王文卿
摘 要:結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)是一種重要的人畜共患病原菌,它們?cè)诟腥具^(guò)程中不可避免地會(huì)面臨宿主環(huán)境中諸如營(yíng)養(yǎng)缺乏,氧化還原以及低pH等壓力,因此結(jié)核分枝桿菌必須通過(guò)及時(shí)調(diào)控基因的表達(dá)來(lái)應(yīng)對(duì)這些環(huán)境變化。近年來(lái)對(duì)結(jié)核分枝桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因及功能的研究取得了令人矚目的進(jìn)展,這將加深我們對(duì)病原菌持續(xù)感染機(jī)制和分子致病機(jī)理的理解。本論文綜合論述了國(guó)外關(guān)于分枝桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控最新研究進(jìn)展。
關(guān)鍵詞:結(jié)核分枝桿菌 感染 轉(zhuǎn)錄調(diào)控 環(huán)境壓力
一、 前言
結(jié)核分枝桿菌 (Mtb) 是嚴(yán)重的人畜共患病原菌之一,目前全球有近20億人口被感染,每年死亡150-200萬(wàn)人 (Banaiee et al., 2006),結(jié)核分枝桿菌 (Mtb) 生長(zhǎng)周期較長(zhǎng),在體內(nèi)感染組織器官后能應(yīng)對(duì)來(lái)自胞內(nèi)各種的環(huán)境壓力如營(yíng)養(yǎng)缺乏、氧化還原限制、酸性壓力,免疫因素、藥物壓力等等,并能逃逸機(jī)體免疫系統(tǒng)的攻擊(Boshoff et al., 2003;Krutiakov, 2006)。因此它需要通過(guò)及時(shí)調(diào)控基因的表達(dá)來(lái)應(yīng)對(duì)各種環(huán)境壓力。然而,相關(guān)的機(jī)制還知道得很少。[1]
結(jié)核分枝桿菌 (Mtb) 的基因組編碼大約將近 4000 個(gè)基因,其中有近 190個(gè)是轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,這暗示轉(zhuǎn)錄調(diào)控對(duì)于病原菌應(yīng)對(duì)各種環(huán)境壓力具有不可或缺的重要作用 (Cole et al., 1998)。因此對(duì)結(jié)核分枝桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因及功能的深入研究將加深我們對(duì)病原菌持續(xù)感染機(jī)制和分子致病機(jī)理的理解。[2]
二、結(jié)核分枝桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究概況
結(jié)核分枝桿菌 (Mtb) 基因組編碼豐富的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,如有 13 個(gè)σ因子,12 個(gè)雙組份系統(tǒng)(Cole et al., 1998),5個(gè)不成對(duì)應(yīng)答調(diào)節(jié)元件,11 個(gè)蛋白激酶 (Av-Gay et al., 2000) 和 140 多個(gè)公認(rèn)的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子 (Bishai, 1998)。目前,在鑒定的轉(zhuǎn)錄因子中有些能夠?qū)Ω鞣N環(huán)境壓力做出應(yīng)答反應(yīng)如氧化壓力、營(yíng)養(yǎng)缺乏、氮饑餓、抗藥性、表面應(yīng)力等等 ( Park et al., 2003;Rodriguez et al., 2003)。[3]
σ因子與RNA聚合酶核心酶可逆結(jié)合,形成RNA聚合酶全酶并且提供啟動(dòng)子特異識(shí)別功能 ( Gruber et al., 2003)。σ因子通過(guò)誘導(dǎo)特殊轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)來(lái)調(diào)控該病原菌與宿主的相互作用,包括粘連、侵入、胞內(nèi)復(fù)制以及擴(kuò)散等 (Manganelli et al., 2004)。因此,σ因子在病原菌存活和發(fā)病機(jī)制中可能發(fā)揮重要作用。[4]
雙組份信號(hào)系統(tǒng)是由一個(gè)組氨酸激酶感應(yīng)器 (histidine kinase sensor) 和一個(gè)胞質(zhì)同源應(yīng)答調(diào)節(jié)子(cytoplasmic cognate response regulator)組成。這些蛋白依靠磷酸轉(zhuǎn)移反應(yīng)起始細(xì)菌內(nèi)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控從而達(dá)到應(yīng)對(duì)環(huán)境刺激的效應(yīng) (Stock et al., 2000)。組氨酸激酶和相應(yīng)的應(yīng)答調(diào)控子的基本元件的組合在自然條件下處于合適水平,且大部分組氨酸激酶是膜偶聯(lián)蛋白 (Shrivastava et al., 2009)。雙組份系統(tǒng)對(duì)于結(jié)核分枝桿菌適應(yīng)宿主細(xì)胞、毒力、病原性以及潛伏等有重要的作用(Malhotra et al., 2004)。[5]
結(jié)核分枝桿菌基因組序列中還包含有 11 個(gè)類真核生物類型的Ser/Thr激酶(Ser/Thr kinases)[6](Cole et al., 1998;Av-Gay et al., 2000),其中的9個(gè)推測(cè)是膜偶聯(lián)蛋白,由膜表面的感應(yīng)結(jié)構(gòu)域和一個(gè)胞質(zhì)催化結(jié)構(gòu)域組成 (Av-Gay et al., 2000), 這些特點(diǎn)表明Ser/Thr激酶很可能是結(jié)核分枝桿菌信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的組成部分。有研究證明它們與細(xì)胞形態(tài)發(fā)育 (Kang et al.,2005)、壓力應(yīng)激(Sharma et al., 2004)以及葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)、胞內(nèi)Glu/Gln調(diào)控 (Molle et al., 2004)等有密切關(guān)系。[7]
參考文獻(xiàn):
[1].Banaiee N, Jr Jacobs W R, Ernst J D. Regulation of Mycobacterium tuberculosis whiB3 in the mouse lung and macrophages. Infect Immun, 2006, 74:6449-6457
[2].Boshoff H I, Reed M B, Barry CE Rd, Mizrahi V. DnaE2 polymerase contributes to in vivo survival and the emergence of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis. Cell, 2003, 113:183-193
[3].Krutiakov V M. Eukaryotic error prone DNA polymerases: suggested roles in replication, repair and mutagenesis. Mol Biol (Mosk), 2006, 40:3-11
[4].Rodriguez G M, Smith I. Mechanisms of iron regulation in mycobacteria: role in physiology and virulence. Mol Microbiol, 2003, 47:1485-1494
[5].Manganelli R, Provvedi R, Rodrigue S, Beaucher J, Gaudreau L, Smith I. Sigma factors and global gene regulation in Mycobacterium tuberculosis. J Bacteriol, 2004, 186:895-902
[6].Stock A. M, Robinson V L, Goudreau P N. Two-component signal transduction. Annu Rev Biochem, 2000, 69:183-215
[7].Shrivastava R, Ghosh A K, Das A K. Intra- and intermolecular domain interactions among novel two-component system proteins coded by Rv0600c,Rv0601c and Rv0602c of Mycobacterium tuberculosis. Microbiology, 2009, 155:772-779endprint