)記,在電泳圖譜450 bp的位置上,可明顯區(qū)分供試材料中1Dx5基因的有無.在141份材料中,有56份材料含有該基因,占參試材料的39.7%.

        M:分子量標(biāo)準(zhǔn);1:‘天選43號’;2:‘天選45號’;3:‘天選46號’;4:‘中梁12號’;5:‘蘭天7號’;6:‘ 蘭天23號’;7:‘中梁14號’;8:‘蘭天24號’;9:‘西峰25號’;10:‘天S98531’.

        圖11Dx5基因特異PCR標(biāo)記對部分材料的擴(kuò)增結(jié)果

        Fig.1PCR amplification in partial varieties with

        1Dx5 specific PCR marker

        2.2Psy-A1位點(diǎn)的等位變異

        采用共顯性標(biāo)記YP7A,對供試材料Psy-A1位點(diǎn)的等位基因Psy-A1a和Psy-A1b進(jìn)行檢測(圖2),分別擴(kuò)增得到194 bp和231 bp大小的片段.在141份材料中,含Psy-A1a等位基因的材料有88份,占62.4%;含Psy-A1b等位基因的材料有53份,占37.6%.表明甘肅省冬小麥品種(系)的Psy-A1位點(diǎn)上廣泛存在Psy-A1a和Psy-A1b2種等位變異類型.

        M:分子量標(biāo)準(zhǔn);1:‘中梁27號’;2:‘天選43號’;3:‘中梁14號’;4:‘中梁23號’;5:‘天選46號’;6:‘隴鑒9811’;7:‘蘭天9號’;8:‘ 蘭天11號’;9:‘天S98531’;10:‘蘭天7號’.

        圖2利用YP7A檢測部分材料中的Psy-A1等位變異

        Fig.2Identification of Psy-A1 locus in partial

        varieties with YP7A

        2.3Ppo-A1位點(diǎn)的等位變異

        利用共顯性標(biāo)記PPO18,對供試材料Ppo-A1位點(diǎn)的等位基因Ppo-A1a和Ppo-A1b進(jìn)行檢測(圖3),分別擴(kuò)增得到685 bp和876 bp大小的片段.在141份材料中,含Ppo-A1a等位基因的材料有60份,占42.6%;含Ppo-A1b等位基因的材料有81份,占57.4%.表明甘肅省冬小麥品種(系)的Ppo-A1位點(diǎn)上廣泛存在Ppo-A1a和Ppo-A1b2種等位變異類型.

        M:M:分子量標(biāo)準(zhǔn);1:‘中梁12號’;2:‘中梁23號’;3:‘中梁14號’;4:‘天選46號’;5:‘蘭天2號’;6:‘蘭天3號’;7:‘蘭天25號’;8:‘隴原011’;9:‘西峰25號’.

        圖3利用PPO18檢測部分材料中的Ppo-A1等位變異

        Fig.3Identification ofPpo-A1 locus in partial

        varieties withPPO18

        2.4聚合優(yōu)異基因材料的篩選

        在所有參試材料中,既含有低黃色素含量等位基因Psy-A1b,又含有低多酚氧化酶活性等位基因Ppo-A1b,同時含有1Dx5基因的材料有19份(‘天選43’‘天選45’‘天選48’‘天選49’‘天03-165-2’‘天S98531’‘S98530-7-2-2-1-1-1’‘03-165-6-1’‘01-61-4-2-1-1-1’‘S98531-1-1-1-2’‘99211-1-1-4-1’‘9474-1-1-5-2-1-2c2’‘05495-34-5-1-4’‘0817-4’‘0741-1-14’‘05184-1-1-4’‘08531-15’‘96289’‘99293’),說明甘肅冬小麥品種(系)中,聚合多個優(yōu)良品質(zhì)性狀基因的品種(系)不是很多,小麥品質(zhì)改良工作急需加強(qiáng).

        2.5不同地區(qū)1Dx5、Psy-A1及Ppo-A1基因類型分布

        從表3可以看出,1Dx5、Psy-A1和Ppo-A1基因在不同地區(qū)分布頻率存在明顯差異,1Dx5和Psy-A1b基因主要分布在天水地區(qū),頻率分別為51.0%和40.8%,Psy-A1a基因在3個地區(qū)的分布頻率明顯高于Psy-A1b基因;Ppo-A1a基因在蘭州地區(qū)分布頻率最高,為55.9%,Ppo-A1b基因在慶陽地區(qū)分布頻率最高,為77.8%.

        表2 不同地區(qū)被測基因等位變異分布頻率

        3討論與結(jié)論

        基因功能標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用是小麥分子育種的重要方向[21].基于PCR技術(shù),本研究檢測的141份材料中,發(fā)現(xiàn)1Dx5基因的分布頻率為39.7%,與王靜等[22]、徐相波等[23]的研究結(jié)果16.3%和34.7%基本一致,但遠(yuǎn)低于國外的基因頻率(約85%)[24],這也與目前甘肅省冬小麥育種中僅重視抗條銹育種,尚不重視品質(zhì)育種有很大關(guān)系.研究發(fā)現(xiàn),本試驗中低黃色素含量等位基因Psy-A1b的分布頻率為37.6%,與楊芳萍等[21]研究的國內(nèi)主要冬麥區(qū)的歷史品種和當(dāng)前主栽品種、胡鳳靈等[25]研究的中國不同地區(qū)的221份小麥品種中Psy-A1b分布頻率分別為37.8%和36.6%的結(jié)果基本一致,表明甘肅乃至中國大部分冬小麥品種(系)的黃色素含量高,不符合中國傳統(tǒng)食品饅頭、面條的白度要求,降低小麥品種黃色素含量是小麥品質(zhì)育種的重要目標(biāo).多酚氧化酶活性檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn),等位基因Ppo-A1b的分布頻率為57.4%,略高于全國平均水平(52%)[15],高于張春利等[26]對黑龍江省小麥品種的研究結(jié)果(41.2%),略低于肖永貴等[27]對中國冬小麥品種的檢測結(jié)果(58.2%),表明盡管甘肅省冬小麥在品質(zhì)育種方面沒有針對Ppo-A1基因進(jìn)行定向選擇,但Ppo-A1b的分布頻率不是很低,選擇潛力大,有利于培育符合甘肅傳統(tǒng)食品面條、饅頭所需的低多酚氧化酶活性的品種,提高甘肅小麥面粉的白度.

        通過對甘肅省141份冬小麥品種(系)1Dx5、Psy-A1b和Ppo-A1b基因等位變異分析,各基因在不同地區(qū)分布頻率存在明顯差異.1Dx5、Psy-A1b基因主要分布在天水地區(qū),Ppo-A1b基因在慶陽地區(qū)分布頻率最高,這可能與各地區(qū)所用親本及育種方向不同有關(guān).綜合來看,供試材料中,聚合有1Dx5、Psy-A1b和Ppo-A1b基因的品種(系)有19份,且全為甘肅天水地區(qū)材料,在甘肅蘭州和慶陽地區(qū)的材料中未檢測到聚合3個基因的品種(系),今后小麥品質(zhì)育種要以聚合多個優(yōu)良品質(zhì)性狀基因為重點(diǎn),同時借助分子標(biāo)記技術(shù)加快小麥品質(zhì)改良的步伐.

        由于小麥籽粒黃色素含量和多酚氧化酶活性分別受多個基因位點(diǎn)的調(diào)控,僅考慮某一位點(diǎn)的基因型并不能準(zhǔn)確評價真實的黃色素含量和多酚氧化酶活性.本研究對甘肅冬小麥品種(系)從Psy-A1和Ppo-A1位點(diǎn)初步進(jìn)行了基因型鑒定,下一步要做的工作應(yīng)該是對黃色素含量和多酚氧化酶活性的另外位點(diǎn)進(jìn)行基因型鑒定及不同位點(diǎn)基因組合方式做深入研究.

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        (責(zé)任編輯李辛)

        收稿日期:2014-04-24;修回日期:2014-06-11

        基金項目:國家自然科學(xué)基金項目(31160362);甘肅省生物技術(shù)研究與應(yīng)用開發(fā)項目(GNSW-2010-24).

        通信作者:宋建榮,男,研究員,研究方向為小麥遺傳育種.E-mail:tskd228202@163.com

        中圖分類號:S 512.1+1

        文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號:1003-4315(2015)02-0054-07

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