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        常見JAK2基因突變的篩檢及在BCR-ABL陰性骨髓增殖病中的臨床意義

        2014-08-25 02:39:00徐修才丁凱陽
        關(guān)鍵詞:基因突變骨髓計(jì)數(shù)

        徐修才,伍 權(quán),鄭 南,丁凱陽,劉 欣

        (安徽醫(yī)科大學(xué)附屬省立醫(yī)院 1.中心實(shí)驗(yàn)室;2.血液科,安徽 合肥230001)

        以腫瘤基因?qū)W為基礎(chǔ)的骨髓增值性疾病(MPD)鑒別診斷,主要是通過檢測BCR-ABL融合基因及JAK2基因突變完成,BCR-ABL陽性者被診斷為慢性髓細(xì)胞白血病(CML),陰性者考慮CML以外的MPD,后者常見的為真性紅細(xì)胞增多癥(PV),原發(fā)性血小板增多癥(ET)以及原發(fā)性骨髓纖維化(IMF)。目前,國內(nèi)外大多采用等位基因特異性聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(AS-PCR)檢測V617F突變,但是MPD患者中還可出現(xiàn)其他突變,特別是PV患者。JAK2 V617F以外的突變主要發(fā)生于第12外顯子,因此對MPD患者同時(shí)進(jìn)行JAK2 V617F和JAK2 exon12突變檢測是非常需要的。本研究建立一種多重位點(diǎn)特異性PCR篩選方法并探討其在骨髓增殖性疾病中的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        1 資料和方法

        1.1研究對象所有病例來自2011年12月至2012年11月間在我院住院和門診隨訪的BCR-ABL 陰性的MPD患者149例為研究組,其中男78 例,女71例,年齡21-86歲,平均(54.5±10.1)歲,包括PV 73例,ET 51例,IMF 25例。對照組35 例,其中急性白血病20 例,男11例,女9例,年齡19-78歲,平均(53.0±11.5)歲;健康對照15例,男8 例,女7例,年齡21-62 歲,平均(33.2±8.5)歲。所有患者均經(jīng)過我院常規(guī)骨髓細(xì)胞形態(tài)學(xué)、組織化學(xué)、免疫表型、融合基因、染色體、骨髓病理檢查等確診,符合相應(yīng)疾病的2008年WHO診斷標(biāo)準(zhǔn)。

        1.2方法

        1.2.1 基因組DNA提取 取200 μl患者骨髓或外周血及健康志愿者外周血標(biāo)本,應(yīng)用Karroten 血液基因組DNA 提取試劑盒(快速型)提取DNA,具體操作步驟按照說明書進(jìn)行。所有DNA樣品經(jīng)過1.5%瓊脂糖凝膠電泳和分光光度計(jì)檢測以確定質(zhì)量良好后,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 多重位點(diǎn)特異性PCR檢測 PCR引物分別根據(jù)5種突變型基因序列設(shè)計(jì)(見表1)。PCR反應(yīng)使用的Taq酶和10×PCR buffer等購買自MBI公司。PCR反應(yīng)體系總體積25μl,包括1×PCR buffer、MgCl21.5 mmol/L、dNTP 200μmol/L、8條引物各200 μmol/L、Taq酶1.5U、基因組DNA 50 ng。PCR反應(yīng)在Biometra Tgradient型PCR儀上進(jìn)行。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性8 min,循環(huán)中95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸 1 min,共循環(huán)40次;循環(huán)后72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,根據(jù)電泳條帶大小判斷標(biāo)本中有無JAK2基因突變和突變類型。JAK2突變陽性的標(biāo)本,分別選擇4例,送上海生物工程公司進(jìn)行測序驗(yàn)證。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法所有數(shù)據(jù)用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件分析處理。正態(tài)分布的計(jì)量資料采行t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料應(yīng)用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1凝膠電泳分析多重AS-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物149例MPD患者中共檢出118例患者存在JAK2突變,其中PV患者陽性68例,ET患者陽性35例,IMF患者陽性15例(見表2,圖1)。20例白血病患者和15例健康對照者中均未檢出JAK2基因突變。

        2.2基因測序驗(yàn)證突變陽性結(jié)果

        將所有JAK2 exon12突變陽性和3例JAK2 V617F突變陽性的MPD患者標(biāo)本送測序。測序結(jié)果顯示,第254堿基處JAK2 V617F突變陽性樣本為G/T重疊峰(雜合突變,圖2A);4例通過本方法檢測為K539L突變的標(biāo)本經(jīng)基因測序分析,1例為H538Q合并K539L復(fù)合突變(圖2B),另3例檢測為K539L突變(圖2C)。

        表1 多重AS-PCR 篩選JAK2突變所用引物序列

        M:DNA 分子量Marker;1:空白對照;2:陰性標(biāo)本;3,4:K539L突變5:V617F突變;6:陰性對照

        圖1多重位點(diǎn)特異性PCR擴(kuò)增JAK2基因突變電泳圖

        2.3外周血細(xì)胞的分析

        我們對于149例病例(包括PV、ET、IMF 3組)的外周血計(jì)數(shù)進(jìn)行了分析。發(fā)現(xiàn)突變型的白細(xì)胞計(jì)數(shù)以及血紅蛋白計(jì)數(shù)較野生型高,均差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。而對于血小板計(jì)數(shù),突變型也較野生型高,但是差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見表3。

        圖2 JAK2突變測序圖

        病種總例數(shù)野生型例數(shù)突變性例數(shù)突變率PV7356893.2%ET51163568.6%IMF25101560%合計(jì)1493111879.2%

        表3 JAK2突變與血液學(xué)特征之間的關(guān)系

        **P≤0.0005;*P≤0.0001 compared with the wild type of the same MPD

        3 討論

        2005年Baxter等多個(gè)研究組[1,2]報(bào)道了MPD患者存在高致病性的獲得性基因突變:JAK2V617F突變,在JAK2基因的第1849位密碼子由G變成T后,JAK2激酶的第617處纈氨酸(V)被苯丙氨酸(F)取代(JAK2V617F)。后續(xù)的研究又發(fā)現(xiàn)在部分JAK2V617F陰性的MPD患者中可檢測到JAK2 exon12突變或其他突變,尤其在多數(shù)JAK2V617F陰性的PV患者中可檢測到JAK2 exon12突變。JAK2基因突變的發(fā)現(xiàn)改變了MPD的分類和診斷標(biāo)準(zhǔn),WHO 2008年修訂的MPD診斷標(biāo)準(zhǔn)中已把JAK2V617F突變列為首選檢測項(xiàng)目,對JAK2V617F突變陰性但仍疑診PV的患者應(yīng)考慮有無JAK2基因其他突變的可能[3]。JAK2V617F以外的突變主要發(fā)生于exon12,因此運(yùn)用在臨床上簡便易行的方法對MPD患者進(jìn)行JAK2V617F和JAK2exon12突變檢測是必要的[4]。

        由于使用的檢測方法不同,JAK2V617F突變在PV、ET和IMF中陽性率分別達(dá)65%~97%、23%~57%和35%~57%[5-7]。在JAK2V617F陰性的MPD患者中5%~40%可檢測到JAK2exon12突變,主要出現(xiàn)于PV患者中[8]。本實(shí)驗(yàn)中,PV中陽性率為93.2%;ET中陽性率為68.6%;IMF中陽性率為60%;和國內(nèi)外運(yùn)用AS-PCR檢測JAK2V617F的文獻(xiàn)報(bào)道的突變率相比,陽性率有所提高[9,10]。149例MPD患者中檢測出4例 exon12突變,均經(jīng)過測序證實(shí),其中3例為PV患者,1例ET患者。在本項(xiàng)研究中,JAK2突變陽性的3種MPD患者白細(xì)胞計(jì)數(shù),PV患者的血小板計(jì)數(shù)及ET患者的血紅蛋白,突變型較其野生型高,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。這些結(jié)果和最近國內(nèi)外的研究報(bào)道基本一致[11,12]。我們在ET患者中也檢測出exon12突變,這表明V617F以外的突變也可能發(fā)生在除PV以外的MPD患者中。由于發(fā)現(xiàn)的陽性病例較少,JAK2 exon12突變陽性患者的臨床和血象特征與JAK2V617突變陽性者是否有差異仍有待積累病例進(jìn)一步研究。

        我們采用外周血單個(gè)核細(xì)胞提取基因組DNA為檢測樣本,通過多重PCR,對149例MPD臨床標(biāo)本具有較高的陽性檢出率;而對15例健康正常人和20例急性白血病患者進(jìn)行檢測,均沒有發(fā)現(xiàn)陽性結(jié)果。研究結(jié)果表明BCR/ABL陰性的MPD中JAK2的陽性率與其他血液惡性疾病有顯著性差異,JAK2可以作為篩查BCR/ABL陰性的MPD的一項(xiàng)重要指標(biāo)。多重等位基因特異性PCR具有很好的特異性和準(zhǔn)確性,能有效提高突變檢出率,簡單易行,具有較好的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        參考文獻(xiàn):

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