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        直接發(fā)酵法生產(chǎn)L-絲氨酸高產(chǎn)菌株的選育

        2014-12-25 02:28:50徐國強竇文芳許泓瑜張曉梅
        食品與生物技術學報 2014年11期
        關鍵詞:絲氨酸產(chǎn)酸谷氨酸

        徐國強 , 竇文芳 , 許泓瑜 , 張曉梅 *

        (1.江南大學 藥學院,江蘇 無錫,214122;2.江南大學 糧食發(fā)酵工藝與技術國家工程實驗室,江蘇 無錫,214122)

        L-絲氨酸(L-serine)是一種非必需氨基酸,具有重要的生理功能,在醫(yī)藥、食品、化妝品及化工等領域具有重要的應用價值。L-絲氨酸的市場需求量很大[1]。目前,L-絲氨酸的主要生產(chǎn)方法有化學合成法、蛋白質(zhì)水解法和前體轉(zhuǎn)化法,而這些方法存在成本較高、產(chǎn)率較低及環(huán)境污染較大等問題,限制了L-絲氨酸的規(guī)?;a(chǎn)。相比之下,以可再生資源糖為原料的微生物發(fā)酵法生產(chǎn)L-絲氨酸則受到廣泛關注。

        目前,發(fā)酵生產(chǎn)L-絲氨酸的微生物主要有黃色短桿菌[2]、重組大腸桿菌[3]和谷氨酸棒桿菌[4-5]。其中谷氨酸棒桿菌(Corrynebacterium glutamicum)已廣泛地用于各種氨基酸的生產(chǎn),由于谷氨酸棒桿菌的生理學、生物化學及遺傳學信息已較為豐富[6],對其進行進一步的代謝工程改造也較為方便,因此,采用谷氨酸棒桿菌來生產(chǎn)L-絲氨酸具有諸多的優(yōu)勢。

        谷氨酸棒桿菌中L-絲氨酸的合成途徑見圖1。主要有3個關鍵酶:包括3-磷酸甘油酸脫氫酶(PGDH,serA)、 磷 酸 絲 氨 酸 氨 基 轉(zhuǎn) 移 酶 (PAST,serC)、磷酸絲氨酸磷酸酶(PSP,serB)。 降解途徑包括2個關鍵酶,分別是L-絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶(SHMT,glyA)和 L-絲氨酸脫氫酶(L-serDH,sdaA)。Peters-Wendisch P等[7]證實了高濃度的L-絲氨酸對C.glutamicum中的PGDH存在反饋抑制作用。他們對L-絲氨酸代謝途徑中的關鍵酶進行了改造,使得模式菌株C.glutamicum ATCC13032可以積累L-絲氨酸到[4,8-9]。而關于野生型谷氨酸棒桿菌產(chǎn)L-絲氨酸卻鮮有報道。作者所在實驗室前期從土壤中篩選獲得一株可以利用糖質(zhì)原料發(fā)酵生產(chǎn)L-絲氨酸的野生型C.glutamicum SYPS-062,并對該菌株展開了一系列的研究[5,10-14]。但還是存在L-絲氨酸產(chǎn)量較低發(fā)酵周期較長等問題,擬采用L-絲氨酸結構類似物D-絲氨酸抗性平板篩選突變株從而解除L-絲氨酸對PGDH的反饋抑制,促進L-絲氨酸的進一步積累。

        利用誘變育種技術獲得具有優(yōu)良性狀的突變株,然后通過全基因組測序找出引起優(yōu)良性狀的遺傳差異,進而運用代謝工程的手段對菌株進行定向改造[15],這種利用反向代謝工程改造菌株的策略將具有明顯的優(yōu)勢。作者旨在通過傳統(tǒng)誘變育種的方法,獲得L-絲氨酸產(chǎn)量等發(fā)酵特性明顯變化的C.glutamicum突變株,為下一步進行反向代謝工程研究提供有價值的實驗材料。

        圖1 谷氨酸棒桿菌中L-絲氨酸的代謝途徑Fig.1 Metabolic pathway of L-serine in C.glutamicum

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1 菌種 C.glutamicum SYPS-062:可直接利用糖質(zhì)原料發(fā)酵生產(chǎn)L-絲氨酸,由江南大學制藥工程研究室保藏。

        1.1.2 培養(yǎng)基

        1) 斜面培養(yǎng)基:Peptone 10 g/L,Beef extract 10 g/L,Yeast extract 5 g/L,NaCl 3 g/L,Agar 20 g/L;pH 7.0,121℃滅菌 20 min。

        2)種子培養(yǎng)基:Glucose 30 g/L,corn steep liquor 20 g/L, (NH4)2SO420 g/L,KH2PO41 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,CO(NH2)21.5 g/L,cottonseed flour 20 g/L;pH 7.0,121 ℃滅菌 20 min。

        3)發(fā)酵培養(yǎng)基:Sucrose 60 g/L,(NH4)2SO430 g/L,KH2PO43 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.02 g/L,MnSO4·H2O 0.02 g/L,biotin 50 μg/L,streptomycin 10 μg/L,CaCO330 g/L, 維生素 B1450 μg/L;pH 7.0,121 ℃滅菌 10 min。

        4)抗性篩選培養(yǎng)基:Peptone 10 g/L,Beef extract 10 g/L,Yeast extract 5 g/L,NaCl 3 g/L,Agar 20 g/L,在此基礎上加入D-serine,使其在培養(yǎng)基中的終質(zhì)量濃度為150 g/L。

        1.1.3 試劑 DES:為上海試劑廠產(chǎn)品;D-serine:為美國Sigma公司產(chǎn)品;其他均為國產(chǎn)分析純試劑。

        1.2 方法

        1.2.1 培養(yǎng)方法

        1)斜面活化及種子培養(yǎng):將保存在4℃冰箱中的斜面菌種接種到新鮮斜面,30℃靜置培養(yǎng)24 h;然后將活化后的菌種接入種子培養(yǎng)基(裝液量為30 mL/250 mL 三角瓶),115 r/min、30 ℃振蕩培養(yǎng) 18 h。

        2)搖瓶發(fā)酵:按5%的接種體積分數(shù)將種子培養(yǎng)液接入發(fā)酵培養(yǎng)基 (裝液量為20 mL/250 mL三角瓶),115 r/min、30 ℃振蕩培養(yǎng) 96 h。

        1.2.2 誘變方法及D-serine抗性變異株的檢測方法 先將種子培養(yǎng)到對數(shù)生長期中后期,再以50%的接種體積分數(shù)轉(zhuǎn)接到新鮮的種子培養(yǎng)基中培養(yǎng)5 h,使所有細胞達到同步生長。將培養(yǎng)液無菌離心,收集菌體,用無菌的0.1 mol/L、pH 7.0的磷酸緩沖液將菌體制成108個/mL的菌懸液,離心洗滌3次,轉(zhuǎn)入無菌的帶玻璃珠的三角瓶中打散,得單細胞懸液。取1 mL的菌懸液,加入硫酸二乙酯,使其終體積分數(shù)為2%,30℃振蕩反應20 min,誘變結束后快速離心終止反應,用無菌的0.1 mol/L、pH 7.0的磷酸緩沖液洗滌3次,將誘變后的單細胞懸液接種到新鮮的種子培養(yǎng)基培養(yǎng)8 h,然后直接涂布抗性篩選平板,30℃恒溫培養(yǎng)3~5 d,長出的大菌落即為D-serine r,挑選這些菌落進行初篩。

        1.2.3 分析方法 細胞干重的測定 (dry cell weight,DCW):取發(fā)酵液 5 mL,加 12 mL 0.25 mol/L的稀鹽酸,待反應完畢后,經(jīng)8 000 r/min離心5 min后傾去上清液,用去離子水洗滌兩次,置于105℃烘箱干燥至恒質(zhì)量后稱量;蔗糖測定方法:采用間苯二酚法;L-絲氨酸定量測定方法:采用日立835-50氨基酸自動分析儀。色譜條件如下:柱溫為40℃;流速為 1.0 mL/min;紫外檢測器:338、262 nm (Pro,Hypro;熒光檢測器:激發(fā)波長340 nm,發(fā)射波長450 nm;激發(fā)波長 266nm,發(fā)射波長 305nm (Pro,Hypro)。

        2 結果與分析

        2.1 出發(fā)菌株及誘變培養(yǎng)時間的確定

        將C.glutamicum SYPS-062的斜面保藏菌種劃線分離,挑選菌落形態(tài)較大的32個單菌落轉(zhuǎn)接到斜面上,培養(yǎng)24 h后接種至搖瓶進行產(chǎn)酸能力的初篩,再將產(chǎn)酸較高的5株菌進行復篩,結果發(fā)現(xiàn)36號菌產(chǎn)酸最高,然后將該突變株連續(xù)傳代5次考察其遺傳穩(wěn)定性,發(fā)現(xiàn)其產(chǎn)酸未見明顯變化。表明其遺傳穩(wěn)定性較好,因此,確定菌株C.glutamicum SYPS-062-36為誘變的出發(fā)菌株,用于后續(xù)相關實驗。

        出發(fā)菌株的生長曲線見圖2。從種子生長曲線上可以看出,該菌經(jīng)過16~18 h的培養(yǎng)后,到達對數(shù)生長中后期,此時細胞代謝活力最為旺盛,并且處在這個時期的細胞對誘變劑更為敏感。因此,確定誘變所用細胞的培養(yǎng)時間為16~18 h。

        圖2 出發(fā)菌的種子生長曲線Fig.2 Growth curve in the seed medium of parent strain

        2.2 誘變育種

        以硫酸二乙酯(DES)為誘變劑,誘變時間為20 min,測定了誘變劑濃度與致死率的關系,結果見表1。從表1可以看出,選擇誘變劑體積分數(shù)為2%比較合適,此時致死率為71.8%。

        表1 對菌株C.glutamicum SYPS-062-36 DES誘變致死率Table 1 Determination of the lethality on C.glutamicum SYPS-062-36 treated by DES

        對出發(fā)菌株SYPS-062-36(圖3a)進行誘變,在150 g/L D-絲氨酸抗性平板上隨機挑選突變株,獲得一株產(chǎn)酸較高P3,其產(chǎn)酸為(7.35±0.21)g/L,然后對突變株P3在同樣的條件下進行第二輪誘變,經(jīng)搖瓶復篩,獲得一株高產(chǎn)L-絲氨酸菌株SYPS-062-33a,將該突變株劃線分離,得到一株遺傳穩(wěn)定的高產(chǎn)菌株SYPS-062-33a-18,其顯微圖像見圖3b。

        圖3 谷氨酸棒桿菌SYPS-062-36及其突變株SYPS-062-33a-18的顯微鏡圖Fig.3 Microscope images of C.glutamicum SYPS-062-36 and its derivative SYPS-062-33a-18

        2.3 高產(chǎn)菌株的發(fā)酵特性

        高產(chǎn)菌與出發(fā)菌在發(fā)酵過程中生物量、L-絲氨酸產(chǎn)量、殘?zhí)呛康淖兓妶D4。由圖4可以看出,菌體進入對數(shù)生長后期時,高產(chǎn)菌的生物量明顯高于出發(fā)菌,發(fā)酵結束時,生物量為(6.56±0.23)g/L,而出發(fā)菌株為(5.61±0.24)g/L,較出發(fā)菌株提高了17.9%。高產(chǎn)菌在90 h時L-絲氨酸產(chǎn)量達到最高,為(11.0±0.25)g/L,L-絲氨酸產(chǎn)量較出發(fā)菌(6.65±0.23)g/L提高了65.4%,且發(fā)酵周期提前約6 h;高產(chǎn)菌株在對數(shù)生長前期(24~60 h)糖耗速率不及出發(fā)菌株,但在對數(shù)生長中后期(60~78 h)的糖耗速率高于出發(fā)菌株。

        文獻[16-17]報道,在谷氨酸棒桿菌胞內(nèi),大約7.5%的碳流是用于細胞生長和代謝所需(如蛋白質(zhì)的合成、甘氨酸、半胱氨酸、色氨酸、磷脂的合成及一碳單元的產(chǎn)生)。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn):出發(fā)菌株C.glutamicum SYPS-062積累L-絲氨酸的原因可能與SHMT活性較低有關[10]。在本研究中,高產(chǎn)菌株C.glutamicum SYPS-062-33a-18的L-絲氨酸對蔗糖的轉(zhuǎn)化率為0.183±0.009 mol/mol,較出發(fā)菌株C.glutamicum SYPS-062提高了64.9%,說明誘變使得更多的碳流流向L-絲氨酸。

        圖4 出發(fā)菌株谷氨酸棒桿菌SYPS-062-36和其突變株SYPS-062-33a-18的發(fā)酵過程曲線Fig.4 Time course of L-serine fermentation by the parental strain C.glutamicum SYPS-062-36 and the mutant C.glutamicum SYPS-062-33a-18 in shake-flask fermentation

        此外,將出發(fā)菌及高產(chǎn)菌分別發(fā)酵96 h和90 h,發(fā)酵液經(jīng)過預處理后,在相同條件下測定氨基酸組分及含量。結果表明:出發(fā)菌的丙氨酸(Ala)產(chǎn)量為(2.05±0.15) g/L,纈氨酸 (Val)的產(chǎn)量為(1.51±0.19)g/L;相比之下,高產(chǎn)菌株的丙氨酸產(chǎn)量為(6.56±0.24) g/L,纈氨酸的產(chǎn)量為(3.00±0.20)g/L,分別較出發(fā)菌株提高了220%和99%。甘氨酸(Gly)、蘇氨酸(Thr)、賴氨酸(Lys)等的產(chǎn)量也有了較大幅度的提高。

        3 結語

        以谷氨酸棒桿菌C.glutamicum SYPS-062-36為出發(fā)菌株,經(jīng)DES逐級誘變處理,獲得對D-絲氨酸有一定抗性的突變株C.glutamicum SYPS-062-33a-18,其 L-絲氨酸產(chǎn)量為(11.0±0.25) g/L,較出發(fā)菌株產(chǎn)酸量提高了65.4%。此外,突變株C.glutamicum SYPS-062-33a-18可以積累更多的丙氨酸、纈氨酸等其它氨基酸。本研究不僅以D-絲氨酸作為抗性平板篩選得到高產(chǎn)L-絲氨酸的突變株,而且為下一步進行反向代謝工程的研究提供了良好的實驗材料。

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