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        基于裂解酶與ATP生物發(fā)光法特異定量檢測炭疽桿菌方法的研究

        2014-10-27 09:04:30張博康懷興米志強安小平張飛雄童貽剛
        生物技術(shù)通訊 2014年1期
        關(guān)鍵詞:生物檢測

        張博,康懷興,米志強,安小平,張飛雄,童貽剛

        1.首都師范大學 生命科學學院,北京 100048;2.軍事醫(yī)學科學院 微生物流行病研究所,病原微生物生物安全國家重點實驗室,北京 100071

        炭疽是嚴重威脅人類健康的烈性傳染病,其病原體為炭疽芽孢桿菌(Bacillus anthracis)。由于其高毒性,炭疽桿菌是一種潛在的生物武器,曾被作為致死戰(zhàn)劑之一。目前,皮膚炭疽在我國各地還有散在發(fā)生,不應放松警惕。因此,發(fā)展快速、靈敏的炭疽桿菌檢測方法具有重要意義[1-3]。

        噬菌體裂解酶是噬菌體在感染宿主菌末期表達的蛋白質(zhì),它通過水解細菌細胞壁的肽聚糖使子代噬菌體釋放[4-5]。γ噬菌體裂解酶(γ phage lysin,PlyG)能夠特異性地殺死炭疽桿菌,同時也能裂解蠟樣芽孢桿菌(B.cereus)RSVF1(ATCC 4342)菌株,且RSVF1是惟一對PlyG敏感的蠟樣芽孢桿菌菌株[6]。Yemini等就曾以蠟樣芽孢桿菌為模型,研究了基于噬菌體的炭疽桿菌檢測方法[7];李曼等也以蠟樣桿菌RSVF1芽孢為模型,進行了殺滅試驗的相關(guān)研究[8]。

        ATP普遍存在于所有活的生物體中,當生物體死亡后,在細胞內(nèi)酶的作用下,ATP很快被分解掉。所以通過測定樣品中的ATP濃度,即可推算出活菌數(shù)[9]。在Mg2+存在下,螢火蟲螢光素酶(luciferase,Luc)以D-螢光素、ATP、O2為底物,將化學能轉(zhuǎn)化為光能,發(fā)出熒光。據(jù)此,可對微生物細胞內(nèi)的ATP進行測定,從而定量檢測細菌數(shù)[10-11]。

        國內(nèi)外多項研究都曾以蠟樣芽孢桿菌RSVF1為對象來替代炭疽桿菌,并且Schuch等[6]的研究也充分證明PlyG對于RSVF1和炭疽桿菌具有明顯的裂解酶活性,而不能裂解其他菌株。本研究以此為基礎,以蠟樣芽孢桿菌RSVF1為指示菌,通過結(jié)合裂解酶與ATP生物發(fā)光法,進行了對炭疽桿菌定性定量檢測的模擬實驗。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        蠟樣芽孢桿菌RSVF1購自美國模式培養(yǎng)物集存庫(ATCC),其他菌株為本實驗室保存;克隆菌株大腸桿菌Trans1-T1、表達菌株大腸桿菌BL21(DE3)購自北京全式金生物技術(shù)公司;質(zhì)粒pUC19-plyG、pLenti-luc為本實驗室保存;限制性內(nèi)切酶NdeⅠ、EcoRⅠ-HF和T4DNA連接酶購自NEB公司;引物由北京諾賽基因組研究中心有限公司合成;2×TransTaq HiFi PCR SuperMixⅡ購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;膠回收試劑盒購自德國QIAGEN公司;DNA marker、蛋白質(zhì)marker和質(zhì)粒提取試劑盒均購自北京博邁德生物技術(shù)有限公司;鎳柱預裝柱購自上海生工生物工程有限公司;螢光素酶檢測試劑盒、D-螢光素(甲蟲螢光素,鉀鹽)購自Promega公司;Profile-1 3560(10X)ATP微生物快速檢測系統(tǒng)購自北京浩正智信科技有限公司;其它常規(guī)試劑由本實驗室自備;BHI(brain heart infusion)培養(yǎng)基購自美國BD醫(yī)療器械有限公司,LB培養(yǎng)基為自配。

        1.2 plyG和luc基因的克隆及表達載體的構(gòu)建

        根據(jù)已知的質(zhì)粒pUC19-plyG和pLenti-luc的序列設計引物[12-13],在2組引物的上游均加入His標簽(斜體字母)以方便純化。引物分別為plyG-F(5'GGAATTCCATATGCATCACCATCACCATCACATG GAAATCCAA3',下劃線序列為NdeⅠ酶切位點)、plyG-R(5'CGGAATTCTTATTTAACTTCATACCACC AACCTTT3',下劃線序列為EcoRⅠ酶切位點)、luc-F(5'GGAATTCCATATGCATCACCATCACCATCACGGA TCCATGGAA3',下劃線序列為NdeⅠ酶切位點)和luc-R(5'CGGAATTCTTACACGGCGATCTTTC3',下劃線序列為EcoRⅠ酶切位點)。

        分別以pUC19-plyG和pLenti-luc為模板,50 μL體系中使用2×TransTaq HiFi PCR SuperMixⅡ,PCR擴增目的基因序列(plyG:94℃預變性5 min,以94℃ 30 s、55℃ 30 s、72℃ 45 s行35個循環(huán),72℃延伸 7 min,4℃恒溫;luc:94℃預變性 5 min,以94℃ 30 s、55℃ 30 s、72℃ 100 s行35個循環(huán),72℃延伸7 min,4℃恒溫)。

        瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR結(jié)果,切膠回收目的基因片段。NdeⅠ、EcoRⅠ雙酶切目的基因和表達載體pET22b,連接轉(zhuǎn)化至大腸桿菌Trans1-T1,提取質(zhì)粒,雙酶切鑒定,挑選陽性克隆,質(zhì)粒分別命名為pET22b-plyG和pET22b-luc。

        1.3 重組裂解酶和螢光素酶的表達及純化

        將重組表達載體pET22b-plyG和pET22b-luc轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3),涂于含有氨芐西林(終濃度100 μg/mL)的固體LB培養(yǎng)基平板上,倒置平板,37℃過夜培養(yǎng);挑取單克隆搖菌至對數(shù)期,加入IPTG(終濃度1 mmol/L),16℃低溫誘導24 h;誘導后的菌液10 000×g離心10 min,棄上清,用PBS重懸菌體,超聲波破碎處理后10 000×g離心10 min,收集上清,經(jīng)0.45 μm濾膜過濾后過鎳柱純化,表達及純化結(jié)果以SDS-PAGE方法檢測。用ASP3700紫外光/可見光微量分光光度計測定純化后酶液的蛋白含量。

        1.4 酶活性檢測

        將蠟樣芽孢桿菌RSVF1培養(yǎng)至對數(shù)期,取500 μL鋪雙層BHI平板,室溫靜置10 min,吸取1.5 μL純化的PlyG酶液滴于平板上,同時以PBS緩沖液為空白對照,正置于30℃溫箱中30 min,待酶液吸收后倒置,培養(yǎng)6 h后觀察結(jié)果。

        將純化的螢光素酶液進行梯度稀釋,取稀釋后的酶液各10 μL與50 μL螢光素酶檢測試劑盒中的檢測底物混合,于Profile-1 3560(10X)ATP微生物快速檢測系統(tǒng)中測得相對發(fā)光單位(RLU)。做3組重復,以測得數(shù)值的平均值來反映螢光素酶的相對活性。

        1.5 平板計數(shù)法定量檢測蠟樣芽孢桿菌RSVF1

        將培養(yǎng)好的RSVF1菌液按1/10梯度分別稀釋至10-1、5×10-2、10-2、5×10-3、10-3、5×10-4、10-4、5×10-5、10-5,分別吸取50 μL涂布于固體LB平板,37℃倒置培養(yǎng)過夜,每個梯度做3個重復,同時做空白對照。次日選取菌落數(shù)為30~300的稀釋度作為標準計算平均值,為平板計數(shù)結(jié)果[14]。

        1.6 ATP發(fā)光法定量檢測蠟樣芽孢桿菌RSVF1

        用PBS緩沖液配置D-螢光素/螢光素酶混合溶液,使得D-螢光素濃度為150 mg/L,螢光素酶濃度為100 mg/L[15]。取如1.5所述的9個稀釋度的菌液和細菌原液以及空白對照,按照Profile-1 3560(10X)ATP微生物快速檢測系統(tǒng)標準操作進行:分別取50 μL加入專用的過濾比色杯中,比色杯下鋪一層濾紙;滴加4滴SRA試劑(非細菌細胞釋放液),用壓力器對準比色杯頂端,按下壓力器把液體壓出至濾紙,重復該步驟一次;將比色杯放入3560(10×)微光度計的抽屜中,加入50 μL稀釋至1/10的PlyG酶液,等待2 min,使細菌充分被裂解;吸取50 μL D-螢光素/螢光素酶混合溶液加入比色杯,吸排混勻3次,推回抽屜,記錄儀器讀數(shù)。每個濃度梯度的樣品做3組重復,計算平均值為最終結(jié)果[16-17]。

        2 結(jié)果

        2.1 plyG、luc基因的擴增和重組表達載體pET22bplyG、pET22b-luc的構(gòu)建

        PCR擴增得到的plyG基因片段約740 bp,luc基因片段約1700 bp,電泳檢測結(jié)果如圖1。重組表達載體pET22b-plyG經(jīng)NdeⅠ、EcoRⅠ雙酶切后,電泳檢測結(jié)果顯示釋放約5400和740 bp的片段(圖2);重組表達載體pET22b-luc經(jīng)NdeⅠ、EcoRⅠ雙酶切后,電泳檢測結(jié)果顯示釋放約5400和1700的片段(圖2)。

        2.2 SDS-PAGE檢測PlyG和Luc的表達和純化

        菌體經(jīng)PBS重懸和超聲波破碎處理,上清上樣經(jīng)電泳檢測,分別在相對分子質(zhì)量約27×103和60×103處有特異性條帶,大小與所報道的蛋白大小一致,證明目的蛋白均實現(xiàn)了可溶性表達;過鎳柱純化后,2個蛋白的條帶較單一,得到了較純的蛋白。測定蛋白濃度,PlyG為0.9 mg/mL,Luc為0.3 mg/mL(圖3)。

        圖1 PCR擴增得到的plyG、luc基因片段

        2.3 裂解酶和螢光素酶活性檢測

        點滴法驗證PlyG活性結(jié)果如圖4,在滴有純化后的PlyG區(qū)域出現(xiàn)透亮的圓形裂解斑,直徑約5 mm。利用螢光素酶檢測試劑盒測得純化后的螢光素酶比活約為3.3×1010RLU/mg。

        2.4 平板計數(shù)法與ATP生物發(fā)光法定量檢測蠟樣芽孢桿菌RSVF1

        3組稀釋度為10-5細菌溶液的平板計數(shù)結(jié)果分別為118、123和141,平均值為132,并由此計算其他稀釋度細菌溶液的平板計數(shù)結(jié)果。平板計數(shù)測得的細菌總數(shù)與ATP發(fā)光法測得的發(fā)光值結(jié)果見表1。

        圖2 NdeⅠ、EcoRⅠ雙酶切重組載體pET22b-plyG和pET-luc

        圖3 SDS-PAGE檢測裂解酶與螢光素酶的表達純化結(jié)果

        圖4 PlyG點板驗證裂解活性

        2.5 ATP測定法與平板計數(shù)法的相關(guān)性

        根據(jù)表1,采用10-4及以上稀釋度各組數(shù)據(jù),以平板計數(shù)的對數(shù)值lg(N/cfu)(N為細菌數(shù))為x軸,以發(fā)光值的對數(shù)值lg(N/RLU)(N為相對光單位)為y軸,做x、y散點圖描繪關(guān)系曲線如圖5。由圖可知,菌落總數(shù)與發(fā)光值呈顯著相關(guān)性。由表1和圖5可知,該方法最低可檢測出50 μL菌液中的約1300個菌落;當細菌數(shù)為1300 cfu以上時,熒光發(fā)光值與細菌總數(shù)呈顯著的線性相關(guān)。

        表1 蠟樣芽孢桿菌RSVF1平板菌落數(shù)與熒光發(fā)光值

        圖5 菌落總數(shù)與發(fā)光值的標準曲線

        3 討論

        近年來,隨著生物技術(shù)的快速發(fā)展,以炭疽桿菌噬菌體裂解酶進行治療和檢測的研究層出不窮[3]。利用ATP生物發(fā)光對細菌進行定量檢測的方法也已應用于食品工業(yè)、臨床檢測等眾多領域[9],Stopa等的研究,對于應用螢光素-螢光素酶檢測系統(tǒng)檢測細菌數(shù)量提供了詳細的理論基礎與操作方法[16]。

        目前以ATP生物發(fā)光法定量檢測細菌的研究往往采用細胞裂解液來裂解細菌從而釋放ATP,大多不具有特異性和專一性。γ噬菌體裂解酶能高效地裂解炭疽桿菌和蠟樣芽孢桿菌RSVF1,Schuch等和李曉靜等的研究對于PlyG的裂解特異性均提供了充分的實驗證明[6,12];螢光素-螢光素酶檢測系統(tǒng)因其檢測快速靈敏對于定量檢測細菌又有著不可比擬的優(yōu)勢。因此,我們采用大腸桿菌原核表達系統(tǒng)高效表達了噬菌體裂解酶和螢光素酶,并且在蛋白前端加入His標簽,采用鎳柱親和層析方法純化目的蛋白,操作簡便易于純化,得到了較純的酶液。以這2種酶為關(guān)鍵工具,以蠟樣芽孢桿菌RSVF1為模型,建立了熒光發(fā)光值與細菌數(shù)量之間的線性關(guān)系且二者相關(guān)性顯著。該檢測方法的檢測下限為1300 cfu,可以滿足一般檢測的需求;當樣品所含細菌數(shù)量低于1300 cfu時,可采用簡便的濃縮富集技術(shù)或多次加樣的方法,使?jié)饪s后的樣品菌落總數(shù)在有效檢測范圍以內(nèi),檢測后再通過換算得到原樣品的細菌數(shù)量。

        另外,在炭疽應急檢測方面,對芽孢的檢測尤為重要。Lee等的研究證實,對芽孢加入TSB培養(yǎng)基并進行37℃、15 min的溫育處理,可成功地使芽孢發(fā)芽,從而實現(xiàn)對芽孢的定量檢測[17]。根據(jù)該研究結(jié)果,對蠟樣芽孢桿菌RSVF1的芽孢或炭疽芽孢桿菌的芽孢做同樣的處理,同時配合裂解酶與ATP生物發(fā)光法,便能夠?qū)ρ挎哌M行特異性定量檢測。

        本研究所建立的方法是以蠟樣芽孢桿菌RSVF1為裂解對象,該菌株與炭疽桿菌一樣對PlyG敏感,因此將這套方法直接移植到對炭疽桿菌的檢測中具有較強的可行性。因該方法具備傳統(tǒng)ATP發(fā)光法檢測技術(shù)靈敏快速的優(yōu)點,在裂解細菌方面又具有特異性,在應用于現(xiàn)場或臨床定性定量檢測炭疽桿菌方面具有良好的前景和實用價值。

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