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        有絲分裂動態(tài)模擬

        2014-07-15 07:47:08蘭志霞,趙聯(lián)文,劉赪
        卷宗 2014年5期
        關(guān)鍵詞:紡錘紡錘體核仁

        蘭志霞,趙聯(lián)文,劉赪

        摘 要:有絲分裂,是每個個體成長發(fā)育都離不開的,是細胞從間期開始,經(jīng)過前、中、后、末等時期分裂成兩個細胞的動態(tài)過程,但在實際學(xué)習(xí)過程中,往往只能看到細胞分裂某一時期的定態(tài)特征。如何讓人們更好的理解有絲分裂,本文通過Mathematica繪圖命令,將它的分裂過程以動畫效果演示出來,生動形象、易于理解。

        關(guān)鍵字:Mathematica 有絲;分裂;細胞;繪圖命令

        1 有絲分裂各時期的特征和變化

        細胞分裂間期的特點是:有絲分裂間期分為G1、S、G2 三個階段,在間期,染色質(zhì)沒有高度螺旋化形成染色體,而是以染色質(zhì)的形式進行DNA單鏈復(fù)制[1]。有絲分裂間期是有絲分裂全部過程重要準(zhǔn)備過程,是一個重要的基礎(chǔ)工作。(2)細胞分裂的前期最明顯的變化是,細胞核中出現(xiàn)染色體,在分裂間期復(fù)制的染色體,由于螺旋纏繞在一起,逐漸縮短變粗,形態(tài)越來越清楚;核膜解體逐漸消失,核仁逐漸消失,中心粒逐漸出現(xiàn)且向細胞兩極慢慢移動;紡錘絲逐漸出現(xiàn),隨中心粒逐步向兩極移,最終形成紡錘體。(3)細胞分裂的中期,紡錘體清晰可見,每條染色體的著絲點兩側(cè)都由紡錘絲附著在上面,紡錘絲牽引著染色體運動,在紡錘絲牽引下,染色體的著絲點排列在細胞的“赤道板”上,所以在細胞分裂中期是觀察染色體的最好時期。(4)在后期,著絲點分裂、分離,姐妹染色單體在紡錘絲的牽引下分裂成兩個單染色體,在細胞內(nèi)的染色體數(shù)目增加了一倍,在同一個細胞內(nèi)具有兩套相同的染色體,兩套染色體分別在紡錘絲的牽引下向細胞的兩端移動,最終兩組染色單體到兩極.(5)末期,染色體分散并消失,紡錘體核,仁及核膜重新形成。(6)在分裂末期結(jié)束后,進行的是質(zhì)分裂,產(chǎn)生分裂溝或細胞板,最后分成兩個子細胞。

        2 用Mathematica動畫效果呈現(xiàn)有絲分裂

        要將Mathematica軟件[2]與有絲分裂相結(jié)合,需要解決的問題主要有:1、作圖,包括細胞、細胞核、核仁、及不同時期出現(xiàn)的染色體、紡錘絲等的作圖問題;2、圖形組合,即把一個分裂期的單個作圖組合起來,形成一個完整的細胞圖;3、加以動畫效果,也就是在不同時期有不同的動態(tài)特征,通過命令將其形象生動的表現(xiàn)出來;4、將動態(tài)圖與動態(tài)圖結(jié)合起來,即不同的動畫效果如何在一個時期同時呈現(xiàn)。

        2.1 繪制間期細胞 根據(jù)第一部分對間期作的的介紹,在Mathematica中用不同半徑的圓來繪制出細胞和細胞核,用實心圓繪制出核仁,同時細胞核內(nèi)有一些蛋白質(zhì)的合成,這個可以通過隨機點來反映,染色體已經(jīng)過復(fù)制,可以用正弦函數(shù)在自變量取不同取值范圍獲得它的圖形。然后將以上所做的圖形進行恰當(dāng)?shù)慕M合,為了更形象一些,通過繪圖命令PlotStyle->{RGBColor[1,0,1]}給核仁加上顏色[3]。最后將所有圖像都做成點態(tài)圖,就可以用同一個作圖命令將隨機點與圖形組合到一起,實現(xiàn)間期細胞的完整圖形,但是,間期細胞在外表上看不出有關(guān)細胞核的形態(tài)或結(jié)構(gòu)上的任何變化,所以不需要加動態(tài)。

        2.2 繪制前期細胞 由于細胞分裂前期,細胞的變化特點比較多,為了能形象的反映這一時期的各種變化,把它分為兩個程序。

        2.2.1 前期 結(jié)合文章第一部分介紹,第一個程序主要做在間期圖形的基礎(chǔ)上,隨機點要逐漸減少用For循環(huán)[4]來解決,每次做出的點隨K的值的變化越來越少代表蛋白質(zhì)的減少;對于中心粒的圖,首先做出兩個交叉直線段代表它,然后改變它的顏色使它逐漸清晰呈現(xiàn);對于核仁的逐漸變小,直接使實心圓半徑逐漸減少即可.

        2.2.2 前中期 第二個程序是通過做幾段圓弧,然后將圓弧修飾成虛線的,用來表示核膜的解體;代表核仁的實心圓半徑逐漸減小直至為零,體現(xiàn)核仁的消失;中心粒分開是通過改變直線的取值范圍和與y軸截距b的變化來實現(xiàn)[5];紡錘體可以通過二次函數(shù)開口大小,與y軸交點的高低,以及x的取值范圍來決定,同時隨著y變化移動;染色體的形態(tài)逐漸清晰,讓兩條表示姐妹染色單體的正弦曲線隨K值逐漸拉開距離,而且X的取值范圍減小使其逐漸變短。最后,將隨機點的定義及各種作圖命令放到一個Table[]作圖命令[3]中,就可以實現(xiàn)需要的前期有絲分裂的動態(tài)圖,

        2.3 繪制中期細胞 對于中期,由第一部分的描述,用正弦函數(shù)和余弦函數(shù)做恰當(dāng)運算組合起來即可得到;然后改變紡錘絲的開口,使其逐漸排在赤道板上,同時相應(yīng)改變正余弦函數(shù)的位置,讓染色體隨紡錘絲移動。依據(jù)前面的經(jīng)驗組合圖形和加動態(tài)便完成所需的有絲分裂中期的動態(tài)圖.

        2.4 繪制后期細胞 同樣依據(jù)第一部分的介紹,要實現(xiàn)染色體的分裂和向兩極移動,可以通過改變中期正余弦函數(shù)的周期[6],可得單條染色體圖,其它圖形在中期已作出,后期的關(guān)鍵問題在于細胞的微凹,經(jīng)多次試驗,發(fā)現(xiàn)可通過畫兩個圓心分別在x軸上方和下方的圓,在控制畫圓的取值范圍后,改變?nèi)≈捣秶顾鼈冎饾u外移,從而呈現(xiàn)一個逐漸內(nèi)凹的效果,后期圖形。

        2.5 繪制末期細胞 末期情況剛好與前期相反:出現(xiàn)核膜、核仁,消失紡錘體、染色體,改變程序中圖形的取值范圍即可實現(xiàn);不同的是在末期需要做兩個圓周和兩個實心圓,圓心分別上下平移便可得呈現(xiàn)細胞的逐漸分離;然后畫染色體的三角函數(shù)圖象逐漸變細成絲,說明染色體又變成了染色質(zhì).

        2.6 質(zhì)分裂 在分裂末期結(jié)束后,進行的是質(zhì)分裂:產(chǎn)生分裂溝或細胞板,最后分成兩個子細胞。對于質(zhì)分裂,在末期作圖基礎(chǔ)上,只需要在圓內(nèi)加入一些隨機點,表示一個新細胞內(nèi)的某些蛋白質(zhì)顆粒;改變表染色質(zhì)的函數(shù)的y軸使其逐步往圓內(nèi)移體現(xiàn)染色質(zhì)往核內(nèi)移的特點;表細胞的兩圓隨圓心逐漸上移或下移以及繪圖區(qū)間的增大,實現(xiàn)兩圓的逐漸分離,末期的分裂圖,見圖1。

        圖1

        3 結(jié)論

        將Mathematica軟件與細胞有絲分裂相結(jié)合,通過Mathematica繪圖命令將有絲分裂的連續(xù)分裂過程生動形象的以動態(tài)形式呈現(xiàn)出來,方便大家對有絲分裂的理解和學(xué)習(xí),同時也讓大家對Mathematica軟件有所了解和認識。

        參考文獻

        [1]朱玉賢,李毅.現(xiàn)代分子生物學(xué)[M].北京:高等教育出版社,2002:39-42.

        [2]黃東衛(wèi),陳漢軍,楊雪.大學(xué)數(shù)學(xué)實驗:Mathematica,Matlab,Spss基礎(chǔ)與應(yīng)用.天津:天津大學(xué)出版社,2007:28-31.

        [3]王建利.利用Mathematica軟件展現(xiàn)植物的生長過程.黑龍江科技信息,2011(18):100.

        [4][美]D.尤金著;鄧建松,彭冉冉譯.Mathematica使用指南.北京:科學(xué)出版社,2002:45-46.

        [5]周祥.Mathematica軟件在二維函數(shù)作圖中的應(yīng)用.內(nèi)江科技,2009(10):176.

        [6]聶俊,楊冬芝,楊晶.細胞分子生物學(xué)[M].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2009:149-150.

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